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Pairing Mismatched ssDNA to dsdna Studied with Reflectometric Interference Spectroscopy Sensor

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Chinese Physics Letters 2016年第8期33卷 151-154页

作者：武青青王凯歌孙聃王爽张琛赵伟 Institute of Photonics & Photon-Technology National Center for International Research of Photoelectric Technology &Nano-functional MaterialsState Key Laboratory of Cultivation Base for Photoelectric Technology and Functional MaterialsKey Laboratory of Optoelectronic Technology of Shaanxi ProvinceNorthwest University

The interaction between two single-stranded DNA （ssDNA） molecules as pairing to a double-stranded DNA （dsdna） molecule is studied by the reflectometric interference spectroscopy （RIFS） technology. A nano-porous anode alumina membrane coated an Au layer is employed as the sensor substrate. The results indicate that when there are mismatched nucleotide bases, the effective optical thicknesses （OTeft） have obvious difference, and the changes of OTeff are connected with the sensor layer thickness and the effective refractive index. It is also demonstrated that the RIFS technique can be used to precisely detect the ssDNA molecules with individual base mismatched as pairing to dsdna.

关键词： dsdna is will ssDNA of with

CO2/NIR light dual-controlled nanoparticles for dsdna unzipping

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Chinese Chemical Letters 2020年第1期31卷 281-284页

作者： Yanjing Wang Hongbo Yuan Dawei Li Chengfen Xing Key Laboratory of Hebei Province for Molecular Biophysics Institute of BiophysicsHebei University of TechnologyTianjin 300401China Institute of Polymer Science and Engineering College of Chemical Engineering Hebei University of TechnologyTianjin 300130China

Both of carbon dioxide(CO2)and near-infrared(NIR)light as triggers for non-invasive remotely control are attracting wide attentions due to their good biocompatibility and easy ***,CO2/NIR light dual controlled nanoparticles are proposed to remotely regulate the unzipping of dsdna by using imidazole functionalized conjugated polymer nanoparticles(imidazole-CPNs).The dsdna successfully coats on the shell of imidazole-CPNs to form imidazole-CPNs/dsdna assembly due to intensively electrostatic interaction triggered by ***,the unzipping process of dsdna is remotely controlled by NIR light based on the photothermal effect,and it can be readily monitored by the fluorescence intensity of ethidium bromide(EB)and CD spectra of ***,dual stimulation responsive imidazole-CPNs effectively control dsdna unzipping under CO2 stimulus and NIR light,promising a new direction in the biological applications of DNA,such as the treatments of diseases caused by gene duplication abnormality.

关键词： Carbon dioxide Conjugated polymers nanoparticles Photothermal effect dsdna Near-infrared light

SSB peptide and DNA co-immunization induces inhibition of anti-dsdna antibody production in rabbits

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Chinese Medical Journal 2008年第3期121卷 227-230页

作者： DING Min ZHANG Jian-zhong Department of Dermatology Peking University People's HospitalBeijing 100044 China

Background Patients with systemic lupus erythematosus often have various autoantibodies. The relationship between these antibodies is still poorly understood. The aim of the present study was to observe the anti-SSB antibody and anti-dsdna antibody production profiles following immunization with synthetic SSB peptide alone, DNA alone or co-immunization with these two antigens. Methods SSB 214-225 aa peptide was synthesized by organic chemistry solid-phase peptide synthesis. Rabbits were immunized with the following antigens： synthetic SSB peptide linked with keyhole limpet hemocyanin （KLH）, DNA, SSB plus dsdna, KLH and PBS. Antibodies were measured by ELISA. Histopathology and direct immufluorescence assays were also applied. Results Anti-SSB and anti-dsdna antibodies were produced following immunization with SSB peptide and DNA respectively. The level of SSB antibody in the co-immunization group was higher than that of the SSB peptide immunization group. The level of anti-dsdna antibody in the co-immunization group was, however, lower than that in the DNA immunization group. Meanwhile, the level of anti-SSB antibody was higher than that of anti-DNA antibody in the co-immunization group. No morphological or immunological abnormalities were found in the heart, liver, kidney, spleen or skin tissues. Conclusion Inhibition of anti-dsdna-antibody was induced by co-immunization with synthesized SSB peptide and DNA, which might explain, at least partly, the mild disease in some LE subsets associated with SSB antibody.

关键词： lupus erythematosus antibody SSB dsdna immunization

基于FLUOstar平台的小麦dsdna荧光定量与基因型分析

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作物学报 2017年第7期43卷 947-953页

作者：肖永贵 Susanne DREISIGACKER Claudia NUNEZ-RIOS 胡卫国夏先春何中虎中国农业科学院作物科学研究所、国家小麦改良中心北京100081 International Maizeand Wheat Improvement Center(CIMMYT) 06600 MéxicoDFMéxico 河南省农业科学院小麦研究所河南郑州450002 CIMMYT中国办事处北京100081

双链DNA(dsdna)定量分析是植物分子生物学研究的基础,对基因型分析尤为重要。本研究以λ噬菌体dsdna为标准样品,建立了荧光定量标准曲线,探讨荧光核酸定量通量性及其与紫外法定量的差异,并分析荧光染料在基因分型中的应用。结果表明,荧... 详细信息

双链DNA(dsdna)定量分析是植物分子生物学研究的基础,对基因型分析尤为重要。本研究以λ噬菌体dsdna为标准样品,建立了荧光定量标准曲线,探讨荧光核酸定量通量性及其与紫外法定量的差异,并分析荧光染料在基因分型中的应用。结果表明,荧光染料能够对dsdna进行高效微量定量分析(dsdna浓度时,总反应体系应大于200mL;对PCR产物进行基因分型时,总反应体系应不低于40mL。相同DNA模板浓度下,FLUOstar平台可以对抗秆锈病基因显性标记csSr32#1(Sr32)和IB-267(Sr50)的PCR产物进行基因型分型,判断准确率为100%。对特异性强且等位基因片段差异大(≥100bp)的共显性标记,如抗叶锈病基因标记We173(Yr26)等,用荧光染料同样可以进行基因分型。与琼脂糖凝胶电泳相比,荧光染料鉴定等位基因价格略高,但方法简单、准确快速、重现性好,可用于分子育种中世代材料快速筛选。

关键词：普通小麦 dsdna 荧光定量显性标记分子育种

胭脂红与dsdna相互作用在有无纳米TiO_2掺杂的碳糊电极上的比较研究及其应用(英文)

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复旦学报（自然科学版） 2014年第1期53卷 84-92页

作者：马明明苏新科西安工程大学环境与化工学院西安710048

与裸碳糊电极相比,胭脂红与dsdna的嵌插作用在TiO_2掺杂的碳糊电极上得到增强.这是由于纳米TiO_2的存在,增加了胭脂红的电子传递速率.基于胭脂红与dsdna的强嵌插作用,当dsdna的浓度在21.24~127.44μg·mL^(-1)时,胭脂红的氧化还原峰电... 详细信息

与裸碳糊电极相比,胭脂红与dsdna的嵌插作用在TiO_2掺杂的碳糊电极上得到增强.这是由于纳米TiO_2的存在,增加了胭脂红的电子传递速率.基于胭脂红与dsdna的强嵌插作用,当dsdna的浓度在21.24~127.44μg·mL^(-1)时,胭脂红的氧化还原峰电流下降值与dsdna的浓度成正比,检测限为16.04μg·mL^(-1).而在裸电极上,dsdna的浓度范围为31.76~74.34μg·mL^(-1),检测限只有30.32μg·mL^(-1).对于这两种电极,胭脂红与dsdna的结合常数分别是4.92×10~8,6.41×10~7L·mol^(-1),结合比均为1∶2.因此,胭脂红与dsdna在纳米TiO_2掺杂的碳糊电极嵌插作用被用于测定合成样品中的dsdna,平均回收率在96.02%~102.5%.

关键词： dsdna 胭脂红电化学纳米TiO2粒子

双极制界面电位法测定鲱鱼精dsdna与联苯胺的结合参数

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纺织高校基础科学学报 2016年第4期29卷 -页

作者：马明明张彦赵强西安工程大学环境与化学工程学院陕西西安710048

将鲱鱼精dsdna通过自吸附方式固定在铅笔芯电极(CP)表面制备出DNA/CP.在pH7.38磷酸缓冲溶液(PBS)中,考察联苯胺(BZ)与铅笔芯电极表面鲱鱼精dsdna相互作用后所导致的DNA/CP零流电位Ezcp变化.结果显示,随着BZ浓度或结合时间的增加,DNA/CP... 详细信息

将鲱鱼精dsdna通过自吸附方式固定在铅笔芯电极(CP)表面制备出DNA/CP.在pH7.38磷酸缓冲溶液(PBS)中,考察联苯胺(BZ)与铅笔芯电极表面鲱鱼精dsdna相互作用后所导致的DNA/CP零流电位Ezcp变化.结果显示,随着BZ浓度或结合时间的增加,DNA/CP的Ezcp均正移;且当BZ浓度在8.0×10^(-7)~1.0×10^(-5) mol·L^(-1)或结合时间在2~18min内,Ezcp与BZ浓度对数lg[BZ]或结合时间呈正比关系.由此计算出dsdna与BZ结合反应呈现一级动力学反应方程,其结合比为1∶1,表观结合常数为3.98×106L·mol^(-1),表观速率常数为2.06×104s^(-1),半衰期为3.36×10^(-5)s.本方法简单灵敏安全,对拓宽致癌或致毒小分子与DNA作用的研究方法有参考价值.

关键词：铅笔芯 dsdna 联苯胺双极制界面电位法

青藤碱对狼疮鼠外周血IL-10、TNF-α、抗dsdna抗体表达的影响

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第三军医大学学报 2010年第8期32卷 856-858页

作者：刘剑平卢来春张国元刘增荣杨婧川北医学院附属医院风湿免疫研究所四川南充637000 第三军医大学新桥医院药剂科重庆400038

目的观察青藤碱对NZB/W F1代狼疮鼠外周血中IL-10、TNF-α、抗dsdna抗体表达的影响。方法32只NZB/W F1代狼疮鼠分为4组:对照组、青藤碱40、120、360 mg/(kg.d)剂量组。分别采用ELISA法和Real-Time RT-PCR法检测NZB/W F1代狼疮鼠外周血中... 详细信息

目的观察青藤碱对NZB/W F1代狼疮鼠外周血中IL-10、TNF-α、抗dsdna抗体表达的影响。方法32只NZB/W F1代狼疮鼠分为4组:对照组、青藤碱40、120、360 mg/(kg.d)剂量组。分别采用ELISA法和Real-Time RT-PCR法检测NZB/W F1代狼疮鼠外周血中IL-10、TNF-α、抗dsdna抗体蛋白含量和IL-10、TNF-αmRNA表达。结果3种剂量青藤碱干预3周后,NZB/W F1代狼疮鼠外周血血清中IL-10、TNF-α、抗dsdna抗体蛋白含量和IL-10、TNF-αmRNA表达均较对照组明显降低(P<0.05,P<0.01)。结论青藤碱在一定程度上能减轻NZB/W F1代狼疮鼠的免疫学异常及炎症反应。

关键词：青藤碱白细胞介素-10 肿瘤坏死因子-α dsdna

系统性红斑狼疮患者血清抗Ro/SS-A和La/SS-B抗体中存在抗dsdna独特型抗体

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International Journal of Dermatology And Venereology 1996年第6期22卷 373-374页

作者：王群

抗dsdna抗体在系统性红斑狼疮(SLE)疾病中具有高度特异性,病情的缓解和活动,特别是肾炎同样伴随患者血清中抗dsdna抗体的消长,而产生抗Ro/SS-A、抗La/SS-B和抗U1RNP抗体SLE患者则抗dsdna抗体很少被检出,且狼疮性肾炎发生率亦很低。该文... 详细信息

抗dsdna抗体在系统性红斑狼疮(SLE)疾病中具有高度特异性,病情的缓解和活动,特别是肾炎同样伴随患者血清中抗dsdna抗体的消长,而产生抗Ro/SS-A、抗La/SS-B和抗U1RNP抗体SLE患者则抗dsdna抗体很少被检出,且狼疮性肾炎发生率亦很低。该文作者对抗Ro/SS-A和抗La/SS-B抗体与抗dsdna抗体之间存在的负性关系进行了研究。对抗

关键词： dsdna La/SS-B 独特型抗体 Ro/SS-A 系统性红斑狼疮 SS 患者血清

173例系统性红斑狼疮患者ANA﹑ENA和dsdna抗体的联合检测分析

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中国卫生检验杂志 2012年第4期22卷 781-782页

作者：吴希国刘秀珍马越山东省潍坊市益都中心医院检验科山东青州262500

目的:探讨ANA、ENA和dsdna抗体联合检测在系统性红斑狼疮诊断中的意义。方法:收集173例患者血清,采用间接免疫荧光法检测ANA和dsdna,用免疫印迹法测定ENA。结果:女性患者三种抗体同时阳性的检出率明显高于男性;患者血清中ANA阳性率为94.... 详细信息

目的:探讨ANA、ENA和dsdna抗体联合检测在系统性红斑狼疮诊断中的意义。方法:收集173例患者血清,采用间接免疫荧光法检测ANA和dsdna,用免疫印迹法测定ENA。结果:女性患者三种抗体同时阳性的检出率明显高于男性;患者血清中ANA阳性率为94.8%,抗dsdna抗体为45.1%,抗Sm抗体为32.2%。结论:ANA﹑ENA和dsdna三类抗体在SLE中的敏感性有显著的差异。这三类抗体的联合检测对SLE具有诊断意义。

关键词：系统性红斑狼疮 ANA ENA dsdna