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‘红颜’草莓脱毒苗组培快繁及移栽驯化

分子植物育种 2022年

作者：李水根方献平张丽张学英张丽勍上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室

组织培养是获得草莓脱毒种苗的高效快捷途径。为了优化草莓脱毒苗的增殖培养基，提高移栽驯化成活率，本研究检测和分析了不同种类和浓度的细胞分裂素对‘红颜’草莓脱毒试管苗丛生芽增殖的影响，以及不同的培养基质和液体营养液对植株...

组织培养是获得草莓脱毒种苗的高效快捷途径。为了优化草莓脱毒苗的增殖培养基，提高移栽驯化成活率，本研究检测和分析了不同种类和浓度的细胞分裂素对‘红颜’草莓脱毒试管苗丛生芽增殖的影响，以及不同的培养基质和液体营养液对植株生根和移栽驯化的影响。结果表明，WPM适合作为‘红颜’草莓的增殖培养基，有利于叶柄伸长生长。氯吡苯脲(CPPU)处理的不定芽增殖效率最高，达到3.79，其次是腺嘌呤(Ade)和6-苄氨基嘌呤(6-BA)，但是激动素(KT)处理对不定芽增殖没有影响。最适合‘红颜’草莓生根的方法为采用直径30 mm的营养土块，同时添加MS或山崎配方的液体营养液，生根率为100%，移栽成活率达到98%。本研究为草莓增殖培养、植株生根及移栽驯化提供技术参考。

关键词：

草莓果生炭疽菌LysM效应子CfLysM2的致病功能分析

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植物保护 2023年第3期49卷 39-49页

作者：余永婷李水根方献平张昊安海山张学英张丽勍上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室上海201403 中国农业科学院植物保护研究所北京100193

果生炭疽菌Colletotrichum fructicola侵染引起的草莓炭疽病是草莓生产中的重要病害。前期研究发现一个在果生炭疽菌侵染阶段高表达的含LysM结构域的候选效应子CfLysM2。为进一步研究CfLysM2的致病功能,运用同源重组方法构建CfLysM2缺... 详细信息

果生炭疽菌Colletotrichum fructicola侵染引起的草莓炭疽病是草莓生产中的重要病害。前期研究发现一个在果生炭疽菌侵染阶段高表达的含LysM结构域的候选效应子CfLysM2。为进一步研究CfLysM2的致病功能,运用同源重组方法构建CfLysM2缺失突变株ΔCfLysM2和回补菌株CfLysM2c。致病力测定结果表明,接种后15 d,ΔCfLysM2接种的草莓叶片病情指数显著下降。荧光定量PCR分析表明CfLysM2基因在果生炭疽菌接种草莓叶片后24 h相对表达量最高。利用转录组技术对野生型菌株(wild-type strain,WT)和ΔCfLysM2接种后24 h的草莓叶片样品进行比较分析,获得差异表达基因109个。CfLysM2的缺失导致宿主代谢途径尤其是次生代谢物生物合成通路的激活,说明CfLysM2可能在果生炭疽菌侵染草莓过程中通过靶向黄酮醇合成酶等代谢相关基因,抑制植物次生代谢产物合成及其介导的抗真菌免疫,保证其顺利侵染。该研究为揭示CfLysM2机理及对果生炭疽菌和草莓互作研究奠定了理论基础。

关键词：果生炭疽菌 LysM结构域致病性转录组

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基于RNA-Seq技术的换锦花转录组分析

分子植物育种 2017年第12期15卷 5044-5051页

作者：李青竹张永春杨柳燕孙翊李心上海市农业科学院林木果树研究所上海201106

换锦花是我国重要的观赏和药用花卉,其植株富含多种生物碱成分,具有良好的经济价值和社会价值。但是换锦花同许多药用植物一样,缺乏基因信息,这限制了其基因功能的挖掘和研究。本研究以盛叶期换锦花的鳞茎和叶片混合样品为材料,利用Illu... 详细信息

换锦花是我国重要的观赏和药用花卉,其植株富含多种生物碱成分,具有良好的经济价值和社会价值。但是换锦花同许多药用植物一样,缺乏基因信息,这限制了其基因功能的挖掘和研究。本研究以盛叶期换锦花的鳞茎和叶片混合样品为材料,利用Illumina Next SeqTM500测序平台对其进行转录组测序,共获得42 509 194条干净数据(clean reads),总碱基数为6 242 970 322 bp。Clean reads经de novo组装后获得86 243条unigenes。进一步利用五大公共数据库进行同源比对,共注释到42 818个Unigenes。对Unigenes进行GO和KEGG功能分类,分别获得67个功能群和263个Pathway,发现了部分生物碱合成途径的候选基因,并查找到11 626个SSR位点。本研究为换锦花生物碱合成分子机理的研究和遗传多样性分析奠定基础。

关键词：换锦花转录组测序生物碱合成 SSR

基于层次分析法的上海地区矾根品种应用性评价

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江苏农业科学 2022年第22期50卷 139-145页

作者：杨贞孙翊杨柳燕李心王桢张永春上海市农业科学院林木果树研究所/上海市设施园艺技术重点实验室上海201403

为筛选出适宜在上海地区推广应用的矾根优良品种,采用层次分析法对收集到的20个矾根品种资源的应用性进行综合评价。以叶部观赏性状、花部观赏性状和生长性状作为3个性状类别,确定进行矾根应用性评价的3级15个指标,建立其综合评价模型... 详细信息

为筛选出适宜在上海地区推广应用的矾根优良品种,采用层次分析法对收集到的20个矾根品种资源的应用性进行综合评价。以叶部观赏性状、花部观赏性状和生长性状作为3个性状类别,确定进行矾根应用性评价的3级15个指标,建立其综合评价模型。根据评价结果可将供试的20个矾根品种分为5个等级,其中Ⅰ级(分值≥4.50)有西瓜、灰皮诺2个品种,观赏性状优秀且越夏成活率高,十分适合在上海地区进行栽培和应用;Ⅱ级(分值4.00~上海地区进行露地推广应用。综合分析认为,西瓜、灰皮诺、花毯、磨砂紫罗兰、里奥、上海是适宜在上海地区进行推广应用的矾根优良品种。

关键词：矾根层次分析法上海地区应用性评价

草莓胶孢炭疽菌CFEM候选效应子的生物信息学鉴定及其侵染过程中的转录分析

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植物保护 2017年第5期43卷 43-51页

作者：张丽勍段可邹小花何成勇高清华上海市农业科学院林木果树研究所上海201403

病原真菌通常分泌效应子到寄主组织中调控寄主的生理过程,从而有利于其侵染。CFEM(common in several fungal extracellular membrane)蛋白是真菌所独有的,且与致病性密切相关。本研究利用Pfam数据库对草莓胶孢炭疽菌全基因组进行搜索,... 详细信息

病原真菌通常分泌效应子到寄主组织中调控寄主的生理过程,从而有利于其侵染。CFEM(common in several fungal extracellular membrane)蛋白是真菌所独有的,且与致病性密切相关。本研究利用Pfam数据库对草莓胶孢炭疽菌全基因组进行搜索,鉴定获得22个CFEM蛋白。对CFEM蛋白的信号肽、跨膜结构域和亚细胞定位进行分析,结果表明仅有8个CFEM蛋白为分泌蛋白。对CFEM分泌蛋白在不同侵染阶段的转录情况进行转录组学及RT-PCR分析,结果显示8个CFEM蛋白在侵染后不同时期均有表达。其中,1个CFEM分泌蛋白于附着胞形成期特异表达,2个于活体寄生阶段特异表达,2个于死体寄生阶段特异表达。综合上述分析结果,预测这8个分泌蛋白可能为草莓胶孢炭疽菌的效应子。本研究为深入解析植物病原真菌CFEM效应子提供了理论依据。

关键词：胶孢炭疽菌效应子 CFEM蛋白

朱顶红SRAP-PCR反应体系的建立和优化

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分子植物育种 2017年第5期15卷 1806-1813页

作者：孙翊张永春殷丽青杨柳燕李心费如桂上海市农业科学院林木果树研究所上海201403

本研究采用L_(16)(4~5)正交试验设计方法,对朱顶红SRAP-PCR反应体系中的5种因素(Mg^(2+)浓度,d NTPs浓度,引物浓度,DNA模板量和Taq DNA聚合酶用量)进行优化,结果表明各因素对朱顶红SRAP-PCR扩增反应影响大小依次为:d NTPs浓度>引物浓度>... 详细信息

本研究采用L_(16)(4~5)正交试验设计方法,对朱顶红SRAP-PCR反应体系中的5种因素(Mg^(2+)浓度,d NTPs浓度,引物浓度,DNA模板量和Taq DNA聚合酶用量)进行优化,结果表明各因素对朱顶红SRAP-PCR扩增反应影响大小依次为:d NTPs浓度>引物浓度>Mg^(2+)浓度>DNA模板量>Taq DNA聚合酶用量。优化获得的朱顶红最佳SRAP-PCR反应体系为:1×PCR Buffer、Mg^(2+)浓度2.0 mmol/L、d NTPs浓度0.2 mmol/L、引物浓度0.25μmol/L、20μL体系中DNA模板量80 ng以及Taq DNA聚合酶用量0.5 U。用10个朱顶红品种基因组DNA对所得最优体系进行验证,证明该体系具有较高的稳定性和重复性,能够为朱顶红遗传多样性研究和遗传图谱构建等提供重要技术支持。

关键词：朱顶红 SRAP 反应体系优化正交设计

多效唑和摘心处理对油桃果实发育和新梢生长量以及各器官碳水化合物含量的影响

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上海农业学报 2022年第3期38卷 7-13页

作者：杜纪红叶正文苏明申周慧娟李雄伟张夏南上海市农业科学院林木果树研究所上海201403

以设施栽培早熟油桃品种‘中油9号’为试材,研究了叶面喷施多效唑和摘心处理对油桃果实发育和新梢生长以及各器官碳水化合物含量的影响。结果表明:(1)多效唑和摘心处理对油桃果实的色泽、可溶性固形物含量、可滴定酸含量影响均不显著。... 详细信息

以设施栽培早熟油桃品种‘中油9号’为试材,研究了叶面喷施多效唑和摘心处理对油桃果实发育和新梢生长以及各器官碳水化合物含量的影响。结果表明:(1)多效唑和摘心处理对油桃果实的色泽、可溶性固形物含量、可滴定酸含量影响均不显著。多效唑处理显著降低了油桃单果重和果肉硬度;摘心处理对油桃单果重和果肉硬度影响均不显著。(2)多效唑和摘心处理均减少了油桃新梢的生长量。(3)多效唑和摘心处理均降低了油桃果肉和叶片的淀粉含量,增加了结果母枝、种子和新梢的淀粉含量。(4)多效唑处理降低了油桃果肉的可溶性总糖含量,增加了种子、叶片、结果母枝和新梢的可溶性总糖含量。摘心处理提高了油桃果肉、叶片和新梢的可溶性总糖含量,降低了种子、结果母枝的可溶性总糖含量。生产中建议合理选择多效唑的施用浓度和时期,避免使用不当造成减产。

关键词：油桃摘心多效唑果实碳水化合物

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枇杷全基因组SSR标记开发及其多态性研究

园艺学报 2021年第5期48卷 1013-1022页

作者：蒋爽张学英安海山徐芳杰章加应上海农业科学院林木果树研究所上海市园艺重点实验室上海201403

搜索枇杷全基因组范围内的SSR位点,分析其分布特点,同时使用10个枇杷品种的重测序数据对这些位点的基因型进行分析。结果显示共获得103509个SSR位点,二核苷酸重复类型有73604个,占71.1%,以AT/TA为主。三核苷酸重复类型占15.0%,以AAG/CT... 详细信息

搜索枇杷全基因组范围内的SSR位点,分析其分布特点,同时使用10个枇杷品种的重测序数据对这些位点的基因型进行分析。结果显示共获得103509个SSR位点,二核苷酸重复类型有73604个,占71.1%,以AT/TA为主。三核苷酸重复类型占15.0%,以AAG/CTT为主。对10个枇杷样本进行重测序,分别获得32~206 Mb的reads,测序深度为12.9×~81.3×。本研究中新开发2个脚本程序(Flank和SSRtype),对重测序数据Reads中包含的SSR位点长度进行了分析,确定基因型。‘早钟6号’的测序深度达到12.9×,能够覆盖80%的SSR位点,说明12×以上的测序深度能够满足SSR位点的分析。枇杷中大量SSR位点为多拷贝(占78.4%),为单个品种单个位点产生3条以上的条带,而在所有品种中呈现两拷贝的SSR位点有12 962个(占12.5%),这些位点产生的多态性条带分别为2~10条不等,多态性信息含量的中位数为0.269,大于0.5的位点有526个。从中挑选20对引物进行荧光PCR,结果显示这些引物的多态性与重测序分析结果一致。

关键词：枇杷 SSR标记全基因组多态性重测序

不同类型果袋对‘新凤蜜露’水蜜桃果实品质的影响

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经济林研究 2018年第1期36卷 147-152页

作者：杜纪红叶正文周慧娟李雄伟苏明申张夏南上海市农业科学院林木果树研究所上海201403

为了提高桃果实的外在和内在品质及商品价值,对水蜜桃生产中常用的各种果袋进行了筛选试验。以‘新凤蜜露’水蜜桃为材料,研究了9种纸袋(2种单层白袋、3种单层黄袋,1种复合袋,3种双层袋)对果实品质的影响情况。结果表明:(1)袋内透光率... 详细信息

为了提高桃果实的外在和内在品质及商品价值,对水蜜桃生产中常用的各种果袋进行了筛选试验。以‘新凤蜜露’水蜜桃为材料,研究了9种纸袋(2种单层白袋、3种单层黄袋,1种复合袋,3种双层袋)对果实品质的影响情况。结果表明:(1)袋内透光率与纸袋的颜色、质地和层数有关,其透光率大小依次为白袋>黄袋>黑袋,单层袋>双层袋;(2)果袋的透光率与果实着色和可溶性固形物含量成显著正相关,透光率太高或太低均不利于提高果实品质;(3)大部分类型果袋处理降低了果实的可溶性固形物含量,单果重和果肉硬度,但是差异未到达显著性。综合比较,小林袋较适合上海地区‘新凤蜜露’水蜜桃套袋使用。

关键词：水蜜桃套袋透光率果实品质