检索结果-南通市图书馆

黑龙江畜牧兽医 2022年第19期 125-129,143,144页

作者：陈晓琳王心雨郑帅夏彦玲东北林业大学野生动物与自然保护地学院哈尔滨150040

为了探究梅花鹿1-磷酸鞘氨醇受体1(s1pr1)基因的结构与功能,并为研究s1pr1在鹿茸快速生长机制中发挥的作用提供数据支持,试验利用PCR法对梅花鹿鹿茸的s1pr1基因进行克隆,使用ORF Finder工具查找其ORF,对s1pr1基因进行序列分析并构建系... 详细信息

为了探究梅花鹿1-磷酸鞘氨醇受体1(s1pr1)基因的结构与功能,并为研究s1pr1在鹿茸快速生长机制中发挥的作用提供数据支持,试验利用PCR法对梅花鹿鹿茸的s1pr1基因进行克隆,使用ORF Finder工具查找其ORF,对s1pr1基因进行序列分析并构建系统进化树,利用生物信息学工具对s1pr1编码蛋白的基本理化性质和结构进行初步分析。结果表明:从鹿茸中成功克隆了梅花鹿s1pr1基因,编码序列长度为1149 bp,编码382个氨基酸;梅花鹿s1pr1基因与加拿大马鹿相似性最高。s1pr1蛋白为疏水性不稳定碱性蛋白;无信号肽,不属于分泌蛋白,存在于内质网的概率最大;s1pr1蛋白具有1个7TM结构域、7个跨膜螺旋区;s1pr1蛋白二级结构中无规则卷曲和α-螺旋占比较高,分别为43.72%、40.84%;s1pr1蛋白序列与模板蛋白(7evz.1D)的相似度为93.77%,并且其三级结构模型与加拿大马鹿间的原子位置均方根偏差为0.01;s1pr1蛋白存在39个磷酸化位点、4个N-糖基化位点和1个乙酰化位点;s1pr1基因与细胞迁移的正调控、跨膜信号受体活性等多个生物过程和功能相关并且参与FoxO信号通路、鞘脂信号通路、神经活性配体-受体相互作用信号通路等。说明梅花鹿s1pr1基因编码序列长度为1149 bp,编码382个氨基酸,编码的蛋白质为疏水性不稳定碱性蛋白,可能主要在细胞质中发挥生物学功能,三级结构与加拿大马鹿更为相似。

关键词： s1pr1基因梅花鹿基因克隆生物信息学分析系统进化树

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