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THE QSAR RESEARCH ON AURONE INHIBITORS OF HEPATITIS C VIRUS RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE BY APPLYING MULTI-DIMENSIONAL SCALING method

引用

International Journal of Biomathematics 2013年第1期6卷 23-39页

作者： YONG-HONG HU BAO-HUA ZHANG School of StatisticsCentral University of Financial and Economics Beijing 100081 P. R. China Supercomputing CenterComputer Network Information Center Chinese Academy of Sciences Beijing 100190 P. R. China

In this paper, we take naturally occurring 2-benzylidenebenzofuran-3-ones （aurones） inhibitors of hepatitis C virus （HCV） RNA-dependent RNA polymerase （RdRp） as an example to study the Multi-dimensional scaling （mds） method for structure-activity relationship. By analyzing training set molecules, our mds method combined with a PROXSCAL algorithm can predict inhibitory activity of most compounds correctly. Thus, a new sample＇s activity can be estimated and judged conveniently, and whether it should be synthesized can be known. The mds method is applicable to optimize the structure for a compound and to provide suggestions for drug design.

关键词： HCV inhibitor structure-activity relationship mds method PROXSCAL algorithm.

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