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干扰素调节因子2结合蛋白2在斑马鱼胚胎早期发育过程中的表达谱分析

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上海交通大学学报（医学版） 2021年第3期41卷 314-319页

作者：王海红高硕朱军周隽上海交通大学医学院附属瑞金医院中法生命科学和基因组研究中心上海200025

目的·探究干扰素调节因子2结合蛋白2(interferon regulatory factor 2 binding protein 2,irf2bp2)基因的2个横向同源物(irf2bp2a和irf2bp2b)在斑马鱼胚胎早期发育过程中的表达异同。方法·选取发育不同时间点(胚胎期和幼虫期)的斑马... 详细信息

目的·探究干扰素调节因子2结合蛋白2(interferon regulatory factor 2 binding protein 2,irf2bp2)基因的2个横向同源物(irf2bp2a和irf2bp2b)在斑马鱼胚胎早期发育过程中的表达异同。方法·选取发育不同时间点(胚胎期和幼虫期)的斑马鱼胚胎,通过mRNA全胚胎原位杂交技术明确irf2bp2a和irf2bp2b的时空表达谱,并通过实时定量PCR检测其表达水平。结果·irf2bp2a和irf2bp2b在神经系统、眼及胸鳍等部位都有着类似的高表达,而各自在肝脏或斯坦尼小体出现特异性表达,提示其在斑马鱼胚胎早期发育过程中具有独特的表达模式。实时定量PCR检测结果显示irf2bp2a和irf2bp2b在胚胎发育早期都有表达,但表达水平有所不同。结论·尽管斑马鱼irf2bp2a和irf2bp2b这2个横向同源物具有高度保守的功能结构域,但二者在胚胎早期发育过程中的表达谱不尽相同,提示其功能并不完全冗余。

关键词：干扰素调节因子2结合蛋白2 斑马鱼胚胎表达谱 mRNA全胚胎原位杂交实时定量PCR

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端粒保护蛋白复合体在氧化应激中作用

中华急诊医学杂志 2014年第12期23卷 1415-1417页

作者：陈连祥朱小伟邢骏姚明玲叶静陆一鸣上海交通大学医学院附属瑞金医院中法生命科学和基因组研究中心急诊科上海200025

端粒特异性保护蛋白复合体（sheherin）是与端粒结合的六蛋白复合体，包括：***2，TIN2，Rapl，TPPl和POTI。6种成分以不同的方式参与维持端粒的结构和功能稳定：（1）TRFI和TRF2负性调节端粒长度。（2）TRF2介导t-环结构形成^[1-2]以... 详细信息

端粒特异性保护蛋白复合体（sheherin）是与端粒结合的六蛋白复合体，包括：***2，TIN2，Rapl，TPPl和POTI。6种成分以不同的方式参与维持端粒的结构和功能稳定：（1）TRFI和TRF2负性调节端粒长度。（2）TRF2介导t-环结构形成^[1-2]以及稳定t-环结构^[3]，与拓扑异构酶II相互作用维持端粒的拓扑结构^[4]。（3）POTI、Rapl等维持3’悬臂稳定。（4）Sheherin盖帽作用抑制DNA损伤系统激活^[5]。（5）shelterin还能募集大量非端粒特异性蛋白成员，包括ERCCI／XPF，Apollo等形成端粒蛋白网络，共同肌同参勺端粒保护和端粒复制延伸^[6]。正是由于sheherin的作用，使得端粒得以躲过DNA损伤反应（DNADamgae Response，DDR）体系的攻击，并在维护染色体稳定、避免染色体末端受核酸酶降解和荩因重排中起重要作JH。大量研究表明shelterin除保护端粒作用外，其可参与细胞多种反应过程，本文将重点讲述sheherin在氧化应激进程中作用。

关键词：特异性保护蛋白复合体端粒长度氧化应激拓扑异构酶II DNA损伤拓扑结构 TRF2

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胃肠道微生物在肿瘤发生中的作用

上海交通大学学报（医学版） 2019年第9期39卷 1083-1088页

作者：陆海洋赵维莅上海交通大学医学院附属瑞金医院血液科上海市血液学研究所医学基因组学国家重点实验室中法生命科学和基因组学研究中心

胃肠道微生物对人体的生理功能具有重要影响。近年,人们发现微生物在肿瘤发生发展中亦起到关键作用。异常细菌定植和菌群比例失调不仅能诱发胃肠道局部上皮组织的癌变,还可能影响黏膜下淋巴组织甚至远端器官的癌变。一些微生物可通过产... 详细信息

胃肠道微生物对人体的生理功能具有重要影响。近年,人们发现微生物在肿瘤发生发展中亦起到关键作用。异常细菌定植和菌群比例失调不仅能诱发胃肠道局部上皮组织的癌变,还可能影响黏膜下淋巴组织甚至远端器官的癌变。一些微生物可通过产生遗传毒素或活性氧损伤DNA和干扰细胞DNA修复机制,引起细胞遗传学不稳定而诱导细胞转化。此外,胃肠道微生物还影响宿主免疫系统功能,构成免疫抑制的微环境,或者诱导慢性炎症反应促进肿瘤发生。胃肠道微生物通过多种机制共同促进肿瘤的发生发展,显示出其与肿瘤的密切关系。

关键词：胃肠道微生物恶性肿瘤遗传学不稳定性氧化应激炎症反应

原发性免疫缺陷病合并卡介苗感染新型白介素12受体β1基因突变一例

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中华儿科杂志 2008年第8期46卷 601-604页

作者：谢娜蒋利萍孔晓飞朱朝敏刘作义刘玮张欣欣杨锡强重庆医科大学附属儿童医院临床免疫研究室 400014 上海交通大学医学院附属瑞金医院中法生命科学和基因组研究中心感染科

目的分析一例白介素12受体β1（IL-12Rβ1）缺陷基因突变合并卡介苗感染患儿的临床特征、基因分析和蛋白表达。方法根据典型的临床表现及免疫学筛查实验排除常见原发性免疫缺陷病（PID），用单克隆抗体流式细胞术检测患者和母亲EB病毒（... 详细信息

目的分析一例白介素12受体β1（IL-12Rβ1）缺陷基因突变合并卡介苗感染患儿的临床特征、基因分析和蛋白表达。方法根据典型的临床表现及免疫学筛查实验排除常见原发性免疫缺陷病（PID），用单克隆抗体流式细胞术检测患者和母亲EB病毒（EBV）永生化的B细胞上IL-12Rβ1蛋白表达，同时，用正向、反向引物分别对患儿和其父、母的IL-12Rβ1基因进行PCR扩增并测序，患儿弟弟产前、产后均已作IL-12Rβ1基因分析。结果患儿有严重、播散性卡介苗接种病，其永生化的B细胞上IL-12Rβ1蛋白表达呈阴性，母亲有部分蛋白表达。患儿为IL-12Rβ1基因纯合单核苷酸替换突变，其第9外显子853位核苷酸（C→T）发生无义突变，使第285位谷氨酸突变为终止密码（Q285X），其父、母亲均为该异常基因的携带者，患儿弟弟产前产后IL-12Rβ1基因正常。结论鉴定出一例新型IL-12Rβ1基因突变（Q285X）患者，发现此基因突变患者的IL-12Rβ1蛋白缺乏，确定此基因突变是引起患者发生播散性卡介苗接种病的根本原因；明确家庭成员携带情况，为产前诊断提供依据。

关键词：白细胞介素12受体β1亚单位重症联合免疫缺陷卡介苗突变

整合蛋白β3近膜端α螺旋中的E726Q突变影响细胞膜与肌动蛋白皮质层相互作用继而诱导细胞膜形成突起小泡

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中国实验血液学杂志 2011年第6期19卷 1450-1455页

作者：孔永奎张玥林明辉奚晓东上海交通大学医学院附属瑞金医院上海血液学研究所、医学基因组学国家重点实验室上海200025 上海交通大学医学院附属瑞金医院中法生命科学与基因组研究中心上海200025

整合蛋白β亚基胞浆段近膜端α螺旋在与诸多蛋白如踝蛋白(talin)、α-辅肌动蛋白(α-actinin)或者骨架蛋白(skelemin)等的结合上发挥着重要的功能。本研究的目的是通过对α螺旋上5个保守的带电荷氨基酸(R724,K725,E726,E731和E733)的研... 详细信息

整合蛋白β亚基胞浆段近膜端α螺旋在与诸多蛋白如踝蛋白(talin)、α-辅肌动蛋白(α-actinin)或者骨架蛋白(skelemin)等的结合上发挥着重要的功能。本研究的目的是通过对α螺旋上5个保守的带电荷氨基酸(R724,K725,E726,E731和E733)的研究,采用定点突变的方法,从而明确其在介导β3与骨架蛋白结合中的作用。实验结果表明,表达有突变型整合蛋白αⅡbβ3E726Q的CHO细胞株在固相化的纤维蛋白原上伸展不良,表型最显著。除此之外,E726Q突变可以诱导CHOαⅡbβ3E726Q细胞株在固相化的纤维蛋白原上的细胞膜起泡现象,且这种突起小泡(blebs)可以被肌凝蛋白轻链ATPase抑制剂blebbistatin所抑制。结论:整合蛋白β3亚基近膜端α螺旋在将细胞膜锚定到膜下肌动蛋白皮质层(submembraneous actin cortex)方面发挥重要作用。

关键词：整合蛋白β3 踝蛋白 E726Q突变 α-辅肌动蛋白突起小泡

维持β细胞身份和功能性成熟：糖尿病干预新机制

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中华内分泌代谢杂志 2018年第1期34卷 11-15页

作者：汪启迪上海交通大学医学院附属瑞金医院内分泌代谢病科.国家代谢性疾病临床医学研究中心中法生命科学和基因组研究中心200025

糖尿病发病机制中的关键原因是功能性胰岛β细胞量（functional β cell mass）的丢失，无法分泌足够的胰岛素以保持机体的血糖稳态。1型糖尿病主要是免疫介导的β细胞凋亡导致的胰岛素绝对缺乏，而2型糖尿病在胰岛素抵抗同时，伴有不... 详细信息

糖尿病发病机制中的关键原因是功能性胰岛β细胞量（functional β cell mass）的丢失，无法分泌足够的胰岛素以保持机体的血糖稳态。1型糖尿病主要是免疫介导的β细胞凋亡导致的胰岛素绝对缺乏，而2型糖尿病在胰岛素抵抗同时，伴有不同程度的β细胞功能异常和凋亡。一系列最新研究提示，2型糖尿病的β细胞功能受损与其无法维持正常的成熟功能状态有关，主要可以归结为：（1）β细胞身份的丢失（loss of cell identity），特别是那些成熟β细胞特异性转录因子及与功能密切相关蛋白的表达异常；（2）去分化（de-differentiation），定义为成熟β细胞退化到祖细胞或类干细胞状态。β细胞功能性成熟的维持还与一群β细胞＂不允许基因＂（disallowed gene）的选择性低表达密切相关。本文将介绍胰岛β细胞成熟分化调控的最新进展，并融入本研究团队在此领域的研究成果，旨在为探索糖尿病临床干预提供一些启示。

关键词：胰岛β细胞功能性成熟 mTORCl 不允许基因 DNA甲基化

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蛋白质的类泛素化修饰

生命科学 2010年第11期22卷 1161-1166页

作者：袁浩朱军中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所上海200025 上海交通大学医学院附属瑞金医院/中法生命科学和基因组研究中心上海200025

SUMO(small ubiquitin-related modifier)是一类重要的类泛素蛋白,在生物进化过程中高度保守,其三维结构及生化修饰过程与泛素类似,但该两类蛋白质修饰的生物学意义却不尽相同。SUMO化修饰作为一种重要的蛋白质翻译后修饰,广泛参与细胞... 详细信息

SUMO(small ubiquitin-related modifier)是一类重要的类泛素蛋白,在生物进化过程中高度保守,其三维结构及生化修饰过程与泛素类似,但该两类蛋白质修饰的生物学意义却不尽相同。SUMO化修饰作为一种重要的蛋白质翻译后修饰,广泛参与细胞活动的各个方面,且SUMO化修饰异常与许多人类重大疾病密切相关。

关键词： SUMO SUMO化修饰人类疾病

乙型肝炎病毒感染不同临床转归患者血清中病毒全长基因组准种特点

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乙型肝炎病毒感染不同临床转归患者血清中病毒全长基因组准种特点

第7届全国疑难及重症肝病大会

作者：杨之涛黄素园陈立刘锋张欣欣上海市瑞金医院感染科中法生命科学与基因组研究中心

[目的]乙型肝炎病毒感染(HBV)的临床转归差异很大,HBV在体内以准种形式存在,准种的变异谱系及其进化方向、可逃避选择压力和改变毒力的变异出现影响了HBV的致病力,从而影响了HBV感染的临床表现和转归。本研究旨在应用生物信息学方法分析... 详细信息

[目的]乙型肝炎病毒感染(HBV)的临床转归差异很大,HBV在体内以准种形式存在,准种的变异谱系及其进化方向、可逃避选择压力和改变毒力的变异出现影响了HBV的致病力,从而影响了HBV感染的临床表现和转归。本研究旨在应用生物信息学方法分析HBV感染不同临床转归中病毒全长基因组准种特点及相关基因突变的差异,探索HBV生物学特性对临床转归的影响。[方法]41例未接受抗病毒治疗的HBV感染者纳入本研究,其中急性乙型肝炎(AHB)10例、慢性HBV携带(ASC) 10例、慢性乙型肝炎(CHB)11例和慢性重型乙型肝炎(CSHB)10例。分离患者外周血血清中HBV DNA,PCR扩增全长基因组后克隆、测序。每例患者获得14-16个序列,并进行HBV全长基因组、大/中/主蛋白编码序列,核心启动区(CP),C、X、P基因和rt区的准种异质性分析及相关基因突变统计等生物信息学分析。[结果]41例患者共获得619个HBV全长基因组序列。AHB、ASC、CHB和CSHB组间基因型构成无统计学差异。HBV准种异质性上,CHB组和CSHB组无显著性差异;ASC组与CHB或CSHB组相比,大/中/主蛋白编码序列、P基因、C基因及rt区的异质性小于后两者;而AHB组和其余三组比较,准种异质性最小。CSHB组内死亡患者的中/主蛋白编码序列的准种复杂度明显高于存活患者(P均组患者的G1896A、T1753C、A1762T、G1764A、C1766T突变率显著不同,均是CSHB组>CHB组>AHB组>ASC组。AHB组和CHB组各有2例患者发现单个位点的拉米夫定相关补偿性耐药突变,突变位点为rtT128P、rtV173L、rtW153Q。CHB和CSHB组中观察到C基因的核苷酸缺失,其中CSHB组患者发生较长片段的框移突变,而AHB和ASC患者未发现C基因的缺失或插入变异。[结论]慢性感染比急性感染具有更宽的HBV变异谱系,慢性感染中免疫清除期比免疫耐受期具有更宽的HBV变异谱系。病情的严重患者中,HBV的准种的复杂度及核心启动子及PreC区突变率较高。

关键词：乙型肝炎病毒遗传异质性重型肝炎准种

来源： cnki会议评论

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斑马鱼体内氧化损伤标志物筛选

郑州大学学报（医学版） 2018年第4期53卷 499-502页

作者：李嘉蔚胡雪菲韩鹏陈呢喃陆一鸣上上海交通大学医学院附属瑞金医院中法生命科学和基因组研究中心海200025 上海交通大学医学院附属瑞金医院北院急诊科上海200025 上海交通大学医学院附属瑞金医院急诊科上海200025

目的:探讨以端粒为靶点的氧化损伤标志物的筛选,进而可能可以用来临床上早期发现或预报氧化损伤。方法:采用端粒重复序列结合因子2(TRF2)基因敲除(TRF2-/-)斑马鱼胚胎作为氧化损伤模型,RT-q PCR法检测野生型和TRF2-/-斑马鱼胚胎中TRF2、... 详细信息

目的:探讨以端粒为靶点的氧化损伤标志物的筛选,进而可能可以用来临床上早期发现或预报氧化损伤。方法:采用端粒重复序列结合因子2(TRF2)基因敲除(TRF2-/-)斑马鱼胚胎作为氧化损伤模型,RT-q PCR法检测野生型和TRF2-/-斑马鱼胚胎中TRF2、PUM3、PACSIN3 mRNA的表达情况。构建pCS2-PUM3、pCS2-PACSIN3质粒并体外转录后,将mRNA分别显微注射至TRF2-/-斑马鱼受精卵中,比较注射组与未注射组斑马鱼畸形率。结果:RT-q PCR结果表明,与野生型斑马鱼胚胎相比,TRF2-/-斑马鱼胚胎TRF2、PUM3、PACSIN3 mRNA的表达量下降(P基因PUM3、PACSIN3的表达,且PUM3能补救TRF2缺失造成的氧化损伤相关器官畸形。

关键词：斑马鱼氧化应激端粒端粒重复序列结合因子2