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Research of Genetic Diversity in Seven kobresia by AFLP in Tibetan Plateau

Agricultural Sciences in China 2009年第8期8卷 994-999页

作者： ZHENG Hong-mei HU Tian-ming WANG Quan-zhen ZHANG Guo-yun SONG Jiang-hu College of Resources and Environment Northwest A＆F University Yangling 712100 P.R. China College of Animal Science and Technology Northwest A＆F University Yangling 712100 P.R.China Key Laboratory of Agricultural Molecular Biology of Shaanxi Province Yangling 712100 P.R.China

This work analyzed the genetic diversity of kobresia accessions at the molecular level, and further obtained the necessary information for breeding and germplasm evaluation. Genomic DNA of kobresia was amplified with four E＋3 and M＋3 primer combinations with AFLP （amplified fragment length polymorphism）. AFLP analysis produced 164 scorable bands, of which 154 （93.96%） were polymorphic. The mean Nei＇s gene diversity index （H） was 0.2430, and the Shannon＇s information index （I） was 0.4012, indicating the abundant genetic diversity of kobresia. The 11 kobresia accessions from Tibetan Plateau, China, can be classified into five groups after cluster analysis based on the UPGMA （unweigbted pair group method arithmetic average） method. In general, there was abundant genetic diversity among kobresia accessions resources, and the genetic coefficient was unrelated to their geographic latitude. Natural habitats influenced genetic differentiation of kobresia.

关键词： kobresia genetic diversity AFLP

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Effect of chemical treatments on seed germination and early seedling growth of kobresia

Effect of chemical treatments on seed germination and early ...

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第十八届中国科协年会——分14 西北地区农牧结合发展草牧业研讨会

作者： Xuhu ZHANG Xitong CHU Yuefei XU Department of Grassland Science College of Animal Science and Technology Northwest A&F University

Seeds of kobresia, which grow on Qinghai-Tibet plateau, China, are known for poor performance in germination and early seedling development. In this study, we investigated the effect of chemicals on seed germination and early seedling growth in five species of kobresia seeds(kobresia setchwanensis, kobresia royleana, kobresia littledalei, kobresia capillifolia and kobresia pygmaea). To assess the actual germination level, we performed germination experiments comparing the behaviors of seeds without any treatment, and tests showed the inherent differences among various species. Pretreatments of these seeds with sodium hydroxide(Na OH), potassium nitrate(KNO3) and sulfuric acid(H2SO4) also been tested and turned out that the best method to enhance germination performance for K. setchwanensis, K. littledalei and K. pygmaea was to immerse seeds in 40% Na OH solution. All the five species of kobresia had longer shoot lengths with treatments of higher Na OH solution concentration. Moreover, KNO3 and H2SO4 do have influence on kobresia seed germination and seedling growth in some specific species. These results suggested that all the chemicals involved had impacts on germination performance, further promoted the early seedling growth of almost all the selected seeds.

关键词： kobresia Qinghai-Tibet Plateau germination seedling growth

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青藏高原嵩草属(kobresia)八种植物的形态-生态学特性的初步研究

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Journal of Integrative Plant Biology 1979年第2期 135-142页

作者：周兴民青海生物研究所

本文通过对嵩草属8种植物的形态-生态学特性的初步研究,论证了植物对高原高寒气候的适应方式和途径。嵩草具有明显的耐寒性以及旱生和中生特征,耐寒性是共同的,而旱生性状是“生理干旱”影响的反映,结合嵩草所处的环境,说明嵩草属于耐... 详细信息

本文通过对嵩草属8种植物的形态-生态学特性的初步研究,论证了植物对高原高寒气候的适应方式和途径。嵩草具有明显的耐寒性以及旱生和中生特征,耐寒性是共同的,而旱生性状是“生理干旱”影响的反映,结合嵩草所处的环境,说明嵩草属于耐寒中生植物范畴。

关键词：植物植物群落建群种表皮细胞 kobresia 青藏高原青藏现代强烈隆起区生态学特性

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基于RNA-seq的西藏嵩草转录组分析

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林业科技通讯 2017年第7期 27-32页

作者：宁宇董树斌武高洁王义飞马骅索朗夺尔基中国林业科学研究院湿地研究所北京100091 四川若尔盖高寒湿地生态系统国家定位观测研究站四川若尔盖624500 湿地生态功能与恢复北京市重点实验室北京100091 北京林业大学生物学院四川若尔盖湿地国家级自然保护区管理局四川若尔盖624500

嵩草属植物是青藏高原及其周边地区高寒草甸的建群种,分蘖能力强、根系发达,耐寒,是优良的牧草资源。目前对该类植物转录组情况的研究相对不足。该文采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术,对西藏嵩草(kobresia tibetica)茎、叶、花及... 详细信息

嵩草属植物是青藏高原及其周边地区高寒草甸的建群种,分蘖能力强、根系发达,耐寒,是优良的牧草资源。目前对该类植物转录组情况的研究相对不足。该文采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术,对西藏嵩草(kobresia tibetica)茎、叶、花及果实的混合样进行转录组分析。经拼接组装共获得63 837个Unigene,序列平均长度890.1bp,N50为1 342bp。将Unigene序列与5个主要的公共数据库(NR,Swiss-Prot,KEGG,GO,KOG)进行比对(Evalue<1e-5),共有40 705条Unigene获得了基因注释,占总Unigene的63.76%。通过KEGG pathways分析,共有10 043Unigene参与了274个代谢通路,获得了西藏嵩草分蘖和抗寒相关Unigene 179个。在15 044条Unigene中共搜索到5 310个SSR位点,其中二核苷酸和三核苷酸的重复类型占所有SSR位点的94.63%。这些数据为嵩草相关基因的发掘和SSR分子标记开发提供了重要依据。

关键词：西藏嵩草 kobresia tibetica 转录组 RAN-seq 基因注释 SSR

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