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作者：钱丹凤安徽医科大学

学位级别：硕士

背景系统性红斑狼疮(SLE)是一种典型的自身免疫性疾病,该疾病以T细胞和B细胞的活化、自身抗体的产生和免疫介导的多系统损伤为特征。临床上以育龄期女性多见,报道的平均男女发病比例为1:9。SLE是一种具有明显的遗传倾向的疾病。然而其... 详细信息

背景系统性红斑狼疮(SLE)是一种典型的自身免疫性疾病,该疾病以T细胞和B细胞的活化、自身抗体的产生和免疫介导的多系统损伤为特征。临床上以育龄期女性多见,报道的平均男女发病比例为1:9。SLE是一种具有明显的遗传倾向的疾病。然而其具体的发病机制尚不明确。近十年来,多种族的GWASs数据发现多种与SLE相关的易感位点。为了揭示更多的SLE易感位点,我们团队做了一个大样本量的跨种族的GWAS Meta分析,然后发现了JAK2,PTPCR基因上的两个非编码变异(分别为rs1887428,rs34889541)均与SLE显著相关。目的本研究中,我们旨在研究JAK2和PTPCR基因的表达水平在病例组与对照组之间是否存在差异,以及探究SLE患者的实验室指标是否与其临床表现相关。方法我们采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测135例SLE患者和130例健康对照的外周血单核细胞(PBMCs)中JAK2和ptprc表达水平的差异。此外,我们通过表达数量性状位点(expression quantitative trait loci,eQTL)研究检测了SNPs对基因表达的调控作用,并利用卡方检验分析了实验室指标与临床参数之间的关系。结果 SLE患者中JAK2基因的mRNA表达水平明显高于健康对照组(P=0.005)。然而,SNP变异rs1887428与JAK2 mRNA表达之间无显著相关性。然而,在SLE病例中,ptprc mRNA表达水平表现出明显的降低(Pptprc基因可能参与SLE的发病。

关键词：系统性红斑狼疮 JAK2 ptprc JAK/STAT通路定量逆转录聚合酶链反应

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TNFα抑制剂治疗JIAU有效性与安全性的系统评价和meta分析及ptprc突变致联合免疫缺陷病2例

TNFα抑制剂治疗JIAU有效性与安全性的系统评价和meta分析及PTPRC...

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作者：李玉璐重庆医科大学

学位级别：硕士

第一部分TNFα抑制剂治疗JIAU有效性与安全性的系统评价和meta分析背景及目的:幼年特发性关节炎相关葡萄膜炎（Juvenile idiopathic arthritis associated uveitis,JIAU）是儿童时期致盲的常见原因。对于局部糖皮质激素及甲氨蝶呤治疗... 详细信息

第一部分TNFα抑制剂治疗JIAU有效性与安全性的系统评价和meta分析背景及目的:幼年特发性关节炎相关葡萄膜炎（Juvenile idiopathic arthritis associated uveitis,JIAU）是儿童时期致盲的常见原因。对于局部糖皮质激素及甲氨蝶呤治疗欠佳的JIAU患者,指南推荐TNFα抑制剂。然而,TNFα抑制剂治疗JIAU的有效性及安全性尚缺乏高级证据支持,本文拟通过系统评价及meta分析对该问题进行探究。方法:通过系统检索Embase、Pubmed、Cochrane library以及Web of science数据库筛选出满足预先制定标准的研究。运用Cochrane偏倚风险评估工具、纽卡斯尔-渥太华量表、JBI清单分别对纳入的随机对照研究、队列研究以及病例系列进行方法学的质量评价。通过去除单项研究法进行敏感性分析。使用亚组分析对异质性的来源进行探讨。本研究以眼内炎症的控制（control of intraocular inflammation,CII）作为首要结局指标,视力及激素的控制作为次要指标。通过meta分析计算不同结局指标的CII合并比（pooled proportion of CII）及95%置信区间。运用I2检验、Q检验、τ2进行异质性分析,当p0时认为存在异质性,当I2>50%时,认为存在较大异质性,选择随机效应模型进行合并,反之选择固定效应模型。当因纳入样本量过少无法进行meta分析时,本研究进行描述性分析或计算率及95%CI。运用Pearson卡方检验判断各组间有无统计学差异。结果:本研究纳入21项符合标准的研究,其中包含3项随机对照研究、3项队列研究、12项病例系列以及3项病案报道,共490名JIAU患者。285名使用阿达木单抗（adalimumab,ADA）、139名使用英夫利昔单抗（infliximab,IFX）、43名使用依那西普（etanercept,ETA）、20名使用戈利木单抗（golimumab,GLM）以及3名使用赛妥珠单抗（certolizumab pegol,CZP）。CII的合并比在使用ADA、IFX、ETA、GLM的患者中分别为83%（95%CI 68%～95%）、61%（95%CI 30%～88%）、39%（95%CI 17%～63%）、65%（95%CI 45～86%）。3名接受CZP治疗的JIAU患者均得到了眼内炎症的控制。ADA与IFX对眼内炎症的控制优于ETA且具有统计学意义（ADA vs ETAχ2=38.861,Pptprc突变致联合免疫缺陷病2例背景及目的:重症联合免疫缺陷病（severe combined immunodeficiency disease,SCID）是由T、B细胞的发育和（或）功能障碍引起的一组疾病。ptprc（亦称为CD45）基因突变可引起SCID。目前,CD45缺陷所致的免疫缺陷病全球仅有4例报道。本研究拟通过对两例ptprc复合杂合突变患儿的临床及免疫特点进行分析,从而扩展CD45缺陷的临床表型谱和免疫表型谱。方法:通过临床资料收集总结患儿临床特点。全外显子测序明确突变位点并进行Sanger测序验证。使用流式细胞术对免疫细胞进行分型探究患儿的免疫特点。通过检索1000 Genome、Ex AC、gnom AD数据库得到突变位点最小等位基因频率。通过NCBI Homolo Gene数据库进行多物种序列比对判断突变位点保守性。通过SIFT、Condel、CADD算法对突变位点有害性进行计算机算法预测。使用Alphafold对蛋白质结构进行预测,通过pymol软件对突变后的结构进行可视化。使用Missense 3D工具进行突变对蛋白结构影响的评估。根据美国医学遗传学与基因组学学会（American

关键词： TNFα抑制剂 JIA相关葡萄膜炎 meta分析免疫缺陷 SCID ptprc CD45

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ptprc(CD45)C77G突变对撒丁尼亚患者多发性硬化的易感性并无影响

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世界核心医学期刊文摘（神经病学分册） 2005年第2期1卷 26-26页

作者： Cocco E. Murru M.R. Melis C. M.G. Marrosu 杜芳 Dipartimento di Neuroscienze Centro Sclerosi Multipla Ospe dale Binaghi Via Is Guadazzonis 2 09126 Cagliari Italy Dr.

A linkage and association of the CD45 (protein tyrosine phosphatase, receptor type C) C77G polymorphism and multiple sclerosis (MS) has been found in some s tudies but not in others. We analysed the C77G polymorphism in MS patients from the genetically homogeneous population of Sardinia. Using the ransmission disequ ilibrium test, the mutation has been sought in 241 patients and 217 healthy sibs (HS) from singleton MS families and it was found in 5 (2.07%) affected and 3 ( 1.38%) HS from 7 heterozygous parents (1.45%). Transmission of the G77 allele was 71.4%(TDT = 1.3, P = 0.26) in patients and 50%(TDT = 0, P = 1) in HS. Str atifying families according to carriage of MS predisposing (DR+) or not predi sposing(DR ) HLA DR DQ genotype in patients, percentage of G77 transmission t o DR+patients was 33 (TDT = 0.33, P = 0.56, Pc = 1.12), while it was 100 (TDT = 4, P = 0.045, Pc = 0.09) in the DR patients. We concluded that, despite the pr esence of CD45 G77 polymorphism in a few patients who did not carry the HLA DR DQ MS predisposing molecules, CD45 did not contribute to development of the d isease in Sardinian MS.

关键词：多发性硬化 CD45)C77G ptprc 撒丁尼亚酪氨酸磷酸酯酶传递率双亲家庭纯合子多态性

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蛋白酪氨酸磷酸酶受体C的免疫功能及其相关疾病研究进展

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中国实用儿科杂志 2023年第3期38卷 228-234页

作者：李玉璐毛华伟重庆医科大学附属儿童医院风湿免疫科、国家儿童健康与疾病临床医学研究中心、儿童发育疾病研究教育部重点实验室、儿童感染免疫重庆市重点实验室重庆400014

蛋白酪氨酸磷酸酶受体C(protein tyrosine phosphatase receptor-type C,ptprc),又称CD45,是仅存在于造血系统有核细胞表面的跨膜糖蛋白。由于外显子的选择性剪接,ptprc存在多种亚型,不同的亚型选择性表达于不同发育阶段和功能状态的细... 详细信息

蛋白酪氨酸磷酸酶受体C(protein tyrosine phosphatase receptor-type C,ptprc),又称CD45,是仅存在于造血系统有核细胞表面的跨膜糖蛋白。由于外显子的选择性剪接,ptprc存在多种亚型,不同的亚型选择性表达于不同发育阶段和功能状态的细胞表面。ptprc的生理功能丰富,在T、B细胞抗原受体信号转导中发挥重要作用,参与T、B细胞发育,还能通过JAK激酶等途径调节细胞因子的产生。此外,ptprc还参与感染性疾病、自身免疫性疾病、重症联合免疫缺陷病以及癌症等多种疾病的发病过程。

关键词： ptprc 抗原受体信号转导淋巴细胞发育自身免疫性疾病原发性免疫缺陷病

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基于生物信息学筛选和分析冒烟型骨髓瘤发生发展的关键基因

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作者：罗启东南昌大学

学位级别：硕士

研究背景和目的:多发性骨髓瘤是种浆细胞恶性克隆性血液系统肿瘤,发病率居于血液系统肿瘤的第二位。冒烟型骨髓瘤是指虽还没有出现骨髓瘤终末器官功能损害但符合多发性骨髓瘤诊断标准的骨髓瘤,也称为无症状性骨髓瘤。绝大部分冒烟型骨... 详细信息

研究背景和目的:多发性骨髓瘤是种浆细胞恶性克隆性血液系统肿瘤,发病率居于血液系统肿瘤的第二位。冒烟型骨髓瘤是指虽还没有出现骨髓瘤终末器官功能损害但符合多发性骨髓瘤诊断标准的骨髓瘤,也称为无症状性骨髓瘤。绝大部分冒烟型骨髓瘤患者最终会进展成为活动性多发性骨髓瘤,但因为发病隐匿、且没有典型症状,所以在尚未进展至出现相关器官功能损害之前,不易被诊断,因此,迫切需要探索冒烟型骨髓瘤发生发展的生物学机制以及寻找早期诊断和预后分层的生物标志物,为延缓冒烟型骨髓瘤进展至活动性骨髓瘤提供帮助。随着基因芯片以及测序技术的发展和普及,使得人们可以从分子生物学水平寻找疾病的发病机制,越来越多的研究人员利用生物信息学方法来研究疾病的发生发展、诊断、治疗以及预后。本研究旨在通过生物信息学方法,利用GEO数据库,对比冒烟型骨髓瘤患者和正常捐献者的CD138阳性浆细胞的表达谱,筛选出二组之间的差异表达基因,以及对差异表达基因进行功能注释、信号通路分析及蛋白质互作网络分析,寻找冒烟型骨髓瘤发展发展的关键基因,并分析其在疾病的进程中的可能作用,为更好地研究冒烟型骨髓瘤提供新的理论依据及方向。研究材料和方法:从基因表达谱数据库GEO中检索并查找含有冒烟型骨髓瘤患者和正常捐献者CD138阳性浆细胞基因芯片表达谱的样本集,选取符合本研究的样本集GSE6477和GSE5900,使用R软件筛选出每个样本集中SMM和正常捐献者的差异表达基因,利用Jvenn在线网站绘制韦恩图对以上两样本集的筛选结果取交集获取共有的差异表达基因,并对其进行基因本体论功能富集分析、KEGG通路分析和蛋白质相互作用网络分析,利用Cytoscape软件的Cytohubba插件进一步筛选出关键基因。最后,利用包含进展型冒烟型骨髓瘤及非进展型冒烟型骨髓瘤患者样本的数据集GSE117847以及Progno Scan数据库分析验证关键基因的相关临床意义。研究结果:1.对GSE6477和GSE5900两个数据集进行分析,共同拥有差异表达基因762个。***功能富集分析显示差异表达基因在生物学过程方面主要富集在细胞与细胞粘附的调节、细胞粘附的正调节、细胞外基质组织、细胞外结构组织、白细胞活化的正调节、细胞活化的正调节、受体介导的内吞作用,在细胞组分方面主要富集在细胞外基质、质膜外侧、细胞-细胞连接、细胞-底物连接、含胶原蛋白,在分子功能方面主要富集在细胞外基质结构组成、肽结合、糖胺聚糖结合、生长因子结合、免疫受体活性、整联蛋白结合。KEGG通路富集分析显示,差异基因主要涉及PI3K-Akt信号通路、Rap1信号通路、造血细胞谱系、补体和凝血级联、细胞粘附分子、ECM-受体相互作用等信号通路。3.利用STRING构建蛋白质相互作用网络图,然后用Cytoscape中的Cyto Hubba插件获取到关键基因7个:CXCL12、APOE、FN1、ITGAM、ATP10B、KIT、ptprc。4.分析关键基因临床相关意义发现ATP10B高表达与冒烟型骨髓瘤进展相关;CXCL12、APOE、FN1、ptprc与多发性骨髓瘤预后相关。结论:在冒烟型骨髓瘤患者中,CXCL12、APOE、FN1、ITGAM、ATP10B、KIT、ptprc等基因可能在该疾病的发生发展过程中发挥着至关重要的作用。

关键词：冒烟型骨髓瘤多发性骨髓瘤生物信息学 ATP10B CXCL12 APOE FN1 ptprc

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