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高通量测序技术在低频突变检测中的应用

遗传 2024年第2期46卷 126-139页

作者：栾洋尤馨悦杨劲上海交通大学医学院公共卫生学院上海200025 中国药科大学药学院南京210009

体细胞突变的累积与衰老、肿瘤及多种疾病的发生密切相关。在正常组织细胞中,基因组中自发突变和诱发突变的变异等位基因频率极低,对这类低频突变的检测一直面临挑战。第二代和第三代高通量测序(next-generation sequencing,NGS)技术的... 详细信息

体细胞突变的累积与衰老、肿瘤及多种疾病的发生密切相关。在正常组织细胞中,基因组中自发突变和诱发突变的变异等位基因频率极低,对这类低频突变的检测一直面临挑战。第二代和第三代高通量测序(next-generation sequencing,NGS)技术的出现,可以实现任意物种全基因组上变异的直接检测,克服传统突变检测技术的诸多局限性。但是常规NGS由于测序错误率较高从而限制了其在低频突变检测上的应用,基于分子一致性测序策略进行错误矫正的高准确性NGS测序技术作为有效的低频突变检测工具,有望在环境诱变剂的评价与研究、细胞与基因治疗药物风险评估、人群健康风险监测和生命科学基础研究领域发挥重要作用。本文对比经典突变检测方法,对基于NGS的低频突变检测技术研究进展进行综述,并对应用前景进行展望,以期为该技术的进一步开发、研究和在相关领域的应用提供参考。

关键词：高通量测序技术低频突变分子一致性测序致突变风险评估

上海地区辅助生殖女性孕前多种农药的暴露水平及其影响因素

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环境与职业医学 2024年第6期41卷 640-647页

作者：夏转宁张妍胡培培赵九如刘志伟田英高宇上海交通大学医学院公共卫生学院上海200025 上海交通大学医学院附属新华医院上海200092 上海交通大学医学院附属国际和平妇幼保健院上海200030 上海交通大学医学院附属新华医院环境与儿童健康教育部和上海市重点实验室上海200092

[背景]农药暴露可能会影响接受辅助生殖技术(ART)治疗女性的生殖健康,然而,目前我国有关ART女性农药暴露水平的数据缺乏且探讨其影响因素的研究较少。[目的]了解ART女性孕前农药的暴露水平及其影响因素。[方法]本研究采用横断面设计的... 详细信息

[背景]农药暴露可能会影响接受辅助生殖技术(ART)治疗女性的生殖健康,然而,目前我国有关ART女性农药暴露水平的数据缺乏且探讨其影响因素的研究较少。[目的]了解ART女性孕前农药的暴露水平及其影响因素。[方法]本研究采用横断面设计的调查方法,于2017年7月至2018年12月在上海交通大学医学院附属国际和平妇幼保健院生殖门诊招募了508名接受ART治疗的女性作为研究对象。采用气相/液相色谱-串联质谱法检测ART女性尿液中有机磷类农药(OPs)、拟除虫菊酯类农药(PYRs)以及新烟碱类农药(NEOs)的代谢产物浓度,并分别计算三类农药代谢产物的摩尔浓度总和(∑2OPs、∑2PYRs、∑2NEOs)以评估农药暴露水平。使用问卷调查ART女性的人口学特征、饮食频率以及行为习惯信息。采用多因素线性回归分析人口学特征、饮食频率以及行为习惯与ART女性尿液中农药代谢产物浓度的关系。[结果]本研究人群中∑2OPs、∑2PYRs、∑2NEOs经尿肌酐校正后的中位浓度分别为419.77、2.95、20.36 nmol·g^(−1)。多因素线性回归结果显示:每天摄入蔬菜的ART女性尿液中∑2OPs浓度比蔬菜摄入频率≤3 d·周^(−1)的ART女性高42.88%(P上海地区ART女性存在农药广泛暴露。年龄、BMI、蔬菜水果摄入频率、宠物饲养情况以及不孕原因可能与ART女性农药暴露水平有关,但仍需要更多的人群数据验证本研究结果。

关键词：辅助生殖农药暴露水平饮食因素不孕原因

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开启中国模式的创新药物定价规则

世界临床药物 2024年第3期45卷 233-238页

作者：胡善联复旦大学公共卫生学院卫生经济学教研室上海200032

目的介绍2024年中国医疗保障局发布的《关于建立新上市化学药品首发价格形成机制鼓励高质量创新的通知》政策内容、意义,并提出完善建议。方法通过政策和文献分析,总结高、中、低3类不同创新程度的新药经济性分析的内容和要求,并对美国... 详细信息

目的介绍2024年中国医疗保障局发布的《关于建立新上市化学药品首发价格形成机制鼓励高质量创新的通知》政策内容、意义,并提出完善建议。方法通过政策和文献分析,总结高、中、低3类不同创新程度的新药经济性分析的内容和要求,并对美国、德国、法国及加拿大对创新药附加效益的分类进行比较。结果近年来中国创新药的研发获得很大进展。坚持药品价格由市场决定的基本原则,发挥政府对新上市药品价格的支持和指引作用。现提出从药学基础、临床价值及循证证据3个维度评价新药的创新程度。评价体系包含3个一级指标、13个二级指标及34个三级指标,按分值进入高(90~150分)、中(50~90分)及低(50分以下)3个组别,引导药企自我测评新上市化学药品的创新程度。结论新政策鼓励高质量创新药物的发展,以临床价值为导向,重视新药的附加治疗效益,明确中国建立境外参考价格的国家和地区的“篮子”和“首发价格”的构成,包括生产制造成本、期间费用、销售利润、税费及流通环节差价5个部分。充分调动药企自主评价、行业协会推荐书、医疗机构出具临床专业意见书,以及调动卫生技术评估专业评价机构、多学科专家的积极性,对药品价格进行社会共治。

关键词：化学药品上市价格高质量发展市场机制自主定价

母体孕期砷暴露与新生儿出生指标关系的Meta分析

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中华地方病学杂志 2024年第6期43卷 502-512页

作者：缪可言刘伟慈景楠杨乾磊安艳苏州大学苏州医学院苏州215000 南京医科大学无锡医学中心无锡214023 苏州大学苏州医学院公共卫生学院卫生毒理学系苏州215021 苏州大学苏州医学院公共卫生学院中日环境与健康联合实验室苏州215021

目的系统评价母体孕期砷暴露对新生儿出生指标的影响。方法通过检索中国知网(CNKI)、万方数据知识服务平台(WanFang Data)、维普中文期刊服务平台(VIP)、PubMed、Web of Science、Embase等数据库,将国内外发表的母体孕期砷暴露与新生儿... 详细信息

目的系统评价母体孕期砷暴露对新生儿出生指标的影响。方法通过检索中国知网(CNKI)、万方数据知识服务平台(WanFang Data)、维普中文期刊服务平台(VIP)、PubMed、Web of Science、Embase等数据库,将国内外发表的母体孕期砷暴露与新生儿出生指标的相关文献纳入研究,检索时间自数据库建库至2022年8月31日。采用Stata SE16软件进行效应值的Meta分析,用I 2统计量和Q检验进行异质性检验。根据检验结果选择随机效应模型或固定效应模型进行综合定量分析,以回归系数(β)作为效应指标;并根据样本类型、研究地区、研究类型进行亚组分析。结果最终纳入34篇文献(共57530对母婴组合),包括中文文献2篇、英文文献32篇。其中,包含母体孕期砷暴露与新生儿出生体重、身长、头围、胸围的分别有31、16、18、5篇,经异质性检验,I 2值分别为81.1%、97.1%、62.8%、98.3%,均≥50%且P<0.05,存在显著异质性,采用随机效应模型进行Meta分析;出生体重、身长、头围、胸围的合并β值(95%CI)分别为-10.99(-15.60,-6.39),-0.02(-0.10,0.06),-0.01(-0.04,0.03),-0.18(-0.35,-0.01)。亚组分析结果显示,当样本类型为血液样本时,母体孕期砷暴露对新生儿出生体重的影响显著[β值(95%CI):-25.72(-44.46,-6.98)]。结论母体孕期砷暴露可能会引起新生儿出生指标相对降低,尤其是出生体重;且血液砷含量可能是评估母体孕期砷暴露致出生指标降低的重要指标。

关键词：砷新生儿妊娠期暴露出生指标 Meta分析

身体基本指数与重症肌无力的因果关联:一项两样本孟德尔随机化研究

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中国循证医学杂志 2024年第6期24卷 673-677页

作者：殷珂宇双思傅道森董文浩夏鹏张国坤沈蓉王德贵王青兰州大学护理学院兰州730000 兰州大学基础医学院人体解剖学教研室兰州730000

目的采用两样本孟德尔随机化分析探究4项身体基本指数(基础代谢率、体脂率、BMI及臀围)与重症肌无力(myasthenia gravis,MG)之间的因果关联。方法在大型公开可检索的数据库中获取全基因关联分析汇总数据,选取4项身体基本指数作为暴露因... 详细信息

目的采用两样本孟德尔随机化分析探究4项身体基本指数(基础代谢率、体脂率、BMI及臀围)与重症肌无力(myasthenia gravis,MG)之间的因果关联。方法在大型公开可检索的数据库中获取全基因关联分析汇总数据,选取4项身体基本指数作为暴露因素,MG作为结局因素,筛选出与暴露因素表型强相关的单核苷酸多态性作为工具变量,进行两样本孟德尔随机化分析,以评估暴露与疾病之间的潜在因果关系。结果逆方差加权法分析结果显示,基础代谢率[OR=1.39,95%CI(1.00,1.93),P=0.047]、体脂率[OR=1.61,95%CI(1.06,2.44),P=0.024]、臀围[OR=1.67,95%CI(1.29,2.17),P<0.001]升高均会增加MG发病风险,但BMI与MG没有显著的因果关联。结论基础代谢率、体脂率及臀围对MG存在致病效应,BMI与MG没有显著的因果关系。

关键词：身体基本指数重症肌无力孟德尔随机化因果关联

《职业卫生与职业医学》混合教学模式改革的思考与实践

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中国继续医学教育 2024年第12期16卷 34-37页

作者：柴小琴程淑群周丽晓夏茵茵韩令力蒋学君邹镇陈承志重庆医科大学公共卫生学院劳动与环境卫生教研室重庆400016

《职业卫生与职业医学》既是公共卫生与预防医学学科的一门基础课程,又是应用性较强的一门课程,如何增加学生对该课程的学习收获对于培养高质量公共卫生人才至关重要。在各种数字网络媒体流行的时代大背景和新时期教育教学改革的不断推... 详细信息

《职业卫生与职业医学》既是公共卫生与预防医学学科的一门基础课程,又是应用性较强的一门课程,如何增加学生对该课程的学习收获对于培养高质量公共卫生人才至关重要。在各种数字网络媒体流行的时代大背景和新时期教育教学改革的不断推进下,信息技术与教学改革的碰撞从未停止,单纯的线上或线下教学模式已无法满足教育系统的更新,以及教师对教学和学生对学习的需要。因此,在《职业卫生与职业医学》课程授课过程中,线上线下混合教学模式逐渐占据主要地位。线上线下混合教学模式作为目前最有发展前景的教学模式,其优势与不足共存,应当加强改善,不断优化,以助力未来教育实践的发展。文章以医科大学为例,综合分析《职业卫生与职业医学》线上线下混合教学改革的优缺点,提出可行性建议或策略,以期为课程改革探索提供新思路和新路径。

关键词：职业卫生与职业医学教学改革线上线下混合教学模式突出优势现存问题优化措施

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乡村振兴背景下上海农村中医药服务研究

中国基层医药 2024年第1期31卷 135-142页

作者：高中制马君雨赵海磊谢国群倪阳张安董恩宏上海市皮肤病医院院长办公室上海200443 上海中医药大学公共健康学院卫生管理教研室上海201203 上海健康医学院健康护理与健康管理学院健康管理教研室上海201318

目的基于“人口公平性”维度分析上海农村中医药服务的资源配置情况,为进一步优化上海农村卫生资源配置及中医药服务发展提供依据。方法采用内容分析法对农村中医药服务政策文本进行计量分析。采用洛伦兹曲线、基尼系数、泰尔指数对上... 详细信息

目的基于“人口公平性”维度分析上海农村中医药服务的资源配置情况,为进一步优化上海农村卫生资源配置及中医药服务发展提供依据。方法采用内容分析法对农村中医药服务政策文本进行计量分析。采用洛伦兹曲线、基尼系数、泰尔指数对上海农村中医药卫生资源公平性进行评价。结果从2016年2月22日至2022年9月,全国农村中医药服务政策文件共纳入27份71条;上海1235家样本村卫生室2019年中医诊疗设备、中医适宜技术、中医诊疗人次、中医执业(助理)医师数、中药配置按人口配置的基尼系数分别为0.17、0.20、0.40、0.80、0.80;总泰尔指数介于0.0906~0.3969,泰尔指数贡献率除中医诊疗人次外,其余四组指标组内大于组间,与基尼系数的结果保持一致。结论上海农村中医药服务发展在全国处于前列,中医药发展政策环境良好,但在某些方面存在卫生资源配置不公平。影响上海农村中医药卫生资源配置公平性的主要原因是区域内的不公平。

关键词：农村卫生中医药卫生服务公平性洛伦兹曲线基尼系数泰尔指数乡村振兴卫生政策上海市

基于“同一健康”(One Health)理念《传染病学》教学的思考

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中国热带医学 2024年第1期24卷 111-114页

作者：常巧呈孟繁邨曹子成刘卫东左培军李丽萍陆家海汕头大学公共卫生学院预防医学教研室广东汕头515041 海南医学院One Health研究中心海南海口571199 中山大学公共卫生学院One Health研究中心广东广州510080

传染病是威胁人类健康和社会发展的重大公共卫生问题,传染病教学是公共卫生教育的重要组成部分。然而,传统的传染病教学存在着内容过于理论化和碎片化、方法过于传统和单一、视野过于局限和孤立等问题,难以适应当前复杂多变的传染病防... 详细信息

传染病是威胁人类健康和社会发展的重大公共卫生问题,传染病教学是公共卫生教育的重要组成部分。然而,传统的传染病教学存在着内容过于理论化和碎片化、方法过于传统和单一、视野过于局限和孤立等问题,难以适应当前复杂多变的传染病防控形势。“同一健康”(One Health)理念强调跨学科、跨部门、跨地区交流与合作,实现人类健康、动物健康和环境健康的和谐统一,在传染病的防控中具有重要意义。本文提出了基于One Health理念的《传染病学》教学改革思路,旨在通过认识到人类健康、动物健康和环境健康之间的紧密联系,提高该课的教学质量和效果。具体而言,建议从引入One Health的基本概念、原则和实践,增加One Health相关的传染病内容,采用多样化和互动化的教学方法,建立跨学科的教学合作等4个方面进行改革,并给出了具体的建议。基于One Health理念的《传染病学》教学改革有利于培养具有全球视野、系统思维和跨界协作能力的公共卫生人才,为应对新发、再发和地方性的传染病威胁提供有力的人才支撑。

关键词：同一健康传染病学教学

固有免疫受体NLRX1在中枢神经系统疾病中作用的研究进展

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神经解剖学杂志 2024年第1期40卷 127-131页

作者：高保青曹碗君高小川吴兴安刘蓉蓉陈雅慧邝芳延安大学医学院生理学教研室延安716000 空军军医大学基础医学院神经生物学教研室西安710032 空军军医大学基础医学院微生物与病原生物学教研室西安710032

中枢神经系统(CNS)正常功能的发挥高度依赖细胞能量供给与固有免疫体系提供的内环境稳定。NOD样受体家族成员X1(NLRX1)是定位于线粒体的固有免疫模式识别受体,具有调节线粒体自噬、炎性反应、活性氧的生成等多种功能,因而可影响炎症、... 详细信息

中枢神经系统(CNS)正常功能的发挥高度依赖细胞能量供给与固有免疫体系提供的内环境稳定。NOD样受体家族成员X1(NLRX1)是定位于线粒体的固有免疫模式识别受体,具有调节线粒体自噬、炎性反应、活性氧的生成等多种功能,因而可影响炎症、肿瘤等多种疾病的进展。近年来的研究表明,NLRX1通过抑制炎性反应、调节神经细胞线粒体自噬、线粒体动力变化和氧化应激反应等机制,在自身免疫性脱髓鞘疾病、缺血缺氧性疾病、创伤等CNS疾病中发挥神经保护作用。了解NLRX1参与CNS疾病过程的机制,可加深对CNS固有免疫分子的认识,并可望为CNS疾病的治疗提供新的思路与靶点。

关键词：中枢神经系统疾病 NLRX1 神经炎症线粒体调节细胞凋亡