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莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)nfr基因的显隐性突变性质及其与叶绿体psba基因之间的相互作用分析

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Acta Genetica Sinica 2003年第7期30卷 646-652页

作者：吾甫尔.米吉提 Zayadan B K 艾尔肯.热合曼 Chunaev A S 新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046 Departmen of Microbiology Al-Farabi Kazakh National University Department of Genetics and Breeding St.Petersburg State University

通过对莱茵衣藻 (Chlamydomonasreinhardtii)nfr/Nfr杂合二倍体的表型分析证明 ,nfr基因是隐性突变基因 ,Nfr 4和Nfr 5突变株对达草灭的抗性是由nfr 1和nfr 2两个不同核基因的隐性突变所导致。psba基因突变株品系与野生型品系CC 12 4和... 详细信息

通过对莱茵衣藻 (Chlamydomonasreinhardtii)nfr/Nfr杂合二倍体的表型分析证明 ,nfr基因是隐性突变基因 ,Nfr 4和Nfr 5突变株对达草灭的抗性是由nfr 1和nfr 2两个不同核基因的隐性突变所导致。psba基因突变株品系与野生型品系CC 12 4和nfr基因突变株进行杂交并对其后代进行的四分子分析结果表明 :在光养条件下 ,叶绿体psba基因突变株品系对达草灭的敏感性是psba突变等位基因的多效效应 ;而在混合营养条件下 ,叶绿体基因组对达草灭抗性性状也产生一定影响。达草灭抗性突变株品系对抗菌素类的交叉抗性性质进行的检测实验结果中发现 ,Nfr 3对红霉素和链霉素具有一定的交叉抗性 ,预测。

关键词：莱茵衣藻达草灭抗性基因突变表型 psba基因交叉抗性

基于psba基因的噬藻体遗传多样性研究进展

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生态与农村环境学报 2016年第3期32卷 417-423页

作者：李樾刘婷婷刘丽夏雪山昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明650500

噬藻体作为一类感染蓝藻的特异性病毒,广泛分布于不同水生态系统中。随着水体富营养化的加剧,蓝藻水华频繁爆发,具有潜在控藻能力的生物因子——噬藻体的研究备受关注。目前对于噬藻体的研究主要集中在其分离纯化及生物学特性等,因缺乏... 详细信息

噬藻体作为一类感染蓝藻的特异性病毒,广泛分布于不同水生态系统中。随着水体富营养化的加剧,蓝藻水华频繁爆发,具有潜在控藻能力的生物因子——噬藻体的研究备受关注。目前对于噬藻体的研究主要集中在其分离纯化及生物学特性等,因缺乏广泛通用的分子标记致使其遗传多样性研究受限。以编码光合作用反应中心D1蛋白的psb A基因为靶基因,综述了海洋、淡水环境中噬藻体psb A基因遗传多样性的最新研究进展,分析了噬藻体在不同自然环境中的分布及差异,同时也提出了噬藻体多样性研究中存在的一些问题。

关键词：噬藻体 psba基因遗传多样性

云南高原异龙湖噬藻体psba基因遗传多样性研究

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生态与农村环境学报 2019年第10期35卷 1322-1329页

作者：李春筱刘婷婷刘玉珊刘丽昆明理工大学生命科学与技术学院

噬藻体作为一类感染蓝藻的特异性病毒,广泛分布于不同水生态系统中。作为噬藻体的一种靶标基因,编码光合作用反应中心D1蛋白的基因psba不仅可用于揭示噬藻体的遗传多样性,还可用于探索噬藻体与其宿主蓝藻之间的关系。该文以云南高原富... 详细信息

噬藻体作为一类感染蓝藻的特异性病毒,广泛分布于不同水生态系统中。作为噬藻体的一种靶标基因,编码光合作用反应中心D1蛋白的基因psba不仅可用于揭示噬藻体的遗传多样性,还可用于探索噬藻体与其宿主蓝藻之间的关系。该文以云南高原富营养化湖泊异龙湖为研究对象,以psba基因为分子标记,从异龙湖浓缩水样中共获得15条噬藻体psba环境序列。基于噬藻体的psba序列构建系统进化树,分析异龙湖水样噬藻体光合作用基因psba的遗传多样性。研究结果表明:云南高原湖泊异龙湖水体中噬藻体psba基因类群与海洋、其他淡水湖和日本稻田水体中psba基因类群不同,与中国东北稻田的生态类群进化距离较近,进化相对独立。异龙湖水体中存在新的噬藻体类群,并且不同季节水样中噬藻体psba基因序列存在差异,秋季其遗传多样性更加丰富。

关键词：噬藻体异龙湖 psba基因遗传多样性

蛋白核小球藻psba基因的克隆及其在自养和异养培养的表达变化

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水产学报 2011年第10期35卷 1469-1474页

作者：孙雪吴晓微徐年军杨锐宁波大学生命科学与生物工程学院教育部应用海洋生物技术重点实验室

psba基因是高等植物和藻类中介导光合电子传递D1蛋白的编码基因,该基因受光照等因素的调控。以单细胞绿藻蛋白核小球藻为材料,克隆了psba全编码序列并用荧光定量PCR的方法研究了自养和异养藻psba基因转录水平的变化,以揭示不同培养方式... 详细信息

psba基因是高等植物和藻类中介导光合电子传递D1蛋白的编码基因,该基因受光照等因素的调控。以单细胞绿藻蛋白核小球藻为材料,克隆了psba全编码序列并用荧光定量PCR的方法研究了自养和异养藻psba基因转录水平的变化,以揭示不同培养方式下psba基因表达变化规律。结果克隆到2 595 bp psba序列,包括676 bp的5’-非翻译区和857 bp的3’非翻译区。该psba基因开放阅读框编码353个氨基酸,A+T百分含量为58.0%,其成熟的D1蛋白加工方式与高等植物高粱相似。荧光定量结果表明,自养藻在光周期内psba基因表达量先升高后下降,而异养藻psba表达变化不明显。从自养转为异养2 h时psba表达量略有升高,4 h后下降至转化前的0.41倍并缓慢下降,而从异养转为自养psba表达量增加,4 h时增加至1.69倍,4 h后趋于稳定。不同浓度光合抑制剂DCMU降低自养小球藻psba转录活性至未添加组的40%～59%,而不同程度地促进了异养藻psba的转录表达。

关键词：蛋白核小球藻 psba基因荧光定量PCR 表达

11种植物psba基因的密码子偏好性及聚类分析

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核农学报 2011年第5期25卷 927-932页

作者：晁岳恩吴政卿杨会民何宁杨攀河南省农科院小麦研究中心/河南省小麦生物学重点实验室河南郑州450002

植物叶绿体psba基因的启动子是叶绿体基因工程中常用的启动子,研究该基因的编码特点对完善叶绿体基因工程的研究设计、提高外源基因在受体物种中高效、稳定的表达具有重要作用。本研究综合运用了多种分析软件,对11种植物的叶绿体psba基... 详细信息

植物叶绿体psba基因的启动子是叶绿体基因工程中常用的启动子,研究该基因的编码特点对完善叶绿体基因工程的研究设计、提高外源基因在受体物种中高效、稳定的表达具有重要作用。本研究综合运用了多种分析软件,对11种植物的叶绿体psba基因进行了分析。结果表明,11种植物psba基因的ENC(Effective Number of Codons)值都小于40,显示出了明显的密码子偏好性,即在碱基组成上偏爱以C结尾的密码子。RSCU(Relative Synonymous Codon Usage)值表明共有20个密码子在编码使用上具有偏好性,其中有8个表现出较强的偏好性;另有12个密码子在psba中出现率极低或没有出现。在聚类分析中,基于密码子偏好性参数RSCU的聚类不能正确反映物种间的进化关系,而基于基因序列的聚类更适合作为系统发育分析的参考。

关键词： psba基因密码子偏好性聚类分析

高粱psba基因启动子“-35”元件的突变效应

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科学通报 1999年第12期44卷 1266-1271页

作者：吴乃虎范天舒任东路中国科学院发育生物学研究所北京100080

应用化学合成的 2 0nt寡核苷酸引物 ,诱导高粱psba基因启动子“ - 35”元件 (TTGACA)中的第 1位T碱基和第 3位G碱基发生突变 ,获得 3个突变体ATTACA ,GTGACA和ATGACA .在菠菜叶绿体蛋白质提取物系统中 ,检测突变的及野生型的高粱psba基... 详细信息

应用化学合成的 2 0nt寡核苷酸引物 ,诱导高粱psba基因启动子“ - 35”元件 (TTGACA)中的第 1位T碱基和第 3位G碱基发生突变 ,获得 3个突变体ATTACA ,GTGACA和ATGACA .在菠菜叶绿体蛋白质提取物系统中 ,检测突变的及野生型的高粱psba基因启动子与蛋白质的结合能力 .凝胶阻滞实验结果表明 ,野生型的具有很强的蛋白质结合条带 ,单碱基突变体ATGACA和GTGACA的蛋白质条带的强度明显下降 ,而双碱基突变体ATTACA的蛋白质结合条带的强度反而比野生型增强 .由此可见“ - 35”元件在调控psba基因启动子与叶绿体特异蛋白质的结合反应中 ,具有重要的作用 ,其中个别碱基的突变便会显著地影响启动子与蛋白质的结合能力 .

关键词：高粱 psba基因定点突变表达调控启动子

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小麦叶绿体psba基因PCR扩增及其克隆

遗传 1995年第3期17卷 23-26页

作者：于玲俞新大张自立南开大学生物系

利用聚合酶链反应（Polymerasechainreaction）对小麦叶绿体的psba基因进行情异性扩增，并以pBS+质粒为载体将完整的psba基因克隆到E.coli中．通过分子杂交，PCR反应和酶切分析证明。重组质粒pTD1Ⅱ中含有完整的小麦叶绿体psba基因．

关键词：小科 psba基因克隆聚合酶链反应扩增

不同盐浓度和光照强度对杜氏盐藻psba基因表达的影响

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华中师范大学学报（自然科学版） 2010年第2期44卷 288-292页

作者：吕文兵刘红涛薛乐勋郑州大学生物工程系郑州450001

利用半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR研究不同浓度的NaCl和不同的光照强度条件下杜氏盐藻psba基因的表达差异.结果显示,杜氏盐藻在2.5 mol NaCl的培养基中,其psbamRNA的表达达到最高,与其它各组不同NaCl浓度(1.5 mol,2.0 mol,3.0 mol和4.... 详细信息

利用半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR研究不同浓度的NaCl和不同的光照强度条件下杜氏盐藻psba基因的表达差异.结果显示,杜氏盐藻在2.5 mol NaCl的培养基中,其psbamRNA的表达达到最高,与其它各组不同NaCl浓度(1.5 mol,2.0 mol,3.0 mol和4.0 mol)相比,差异显著(Ppsba基因的表达.此外,与暗培养相比,杜氏盐藻在3 000 lx和4 500 lx的条件下,psba基因的表达量明显升高(Ppsba表达量达到峰值.但高光强(8 000 lx)与暗培养相比,psba基因的表达量无差异(P>0.05).上述结果提示,高浓度的盐(4.0 mol)和高光强(8 000 lx)能明显抑制psba基因mRNA的表达;而适量浓度的盐和光照条件能促进psba基因mRNA的表达.

关键词：杜氏盐藻 psba基因氯化钠光照强度

冈村枝管藻叶绿体psba基因的克隆及序列分析

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海洋科学 2009年第9期33卷 20-24页

作者：朱清华张学成李玉晖德州学院生物系山东德州253023 中国海洋大学海洋生命学院山东青岛266003 合肥学院生物与环境工程系安徽合肥230022

psba基因编码光合系统II反应中心的D1蛋白,是叶绿体基因组中一个重要的光调控基因。根据网管藻(Dictyosiphon foeniculaceus)、髋藻(Myelophycus simplex)、粗粒藻(Asperococcus fistulosus)、索藻(Chor-daria flagelliformis)、点叶藻(Punctaria latifolia)、水云(Ectocarpus siliculosus)、铁钉菜(Ishige okamu-rae)、绳藻(Colpomeniasinuosa)、网胰藻(Hydroclathrus clathratus)、幅叶藻(Petalonia fascia)等10种藻类的psba基因高度保守序列,设计引物,利用PCR方法从冈村枝管藻(Cladosiphon okamuranus)基因组DNA中扩增出约750 bp的片段,将该片段连接到pMD18-T载体上进行序列测定。结果表明:片段长度为737bp,推导的245个氨基酸序列与网管藻、髋藻、粗粒藻、索藻、点叶藻、水云、铁钉菜、绳藻、网胰藻、幅叶藻的D1蛋白相对应的氨基酸序列的同源性均高于96%。该基因序列已被GenBank收录,登录号为EU332142。

关键词：冈村枝管藻(Cladosiphon okamuranus) PCR扩增 psba基因序列分析