检索结果-南通市图书馆

孔雀球虫的分子鉴定及其its rRNA基因序列分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

动物医学进展 2023年第6期44卷 139-142页

作者：张誉方刘永张贺君君邹丰才杨建发云南农业大学动物医学院云南昆明650201 云南省昆明动物园云南昆明650021

为了解云南省昆明市孔雀感染球虫的种类及种属关系,采集昆明市2个动物园孔雀粪便样品及肠道内容物样本进行球虫卵囊的收集,进行形态学鉴定,PCR扩增球虫its rRNA基因,测序和序列分析,并利用MEGA6.0软件构建遗传系统进化树。结果显示,扩增... 详细信息

为了解云南省昆明市孔雀感染球虫的种类及种属关系,采集昆明市2个动物园孔雀粪便样品及肠道内容物样本进行球虫卵囊的收集,进行形态学鉴定,PCR扩增球虫its rRNA基因,测序和序列分析,并利用MEGA6.0软件构建遗传系统进化树。结果显示,扩增的its rRNA基因序列长度为492 bp和493 bp,共鉴定出2种球虫,分别为和缓艾美耳球虫(Eimeria mitis)和火鸡和缓艾美耳球虫(E.meleagrimitis),相似度均为100%;进化分析结果表明,孔雀和火鸡之间可能存在球虫的交叉感染风险。该研究结果丰富了野生雉类寄生虫病的资料。

关键词：孔雀球虫 its基因基因序列分析

刺参养殖池塘一种小头虫的分类鉴定及遗传多样性分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国水产科学 2024年第4期31卷 476-487页

作者：赵宏晶王印庚葛建龙廖梅杰李彬荣小军王锦锦袁春营崔青曼常玉松施国军天津科技大学海洋与环境学院中国水产科学研究院黄海水产研究所海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室东营万德海水养殖装备有限公司东营市河口区科学技术局

为明确刺参养殖池塘大量出现的一种潜在敌害生物种类以及不同养殖区域的遗传关系,本研究采用形态学和分子生物学方法确定了小头虫的种类,并基于18S rDNA、CO I和its基因序列,对山东东营和青岛两个地理群体的遗传多样性及遗传结构进行解... 详细信息

为明确刺参养殖池塘大量出现的一种潜在敌害生物种类以及不同养殖区域的遗传关系,本研究采用形态学和分子生物学方法确定了小头虫的种类,并基于18S rDNA、CO I和its基因序列,对山东东营和青岛两个地理群体的遗传多样性及遗传结构进行解析,结果显示,虫体外观呈红色,长7.94～25.27 mm,宽0.65～0.94 mm,头部呈圆锥状或钝圆形;胸部九个胸节,前七胸节具毛状刚毛;雄体在第八、九胸节具有钩状生殖棘;雌体在腹部具成对的卵巢;身体背部圆形,腹部较扁平,后腹部无鳃;尾部末端具肛门。基于线粒体COI基因系统发育树和序列比对,发现其与Capitellateleta聚为一支且序列相似性为99.11%。结合形态学特征及COI基因分析结果,确定山东刺参养殖池塘的小头虫为C. teleta。不同地区小头虫的遗传进化分析结果显示,中国山东C. teleta和韩国C. teleta以及日本C. teleta的亲缘关系最近,进一步说明刺参养殖池塘中的小头虫为C. teleta。东营和青岛小头虫群体的遗传多样性和AMOVA分析结果显示,东营群体遗传多样性高于青岛群体,两个地理群体的亲缘关系较远,两个群体存在一定程度的遗传分化。研究结果明确了刺参养殖池塘中小头虫的种类以及不同养殖区域小头虫群体的遗传关系,为构建刺参健康养殖技术提供了科学依据。

关键词：海参小头虫形态学 CO I基因 18S rDNA its基因

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

仰口线虫PCR检测方法的建立及应用

动物医学进展 2024年第6期45卷 15-19页

作者：周璐露要慧中刘天缘张佳琳马丽任洪英杨钰莹林青西北农林科技大学动物医学院陕西杨凌712100 炉霍县农牧农村和科技局四川炉霍626500

为特异性检测羊感染仰口线虫的情况,基于仰口线虫its基因序列设计特异性引物,进行退火温度及反应条件的优化,建立其属特异性PCR检测方法。应用该方法对仰口线虫、食道口线虫、毛尾线虫、捻转血矛线虫、细颈线虫、奥斯特线虫、夏伯特线... 详细信息

为特异性检测羊感染仰口线虫的情况,基于仰口线虫its基因序列设计特异性引物,进行退火温度及反应条件的优化,建立其属特异性PCR检测方法。应用该方法对仰口线虫、食道口线虫、毛尾线虫、捻转血矛线虫、细颈线虫、奥斯特线虫、夏伯特线虫、筒线虫、毛圆线虫的DNA样本进行扩增,仅能特异性扩增出仰口线虫的目的条带;该方法成功从仰口线虫中扩增出约500 bp的特异性片段,最低检测浓度为3.6×10^(3)copies/μL;该PCR检测方法对临床奶山羊粪便样品的检测结果显示,羊粪便样品中仰口线虫卵的阳性率为10%,且与显微镜镜检所得的结果一致。结果表明,建立的仰口线虫PCR检测方法敏感性较高且特异性良好,可以应用于临床羊粪便样品中仰口线虫的虫卵检测,为羊仰口线虫病的诊断与防治提供了一种技术支持。

关键词：山羊仰口线虫聚合酶链反应 its基因虫卵检测

中日产川芎的matK、its基因序列及其物种间的亲缘关系

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

药学学报 2002年第1期37卷 63-68页

作者：刘玉萍曹晖韩桂茹伏见裕利小松かつ子中国中医研究院中药研究所北京100700 国家中药现代化工程技术研究中心广东珠海519020 河北省药品检验所河北石家庄050011 富山医科药科大学和汉药研究所药效解析中心

目的　分析中国产川芎LigusticumchuanxiongHort.及日本产川芎CnidiumofficinaleMakino的核基因组its和叶绿体基因组matK序列 ,为探讨中日产川芎物种间的亲缘关系提供分子依据。方法　采用PCR直接测序技术测定川芎和日本川芎的its基因和... 详细信息

目的　分析中国产川芎LigusticumchuanxiongHort.及日本产川芎CnidiumofficinaleMakino的核基因组its和叶绿体基因组matK序列 ,为探讨中日产川芎物种间的亲缘关系提供分子依据。方法　采用PCR直接测序技术测定川芎和日本川芎的its基因和matK基因核苷酸序列并作序列变异分析。结果　川芎和日本川芎的matK序列长度均为 12 68bp ,编码 4 2 2个氨基酸。its1 5 8S its2序列长度均为 699bp ,其中 18SrRNA基因 3′端序列 5 4bp ,its1序列 2 15bp ,5 8SrRNA基因序列 162bp ,its2序列 2 2 2bp ,2 6SrRNA基因 5′端序列 4 6bp。根据排序比较 ,川芎原植物与其商品药材间的matK基因和its基因序列完全相同 ,而川芎与日本川芎间matK基因则仅有 1个变异位点 ,即在上游 95 9nt处 1个转换替代 (T→C) ,反映在氨基酸序列则发生一个非同义取代V(GTG)→A(GCG) ;its基因也仅有 1个变异位点 ,即在its1上游 5 4nt处 1个转换替代 (T→C)。结论　通过进化速率较快的基因序列同源性分析 ,基本可以认为中日所产川芎基原一致 ,日本川芎学名似应改为LigusticumchuanxiongHort.

关键词：川芎日本川芎 matK基因 its基因核苷酸测序

利用its基因研究徐闻滨珊瑚的系统发生关系

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

海洋科学 2012年第7期36卷 56-60页

作者：李文娟刘楚吾刘丽廖宝林广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室广东湛江524025 徐闻珊瑚礁国家级自然保护区广东湛江524100

分别研究了徐闻3种滨珊瑚的its1和its2基因的碱基组成和G+C含量,并和已上传至Genbank上的其他9种滨珊瑚的its序列进行比较,研究了徐闻3种滨珊瑚的系统发生关系。序列分析结果显示,3种滨珊瑚的its1的长度为205 bp～209 bp,G+C含量为37.6%... 详细信息

分别研究了徐闻3种滨珊瑚的its1和its2基因的碱基组成和G+C含量,并和已上传至Genbank上的其他9种滨珊瑚的its序列进行比较,研究了徐闻3种滨珊瑚的系统发生关系。序列分析结果显示,3种滨珊瑚的its1的长度为205 bp～209 bp,G+C含量为37.6%～45.5%,its2的长度为192 bp～226 bp,G+C含量为45.1%～50.7%,利用MEGA4.1软件计算滨珊瑚属基于its1和its2基因的平均遗传距离分别为0.097和0.200。基于its1和its2的NJ系统进化树都显示出,灰黑滨珊瑚位于进化树的基部,是原始的类群,普格滨珊瑚是进化类群,澄黄滨珊瑚是过渡类群。

关键词：滨珊瑚 its基因系统发生关系

基于its基因分析黑斑蛙裂头蚴种系发育关系

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国兽医学报 2017年第10期37卷 1924-1927页

作者：谭磊王爱兵周湘刘雪松孔小鲜刘伟湖南农业大学动物医学学院湖南长沙410128 湖南生物机电职业技术学院湖南长沙410127

为了研究黑斑蛙裂头蚴种系发育关系,本研究利用聚合酶链式反应(PCR)对黑斑蛙裂头蚴湖南株核糖体DNA内转录间隔区(its)进行扩增与测序,应用ClustalX 2.0程序对序列进行比对,再利用Mega4.0程序进行NJ法绘制种系发育树,研究黑斑蛙裂头蚴与... 详细信息

为了研究黑斑蛙裂头蚴种系发育关系,本研究利用聚合酶链式反应(PCR)对黑斑蛙裂头蚴湖南株核糖体DNA内转录间隔区(its)进行扩增与测序,应用ClustalX 2.0程序对序列进行比对,再利用Mega4.0程序进行NJ法绘制种系发育树,研究黑斑蛙裂头蚴与其他带科绦虫的种群遗传关系。结果显示,湖南省不同地区10个黑斑蛙裂头蚴分离株its序列基本一致,为1 362~1 382bp,各分离株之间its-1和its-2序列的同源性均高于95.4%和94.6%;与基因库中其他带科绦虫its-1和its-2序列的同源性均低于59.5%和56.9%。通过建立NJ系统发育树,湖南省黑斑蛙裂头蚴分离株与欧猬迭宫绦虫位于同一大分支,得到了很好的鉴定。黑斑蛙its序列在种内相对保守,而种间差异较大,因此its序列可以作为分子标记研究黑斑蛙裂头蚴种系遗传变异,从而为黑斑蛙裂头蚴的分子流行病学和群体遗传研究奠定基础。

关键词：黑斑蛙裂头蚴核糖体DNA its基因序列分析种系发育关系

基于its基因、Actin基因和EF-1α基因序列的新疆向日葵黑茎病菌亲缘关系分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

植物检疫 2013年第5期27卷 50-56页

作者：刘启鹏赵思峰吴品珊杜洪忠张海燕王志霞新疆石河子大学新疆石河子832003 中国检验检疫科学研究院

对不同地理来源的向日葵黑茎病菌的its基因、Actin基因和EF基因进行测序,结合GenBank中的同源序列,对这3种基因的序列进行比对分析和系统进化分析,探讨its、Actin以及EF基因用于向日葵黑茎病菌的种内鉴定以及其系统进化的可行性。结果表... 详细信息

对不同地理来源的向日葵黑茎病菌的its基因、Actin基因和EF基因进行测序,结合GenBank中的同源序列,对这3种基因的序列进行比对分析和系统进化分析,探讨its、Actin以及EF基因用于向日葵黑茎病菌的种内鉴定以及其系统进化的可行性。结果表明:its序列和Actin序列比较保守,无法作为种内鉴定的依据。EF基因序列其变异几率比较高,不同地理来源的菌株在EF-1α基因序列上表现出了比较大的差异,可以用于种内亲缘关系的研究。

关键词：向日葵黑茎病基因序列亲缘关系 its基因 Actin基因 EF-1α基因

棕囊藻渤海株核糖体18SrDNA和its基因结构序列分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

海洋科学进展 2008年第2期26卷 200-206页

作者：曲凌云吕颂辉高春蕾李艳孙萍孙修勤国家海洋局第一海洋研究所暨南大学赤潮与水环境研究中心广东广州510632

对分离自渤海赤潮发生区的1株棕囊藻进行核糖体18S rDNA及its序列克隆测定,获得了长度为1 648bp的18S rDNA序列和长度为890 bp的its序列。对获得的基因序列进行同源性分析,结果表明,该棕囊藻的核糖体18S rDNA及its序列均与NCBI数据库中... 详细信息

对分离自渤海赤潮发生区的1株棕囊藻进行核糖体18S rDNA及its序列克隆测定,获得了长度为1 648bp的18S rDNA序列和长度为890 bp的its序列。对获得的基因序列进行同源性分析,结果表明,该棕囊藻的核糖体18S rDNA及its序列均与NCBI数据库中登录的球形棕囊藻的相应序列同源性最高;从GenBank中获取不同地理来源的19种棕囊藻的18S rDNA序列及6种棕囊藻的its序列,分别以棕囊藻核糖体18S rDNA和its为对象构建了棕囊藻属的系统发育树,从分子生物学角度确定了棕囊藻渤海株为球形棕囊藻(Phaeocystis globosa)。

关键词：棕囊藻 18S rDNA基因 its基因系统发育分析

牛瑟氏泰勒虫its基因PCR诊断方法的建立

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国畜牧兽医 2012年第8期39卷 80-82页

作者：王轶男贾立军薛书江张影钱年超张守发延边大学农学院动物医学系吉林延吉133002

本试验根据GenBank上登录的牛瑟氏泰勒虫its基因序列(AY661522.1),应用Primer Premier 5.0和Oligo 6.31软件设计合成1对特异性引物,以牛瑟氏泰勒虫DNA为模板,建立了牛瑟氏泰勒虫its基因PCR诊断方法。该方法扩增片段大小为1020 bp,与参... 详细信息

本试验根据GenBank上登录的牛瑟氏泰勒虫its基因序列(AY661522.1),应用Primer Premier 5.0和Oligo 6.31软件设计合成1对特异性引物,以牛瑟氏泰勒虫DNA为模板,建立了牛瑟氏泰勒虫its基因PCR诊断方法。该方法扩增片段大小为1020 bp,与参考序列的同源性为98%;建立的PCR方法与猪附红细胞体、犬新孢子虫和弓形虫均无交叉反应,最低DNA检出量为1.5 pg/μL;通过对60份临床样品的检测,并与血涂片方法进行比较,结果显示PCR方法具有特异、敏感等特点,适用于牛瑟氏泰勒虫的检测。

关键词：牛瑟氏泰勒虫 its基因 PCR