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激活数据学视角下的中成药精准机制研究思考

中国中药杂志 2020年第14期45卷 3331-3335页

作者：王连心谢雁鸣中国中医科学院中医临床基础医学研究所北京100700

中医药辨证论治在重大疾病(无论是新发、突发传染病,还是重大慢性疾病)防治中具有疗效特色和优势,当前以西医病名、分期、分型等为适应症的临床应用,限制了中医药辨证论治作用发挥,使中医特色也难以发挥,因而中成药上市后的治疗价值和... 详细信息

中医药辨证论治在重大疾病(无论是新发、突发传染病,还是重大慢性疾病)防治中具有疗效特色和优势,当前以西医病名、分期、分型等为适应症的临床应用,限制了中医药辨证论治作用发挥,使中医特色也难以发挥,因而中成药上市后的治疗价值和社会价值属性并不能得到切实的彰显,甚至被一概而论为辅助用药。之所以面对这样的局面,很大程度由于难以提出有别于化药的精准定位,更是鲜有精准定位的高级别、高质量循证证据,关于其作用于疾病的病理环节和疗效机制的研究同样缺乏系统性。基因组学等生物技术的发展将医学带入精准时代,为证候生物标记物的探索以及以其为参数探析疗效机制提供了思路与技术支撑。数字中国智库论坛曾提到测序技术的发展提供了人类百分之百的遗传密码,而能看懂的仅占3%,《块数据4.0:人工智能时代的激活数据学》一书提出了激活数据学的概念,可以将其看作是面向大数据的理论假说,为生物信息爆炸与临床大数据之间越发凸显的数据悖论提供了一种新的认知思维和解决方案,是架起数据跨界关联融合的桥梁。深度挖掘临床数据与组学数据的显性价值和隐性价值之后,可以使辨证论治作用的病机环节由暗知识逐渐成为明知识。因而,以中成药为先导进行中药上市后精准定位疗效机制研究,构建"以证统病-功能及病理环节-生物学内涵"精准体系,为增加品种的科技含量提供了强大的依据与支撑。

关键词：中成药上市后评价精准定位效应机制激活数据学

安慰剂效应及临床试验中针刺安慰效应的设计思路

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中医杂志 2024年第9期65卷 904-908页

作者：张艳宏艾艳珂杨金洪岗卫娟景向红刘保延中国中医科学院针灸研究所北京市100700 中国中医科学院中医临床基础医学研究所中国中医科学院中医药数据中心

临床研究通常以疗效为目的和导向,如何从治疗效果中厘清净效应和安慰效应是临床研究的重要问题。梳理安慰剂效应的涵义,认为临床中可能产生安慰剂效应的因素包括既往经验关联、患者期望、暗示、医患关系,并总结反安慰剂效应的特点、产... 详细信息

临床研究通常以疗效为目的和导向,如何从治疗效果中厘清净效应和安慰效应是临床研究的重要问题。梳理安慰剂效应的涵义,认为临床中可能产生安慰剂效应的因素包括既往经验关联、患者期望、暗示、医患关系,并总结反安慰剂效应的特点、产生因素及对临床预后的影响。结合中医学特点,探讨设计能够体现安慰效应测量的针刺临床试验,试图对中医针刺疗效评价中的安慰剂效应做出更清晰的阐释。以原发性失眠症为例,设计前瞻性随机安慰剂对照试验,以观察和评价不同患者在同一医生诊治下针刺的治疗效果和安慰剂效应之间的关系,其组间比较有助于更好地区分不同情形下的临床效应。并尝试探讨安慰剂效应的反应人群,以及安慰剂在不同人群中的效应。

关键词：安慰剂安慰效应针刺疗效评价

基于真实世界及靶点网络的鹿瓜多肽注射液治疗骨关节炎的人群特征、疗效、联合用药及机制预测分析

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中草药 2022年第17期53卷 5445-5458页

作者：刘毅谢雁鸣黎元元高明慧中国中医科学院中医临床基础医学研究所北京100700 中国人民大学统计学院北京100872

目的探讨在真实世界中鹿瓜多肽注射液治疗骨关节炎的人群特征及联合用药情况,并通过构建靶点网络预测其作用机制。方法通过调取医院信息系统(hospital information systeam,HIS)数据库中使用过鹿瓜多肽注射液治疗骨关节炎患者信息,使... 详细信息

目的探讨在真实世界中鹿瓜多肽注射液治疗骨关节炎的人群特征及联合用药情况,并通过构建靶点网络预测其作用机制。方法通过调取医院信息系统(hospital information systeam,HIS)数据库中使用过鹿瓜多肽注射液治疗骨关节炎患者信息,使用SAS9.2及R软件对其使用人群特征及用药情况进行统计;通过分析应用鹿瓜多肽注射液的骨关节炎患者的治疗结局以判断其有效性,并与未使用鹿瓜多肽的骨关节炎患者的治疗结局进行对比分析;Clementine 12.0对联合用药情况进行关联规则分析,并按照置信度排序;利用CNKI、TCMSP数据库及Cytoscape软件构建“疾病-药物-成分-靶点”网络及蛋白相互作用网络,并进行拓扑学分析筛选核心成分与核心靶点;将药物靶点与疾病靶点的交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析;最后将核心成分与核心靶点进行分子对接。结果 4050例骨关节炎患者中,46~65岁年龄段最多(2248例,55.51%),其次为66~75岁年龄段(850例,20.99%),其中女性患者占多数(2657例,70.35%)。4050例应用鹿瓜多肽注射液治疗的骨关节炎患者的总有效率为97.88%,对比未应用鹿瓜多肽注射液的骨关节炎患者的治疗效果,显示鹿瓜多肽注射液疗效更好。关联规则显示鹿瓜多肽注射液治疗骨关节炎常与激素(倍他米松)、抗生素(头孢唑啉)、抗炎镇痛药(骨肽注射剂)、补肾壮骨剂(金天格胶囊)、活血化瘀剂(脉血康胶囊)合并用药。靶点网络分析得到核心成分棕榈酸、肉豆蔻酸、色氨酸、维生素A等10种;核心靶点过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisomeproliferator-activatedreceptorgamma,PPARG)、髓过氧物酶(myeloperoxidase,MPO)、受体型酪氨酸蛋白磷酸酶C(receptor-type tyrosine-protein phosphatase C,PTPRC)等9个,其中分子对接较好的组合:维生素A与丝裂原活化蛋白激酶14(mitogen-activated protein kinase 14,MAPK14)、色氨酸与基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase 9,MMP9)、维生素A与PTPRC。GO及KEGG分析结果显示,主要涉及免疫炎症、激素分泌、血液循环及MAPK通路等方面。结论鹿瓜多肽治疗骨关节炎的患者主要为女性中老年人,其常见证型为肝肾亏虚、湿热及气滞血瘀证;其中药治疗多联合补肾壮骨剂、活血化瘀剂以求标本同治,而化学药治疗常对症治疗以缓解症状。通过靶点网络构建与分析则得出鹿瓜多肽主要通过维生素A及氨基酸对MMP9、MPO等靶点进行调控从而发挥作用。

关键词：真实世界靶点网络鹿瓜多肽注射液人群特征联合用药骨关节炎医院信息系统

基于数据挖掘探讨朱文增治疗重症肌无力用药规律

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中国中医基础医学杂志 2023年第12期29卷 2049-2054页

作者：彭思扬田煜坤常玮倩李少红倪金霞朱文增中国中医科学院广安门医院北京100053 中国中医科学院中医临床基础医学研究所北京100700 北京中医药大学东直门医院北京100007

目的探讨朱文增教授治疗重症肌无力(myasthenia gravis,MG)的用药特点与组方规律。方法收集2017年1月至2021年12月就诊于朱文增教授门诊且诊断为MG的初诊患者病历资料,纳入初诊处方并建立数据库,进行药物频次、四气五味、归经与功效... 详细信息

目的探讨朱文增教授治疗重症肌无力(myasthenia gravis,MG)的用药特点与组方规律。方法收集2017年1月至2021年12月就诊于朱文增教授门诊且诊断为MG的初诊患者病历资料,纳入初诊处方并建立数据库,进行药物频次、四气五味、归经与功效频次统计,关联规则分析及聚类分析,发掘用药规律与经验。结果共纳入中药处方212首,涉及药物126味,各药物累计使用5 320次,使用频次前5位的中药分别是黄芪(212次)、马钱子(212次)、紫河车(212次)、党参(211次)、甘草(211次);性味上以温性药(2 645次)、甘味药(3 492次)使用最多;归经频次前4位分别为肝经(2 927次)、肺经(2 581次)、脾经(2 534次)、肾经(1 624次);药物功效频次前5位分别是补虚药(2 215次)、解表药(1 036次)、活血药(438次)、平肝息风药(418)、清热药(114次);关联规则分析结果显示黄芪、马钱子、党参、升麻、柴胡等为核心药物,其中黄芪-马钱子-紫河车为处方必备药组;聚类分析可将药物分为9类。结论本研究显示朱文增以肺脾肾阳气亏虚为MG的基本病机,治疗上以益气温阳为基本组方原则,重视活血通络、固表祛风、燥湿祛痰药物的配合应用。

关键词：重症肌无力数据挖掘益气温阳朱文增

基于数据挖掘分析叶天士《临证指南医案》治疗脑系疾病的用药规律

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中国医药导报 2023年第7期20卷 17-21页

作者：宋佳卫东锋陈仁波盖国忠李鹤中国中医科学院中医临床基础医学研究所北京100700

目的利用数据挖掘方法分析叶天士《临证指南医案》中脑系疾病的用药规律,为中医临床治疗脑系疾病提供参考。方法筛选《临证指南医案》中治疗脑系疾病的医案,对医案处方中的药物进行规范化处理后录入中医传承辅助平台(V2.5),并对录入处... 详细信息

目的利用数据挖掘方法分析叶天士《临证指南医案》中脑系疾病的用药规律,为中医临床治疗脑系疾病提供参考。方法筛选《临证指南医案》中治疗脑系疾病的医案,对医案处方中的药物进行规范化处理后录入中医传承辅助平台(V2.5),并对录入处方中药物四气、五味、归经、使用频次、常用药对进行分析,采用复杂系统熵聚类算法生成新处方。结果共录入处方116首,含中药151味,其中性寒、味甘之药所占比例最大,归经以肝经为主,使用频次较高的中药有茯苓、生地黄、人参、枸杞子、菊花等;得到支持度≥8、置信度≥0.5的关联规则24组,设置相关度10、惩罚度4、关联系数≥0.023,基于改进的互信息法挖掘得到药对26对,得到11首新处方。结论叶天士治疗脑系疾病重视从肾论治、填精益髓,擅用温补和化痰类中药,挖掘得到的新处方具有一定的临床应用价值。

关键词：数据挖掘临证指南医案脑系疾病用药规律

基于网络药理学和实验验证探讨二仙汤及其温肾拆方治疗抑郁症的可行性

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中国实验方剂学杂志 2022年第16期28卷 211-220页

作者：佘楷杰巩子汉杨婧雯梁文青孟丹华岳广欣中国中医科学院中医基础理论研究所北京100700 河南中医药大学基础医学院河南450000

目的:基于网络药理学技术预测二仙汤全方和温肾方治疗抑郁症的分子机制,通过母婴分离结合慢性束缚应激抑郁模型进行药效及机制对比,探讨温肾拆方治疗抑郁症的可行性。方法:通过中药系统药理学数据平台(TCMSP)和中药分子机制生物信息学... 详细信息

目的:基于网络药理学技术预测二仙汤全方和温肾方治疗抑郁症的分子机制,通过母婴分离结合慢性束缚应激抑郁模型进行药效及机制对比,探讨温肾拆方治疗抑郁症的可行性。方法:通过中药系统药理学数据平台(TCMSP)和中药分子机制生物信息学数据库(BATMAN)收集二仙汤全方及温肾方的活性成分及作用靶点;利用人类基因数据库(Genecards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、药物银行(Drugbank)等数据库筛选抑郁症相关靶点,与药物靶点取交集获得药物-疾病共同靶点,随后导入Cytoscape 3.8.2软件绘制中药-活性成分-靶点-疾病网络图;利用STRING平台构建蛋白互相作用网络并筛选核心靶点及关联的核心成分;采用Metascape平台对交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析。采用母婴分离结合慢性束缚应激制备抑郁小鼠模型,在离乳第21天(PD21)至束缚完成第111天(PD111)给予二仙汤全方和温肾方的药混饲料进行干预。根据糖水偏好实验、悬尾实验、旷场实验、高架O迷宫实验评估小鼠抑郁状态;免疫组织化学法(IHC)观察小胶质细胞离子钙接头蛋白-1(Iba-1)表达;蛋白免疫印迹法(Western blot)、实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)检测蛋白激酶B1(Akt1)、脑源性神经营养因子(BDNF)、突触后致密物95(PSD95)、突触素(Syn)等表达水平。结果:共筛选二仙汤全方和温肾方治疗抑郁症靶点126和118个,全方仅多8个靶点。两方核心靶点相同,主要包括Akt1、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、KEGG通路富集分析预测二仙汤全方和温肾方治疗抑郁症主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路及神经活性配体-受体相互作用通路。动物实验表明,与抑郁症模型组比较,二仙汤全方和温肾方均可明显上调小鼠糖水偏好指数、中央区活动时间及穿越次数、开放臂停留时间及穿越次数、p-Akt1、BDNF、PSD95及Syn的表达水平(P<0.05,P<0.01),明显下调悬尾不动时间和海马小胶质细胞Iba-1表达水平(P<0.05,P<0.01),两方疗效差异无统计学意义。结论:以肾阳虚为主的抑郁症病机和证候规律下,二仙汤的温肾拆方治疗具有可行性。其机制可能与两方均可通过影响Akt1、IL-1β、IL-6、TNF-α等核心靶点及调控PI3K/Akt、MAPK及神经活性配体-受体相互作用信号通路,改善海马区神经炎症及突触可塑性有关。

关键词：抑郁症二仙汤拆方研究网络药理学实验验证

基于关联规则挖掘治疗心血管疾病常用中药组分药理作用研究

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中国中医基础医学杂志 2022年第8期28卷 1330-1334页

作者：巩子汉刘丽梅李园白刘振丽岳广欣中国中医科学院中医基础理论研究所北京100700 中国中医科学院中医药信息研究所北京100700

目的:挖掘使用中药治疗心血管疾病中组分-药理作用规则及组分潜在药理作用,为组分潜在药理作用研究提供了前瞻性推断,同时为使用组分中药治疗心血管疾病优化配伍和应用提供了理论依据。方法:基于“治疗心血管疾病的方剂-中药-组分信息... 详细信息

目的:挖掘使用中药治疗心血管疾病中组分-药理作用规则及组分潜在药理作用,为组分潜在药理作用研究提供了前瞻性推断,同时为使用组分中药治疗心血管疾病优化配伍和应用提供了理论依据。方法:基于“治疗心血管疾病的方剂-中药-组分信息检索统计系统”收集中医药治疗心血管疾病的相关文献,筛选近25年文献数据中关键点的采集及结构化加工,利用Excel 2010中数据挖掘模块的关联规则算法,设置每个规则最低支持为2项,最小概率为10%的参数,对数据进行分析,挖掘治疗心血管疾病的组分-药理作用规则及组分潜在的药理作用。结果:通过关联规则挖掘,得出与临床治疗心血管疾病关联度较高的组分-药理作用规则,如白藜芦醇->抗氧化作用、丹参素->抗血小板凝集作用及丹参酮IIA->降血脂作用等,推测白藜芦醇潜在抗氧化、抗动脉粥样硬化及抗心肌缺血的药理作用,丹参酮IIA潜在降血脂及扩张冠状动脉的药理作用;同一组分在已确定药理作用基础上可能潜在其他药理作用,同一药理作用可能涉及多个组分。结论:组分-药理作用及组分-潜在药理作用规则的挖掘,为组分潜在药理作用研究提供了前瞻性推断,同时为临床采用组分中药治疗心血管疾病优化配伍和应用提供理论依据。

关键词：关联规则组分-药理作用组分-潜在药理作用心血管疾病

基于网络靶点收敛算法预测治疗晚期肺腺癌的候选药物

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中国医学物理学杂志 2024年第4期41卷 504-511页

作者：刘溪关双俞成诚王忠中国中医科学院中医临床基础医学研究所北京1007000

目的:筛选晚期肺腺癌调控网络的收敛基因集,借助关联性图谱(CMap)预测治疗晚期肺腺癌的候选药物。方法:利用TCGA数据库检索肺腺癌转录组与临床数据,使用R4.0.3软件筛选肺腺癌早晚期患者的差异基因,使用Kaplan-Meier与log秩检验识别预后... 详细信息

目的:筛选晚期肺腺癌调控网络的收敛基因集,借助关联性图谱(CMap)预测治疗晚期肺腺癌的候选药物。方法:利用TCGA数据库检索肺腺癌转录组与临床数据,使用R4.0.3软件筛选肺腺癌早晚期患者的差异基因,使用Kaplan-Meier与log秩检验识别预后基因。DAVID和KEGG数据库对预后基因进行富集分析。依据背景网络构建差异预后基因调控网络,集体影响(CI)算法计算网络收敛基因集,将基因集导入CMap获得治疗晚期肺腺癌的候选药物,进一步对候选药物进行查找和分析。结果:共获得差异表达基因3409个,其中1981个与生存显著相关。富集分析结果显示,预后基因主要与细胞分裂、染色体分离、有丝分裂细胞周期、DNA复制、B细胞激活、T细胞激活等生物学过程相关;CI方法筛选得到晚期肺腺癌收敛预后基因96个,通过CMap连接图计算得到排名前20的候选化合物,其中,thapsigargin和nutlin-3通过文献验证对晚期肺腺癌有潜在的治疗作用。结论:借助生物信息学、网络靶点收敛算法和CMap数据库挖掘对晚期肺腺癌具有治疗作用的药物,为发现疾病的候选治疗靶点与药物开辟了新途径和思路。

关键词：晚期肺腺癌预后基因复杂网络靶点收敛抗致癌药

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冠心病热相关证临床用药规律分析

中药新药与临床药理 2022年第5期33卷 707-713页

作者：张佳乐许伟明张逸雯江丽杰胡镜清中国中医科学院中医基础理论研究所北京100700

目的分析近十年冠心病热相关证临床用药规律,为冠心病相关证的临床治疗提供借鉴。方法系统检索2011-2021年国内外主要医学数据库发表的冠心病热相关证的临床观察文献,提取方剂名称、证候名称、药物组成,统计药物使用频率、药物类别,对... 详细信息

目的分析近十年冠心病热相关证临床用药规律,为冠心病相关证的临床治疗提供借鉴。方法系统检索2011-2021年国内外主要医学数据库发表的冠心病热相关证的临床观察文献,提取方剂名称、证候名称、药物组成,统计药物使用频率、药物类别,对高频药物进行关联规则分析,通过“古今医案云平台”进行系统聚类,利用Gephi和Liquorice软件进行药物复杂网络可视化分析。结果最终纳入75篇合格文献,涉及到的热相关证的构成比大小排序:热(29.03%)>痰(28.23%)>瘀(20.97%)>毒(8.87%)。排在前3位的复合证为:痰热瘀阻证、痰热互结证、热瘀痰阻证;药物总频次为631次,共计109种药物,其中44种药物使用频率≥5%,使用频率前6位分别为丹参(64.00%)、黄连(57.33%)、半夏(42.67%)、川芎(28.00%)、茯苓(28.00%)、赤芍(28.00%)。清热类药物使用频次较高的依次为黄连(57.33%)、黄芩(25.33%)、金银花(20.00%)。药物功效类别共涉及16种,清热药(17.59%)、补虚药(16.67%)、活血化瘀药(16.67%)、理气药(10.19%)使用频率较高。关联组合使用较多的药对为黄连→丹参、半夏→黄连、半夏→丹参;药物聚类分析总共得到7组药物组合。而在药物的复杂网络分析中,丹参是全局网络的核心,与黄连、半夏、川芎、茯苓、赤芍、瓜蒌等药物的连线较粗,表示药物之间组合度较高。结论冠心病热相关证的治疗以清热解毒、散结养脉、活血化瘀为核心治法,辅以补气化痰。丹参、黄连、半夏、瓜蒌、茯苓等配伍在冠心病热相关证的治疗中最常用,小陷胸汤、四妙勇安汤、桂枝茯苓丸、十味温胆汤合定志丸、生脉饮为常用方剂组合,该研究可为冠心病热相关证的临床用药提供参考。

关键词：冠心病热证清热解毒数据挖掘用药规律