小米psbA基因5'末端非编码区的结构特征

作     者：黄瑶 吴乃虎 Huang Yao Wu Naihu(Institute of Developmental Biology, Academia Sinica, Beijing 100080)

作者机构：中国科学院发育生物学研究所 

出 版 物：《生物工程学报》 (Chinese Journal of Biotechnology)

年 卷 期：1996年第12卷第2期

页      面：119-123页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家"863-10l-O7-05"基金 

主　　题：小米 psbA基因 启动子 茎环结构 

摘      要：以小米(Setaria italica)为材料,克隆了含有叶绿体psbA基因的2.2kb EcoRⅠ片段,测定了该基因5＇末端非编码区的核苷酸序列。序列分析显示psbA基因5＇末端非编码区存在着与原核类似的启动子结构,其“-10区的序列为TATACT,与原核生物“-10共有基序(Consensus motif)仅相差一个核苷酸;其“-35区的序列为TTGACA,与原核生物“-35共有基序完全相同。另外,在“-10区和“-35区之间还存在着一个类似真核启动子结构的“TATATA保守序列。这些结果表明小米psbA基因的启动子既具有原核的特征又具有真核的特征。小米psbA基因的mRNA前导序列长87bp,与高粱完全一致,而比水稻多出了“CTATTTT7个核苷酸,比小麦、大麦和黑麦多出了“TTTT4个核苷酸。因此推测在禾本科的C_3和C_4植物之间,psbA基因mRNA前导序列区的差异可能具有普遍性。计算机分析结果显示,以上6种植物的psbA基因mRNA前导序列区内均能形成小的茎环结构,而且这段“CTATTTT额外序列恰好位于茎环结构中,造成了6种植物间茎环大小的差异。这一小的二级结构可能对psbA基因的表达调控有一定的影响。