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结核分枝杆菌毒力因子ESAT-6和CFP-10的研究进展

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中国病原生物学杂志 2024年第1期19卷 96-100页

作者：高利罗丽莎吴新雅马玮洁钟蕾柳爱华宝福凯昆明医科大学云南省高校热带传染病重点实验室云南昆明650500 昆明医科大学病原生物学与免疫学系昆明医科大学生物化学与分子生物学系

ESAT-6和CFP-10是结核分枝杆菌中含量丰富的毒力因子,分别由RD1区相邻的基因esxA和esxB编码,二者可以协同转录形成紧密二聚体。此二聚体在破坏宿主的免疫应答、发挥毒性、参与吞噬溶酶体到宿主细胞质的易位、激活嗜中性粒细胞发挥趋化... 详细信息

ESAT-6和CFP-10是结核分枝杆菌中含量丰富的毒力因子,分别由RD1区相邻的基因esxA和esxB编码,二者可以协同转录形成紧密二聚体。此二聚体在破坏宿主的免疫应答、发挥毒性、参与吞噬溶酶体到宿主细胞质的易位、激活嗜中性粒细胞发挥趋化作用等生物学作用中扮演着重要角色。ESAT-6和CFP-10有良好的免疫原性,可应用于结核病的诊断和疫苗研究。进一步探索它们的分子结构和致病机制可为结核病的预防、诊断和治疗提供新思路。

关键词： ESAT-6 CFP-10 结核病致病机制诊断疫苗综述

基于生物信息学分析多囊卵巢综合征中影响卵巢生长发育的关键差异基因

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中国实验诊断学 2024年第4期28卷 455-462页

作者：沈蓓蕾李娜李聚学刘煜南京医科大学附属逸夫医院内分泌科南京医科大学生物化学与分子生物学系

目的采用生物信息学方法从基因表达数据库(gene expression omnibus, GEO)中分析发掘有关多囊卵巢综合征(polycystic ovarian syndrome, PCOS)的重要基因并对其进行富集分析，为研究PCOS的发病机制提供新的靶点。方法首先从GEO数据库... 详细信息

目的采用生物信息学方法从基因表达数据库(gene expression omnibus, GEO)中分析发掘有关多囊卵巢综合征(polycystic ovarian syndrome, PCOS)的重要基因并对其进行富集分析，为研究PCOS的发病机制提供新的靶点。方法首先从GEO数据库选取两个数据集(GSE171431和GSE59456),使用R语言进行差异分析并获取两个数据集共有的差异基因，然后进行基因本体论(Gene Ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia ofGenes and Genomes, KEGG)分析。根据差异倍数和卵巢功能相关(例如排卵、细胞凋亡、卵泡生长和黄体形成等)筛选出候选关键差异基因，构建了PCOS小鼠模型并用实时定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction, RT-qPCR)法验证这些基因。最后运用比较毒理基因组学数据库(Comparative Toxicogenomics Database, CTD)查找与基因相关的疾病。结果本研究从两个数据集中筛选出27个共有差异基因，根据差异倍数和卵巢功能确定4个下调基因为候选关键差异基因，分别为分泌卷曲相关蛋白4(secreted frizzled-related protein 4,Sfrp4)、信号素3D(Semaphorin-3D,Sema3d)、FK506结合蛋白5(FK506 binding protein 5,Fkbp5)和丝氨酸蛋白酶35(serine protease 35,Prss35),并在小鼠mRNA水平获得验证。此外，CTD数据库结果显示这些基因与生殖疾病关系密切。结论应用生物信息学技术筛选获得的与PCOS发生发展的4个差异基因，分别是Sfrp4,Sema3d, Fkbp5,Prss35,它们与细胞增殖分化、卵泡生长、排卵及代谢稳态有关。这些候选基因为深入探究PCOS的发病机制提供了相关的前期基础。

关键词：多囊卵巢综合征生物信息学差异表达基因富集分析

单核细胞趋化蛋白1对肺癌A549细胞迁移和侵袭的影响及其机制

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吉林大学学报（医学版） 2024年第3期50卷 666-675页

作者：王远王志娟张明姝王艺慧张晴叶丽平锦州医科大学基础医学院病理学教研室辽宁锦州121001 锦州医科大学基础医学院病理生理学教研室辽宁锦州121001 锦州医科大学生物人类学研究所辽宁锦州121001

目的:探讨单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)对肺癌A549细胞迁移和侵袭的影响,并阐明其作用机制。方法:采用免疫组织化学法检测80例非小细胞肺癌(NSCLC)及癌旁正常肺组织中MCP-1蛋白表达情况。体外培养人肺癌A549细胞,MCP-1-小干扰RNA(siRNA)实... 详细信息

目的:探讨单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)对肺癌A549细胞迁移和侵袭的影响,并阐明其作用机制。方法:采用免疫组织化学法检测80例非小细胞肺癌(NSCLC)及癌旁正常肺组织中MCP-1蛋白表达情况。体外培养人肺癌A549细胞,MCP-1-小干扰RNA(siRNA)实验分为空白组、阴性对照组(si-NC组)、MCP-1-siRNA-1组和MCP-1-siRNA-2组;MCP-1过表达实验分为对照组、空载对照组(OE-NC组,转染MCP-1过表达空载质粒)、过表达MCP-1组(OE-MCP-1组,转染MCP-1过表达质粒)、过表达MCP-1+细胞外调节蛋白激酶(ERK)信号通路抑制剂PD98059组(OE-MCP-1+PD98059组,共转染MCP-1过表达质粒和PD98059)和PD98059组(转染PD98059)。分别将MCP-1-siRNA和质粒转染至肺癌A549细胞,Western blotting法验证各组A549细胞转染效率。细胞划痕实验和Transwell小室实验观察各组A549细胞迁移率和侵袭细胞数,Western blotting法检测各组A549细胞中磷酸化ERK(p-ERK)、总ERK(t-ERK)和上皮-间质转化(EMT)相关蛋白表达水平。结果:与癌旁组织比较,NSCLC组织中MCP-1蛋白阳性表达率明显升高(P室实验,与si-NC组比较,MCP-1-siRNA-1组和MCP-1-siRNA-2组侵袭细胞数明显减少(P<0.01);与OE-NC组比较,OE-MCP-1组侵袭细胞数明显增加(P<0.01);与OE-MCP-1组比较,OE-MCP-1+PD98059组侵袭细胞数明显减少(P<0.01);与OE-MCP-1+PD98059组比较,PD98059组侵袭细胞数明显减少(P<0.01)。Western blotting法,与si-NC组比较,MCP-1-siRNA-1组和MCP-1-siRNA-2组A549细胞中p-ERK、波形蛋白(Vimentin)和N-钙黏蛋白(N-cadherin)表达水平均明显降低(P<0.05或P<0.01),E-钙黏蛋白(E-cadherin)表达水平均明显升高(P<0.01);与OE-NC组比较,OE-MCP-1组A549细胞中p-ERK、Vimentin和N-cadherin蛋白表达水平均明显升高(P<0.01),E-cadherin蛋白表达水平均明显降低(P<0.01);与OE-MCP-1组比较,OE-MCP-1+PD98059组A549细胞中p-ERK、Vimentin和N-cadherin蛋白表达水平均明显降低(P<0.01),E-cadherin蛋白表达水平均明显升高(P<0.05);与OE-MCP-1+PD98059组比较,PD98059组A549细胞中p-ERK、 Vimentin和N-cadherin蛋白表达水平均明显降低(P<0.05或P<0.01),E-cadherin蛋白表达水平明显升高(P<0.01)。结论:MCP-1蛋白可上调肺癌A549细胞中EMT相关蛋白表达,促进肺癌A549细胞的迁移和侵袭,其作用机制与激活ERK信号通路有关。

关键词：单核细胞趋化蛋白1 细胞外信号调节激酶癌,非小细胞肺细胞侵袭细胞迁移

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氨基酸代谢重编程对肝细胞癌发生发展及治疗的影响

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第10期 1392-1399页

作者：张青周青鸟林文珍广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室广西高校生物分子医学研究重点实验室

在肿瘤细胞中，特定氨基酸的改变会对癌细胞的代谢产生显著影响，并使肿瘤微环境中的免疫细胞发生改变，影响肿瘤的发生发展和治疗效果。本文首先介绍肿瘤中氨基酸的作用，从外源性氨基酸的摄入，氨基酸修饰，支链氨基酸的代谢探讨肿瘤... 详细信息

在肿瘤细胞中，特定氨基酸的改变会对癌细胞的代谢产生显著影响，并使肿瘤微环境中的免疫细胞发生改变，影响肿瘤的发生发展和治疗效果。本文首先介绍肿瘤中氨基酸的作用，从外源性氨基酸的摄入，氨基酸修饰，支链氨基酸的代谢探讨肿瘤中必需氨基酸的代谢，并阐明非必需氨基酸在非必需氨基酸营养缺陷型肿瘤中的作用。其次，阐述了氨基酸代谢重编程对肝细胞癌发生发展的影响。必需氨基酸和非必需氨基酸在肝细胞癌中存在不可或缺的作用。在肝癌细胞内，必需氨基酸含量异常升高，促进肝癌细胞的发生发展，但支链氨基酸含量的升高却存在双重作用。非必需氨基酸在肝癌细胞中常作为抑制因子发挥作用，但精氨酸可联合天冬酰胺形成正反馈循环促进肝细胞癌的发生发展。最后阐述了氨基酸代谢重编程对肝细胞癌治疗的影响。谷氨酸、丝氨酸，支链氨基酸，S-腺苷甲硫氨酸，甘氨酸，精氨酸等可作为肝细胞癌的作用靶点，抑制氧化戊二酸脱氢酶的表达可以提高肝细胞癌患者对索拉非尼的药物敏感性。肝细胞癌肿瘤微环境中的氨基酸代谢重编程促进了肝癌细胞的恶性增殖和免疫逃逸，研究其中特异性改变的氨基酸有利于为患者制定个性化的免疫治疗。

关键词：氨基酸代谢支链氨基酸非必需氨基酸肿瘤肝细胞癌

尿酸盐在慢性肾病并发肾间质纤维化中的作用及机制

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安徽医科大学学报 2024年第7期59卷 1206-1212页

作者：杨萍徐德苹童子文陈琼徐如月周海胜安徽医科大学生物化学教研室合肥230032 安徽医科大学附属合肥医院检验科合肥230011 安徽省第二人民医院检验科合肥230041 安徽医科大学科研实验中心合肥230032

目的探讨尿酸盐在慢性肾病并发肾间质纤维化过程中的作用及机制。方法利用0.2%腺嘌呤的饲料喂养小鼠9周,构建慢性肾病小鼠模型。造模结束后,小鼠眼眶后静脉丛采血,检测肾功能和血尿酸含量;HE染色和PAS染色分析肾脏组织病理变化;Masson... 详细信息

目的探讨尿酸盐在慢性肾病并发肾间质纤维化过程中的作用及机制。方法利用0.2%腺嘌呤的饲料喂养小鼠9周,构建慢性肾病小鼠模型。造模结束后,小鼠眼眶后静脉丛采血,检测肾功能和血尿酸含量;HE染色和PAS染色分析肾脏组织病理变化;Masson染色观察肾脏纤维化程度;尿酸盐染色观察肾组织中尿酸盐沉积;Western blot和免疫组化检测目标分子的表达变化。利用不同浓度尿酸刺激原代培养小鼠肾小管上皮细胞(mRTECs)及人肾小管上皮细胞系(HKC);划痕实验观察尿酸对细胞迁移的影响。结果动物水平上,生化分析检测结果显示,模型组小鼠血清尿素氮(P=0.0064)、肌酐(P=0.0080)、血尿酸(P=0.0007)水平较对照组明显增加;HE和PAS染色结果显示,模型组小鼠出现严重肾小管损伤及炎症细胞浸润;Masson染色结果显示,模型组胶原沉积明显增加;尿酸盐染色结果显示,与对照组比较,模型组小鼠肾组织出现大量尿酸盐结晶;Western blot和免疫组化结果显示,模型组小鼠波形蛋白、平滑肌肌动蛋白和转化生长因子β1(TGF-β1)水平较对照组升高,E钙黏蛋白水平较对照组降低。细胞水平上,划痕结果显示,尿酸刺激促进肾小管上皮细胞迁移;Western blot检测结果与免疫组化一致。结论尿酸可通过促进肾小管上皮细胞分泌TGF-β1,进而促进上皮-间质细胞转分化,加速肾间质纤维化的发生。

关键词：尿酸盐高尿酸血症慢性肾病肾间质纤维化上皮-间质细胞转分化

钙激活氯通道TMEM16A在头颈部鳞状细胞癌中的研究现状与进展

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中华肿瘤防治杂志 2024年第17期31卷 1087-1093页

作者：李思张屾煜王惠杰沈阳医学院基础医学院生物化学与分子生物学教研室中国医科大学基础医学院人体解剖学教研室中国医科大学基础医学院病理生理学教研室

目的总结跨膜蛋白16A(TMEM16A)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的研究现状，就临床预后、调控机制、癌症治疗、存在问题及未来研究方向进行系统综述，以期为TMEM16A在HNSCC的临床转化提供依据。方法以“跨膜蛋白16A、头颈部鳞状细胞癌、... 详细信息

目的总结跨膜蛋白16A(TMEM16A)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的研究现状，就临床预后、调控机制、癌症治疗、存在问题及未来研究方向进行系统综述，以期为TMEM16A在HNSCC的临床转化提供依据。方法以“跨膜蛋白16A、头颈部鳞状细胞癌、表皮生长因子受体、转化生长因子-β、免疫治疗”为中文关键词，以“transmembrane protein 16A(TMEM16A or ANO1)、head and neck squamous cell carcinoma、epidermal growth factor receptor、transforming growth factor-β、immunotherapy”为英文关键词，检索2006-01-01-2023-09-18中国知网及PubMed数据库发表的相关文献。纳入标准：(1)TMEM16A在HNSCC中的研究现状；(2)TMEM16A调控的表皮生长因子受体(EGFR)及转化生长因子-β(TGF-β)信号通路；(3)TMEM16A在抗肿瘤药物治疗中的研究现状。排除标准：(1)样本量小或数据不全的文献；(2)低质量文献；(3)综述文献。最终纳入50篇相关文献。结果 TMEM16A高表达与HNSCC发生发展、低生存期及不良预后呈正相关。作为肿瘤促进因子，TMEM16A分别通过EGFR和TGF-β及其下游信号通路驱动HNSCC的生长和转移。TMEM16A抑制剂与HNSCC治疗药物的联合使用显著减少肿瘤生长。结论靶向TMEM16A的药物在HNSCC免疫治疗、靶向治疗和化学治疗中具有潜在价值。阐明TMEM16A在肿瘤免疫微环境中的作用是未来重要的研究方向。

关键词：跨膜蛋白16A 头颈部鳞状细胞癌表皮生长因子受体转化生长因子-β 免疫治疗综述文献

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睾丸类器官在体外精子发生中的研究进展

合成生物学 2024年第4期5卷 770-781页

作者：张博航祁晓萱袁艳南京医科大学生殖医学与子代健康全国重点实验室江苏南京211166

随着全球不孕不育问题的日益严重,特别是男性不育症的比例逐年上升,睾丸类器官的研究为这一领域提供了新的希望和策略。本综述全面探讨了睾丸类器官在模拟自然生精环境、深入探究精子发生机制以及应对男性生殖健康挑战中的应用。首先,... 详细信息

随着全球不孕不育问题的日益严重,特别是男性不育症的比例逐年上升,睾丸类器官的研究为这一领域提供了新的希望和策略。本综述全面探讨了睾丸类器官在模拟自然生精环境、深入探究精子发生机制以及应对男性生殖健康挑战中的应用。首先,介绍了睾丸的生理功能和精子发生过程的重要性,关注了睾丸组织体外培养和睾丸细胞重聚类器官的技术及其研究进展。其次,探讨了睾丸类器官在探究分子机制、药物筛选和毒性评估及男性生育力保存方面的潜在应用。最后,对当前方法的局限性和未来研究方向进行了讨论,特别是在提高体外环境下精子质量和成熟度方面的研究成果。尽管睾丸微环境复杂,在体外完整模拟人类精子发生仍面临挑战,但睾丸类器官领域的不断发展有望为临床生殖医学和男性健康研究提供新的解决方案。

关键词：睾丸类器官精子发生生殖医学睾丸微环境应用

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虚拟仿真在生物化学实验教学中的应用与探讨

基础医学教育 2024年第1期26卷 70-75页

作者：张亚琴张颖张伟裴丽丽陈园园南京医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系南京211100 南京医科大学口腔医学院口腔医学专业南京医科大学康达学院基础医学部生物化学与分子生物学教研室

虚拟仿真实验室是一个计算机网络化的虚拟环境,具有交互性和仿真性的特点。生物化学与分子生物学是一门综合性较强的医学基础学科,重点对学生进行生物化学与分子生物学的基础理论、研究方法和实践技能的训练与培养。文章结合南京医科大... 详细信息

虚拟仿真实验室是一个计算机网络化的虚拟环境,具有交互性和仿真性的特点。生物化学与分子生物学是一门综合性较强的医学基础学科,重点对学生进行生物化学与分子生物学的基础理论、研究方法和实践技能的训练与培养。文章结合南京医科大学的虚拟仿真实验教学实践,对如何将虚拟仿真实验技术更好地应用于生物化学实验教学中,改进虚拟仿真实验平台,从而与传统的实验教学相辅相成展开了探讨。

关键词：生物化学实验教学虚拟仿真教学方法虚拟仿真实验平台教学改革

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肝癌微环境重塑与免疫治疗策略

生物化学与生物物理进展 2024年第10期51卷 2587-2601页

作者：韩月晴张语涵刘嘉夫陈云南京医科大学免疫学系南京211166

肝细胞癌是消化系统常见的恶性肿瘤之一,局部免疫微环境与肿瘤疾病的发生发展及治疗效果密切相关。肿瘤细胞可诱导免疫细胞表型和功能改变塑造免疫抑制微环境,减弱免疫系统杀伤功能。同时,免疫细胞代谢调节对机体抗肿瘤免疫应答至关重... 详细信息

肝细胞癌是消化系统常见的恶性肿瘤之一,局部免疫微环境与肿瘤疾病的发生发展及治疗效果密切相关。肿瘤细胞可诱导免疫细胞表型和功能改变塑造免疫抑制微环境,减弱免疫系统杀伤功能。同时,免疫细胞代谢调节对机体抗肿瘤免疫应答至关重要。肝癌微环境中的代谢产物及肠道菌群代谢物失衡可通过调控免疫细胞表型和功能重塑影响肝癌进展。目前,肝癌细胞与微环境免疫细胞之间相互作用导致肿瘤免疫逃逸已成为当前研究的热点。本文总结了肝癌免疫抑制微环境的构成及其代谢调控,并探讨了靶向微环境重塑治疗肝癌的潜在策略,为肿瘤免疫治疗提供新思路。

关键词：肝细胞癌免疫微环境免疫逃逸免疫代谢免疫治疗