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中草药 2024年第20期 7072-7084页

作者：洪森荣徐燕萍郭依瑶章成上饶师范学院生命科学学院上饶农业技术创新研究院上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室

目的通过lncrna测序鉴定三叶青Tetrastigma hemsleyanum烟草花叶病毒蛋白基因。方法利用大肠杆菌重组技术表达三叶青烟草花叶病毒蛋白,并采用生物信息学方法进行序列分析。结果三叶青烟草花叶病毒蛋白基因包括复制酶、RNA聚合酶、运... 详细信息

目的通过lncrna测序鉴定三叶青Tetrastigma hemsleyanum烟草花叶病毒蛋白基因。方法利用大肠杆菌重组技术表达三叶青烟草花叶病毒蛋白,并采用生物信息学方法进行序列分析。结果三叶青烟草花叶病毒蛋白基因包括复制酶、RNA聚合酶、运动蛋白、带电蛋白和外壳蛋白等基因;三叶青烟草花叶病毒RNA聚合酶、运动蛋白(MP)、带电蛋白和外壳蛋白(CP)可实现大肠杆菌重组表达,表明三叶青烟草花叶病毒的lncrna测序结果准确;三叶青烟草花叶病毒CP、MP、RNA聚合酶和带电蛋白基因cDNA总长度分别为480、807、1 425、123bp,三叶青烟草花叶病毒CP、MP、RNA聚合酶和带电蛋白分别由159、268、474、40个氨基酸组成;三叶青烟草花叶病毒CP、MP、RNA聚合酶为亲水性蛋白质,带电蛋白为疏水性蛋白质;三叶青烟草花叶病毒CP、MP、RNA聚合酶二级结构由α螺旋、β-片层、无规则卷曲构成,带电蛋白二级结构由β-片层和无规则卷曲构成,三级结构均为单体,分别定位于叶绿体、叶绿体、细胞质和线粒体中。三叶青烟草花叶病毒CP、MP、RNA聚合酶和带电蛋白与烟草花叶病毒亲缘关系较近,同源性达98%以上。结论三叶青烟草花叶病毒具有烟草花叶病毒的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守。

关键词：三叶青烟草花叶病毒 lncrna测序鉴定蛋白表达序列分析

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信前胡烟草花叶病毒lncrna测序鉴定、原核蛋白表达及其序列分析

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中国农学通报 2024年第21期40卷 106-113页

作者：尹明华郭依瑶李启诺罗泽全林文龙熊姿雯上饶师范学院生命科学学院江西上饶334001 上饶农业技术创新研究院江西上饶334001 上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室江西上饶334001 上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室江西上饶334001

本研究对信前胡烟草花叶病毒进行鉴定、原核蛋白表达和序列分析,为信前胡脱毒苗的培育和鉴定提供理论依据。通过lncrna测序和RT-PCR鉴定信前胡烟草花叶病毒蛋白基因,利用大肠杆菌重组技术表达信前胡烟草花叶病毒蛋白,并采用生物信息学... 详细信息

本研究对信前胡烟草花叶病毒进行鉴定、原核蛋白表达和序列分析,为信前胡脱毒苗的培育和鉴定提供理论依据。通过lncrna测序和RT-PCR鉴定信前胡烟草花叶病毒蛋白基因,利用大肠杆菌重组技术表达信前胡烟草花叶病毒蛋白,并采用生物信息学方法进行序列分析。信前胡烟草花叶病毒蛋白基因包括复制酶(ORF1)、运动蛋白(ORF2)和外壳蛋白(ORF3);信前胡烟草花叶病毒复制酶、运动蛋白和外壳蛋白均可通过RT-PCR检测到,并可实现大肠杆菌重组表达,表明信前胡烟草花叶病毒的lncrna测序结果准确;信前胡烟草花叶病毒复制酶、运动蛋白和外壳蛋白基因cDNA总长度分别为3351 bp、807 bp和480 bp;信前胡烟草花叶病毒复制酶、运动蛋白和外壳蛋白与烟草花叶病毒的亲缘关系较近,同源性分别为99.64%、98.88%、98.74%。信前胡烟草花叶病毒(Peucedanum praeruptorm tobacco mosaic virus,PpTMV)在江西省上饶市信前胡主产区信州、广信、玉山、广丰、婺源、德兴、弋阳的7个区或县均有发生。这是首次报道在信前胡上检测到PpTMV。

关键词：信前胡烟草花叶病毒 lncrna测序鉴定 RT-PCR 原核蛋白表达序列分析

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广丰千金薯烟草花叶病毒lncrna测序鉴定、原核蛋白表达及其序列分析

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中草药 2023年第11期54卷 3666-3675页

作者：尹明华张艳红李淑娟段俊蒋晓峰上饶师范学院生命科学学院江西上饶334001 上饶农业技术创新研究院江西上饶334001 上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室江西上饶334001 上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室江西上饶334001

目的对广丰千金薯Dioscorea polystachya *** Qianjin烟草花叶病毒进行鉴定、原核蛋白表达和序列分析,为广丰千金薯脱毒苗的培育和鉴定提供理论依据。方法通过lnc RNA测序鉴定广丰千金薯烟草花叶病毒蛋白基因,利用大肠杆菌重组技术表达... 详细信息

目的对广丰千金薯Dioscorea polystachya *** Qianjin烟草花叶病毒进行鉴定、原核蛋白表达和序列分析,为广丰千金薯脱毒苗的培育和鉴定提供理论依据。方法通过lnc RNA测序鉴定广丰千金薯烟草花叶病毒蛋白基因,利用大肠杆菌重组技术表达广丰千金薯烟草花叶病毒蛋白,并采用生物信息学方法进行序列分析。结果广丰千金薯烟草花叶病毒蛋白基因包括复制酶1(ORF1)、复制酶2(ORF2)、RNA聚合酶、运动蛋白(movement protein,MP)、带电蛋白和外壳蛋白(coat protein,CP);广丰千金薯烟草花叶病毒CP、MP、RNA聚合酶、带电蛋白、ORF1和ORF2基因c DNA总长度分别为480、807、1425、123、4851、3351 bp,其蛋白分别由159、268、474、40、1613和1114个氨基酸组成;广丰千金薯烟草花叶病毒蛋白除带电蛋白为疏水性蛋白质外,其余如ORF1、ORF2、RNA聚合酶、运动蛋白和外壳蛋白均为亲水性蛋白质;广丰千金薯烟草花叶病毒带电蛋白二级结构由β-片层和无规则卷曲构成,CP、MP、RNA聚合酶、ORF1和ORF2的二级结构均由α螺旋、β-片层、无规则卷曲构成;广丰千金薯烟草花叶病毒CP、MP、RNA聚合酶、带电蛋白、ORF1和ORF2三级结构均为单体;广丰千金薯烟草花叶病毒CP、MP、RNA聚合酶、带电蛋白、ORF1和ORF2的亚细胞定位分别为内质网、细胞核、细胞质、细胞核、线粒体、叶绿体;广丰千金薯烟草花叶病毒CP、MP、RNA聚合酶、带电蛋白、ORF1和ORF2与烟草花叶病毒的亲缘关系较近,同源性分别为99.79%、99.38%、99.23%、100%、99.38%、99.49%;广丰千金薯烟草花叶病毒复制酶、RNA聚合酶、MP和CP可实现大肠杆菌重组表达,表明广丰千金薯烟草花叶病毒的lnc RNA测序结果准确。结论广丰千金薯烟草花叶病毒与烟草花叶病毒同源性极高,氨基酸序列及核酸序列与烟草花叶病毒其他植物分离物相似度高,在进化上高度保守。

关键词：广丰千金薯烟草花叶病毒 lncrna测序鉴定原核蛋白表达序列分析

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