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基于幽门螺杆菌hp0169基因三维结构的生物信息学分析

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吉林大学学报（医学版） 2024年第3期50卷 739-748页

作者：林玲辉李娜尹晓燕王晓凌胡亚平刘威费瑞田新利邢台医学高等专科学校病原生物学与免疫学教研室河北邢台054000 陆军军医大学基础医学院全军免疫学研究所重庆400038 吉林大学基础医学院细胞生物学系吉林长春130021

目的:克隆幽门螺杆菌(Hp) hp0169基因并进行晶体学研究,分析其二级结构和三维结构。方法:由UniProt数据库中检索Hp NCTC26695菌株hp0169基因及其编码蛋白序列,采用生物信息学方法分析Hp重组胶原蛋白酶(HpPrtC)蛋白理化性质,SOPMA和DNASt... 详细信息

目的:克隆幽门螺杆菌(Hp) hp0169基因并进行晶体学研究,分析其二级结构和三维结构。方法:由UniProt数据库中检索Hp NCTC26695菌株hp0169基因及其编码蛋白序列,采用生物信息学方法分析Hp重组胶原蛋白酶(HpPrtC)蛋白理化性质,SOPMA和DNAStrar软件预测HpPrtC蛋白二级结构特征,SWISS-MOPEL软件构建HpPrtC蛋白三维结构,IEDB和ABCpred软件预测HpPrtC蛋白B淋巴细胞抗原表位,SYFPEITHI网站预测T淋巴细胞抗原表位,专家库(EP)算法和随机森林(RF)算法预测HpPrtC蛋白可结晶性。原核表达HpPrtC重组蛋白,经Ni^(2+)亲和层析和分子筛技术纯化蛋白,结晶试剂盒筛选HpPrtC的结晶条件。结果:hp0169基因共包含1 269个碱基配对,编码蛋白全长422个氨基酸,理论等电点为7.64,相对分子质量为47 300。HpPrtC蛋白为亲水性、可溶性蛋白。HpPrtC蛋白α螺旋的氨基酸数量占全部氨基酸数量百分率为35.78%,β片层为18.72%,β转角为6.87%,无规则卷曲为38.63%。抗原表位分析,HpPrtC蛋白含有B淋巴细胞的5个优势线性表位和3个构象表位及多个T淋巴细胞潜在优势抗原表位。同源建模,HpPrtC蛋白呈二聚体,单体由β折叠围成桶状结构,周围被α螺旋和无规则卷曲围绕。HpPrtC蛋白为中等难度结晶,且无信号肽和跨膜螺旋,在0.2 mol·L^(-1)氯化镁、 0.1 mol·L^(-1)三羟甲基氨基甲烷(Tris)、3.4 mol·L^(-1)己二醇和pH 8.5条件下出现细小成簇的针状晶体。结论:HpPrtC是一种亲水型蛋白,呈二聚体构造,在适宜条件下呈细小成簇针状晶体,其具有T淋巴细胞和B淋巴细胞优势抗原表位,可作为Hp疫苗设计的抗原,用于构建多价融合疫苗或多表位疫苗,本研究结果为Hp的防治提供了实验基础。

关键词：幽门螺杆菌 hp0169基因抗原表位蛋白结晶生物信息学

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原发性免疫缺陷病合并肺炎的发病机制

中华儿科杂志 2024年第10期62卷 1000-1004页

作者：杨忻朴龚权刘莲刘超红长江大学医学部免疫学系荆州华中科技大学同济医学院基础医学院病原生物学系武汉

原发性免疫缺陷病(PID)是一组由基因变异引起的疾病, 这些变异影响免疫系统的各个层面, 导致免疫功能障碍。在PID患儿中, 呼吸系统并发症非常普遍, 特别是肺炎, 对患儿的预后有重大的影响。现聚焦于几种常见的PID类型, 探讨了PID的发病...

原发性免疫缺陷病(PID)是一组由基因变异引起的疾病, 这些变异影响免疫系统的各个层面, 导致免疫功能障碍。在PID患儿中, 呼吸系统并发症非常普遍, 特别是肺炎, 对患儿的预后有重大的影响。现聚焦于几种常见的PID类型, 探讨了PID的发病机制与肺炎并发症之间的联系, 旨在为国内未来的研究和临床实践提供参考依据。

关键词：

云南省2例婴幼儿输入性内脏利什曼病病例临床分析

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2024年

作者：世淑兰李翠英张倩李荣杰奎莉越樊茂昆明市儿童医院检验科云南省儿童医学中心昆明医科大学基础医学院病原生物学与免疫学系

回顾性分析2021年1月至2022年12月昆明市儿童医院收治的2例内脏利什曼病患儿的实验室检查及临床病历资料。2例均为云南女性患儿，年龄分别为9个月和2岁，均有内脏利什曼病流行区（分别为甘肃省甘南藏族自治州舟曲县及新疆维吾尔自治区... 详细信息

回顾性分析2021年1月至2022年12月昆明市儿童医院收治的2例内脏利什曼病患儿的实验室检查及临床病历资料。2例均为云南女性患儿，年龄分别为9个月和2岁，均有内脏利什曼病流行区（分别为甘肃省甘南藏族自治州舟曲县及新疆维吾尔自治区库车市）居住史和白蛉叮咬史。2例患儿均有长期不规则发热，体温39.7～40℃，有皮疹，面色苍白。血常规示血白细胞（病例1、病例2分别为3.92×10～9/L、3.34×10～9/L）、血红蛋白（98 g/L、79 g/L）、血小板（49×10～9/L、57×10～9/L）减少；超敏C反应蛋白（200 mg/L、58.19 mg/L）、降钙素原（2.29 ng/ml、1.38 ng/ml）、铁蛋白（69 445μg/L、2 800μg/L）升高。rK39抗体均为阳性。骨髓穿刺涂片均检出利什曼原虫无鞭毛体。病例2经全套病原微生物宏基因组高通量测序，检出杜氏利什曼原虫序列32 026条。腹部B超示2例患儿均有肝脏、脾脏肿大。确诊为内脏利什曼病后给予葡萄糖酸锑钠240 mg/kg （均分为6剂），每日静脉注射1次，一个疗程6 d，共3个疗程。2例患儿均治愈，随访半年、1年均未见异常。儿童内脏利什曼病临床症状不典型，若长期不规则发热，临床医师应详细询问内脏利什曼病的流行病学史，结合实验室检查及骨髓穿刺涂片寻找病原体，若骨髓中未找到病原体时，应及时行病原体宏基因组高通量测序等检查，以减少误诊或漏诊。

关键词：内脏利什曼病婴幼儿临床分析云南省

基于转录组测序研究嗜肺军团菌抑制小鼠巨噬细胞内体溶酶体融合机制

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解放军医学杂志 2024年

作者：陈民佳曹秀琴贺瑞霞陈海霞杨志伟宁夏医科大学基础医学院病原生物学与医学免疫学系宁夏医科大学生育力保持省部级共建教育部重点实验室

目的探究嗜肺军团菌感染抑制小鼠巨噬细胞内体溶酶体融合的相关致病机制。方法将12只C57小鼠随机分为对照组和嗜肺军团菌感染组（n=6），麻醉后经鼻分别滴入相同体积的生理盐水或嗜肺军团菌液；连续3d记录体重变化，取出整肺观察其伤... 详细信息

目的探究嗜肺军团菌感染抑制小鼠巨噬细胞内体溶酶体融合的相关致病机制。方法将12只C57小鼠随机分为对照组和嗜肺军团菌感染组（n=6），麻醉后经鼻分别滴入相同体积的生理盐水或嗜肺军团菌液；连续3d记录体重变化，取出整肺观察其伤情，HE和免疫组化染色观察两组小鼠肺组织病理特征；转录组测序分析两组肺组织的差异表达基因（DEGs）和相关信号通路。提取小鼠骨髓巨噬细胞（BMDMs），与嗜肺军团菌共培养，采用免疫荧光染色鉴定感染情况，转录组测序分析感染前后的DEGs和富集的相关信号通路。筛选感染后共同参与信号通路的核心基因，用RT-qPCR验证核心基因m RNA表达水平在体内外的一致性，Western blotting检测相关蛋白的表达情况，细菌繁殖实验检测嗜肺军团菌在细胞内的繁殖情况。结果与对照组比较，感染后2d、3d，嗜肺军团菌感染组小鼠体重明显下降（P免疫组化检测结果显示，嗜肺军团菌感染组小鼠肺组织髓过氧化物酶（MPO）活性明显增高（P免疫荧光检测结果显示，嗜肺军团菌在体外小鼠BMDMs内增殖；转录组测序筛选出DEGs 2550个，其中上调基因1677个，下调基因873个；KEGG富集分析显示，富集通路涉及癌症中的转录失调、PI3K-Akt和吞噬体通路等。筛选出富集在吞噬反应集群中的DEGs，得到小鼠肺组织和BMDMs重叠的微管蛋白β1(Tubb1)等13个核心基因。小鼠肺组织和BMDMs感染嗜肺军团菌后，RT-qPCR检测结果显示，Tubb1表达水平均明显降低（P<0.001）;Westernblotting检测结果显示，Rab7、Tubb1、LAMP2蛋白表达水平明显降低（P<0.05）,iNOS和MPO表达水平明显增高（P<0.05）。胞内增殖实验结果显示，随着感染时间增加，BMDMs中的嗜肺军团菌逐渐增多。结论嗜肺军团菌感染小鼠巨噬细胞的可能机制是下调Rab7/Tubb1/LAMP2，抑制内体溶酶体的融合。

关键词：嗜肺军团菌微管蛋白β1 内体溶酶体融合转录组测序巨噬细胞

结核分枝杆菌毒力因子ESAT-6和CFP-10的研究进展

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中国病原生物学杂志 2024年第1期19卷 96-100页

作者：高利罗丽莎吴新雅马玮洁钟蕾柳爱华宝福凯昆明医科大学云南省高校热带传染病重点实验室云南昆明650500 昆明医科大学病原生物学与免疫学系昆明医科大学生物化学与分子生物学系

ESAT-6和CFP-10是结核分枝杆菌中含量丰富的毒力因子,分别由RD1区相邻的基因esxA和esxB编码,二者可以协同转录形成紧密二聚体。此二聚体在破坏宿主的免疫应答、发挥毒性、参与吞噬溶酶体到宿主细胞质的易位、激活嗜中性粒细胞发挥趋化... 详细信息

ESAT-6和CFP-10是结核分枝杆菌中含量丰富的毒力因子,分别由RD1区相邻的基因esxA和esxB编码,二者可以协同转录形成紧密二聚体。此二聚体在破坏宿主的免疫应答、发挥毒性、参与吞噬溶酶体到宿主细胞质的易位、激活嗜中性粒细胞发挥趋化作用等生物学作用中扮演着重要角色。ESAT-6和CFP-10有良好的免疫原性,可应用于结核病的诊断和疫苗研究。进一步探索它们的分子结构和致病机制可为结核病的预防、诊断和治疗提供新思路。

关键词： ESAT-6 CFP-10 结核病致病机制诊断疫苗综述

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X射线对胃癌细胞和人脐静脉内皮细胞LOX家族成员的不同影响

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医学研究与战创伤救治 2024年第1期37卷 7-13页

作者：王欣怡牛海亚邓红杨新燕刘一凡王凯博徐传皓韩梅宁夏医科大学基础医学院病原生物学与医学免疫学系银川750004 新疆医科大学第一附属医院昌吉分院放射科昌吉831100

目的比较不同剂量X射线对人低分化粘液样胃腺癌细胞MGC-803和人脐静脉内皮细胞(HUVEC)赖氨酰氧化酶(LOX)家族成员的影响,为了解X射线辐射后不同细胞中基因和蛋白的改变提供依据。方法0、2、4、6、8和10 Gy剂量X射线辐射MGC-803和HUVEC细... 详细信息

目的比较不同剂量X射线对人低分化粘液样胃腺癌细胞MGC-803和人脐静脉内皮细胞(HUVEC)赖氨酰氧化酶(LOX)家族成员的影响,为了解X射线辐射后不同细胞中基因和蛋白的改变提供依据。方法0、2、4、6、8和10 Gy剂量X射线辐射MGC-803和HUVEC细胞,用细胞增殖实验检测细胞致死率并计算细胞半数致死量(LD 50),确定后序测试剂量组;Realtime PCR、Western blot、ELISA及Amplex Red过氧化氢法分别检测辐射后细胞LOX家族成员mRNA丰度、蛋白相对量、分泌量及LOX酶活性变化;Western blot方法分析X射线辐射对细胞p-p38MAPK和p-Erk1/2MAPK影响。结果X射线辐射后的LD 50胃癌MGC-803为8.2 Gy,HUVEC为6 Gy,后序试验选用0、2、4和6 Gy剂量组。MGC-803细胞经各剂量X射线辐射后LOXL1、LOXL2和LOXL4的mRNA均下调,而LOX的mRNA上调(P<0.05);2 Gy组LOX和LOXL4的蛋白和酶分泌水平低于0 Gy组(P<0.05);4 Gy组LOX、LOXL1、LOXL2和LOXL4的蛋白和分泌低于0 Gy组(P<0.05);6 Gy组LOXL1的蛋白和分泌低于0 Gy组(P<0.05);但LOXL3的mRNA、蛋白和分泌在2 Gy组均高于0 Gy组(P<0.05)。HUVEC中,2 Gy组LOXL1和LOXL3的mRNA、蛋白和酶分泌水平均显著高于0 Gy组(P<0.05);4 Gy组LOX、LOXL1、LOXL3和LOXL4的mRNA、蛋白和酶分泌水平均较0 Gy组升高(P<0.05);6 Gy组LOXL2和LOXL4的mRNA、蛋白和酶分泌水平均较0 Gy组升高(P<0.05)。2 Gy和6 Gy组HUVEC的LOX酶活性增强(P<0.05)。MGC-803细胞的2 Gy和6 Gy组p-p38、p-p42、p-p44较0 Gy组上调(P<0.05);HUVEC经各剂量辐射p-p38、p-p42和p-p44均上调(P<0.05)。结论X射线辐射对两种细胞作用不同,一定剂量X射线辐射上调HUVEC的LOX及其家族成员的产生、分泌和酶活性,下调胃癌细胞MGC-803的除LOXL3外其他成员的产生和分泌。

关键词： X射线赖氨酰氧化酶家族人脐静脉内皮细胞胃癌细胞 MAPK信号通路

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妊娠期、产后和育龄未孕期慢性HBV感染者间HBV特异性T细胞反应活性比较

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第09期44卷

作者：王根菊吴燕丹纪瑞雪岳芳平江红秀南京市第二医院妇产科，南京 210003 东南大学医学院病原生物学与免疫学系，南京 210009

摘要目的探讨妊娠期、产后以及育龄未孕期慢性HBV感染患者HBV特异性T细胞反应活性的特征。方法选取100例慢性HBV感染患者，其中妊娠组43例，产后6个月内组26例，育龄未孕组31例，ELISPOT系统检测患者外周血HBV特异性T细胞的反应活... 详细信息

摘要目的探讨妊娠期、产后以及育龄未孕期慢性HBV感染患者HBV特异性T细胞反应活性的特征。方法选取100例慢性HBV感染患者，其中妊娠组43例，产后6个月内组26例，育龄未孕组31例，ELISPOT系统检测患者外周血HBV特异性T细胞的反应活性，同时收集临床资料和HBV病毒学及血清学常规检测数据进行分层分析。结果妊娠组感染者的HBV特异性T细胞反应活性与产后组的差异无统计学意义，但明显低于育龄未孕组( P 学意义，但明显低于育龄未孕组( P 学意义，但是妊娠组和育龄未孕组都明显高于产后组( P 免疫功能评价和治疗提供有价值的指导。

关键词：慢性HBV感染妊娠抗原特异性T细胞

国学“三十六计”融入微生物学与免疫学课程思政的思考

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中国免疫学杂志 2024年第1期40卷 174-177页

作者：盛彬彬尹辉王卓娅刘晓波广东药科大学基础医学院病原生物学与免疫学系广州510006

微生物学与免疫学是医药类院校本科生核心专业基础课程之一。笔者结合本课程特点、授课感悟以及课程思政教学大背景,思考将国学经典“三十六计”有机融入本课程教学实践,并阐明其多方面的意义,为其他国学经典引入专业课课程思政教育提... 详细信息

微生物学与免疫学是医药类院校本科生核心专业基础课程之一。笔者结合本课程特点、授课感悟以及课程思政教学大背景,思考将国学经典“三十六计”有机融入本课程教学实践,并阐明其多方面的意义,为其他国学经典引入专业课课程思政教育提供有益借鉴。

关键词：微生物学与免疫学课程思政 “三十六计”

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人工智能推动医学教育改革的现状与展望

基础医学教育 2024年 891-895页

作者：刘成程寻萌韩蕾秦棪楠西安交通大学基础医学院病原生物学与免疫学系西安交通大学基础医学院细胞生物学与遗传学系

文章整理和总结了人工智能(AI)技术在医学教育中的应用现状,分析了其在提高教学效率、增强学习体验和实现个性化教育方面的优势。研究表明,AI技术通过智能系统和虚拟现实技术提供实时反馈和个性化学习路径,显著提升了学生对复杂知识点... 详细信息

文章整理和总结了人工智能(AI)技术在医学教育中的应用现状,分析了其在提高教学效率、增强学习体验和实现个性化教育方面的优势。研究表明,AI技术通过智能系统和虚拟现实技术提供实时反馈和个性化学习路径,显著提升了学生对复杂知识点的掌握和实践技能。同时,AI技术在实验教学中的应用,如虚拟实验室和模拟手术平台,提高了学生的实验操作能力和临床技能。然而,AI技术的应用也面临着技术成本高、教师培训不足和数据隐私等挑战。文章进一步探讨了AI技术在医学教育中的应用前景,为未来研究和应用提供了参考。

关键词：高等教育医学教育教学改革人工智能个性化教育实验教学