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STAT4基因多态性与中国人群2型糖尿病伴慢性牙周炎的关联性研究

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STAT4基因多态性与中国人群2型糖尿病伴慢性牙周炎的关联性研究

作者：孙元鹏兰州大学

学位级别：硕士

研究背景：2型糖尿病和慢性牙周炎是由遗传和环境因素交互作用而导致的复杂疾病。这两种疾病之间可以相互影响,且都是和炎症有关的慢性疾病。慢性牙周炎己作为糖尿病的第六并发症。信号转导和转录活化因子4（signal transducer and acti... 详细信息

研究背景：2型糖尿病和慢性牙周炎是由遗传和环境因素交互作用而导致的复杂疾病。这两种疾病之间可以相互影响,且都是和炎症有关的慢性疾病。慢性牙周炎己作为糖尿病的第六并发症。信号转导和转录活化因子4（signal transducer and activator of transcription 4,stat4）可以诱发炎症反应。本研究主要探讨STAT4基因的多态性与中国人群中的2型糖尿病（T2DM）、慢性牙周炎（CP）、2型糖尿病伴慢性牙周炎（T2DM＆CP）之间的关联性。方法：本文采用病例-对照研究。样本分为四组,分别是CP组（n=255）、T2DM组（n=235）、T2DM＆CP组（n=215）和健康对照组（n=262）。采用聚合酶链式反应-限制性长度多态性（PCR-RFLP）方法并结合基因测序方法检测STAT4基因的3个SNP位点（rs3821236、rs10168266和rs16833260）基因多态性,所得的结果由SPSS 19.0软件的卡方检验进行差异性检测。通过SHEsis软件进行单倍型类型分析。结果：病例组与健康对照组比较,rs3821236位点的AA基因型在T2DM、 CP和T2DM＆CP中都起到了保护作用[P=0.002,OR=0.430;P=0.002, OR=0.451;P=0.001, OR=0.448]。rs10168266位点TT基因型增加了T2DM和T2DM＆CP的患病风险[P=0.007, OR=1.983;P=0.002, OR=2.249]。rs16833260位点GG基因型在T2DM和T2DM＆CP中起到危险作用[P=6.75e-005,OR=2.630;P=8.07e-005,OR=2.790]。在单倍型分析中发现,AT C在CP、T2DM和T2DM＆CP中是保护性单倍型[P=0.0013,OR=0.527;P=1.77e-010,OR=0.179;P=3.19e-013,OR=0.079]。结论：研究结果表明STAT4基因rs3821236、rs10168266和rsl6833260位点多态性与中国人群2型糖尿病和2型糖尿病伴慢性牙周炎的易感性相关。此外,研究发现rs3821236位点多态性与中国人群慢性牙周炎的易感性相关联。

关键词： 2型糖尿病慢性牙周炎 2型糖尿病伴慢性牙周炎 STAT4基因单核苷酸多态性

STAT4基因多态性与肝硬化发生病因学的相关性研究

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齐齐哈尔医学院学报 2018年第11期39卷 1245-1248页

作者：张莉翟蕙徐葵花刘传苗蚌埠医学院第一附属医院感染性疾病科安徽233000

目的研究信号传导与转录激活因子-4(stat4)基因多态性与肝硬化发生的风险及病因学的相关性。方法本研究纳入209例肝硬化患者,其中118例为乙型病毒性肝炎肝硬化患者、49例为丙型病毒性肝炎肝硬化患者、42例为酒精性肝硬化患者,以及200例... 详细信息

目的研究信号传导与转录激活因子-4(stat4)基因多态性与肝硬化发生的风险及病因学的相关性。方法本研究纳入209例肝硬化患者,其中118例为乙型病毒性肝炎肝硬化患者、49例为丙型病毒性肝炎肝硬化患者、42例为酒精性肝硬化患者,以及200例健康人群为对照组,采用PCR-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测并比较STAT4基因rs7574865位点的基因型分布。结果肝硬化患者rs7574865位点的G等位基因频率均显著高于对照组(OR=1.62,P=0.002),并且隐性模型、显性模型、加性模型分析的分析结果均表明该位点的多态性与肝硬化的发生存在显著的相关性。并且STAT4基因rs7574865位点的G等位基因位点在乙型肝炎肝硬化及丙型肝炎肝硬化与对照组存在显著差异(OR=1.72,P=0.004;OR=1.87,P=0.020);与酒精性肝硬化患者无显著性差异(P=0.480)。结论 STAT4基因中rs7574865等位基因位点G与乙型肝炎肝硬化及丙型肝炎肝硬化的发生呈正相关,即携带有G等位基因位点的个体会增加肝硬化发生的风险性。

关键词： STAT4基因肝硬化多态性 rs7574865 疾病易感性

PRLR和STAT4基因多态性及其与牛生产性状关联性研究

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PRLR和STAT4基因多态性及其与牛生产性状关联性研究

作者：张芬芬南京农业大学

学位级别：硕士

本研究以966头牛为样本(包括3个品种：中国荷斯坦、鲁西黄牛和渤海黑牛),通过PCR-SSCP, PCR-RFLP和DNA测序等方法检测牛PRLR基因和STAT4基因中新的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并将发现的这些SNPs位点及其不同单倍型与牛的生产性状进行关... 详细信息

本研究以966头牛为样本(包括3个品种：中国荷斯坦、鲁西黄牛和渤海黑牛),通过PCR-SSCP, PCR-RFLP和DNA测序等方法检测牛PRLR基因和STAT4基因中新的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并将发现的这些SNPs位点及其不同单倍型与牛的生产性状进行关联性分析,筛查与奶牛产奶性状相关的分子标记,为未来培育高产奶量、高乳蛋白及高乳脂率奶牛提供参考依据。一.(?)PRLR基因多态性与牛生产性状关联性分析催乳素受体(PRLR)在从催乳素到乳蛋白基因的信号通路中起着关键作用。它与催乳素结合后激活JAK2激酶,进而使得stat5转录因子磷酸化随后结合到乳蛋白基因启动子的识别序列上。因此,PRLR可作为奶牛乳蛋白量和乳蛋白率的候选基因。本试验在PRLR基因中发现了12个SNPs位点,其中42054A>G突变产生了Tas Ⅰ的识别位点,通过PCR-RFLP方法酶切分成AA, AG和GG三种基因型。在中国荷斯坦牛群体中,AG基因型为优势基因型,而在鲁西黄牛和渤海黑牛中,GG基因型为优势基因型。另一个42275C>T多态位点可被Msp Ⅰ识别产生三种基因型CC, TC和TT。在中国荷斯坦牛中,CC为优势基因型,而在鲁西黄牛和渤海黑牛中,TT为优势基因型。这2个多态位点在所研究的3个群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。将检测的793头中国荷斯坦奶牛的这两个多态性位点与产奶性状进行了相关性分析,发现其对产奶性状均没有显著影响。进一步地单倍型分析表明：在构建的8种单倍型中,AACC单倍型个体的乳脂率显著高于AGCC、AGTC和GGTC个体(PSTAT4基因多态性与牛生产性状关联性分析信号转导和转录激活因子4(stat4)在乳蛋白基因的表达和乳腺发育中起着重要作用。本试验通过与相关的序列比对,发现了4个新的SNPs位点(g.62624A>C ss175327225, g.60330A>G ss175327226, g.63823G>C ss175327227和g.66912C>T ss175327228)。4个位点中,有2个(g.62624A>C和g.63823G>C)没有在所研究的三个品系中检测到。通过PCR-RFLP方法,突变位点g.60330A>G ssl75327226由内切酶Msp Ⅰ识别切成三种基因型AA, AG和GG。另一个位点g.66912C>T ss175327228通过PCR-SSCP方法仅检测到两种基因型CC和TC。 g.60330A>G位点的等位基因频率在牛的3个品种中存在差异。将检测的793头中国荷斯坦奶牛的STAT4基因的多态性位点与产奶性状进行了相关性分析。g.60330A>G多态位点对奶牛的305天成年产奶当量和乳脂率具有显著性影响(P0.05)。然而,g.66912C>T多态位点与产奶性状没有显著相关性(P>0.05)。因此,STAT4基因的g.60330A>G突变可作为一种分子标记以区别多种群体,并在牛的育种计划中用于产奶量和乳脂率的选择。 g.60330A>G和g.66912C>T多态位点单倍型分析表明：共构建出6种单倍型,AATC和AACC单倍型个体的乳脂率显著高于AGCC单倍型组合个体(P基因组合,可作为未来选育高产奶量和高乳品质牛群的单倍型分子标记。

关键词：肉牛奶牛 PRLR基因 STAT4基因 SNP 产奶性状

STAT4基因与吉林人群强直性脊柱炎关联研究

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中国老年保健医学 2011年第5期9卷 26-30页

作者：杨帆张建佚周林宋玉国张吉林朱小泉张玉荣黄慈波霍正浩杨泽卫生部北京医院北京老年医学研究所 100730 宁夏医科大学基础学院 750004 北华大学附属医院临床免疫研究 132001 北华大学分子生物学教研室 132001

目的探讨STAT4基因与吉林人群强直性脊柱炎(AS)发病风险之间的关联。方法应用病例-对照方法,选取56例吉林强直性脊柱炎患者及年龄、性别匹配的56例吉林正常对照人群为研究对象,采用聚合酶链式反应-高分辨率熔解曲线(PCR-HRM)技术及聚合... 详细信息

目的探讨STAT4基因与吉林人群强直性脊柱炎(AS)发病风险之间的关联。方法应用病例-对照方法,选取56例吉林强直性脊柱炎患者及年龄、性别匹配的56例吉林正常对照人群为研究对象,采用聚合酶链式反应-高分辨率熔解曲线(PCR-HRM)技术及聚合酶链式反应-限制性位点多态性(PCR-RFLP)基因分型,经测序验证,检测STAT4基因4个SNP位点(rs7574865,T)、(rs8179673,T)、(rs7582694,G)及(rs10181656,G)多态性在病例组与对照组间的等位基因及基因型频率的差异,构建单倍型,进行分析。结果①STAT4基因上这4个SNPs位点基因型及基因频率在两组间分布均无显著性差异(P>0.05);②经多位点单倍型频率分布分析后发现,rs8179673位点和rs10181656位点组成的单倍型TG在病例和对照中分布具有显著性差异(P=0.045;OR=3.126,95%CI:0.973-10.044)。结论 rs7574865、rs8179673、rs7582694及rs10181656位点多态性可能与吉林人群强直性脊柱炎的发生无关联性,但rs8179673位点和rs10181656组成的单倍型区域或其侧翼序列可能存在与AS发生真正关联的变异。

关键词： STAT4基因单核苷酸多态性强直性脊柱炎关联

水牛STAT4基因克隆分析及其真核表达载体的构建

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中国畜牧兽医 2016年第8期43卷 1929-1937页

作者：朱鹏庞春英段安琴邓廷贤陆杏蓉梁贤威中国农业科学院广西水牛研究所广西水牛遗传繁育重点实验室南宁530001

为了阐明水牛信号转导子和转录激活子4(signal transducer and activator of transcription 4,stat4)基因在水牛卵泡、胚胎发生及泌乳调节过程中的作用及分子机制,本试验采用了3′-RACE克隆获得STAT4基因,并对其核苷酸序列和蛋白质序列... 详细信息

为了阐明水牛信号转导子和转录激活子4(signal transducer and activator of transcription 4,stat4)基因在水牛卵泡、胚胎发生及泌乳调节过程中的作用及分子机制,本试验采用了3′-RACE克隆获得STAT4基因,并对其核苷酸序列和蛋白质序列进行了信息学分析,通过构建其真核表达载体并转染HEK293T细胞验证所构建载体的准确性。结果表明,水牛STAT4基因编码区长2 247bp,3′-UTR区长268bp,编码748个氨基酸。BLAST分析显示,水牛stat4核苷酸序列与牛、山羊、绵羊、猪、马、犬和人相应序列的同源性分别为99%、99%、99%、95%、93%、93%和92%,系统进化树分析结果表明,STAT4基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性。蛋白质分析结果表明,stat4蛋白呈弱酸性,无信号肽,定位于细胞质,存在stat_int、stat_alpha、stat_bind和SH2_stat4等结构域。microRNA靶标预测显示bta-miR-200a、bta-miR-2429和bta-miR-2410等为stat4 3′-UTR潜在microRNAs。试验成功构建了水牛STAT4基因真核表达载体pEGFPN1-stat4,转染HEK293T后产生较强的绿色荧光信号,表明能够形成stat4-EGFP融合蛋白。

关键词：水牛 STAT4基因克隆生物信息学分析载体构建

信号传导与转录激活因子-4基因rs7574865位点单核苷酸多态性与类风湿关节炎易感性荟萃分析

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中国中西医结合外科杂志 2014年第5期20卷 488-493页

作者：陈啸黄竞敏唐建军天津医院关节镜科天津300211

目的:综合评价信息传导与转录激活因子-4基因(STAT4基因)rs7574865位点单核苷酸多态性与类风湿关节炎易感性的相关性。方法:计算机检索Pubmed、Embase、中国生物医学文献数据库和万方数据库数据库等,并手工检索相关杂志,收集有关不同人... 详细信息

目的:综合评价信息传导与转录激活因子-4基因(STAT4基因)rs7574865位点单核苷酸多态性与类风湿关节炎易感性的相关性。方法:计算机检索Pubmed、Embase、中国生物医学文献数据库和万方数据库数据库等,并手工检索相关杂志,收集有关不同人群STAT4基因rs7574865位点单核苷酸多态性的等位基因频率、基因型频率与类风湿性关节炎易感性相关性的研究,采用stata 12.0软件进行Meta分析;选择的遗传模型包括GT+TT与GG比较,TT与GT+GG比较,TT与GG比较以及等位基因T与G之间比较。结果:STAT4基因rs7574865位点T等位基因频率与类风湿性关节炎易感性可能具有相关性(OR=1.259,95%CI=1.202-1.319,P基因频率与类风湿性关节炎易感性的相关性在欧洲、亚洲、非洲、拉丁美洲人群中有统计学意义;在总体人口中STAT4基因rs7574865位点的基因型与类风湿性关节炎易感性可能具有相关性;在总体人口中STAT4基因rs7574865位点多态性与抗CCP抗体阳性或RF因子阳性类风湿性关节炎易感性仍可能具有相关性。结论:STAT4基因rs7574865位点单核苷酸多态性与类风湿性关节炎易感性可能具有相关性,而且这种相关性可能独立于患者RF因子以及抗CCP抗体水平。

关键词： rs7574865位点 STAT4基因基因多态性类风湿关节炎 Meta分析

stat4、T-bet和IL-2基因多态性与中国汉族人群哮喘的相关性研究

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STAT4、T-bet和IL-2基因多态性与中国汉族人群哮喘的相关性研究

作者：张文静山东大学

学位级别：硕士

[研究背景] 哮喘是由多种炎症细胞(嗜酸性粒细胞、肥大细胞和T淋巴细胞)参与、由IgE介导的慢性炎症性疾病,是一种由遗传因素和环境因素共同作用的多基因遗传病,主要表现为气道高反应性、气道阻塞、气道炎症和气道重构。临床以反复发作... 详细信息

[研究背景] 哮喘是由多种炎症细胞(嗜酸性粒细胞、肥大细胞和T淋巴细胞)参与、由IgE介导的慢性炎症性疾病,是一种由遗传因素和环境因素共同作用的多基因遗传病,主要表现为气道高反应性、气道阻塞、气道炎症和气道重构。临床以反复发作的咳嗽、喘鸣和呼吸困难为主要表现,可自愈或经药物缓解。近年来陆续报道哮喘发生与Th1、Th2细胞分化不平衡有关。stat4(signaltransducer and activator of transcription 4)---T-bet(T-box expressed in T cells)途径与stat6---GATA3途径分别被认为是Th1细胞与Th2细胞分化的两种主要途径。任何一条途径出现异常都会导致Th1/Th2细胞分化异常。已知Th2细胞的分化与哮喘发生密切相关,Th1方向分化减弱或者Th2方向分化增强都将导致免疫调节失常,引起哮喘。2005年,Park等在韩国人群中发现STAT4基因的单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)与哮喘相关,并认为stat4是特异性IgE产生的遗传学因素之一。T-bet是Th1分化的重要转录因子。Susetta等报道T-bet基因缺失的小鼠会发生哮喘。同时在2006年发现,T-bet基因多态位点与美国人群哮喘和气道高反应性相关。2005年在日本人群中也发现,T-bet基因多态位点与药物诱发的哮喘相关。IL-2位于4q27,包含4个外显子,2006年,Ulla Christensen等首次报道IL-2可作为哮喘的候选基因,并在丹麦人群中发现IL-2基因的两个多态位点与IgE介导过敏性疾病相关。上述遗传学研究提示stat4、T-bet和IL-2基因在不同人群中与哮喘和气道高反应性有不同程度的相关性,但到目前为止,上述三个基因在中国汉族人群中与哮喘的相关性尚未见报道。 [研究目的] 利用病例—对照方法探讨stat4、T-bet及IL-2基因的三个多态位点与中国汉族人群哮喘之间的相关性。这些多态位点分别是:STAT4基因启动子区域SNP位点—608 A＞G,T-bet基因—1993 T＞C,IL-2基因启动子区域—92T＞G。 [研究方法] 1.哮喘组与对照组样本收集:收集中国汉族哮喘患者及正常对照个体外周血样,提取基因组DNA。收集的哮喘患者均符合支气管哮喘的诊断标准;正常对照个体均无哮喘及其他过敏性疾病症状与病史,排除肝、肾疾病。 2.基因分型,基因型及等位基因频率统计:用PCR-RFLP方法对STAT4基因—608 A＞G位点分型;用Tetra-primer ARMS-PCR方法对T-bet基因—1993T＞C位点和IL2基因—92 T＞G位点分型。根据琼脂糖凝胶电泳结果确定个体基因型,计算各位点在哮喘组及对照组中的基因型频率及等位基因频率。 3.Hardy-Weinberg平衡吻合度检验:根据Hardy—Weinberg平衡定律计算各多态位点在哮喘组和对照组的预期基因型频率,采用卡方检验进行组间比较。 4.基因型与等位基因分布差异检测:采用卡方检验比较各多态位点在哮喘组与对照组的基因型与等位基因频率差异,检验多态位点与哮喘的相关性。 [结果] 1.STAT4基因多态位点—608 A＞G,在哮喘组中,A/A、A/G、G/G基因型频率分别是0.536、0.377和0.086,在对照组中分别是0.515、0.399和0.086;等位基因A和G的频率在哮喘组分别是0.725和0.275,在对照组分别是0.715和0.285,经χ检验P=0.889。 2.T-bet基因多态位点—1993 T＞C,哮喘组中,T/T、T/C、C/C基因型频率分别是0.630、0.315、0.055,在对照组中分别是0.632、0.324、0.044;等位基因T和C的频率在哮喘组分别是0.788、0.212,在对照组分别是0.794、0.206,经χ检验P=0.837。 3.IL-2基因多态位点—92 T＞G,哮喘组中,T/T、T/G、G/G基因型频率分别是0.344、0.511、0.145,在对照组中分别为0.331、0.532、0.137;等位基因T、G的频率在哮喘组分别为0.599和0.401;在对照组分别为0.597和0.403,经χ检验P=0.894。 [结论] STAT4基因多态位点—608 A＞G,T-bet基因多态位点-1993 T＞C以及IL-2基因多态位点—92 T＞G在中国汉族人群中与哮喘无显著相关,但不排除这三个基因内的其它多态位点与哮喘相关。

关键词：哮喘相关性单核苷酸多态 STAT4基因 T-bet基因 IL-2基因

mtDNA单倍型M/N及核SNP stat4rs3821236与湖南汉族女性SLE的相关性研究

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mtDNA单倍型M/N及核SNP STAT4rs3821236与湖南汉族女性SLE的相关...

作者：王丽中南大学

学位级别：硕士

系统性红斑狼疮（systemic lupus erythematosus,SLE）是一种多重遗传因素和环境因素相互作用的复杂疾病,功能基因筛选法和全基因组关联分析（genome-wide association study, GWAS）是基于查找病例-对照之间存在频率差异的遗传多态性... 详细信息

系统性红斑狼疮（systemic lupus erythematosus,SLE）是一种多重遗传因素和环境因素相互作用的复杂疾病,功能基因筛选法和全基因组关联分析（genome-wide association study, GWAS）是基于查找病例-对照之间存在频率差异的遗传多态性发现疾病易感基因的主要方法,其中最常见的遗传多态性是单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP）,但上述方法存在多中心研究结果不一致等问题,需要反复验证和生物学功能验证。目前发现众多的SLE易感基因,其中信号转导与转录激活因子（signal transducer and activator of transcription4, stat4）因参与SLE的多种免疫紊乱备受关注;另外对凋亡及炎症反应具有重要调节功能的线粒体DNA （mitochondria DNA, mtDNA）在SLE中的探讨较少。在多个独立样本中重复验证stat4SNPs与SLE的关联性及进行深入的生物功能学验证是一项重要任务,同时发现新的可能与SLE相关联的mtDNA多态性是另一项充满吸引力的工作。目的：以湖南地区汉族女性为对象,1)探讨通过特征mtSNPs8701A/G、10398A/G和10400C/T区分的汉族人M和N宏单倍型组之间的SLE风险差异性;2)分析核基因stat4中SNPrs3821236G/A的SLE风险相关性,并初步比较两种SNP基因型携带者之间stat4mRNA的表达水平差异。方法：采用等位基因特异性扩增方法、PCR-RFLP （PCR-restriction fragment length polymorphism）分析进行SLE-对照大样本个体mtDNAM/N分型、stat4rs3%21236等位基因分型,并分析其组间频率分布差异及与SLE各临床表型的相关性。利用qRT-PCR检测SLE及对照外周血有核细胞总stat4,及异构体stat4α、stat4β mRNA表达水平。结果：1)868例女性SLE患者中mtDNA M和N单倍型个体分别为429例（49.4%）、439例（50.6%）,870例对照组中分别为456例（52.4%）、414例（47.6%）,二者无显著性差异（P=0.213）,但与≧50岁的健康对照相比,mtDNAN单倍型频率在≧50岁的SLE病例组升高（59.6%vs41.7%,P=0.042）。进一步分析mtDNA M/N单倍型与SLE起病年龄、有无狼疮肾炎等临床表型的相关性,发现mtDNAN单倍型可能为SLE发生血液系统损害（P=0.000,OR=2.128）、皮肤损害（P=0.000,OR=1.873）、神经系统改变（P=0.000,OR=3.956）及脱发（P=0.044,OR=1.322）的危险因素。2)PCR-PFLP（Ban Ⅰ）方法成功进行了stat4rs3821236G/A等位基因分型。3)475例女性SLE患者中stat4rs3821236AA、AG、GG双等位基因型个体分别为125例（26.3%）、238例（50.1%）、112例（23.6%）,548例健康对照中三种基因型个体分别为105例（19.2%）、249例（45.4%）、194例（35.4%）,两组间A基因型频率分别为51.4%、41.9%,即SLE组stat4rs3821236AA双等位基因型及A基因型频率明显升高（P=8×10-,OR=1.656;P=1.76×10-5, OR=1.466）。同时分析其与SLE发病年龄等临床表型相关性,发现stat4rs3821236A基因型可能增加狼疮肾炎（P=0.026,OR=1.345）、脱发的风险（P=0.000,OR=1.684）。4)与19例正常对照相比,11例活动期SLE患者总stat4mRNA表达升高1.044倍,stat4α升高约1.103倍,而stat4β降低约0.819倍;在11例SLE患者中携带stat4rs3821236风险基因型（AA+AG）的个体总stat4、stat4α、stat4β、mRNA表达水平分别上升2.288倍、1.763倍、1.981倍。结论：1)mtDNA N单倍型增大湖南汉族女性携带者晚发SLE发病风险;并且携带mtDNA N单倍型的患者更容易发生皮肤损害、血液系统损害、神经系统改变及脱发。2)stat4rs3821236A基因型及AA双等位基因型增大湖南汉族女性携带者发生SLE的风险;且stat4rs3821236A基因型增加SLE患者发生狼疮肾炎及脱发风险。

关键词：系统性红斑狼疮单核苷酸多态性 mtDNAM/N单倍型 STAT4基因 stat4α stat4β