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滇黄精全长转录组测序及生物信息学分析

药学学报 2024年第6期59卷 1864-1872页

作者：米琪赵艳丽徐萍于梦雯张萱涂振华李春华郑国伟陈佳云南中医药大学中药学院云南昆明650500 云南中医药大学民族医药学院云南昆明650500 贡山县农业农村局农业综合发展服务中心云南怒江傈僳族自治州673500

本文通过PacBio Sequel平台对滇黄精根茎进行全长转录组测序,并对测序结果进行生物信息学分析,旨在为滇黄精基因功能的研究提供参考。最终测得polymerase reads为1120485个,总数据共77.73 GB。在NR数据库中,有41864个同源序列比对到5个... 详细信息

本文通过PacBio Sequel平台对滇黄精根茎进行全长转录组测序,并对测序结果进行生物信息学分析,旨在为滇黄精基因功能的研究提供参考。最终测得polymerase reads为1120485个,总数据共77.73 GB。在NR数据库中,有41864个同源序列比对到5个物种;有40506个在KOG数据库得到注释,根据其功能分为26类;有69060个得到GO注释,分为细胞组分、分子功能及生物学过程等3大类的32个功能组;有45779个注释到KEGG数据库的145条代谢途经中,其中鉴定与多糖合成有关的转录本在糖酵解/糖异生代谢通路中有127条,淀粉和蔗糖代谢通路有144条,氨基酸糖和核苷酸糖代谢通路有85条,果糖和甘露糖代谢通路有69条;此外还检测到1781个转录因子,分布在37个转录因子家族中;检测到了180293个SSR位点,其中以单碱基重复占比最多,占所有碱基重复类型的30.48%,最少的是五碱基重复,仅为单碱基重复的0.14%。本研究结果为丰富滇黄精基因组信息,探索其有效成生物合成途径提供重要的数据支持。

关键词：滇黄精全长转录组种质资源多糖合成

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大额牛瘤胃细菌CDT-1蛋白的生物信息学特征研究

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黑龙江畜牧兽医 2022年第17期 6-10,138,139页

作者：周子健吴东旺张光荣和虎生杨舒黎云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 云南省动物营养与饲料科学重点实验室昆明650201 怒江州贡山独龙族怒族自治县农业农村局云南贡山独龙族怒族自治县673599

为了研究从云南大额牛(Bas frontalis)瘤胃微生物宏基因组文库中发掘出的纤维糊精酶-1(CDT-1)蛋白的生物信息学特征,试验使用ProtParam、TMHMM Server 2.0、ProtScale、NCBI Conserved Domains、SignalP 5.0、TargetP 2.0、PSORTⅡserver、SOPMA、SWISS-MODEL、NetN Glyc 1.0 Server、NetP hos 3.1 Server、NCBI protein BLASTp和MEGA 7.0等在线分析工具和软件,分析CDT-1蛋白的基本理化性质、跨膜区、亲水性/疏水性、结构域、信号肽、亚细胞定位、二级结构、三级结构、N端糖基化位点和丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的磷酸化位点及系统进化情况等生物信息学特征。结果表明:CDT-1蛋白的相对分子质量为38082.24,理论等电点为4.80,带负电荷的残基总数为45个,带正电荷的残基总数为29个,估计半衰期为30 h,属于亲水型稳定的脂蛋白,定位于细胞壁和细胞外,含有1个由α-螺旋、无规则卷曲、扩展链和β-转角组成的保守结构域,三级结构同源建模有较高的可信度,有2个N端糖基化位点和26个磷酸化位点,可能具有较高的酶活力;CDT-1蛋白与系统进化树中的内切葡聚糖酶的纤维素酶蛋白高度同源。说明CDT-1蛋白是来源于内切葡聚糖酶中的纤维素酶蛋白的亲水型稳定脂蛋白。

关键词：大额牛 CDT-1蛋白生物信息学蛋白质功能瘤胃细菌

双减政策下初中物理教学中培养学生创新能力的策略

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中文科技期刊数据库（全文版）教育科学 2022年第12期 45-48页

作者：苏义龙云南省怒江州贡山独龙族怒族自治县普拉底乡中心校云南怒江673501

在我国教育教学改革的背景下,教师对学生自身素质提升、创新能力发展提出了更高的要求。基于传统的应试教学模式,学生的学习太过消极,思想上的束缚给他们带来了很大的压力和负担。随着“双减”政策的出台,为了缓解学生的学习压力,在课... 详细信息

在我国教育教学改革的背景下,教师对学生自身素质提升、创新能力发展提出了更高的要求。基于传统的应试教学模式,学生的学习太过消极,思想上的束缚给他们带来了很大的压力和负担。随着“双减”政策的出台,为了缓解学生的学习压力,在课堂上加强课堂教学,确保学生的学习效果至关重要。初中物理对学生来说是一个很大的挑战,在初中物理教学过程中,教师应注重学生的学习心理特征,并与物理课程内容相结合,使其形成良好的学习习惯。通过提高学生的个体学习能力,培养他们的学习和创造精神,使他们能够把所学的知识运用到实际中去,并能够充分发挥自己的潜能。本文在分析初中物理教学中培养创新能力的重要意义及当前存在不足之处的基础上,就如何在“双减”的大环境下,在初中物理课堂上提高学生的创造力提出几点有效策略,以供广大教师借鉴及参考。

关键词： “双减”政策初中物理教学创新能力培养策略

拉沙山区域不同时空条件下的土壤线虫群落多样性分析

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南方农业 2024年第7期18卷 131-137,148页

作者：王杨孙旭辉穆云飞杨贵伟大理大学东喜玛拉雅研究院云南大理671003 大理大学农学与生物科学学院云南大理671003 高黎贡山国家级自然保护区怒江管护局云南怒江673100 云南省普洱市镇沅彝族哈尼族拉祜族自治县人民政府办公室云南普洱666500

为了解土壤线虫群落结构在不同时空条件下的分布差异,于2021年春季(5月)和秋季(10月)对拉沙山区域13个综合监测样地采集的104个混合土壤样品,进行土壤线虫群落组成及多样性差异分析。利用宏基因技术共获取线虫扩增子序列变体(Amplicon S... 详细信息

为了解土壤线虫群落结构在不同时空条件下的分布差异,于2021年春季(5月)和秋季(10月)对拉沙山区域13个综合监测样地采集的104个混合土壤样品,进行土壤线虫群落组成及多样性差异分析。利用宏基因技术共获取线虫扩增子序列变体(Amplicon Sequence Variant, ASV) 931个,隶属于2纲10目46科75属,其中2个优势类群、14个常见类群和59个稀有类群。在空间分布格局上利用方差分析及独立样本t检验方法发现,不同海拔、坡向及水陆的土壤线虫群落结构均不具有显著性差异(p>0.05);在时间分布格局上利用配对t检验方法发现,在秋季(10月)比春季(5月)的土壤线虫群落的多样性更高,且差异极显著(p<0.01)。

关键词：土壤线虫群落多样性时空分布拉沙山区域

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2016—2021年云南省贡山县人群土源性线虫感染监测结果分析

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2023年第6期41卷 766-771页

作者：段承丽何冬梅杨舒张妍黎罗自荣雄碧才字金荣彭佳吴方伟怒江傈僳族自治州疾病预防控制中心云南泸水673199 怒江傈僳族自治州人民医院云南泸水673199 贡山独龙族怒族自治县疾病预防控制中心云南贡山673599 云南省寄生虫病防治所普洱665000

为了解贡山县人群土源性线虫感染现状及流行趋势,2016—2021年,根据《全国肝吸虫病和土源性线虫病监测方案(试行)》要求,按照地理方位将贡山县划分为东、西、南、北、中5个片区,每年在每个片区随机抽取1个乡(镇)的1个行政村为调查村,调... 详细信息

为了解贡山县人群土源性线虫感染现状及流行趋势,2016—2021年,根据《全国肝吸虫病和土源性线虫病监测方案(试行)》要求,按照地理方位将贡山县划分为东、西、南、北、中5个片区,每年在每个片区随机抽取1个乡(镇)的1个行政村为调查村,调查对象为调查村3岁及以上本地常住人口。收集调查对象的粪样,采用改良加藤厚涂片法检查土源性线虫虫卵并计数,采用试管滤纸培养法鉴别钩虫虫种,3~9岁儿童加做透明胶纸肛拭法检查蛲虫卵。记录感染虫种和人数,计算感染率,感染率间比较采用卡方检验。共粪检6175人,土源性线虫感染928例,总感染率为15.03%(928/6175),其中蛔虫、鞭虫、钩虫和蛲虫的感染率分别为7.92%(489/6175)、8.87%(548/6175)、3.27%(202/6175)和0.19%(12/6175)。透明胶纸肛拭法检查3~9岁儿童823人,检出蛲虫感染6例。对202例钩虫感染者采用试管滤纸培养法进行钩虫虫种鉴别,其中美洲钩虫感染89例,十二指肠钩虫感染72例,两者混合感染1例,分别占44.06%(89/202)、35.64%(72/202)和0.50%(1/202)。钩虫、蛔虫和鞭虫轻度感染者分别占81.19%(164/201)、69.33%(339/489)和78.29%(429/548)。2016—2021年贡山县各年度人群土源性线虫感染率分别为38.78%(389/1003)、14.76%(156/1057)、6.53%(68/1042)、13.15%(134/1019)、11.89%(121/1018)和5.79%(60/1036),各年度间感染率差异有统计学意义(χ^(2)=581.98,P独龙江乡人群土源性线虫感染率最高,为32.07%(398/1241),茨开镇最低,为9.09%(112/1232),不同乡(镇)间人群土源性线虫感染率差异有统计学意义(χ^(2)=359.24,P族分布以独龙族人群土源性线虫感染率最高(30.39%,392/1290);职业分布以儿童土源性线虫感染率最高(27.78%,170/612);文化程度分布以学龄前儿童土源性线虫感染率最高(27.48%,169/615)。不同年龄、民族、职业和文化程度间人群土源性线虫感染率差异均有统计学意义(χ^(2)=172.16、310.89、195.59、197.59,均P贡山县人群土源性线虫感染率呈下降趋势,但仍维持在较高水平,应继续加强对独龙族、儿童、老年人等重点人群的土源性线虫病综合防治工作。

关键词：土源性线虫感染率监测贡山县

畜牧兽医工作中动物检疫的问题分析及解决措施

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中文科技期刊数据库（全文版）农业科学 2023年第6期 23-25页

作者：迪振华云南省贡山独龙族怒族自治县茨开镇人民政府云南怒江673599

简述了动物检疫工作;概述了保证养殖健康与食品安全、强化疫情防控等畜牧兽医工作中动物检疫的重要性;介绍了3种动物检疫方式;梳理了养殖户检疫意识薄弱、缺乏严格的检疫监管等畜牧兽医工作中动物检疫的问题;提出了加大宣传力度增强养... 详细信息

简述了动物检疫工作;概述了保证养殖健康与食品安全、强化疫情防控等畜牧兽医工作中动物检疫的重要性;介绍了3种动物检疫方式;梳理了养殖户检疫意识薄弱、缺乏严格的检疫监管等畜牧兽医工作中动物检疫的问题;提出了加大宣传力度增强养殖户检疫意识、建立完善的检疫监管机制、完善检疫站设备设施建设等畜牧兽医工作中动物检疫优化策略。

关键词：畜牧业兽医动物检疫

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贡山县特色农产品优势区域建设思考

南方农业 2019年第12期13卷 104-105页

作者：余新生贡山独龙族怒族自治县农业农村局

我国提出的乡村振兴战略为农产品品牌战略目标的实现提供了强有力的支持。在大力发展农产品的过程中,应紧跟社会经济发展的要求,站在战略的高度积极进行区域内农产品品牌的发展和规划布局,通过大力发展现代化农业产业的方式,加快农产品... 详细信息

我国提出的乡村振兴战略为农产品品牌战略目标的实现提供了强有力的支持。在大力发展农产品的过程中,应紧跟社会经济发展的要求,站在战略的高度积极进行区域内农产品品牌的发展和规划布局,通过大力发展现代化农业产业的方式,加快农产品加工企业转型升级的步伐,为特色云南农产品品牌的建设和发展奠定坚实的基础。

关键词：乡村振兴农产品品牌品牌农业战略实施

草果叶斑病类致病菌对新型低毒药剂的敏感性及交互抗性

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南方农业学报 2022年第8期53卷 2153-2160页

作者：李纪潮张金渝蔡明姬陈秀花唐乙云杨绍兵云南省农业科学院药用植物研究所云南昆明650231 云南省元谋县黄瓜园镇农业农村服务中心云南楚雄652100 云南省贡山县农业农村局云南怒江傈僳族自治州673200 云南省怒江州木本油料产业发展研究所云南怒江傈僳族自治州673200

【目的】筛选高效防治草果叶斑类病害的绿色低毒药剂,为草果叶斑类病害的绿色防控和生态种植提供科学依据。【方法】以3种草果叶斑类病害(炭疽病、叶瘟病和叶斑病)的强致病菌[炭疽菌(Colletotrichum sp.)、灰梨孢菌(Pyricularia grisea... 详细信息

【目的】筛选高效防治草果叶斑类病害的绿色低毒药剂,为草果叶斑类病害的绿色防控和生态种植提供科学依据。【方法】以3种草果叶斑类病害(炭疽病、叶瘟病和叶斑病)的强致病菌[炭疽菌(Colletotrichum sp.)、灰梨孢菌(Pyricularia grisea)和茎点霉(Phoma sp.]为材料,采用菌丝生长速率法测定6种药剂(嘧霉胺、腈菌唑、咪鲜胺、代森锰锌、嘧菌酯和吡噻菌胺)对草果叶斑病类致病菌株的敏感性和毒力变异系数;通过药剂间交互抗性分析,筛选具有较好协同作用的药剂组合。【结果】吡噻菌胺和咪鲜胺对炭疽菌和灰梨孢菌的毒力最强,与其他药剂的半最大效应浓度(EC_(50))差异显著(P<0.05),其中吡噻菌胺和咪鲜胺对炭疽菌的EC_(50)平均值分别为0.04和0.08μg/mL,吡噻菌胺对炭疽菌菌丝生长抑制率均在61.68%以上,最高达93.57%。6种药剂对茎点霉均具有较高毒力,EC_(50)介于0.17~4.99μg/mL,其中咪鲜胺和嘧菌酯的毒力最强。6种药剂对3种病原菌的毒力变异系数分析结果显示,吡噻菌胺和咪鲜胺2种药剂的毒力虽然较强但变异系数较大,对病菌存在较大的个体差异。各药剂对3种病菌的lgEC_(50)相关性分析结果显示,吡噻菌胺、咪鲜胺和腈菌唑3种药剂间具有较高的交互抗性(P<0.01);而吡噻菌胺和咪鲜胺分别与嘧霉胺、代森锰锌、嘧菌酯之间交互抗性较小。【结论】吡噻菌胺和咪鲜胺单剂分别与嘧霉胺、代森锰锌、嘧菌酯的复配剂可作为草果叶斑病类病害的新型低毒防控药剂在草果生态种植中推广使用。

关键词：草果叶斑病类病害抗性评价药剂筛选交互抗性

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艰苦奋斗创新业——贡山独龙族怒族自治县腊早大队大搞农田基本建设的情况

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云南农业科技 1974年第2期 35-37页

贡山独龙族怒族自治县向阳公社腊早大队,在毛主席“农业学大寨”伟大号召鼓舞下,以大寨为榜样,坚持党的基本路线,狠抓两个阶级、两条道路、两条路线的斗争,从改善农业生产基本条件入手,大搞农田基本建设,使昔日满目荒凉的穷山坡,变成了... 详细信息

贡山独龙族怒族自治县向阳公社腊早大队,在毛主席“农业学大寨”伟大号召鼓舞下,以大寨为榜样,坚持党的基本路线,狠抓两个阶级、两条道路、两条路线的斗争,从改善农业生产基本条件入手,大搞农田基本建设,使昔日满目荒凉的穷山坡,变成了层层梯田满山梁,五谷丰收牛羊壮的社会主义新山村。腊早大队座落在碧罗雪山西麓的几十个坡梁子上。解放前,在帝国主义国民党反动派的统治下,这里仅有四百多公尺长的一条水沟,几十亩水田。百分之九十五以上的土地都挂在高山陡坡上,生产处于刀耕火种,毁林开荒的原始落后状态。“庄稼挂在墙壁

关键词：农田基本建设贡山独龙族怒族自治县党的基本路线农业学大寨两条路线斗争碧罗雪山创新