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PoreScript:Semi-automated pore size algorithm for scaffold characterization

Bioactive Materials 2022年第7期7卷 1-8页

作者： Dana Jenkins Karim Salhadar Grant Ashby Anita Mishra Joy Cheshire Felipe Beltran Melissa Grunlan Sebastien Andrieux Cosima Stubenrauch Elizabeth Cosgriff-Hernandez Department of Biomedical Engineering University of Texas–AustinAustinTX78712USA Department of Biomedical Engineering Texas A&M UniversityCollege StationTX77843USA Universite de Strasbourg CNRSInstitut Charles Sadron UPR22F-67000StrasbourgFrance Institut für Physikalische Chemie Universitat StuttgartPfaffenwaldring 55D-70569StuttgartGermany

The scaffold pore size influences many critical physical aspects of tissue engineering,including tissue infiltration,biodegradation rate,and mechanical *** measurements of pore sizes from scanning electron micrographs using ImageJ/FIJI are commonly used to characterize scaffolds,but these methods are both time-consuming and subject to user *** semi-automated analysis tools are limited by a lack of accessibility or limited sample size in their verification *** work here describes the development of a new MATLAB algorithm,PoreScript,to address these *** algorithm was verified using three common scaffold fabrication methods(e.g.,salt leaching,gas foaming,emulsion templating)with varying pore sizes and shapes to demonstrate the versatility of this new *** results demonstrate that the pore size characterization using PoreScript is comparable to manual pore size *** PoreScript algorithm was further evaluated to determine the effect of user-input and image parameters(relative image magnification,pixel intensity threshold,and pore structure).Overall,this work validates the accuracy of the PoreScript algorithm across several fabrication methods and provides user-guidance for semi-automated image analysis and increased throughput of scaffold characterization.

关键词： Pore size measurement polymer scaffolds MATLAB program Tissue engineering

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