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eb病毒BZLF1基因表位疫苗的预测及构建

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中国病原生物学杂志 2023年第1期18卷 12-18页

作者：丁一李昆芳薛庆节屈艳琳济宁医学院基础医学院山东济宁272067 济宁医学院形态学实验室

目的采用生物信息学方法预测eb病毒BZLF1基因编码蛋白的结构、抗原表位及疫苗的初步构建,为eb病毒相关疾病的疫苗的研制提供依据。方法通过NCBI获得eb病毒BZLF1蛋白的核苷酸序列和氨基酸序列,采用ORF Finder、Protparam、SOPMA、DTU H... 详细信息

目的采用生物信息学方法预测eb病毒BZLF1基因编码蛋白的结构、抗原表位及疫苗的初步构建,为eb病毒相关疾病的疫苗的研制提供依据。方法通过NCBI获得eb病毒BZLF1蛋白的核苷酸序列和氨基酸序列,采用ORF Finder、Protparam、SOPMA、DTU Health Tech、TMHMM-2.0、Cell-PLoc 2.0、NetPhos 3.1 Servera、NetNGlyc、SWISS MODE、Immunomedicine Group、IEDB、BLAST、Uniprot等生物信息学软件对eb病毒BZLF1蛋白的理化性质、亲疏水性、结构域、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、磷酸化及糖基化位点、二级结构、三级结构、抗原决定簇、B细胞与T细胞抗原表位、蛋白同源性及相互作用蛋白进行预测分析。在T4DNA连接酶作用下连接BZLF1基因与穿梭表达载体pMV261,对连接产物进行PCR及双酶切鉴定。结果 BZLF1蛋白是由245个氨基酸组成的亲水蛋白,分子式为C_(1185)H_(1850)N_(332)O_(366)S_(8),相对分子质量为26.860×10^(3),理论等电点为5.25,脂肪族氨基酸指数为71.35,平均亲水系数为-0.529;该蛋白二级结构以无规则卷曲居多,占51.84%,无信号肽和跨膜区,存在18个磷酸化位点,2个糖基化位点,含有1个碱性亮氨酸拉链结构。预测该蛋白有9个抗原决定簇,8个B细胞优势抗原表位,9个CTL细胞优势表位,8个Th细胞表位,与人类环状amp反应元件结合蛋白相似度为6.12%,同源性较低。PCR及双酶切鉴定含BZLF1基因的pMV261载体构建正确。结论生物信息学预测BZLF1属于亲水蛋白,热稳定性较好。该蛋白含有多个磷酸化位点可参与相关信号通路,对疾病的发展起到重要作用。BZLF1含有多个B、T细胞抗原表位,且与人体蛋白同源性低,不易发生免疫交叉反应,可作为eb病毒候选疫苗表位。

关键词： eb病毒 BZLF1 生物信息学抗原表位

非高发区人群中血浆eb病毒DNA对鼻咽癌的筛查及临床应用价值

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中华检验医学杂志 2022年第4期45卷 381-387页

作者：贺巧李贤兵李罗娜黄叶才周杰王秋菊兰美罗皓吴立春张莉宋晓玉杨牧王东生四川省肿瘤医院·研究所四川省癌症防治中心检验科电子科技大学医学院成都610000 四川省肿瘤医院·研究所四川省癌症防治中心放疗中心电子科技大学医学院成都610000 四川省肿瘤医院·研究所肿瘤基础研究中心电子科技大学医学院成都610000

目的探讨非高发区人群血浆eb病毒(ebV)DNA检测对鼻咽癌筛查的价值及临床应用。方法回顾性分析2015年11月至2020年7月就诊于四川省肿瘤医院的1153例初治鼻咽癌和244例性别年龄相匹配的健康正常人血浆ebV DNA检测结果。用实时荧光定量PCR... 详细信息

目的探讨非高发区人群血浆eb病毒(ebV)DNA检测对鼻咽癌筛查的价值及临床应用。方法回顾性分析2015年11月至2020年7月就诊于四川省肿瘤医院的1153例初治鼻咽癌和244例性别年龄相匹配的健康正常人血浆ebV DNA检测结果。用实时荧光定量PCR法检测ebV DNA。分别以400拷贝/ml为临界值判断(≥400拷贝/ml判定为阳性)和优化临界值方法(将有S型扩增者均判定为阳性)统计ebV DNA阳性率。比较不同临床分期、TNM分期的患者血浆中ebV DNA拷贝数分布特征,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析2种临界值判定方法对鼻咽癌的诊断价值。结果初治鼻咽癌组血浆ebV DNA明显高于正常对照组(PebV DNA水平比较,差异有统计学意义(PebV DNA阳性率有升高趋势(P均ebV DNA对鼻咽癌诊断的敏感度为40.9%,特异度为100%,曲线下面积为0.704(95%CI 0.676~0.733,PebV DNA以400拷贝/ml为检出下限,鼻咽癌诊断的敏感度仅为40.9%,可考虑优化核酸提取方法,从检测技术上落实临界值的优化,在保证诊断特异度的基础上提高诊断的敏感度。

关键词：鼻咽肿瘤 eb病毒 DNA 临床实验室技术

Hsa_circ_0001459在eb病毒感染者外周血单个核细胞中的表达水平及其临床意义

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中华微生物学和免疫学杂志 2023年第12期43卷 969-976页

作者：梁兴东闭婉英王万平龙涌文赵锦唐石伏柳州市人民医院检验科柳州545006 广西中医药大学研究生院南宁530200

目的检测hsa_circ_0001459在eb病毒(Epstein-Barr virus,ebV)感染者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中的表达水平,判断其对ebV感染者的诊断价值。方法全转录组测序获得ebV感染者PBMC中差异表达circRNAs表达谱,根据∣log2差异倍数∣≥1且PebV感染者和45例健康对照者PBMC中hsa_circ_0001459的相对表达量;受试者工作特征(ROC)曲线和Kappa分析其对ebV感染者的诊断价值。结果与健康对照组相比,hsa_circ_0001459在ebV感染者中表达上调趋势与测序结果一致;其曲线下面积为0.83(95%CI为0.75~0.91),敏感度为0.80(95%CI为0.66~0.89),特异度为0.77(95%CI为0.65~0.86)。Kappa分析结果表明,hsa_circ_0001459与ebV DNA对判断ebV感染有中度一致性(κ=0.51)。结论Hsa_circ_0001459在ebV感染者PBMC中高表达,可能成为ebV感染者的诊断标志物。

关键词： eb病毒 Hsa_circ_0001459 外周血单个核细胞诊断

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eb病毒感染和儿童皮肤病相关性研究

临床皮肤科杂志 2022年第12期51卷 718-720页

作者：李敏谢骏逸杨苏宋闯张红叶王申杨潇孙晨吴红巾董青邵冰洁南京医科大学附属儿童医院皮肤科江苏南京210008 南京医科大学第一附属医院皮肤性病科江苏南京210029

目的:回顾性分析儿童皮肤病与eb(Epstein Barr virus,eb)病毒感染相关性。方法:南京医科大学附属儿童医院门诊就诊和收治入院患儿552例为病例组,病种包括荨麻疹、多形红斑、过敏性紫癜、系统性红斑狼疮、虫咬皮炎、皮肌炎及丘疹性肢端... 详细信息

目的:回顾性分析儿童皮肤病与eb(Epstein Barr virus,eb)病毒感染相关性。方法:南京医科大学附属儿童医院门诊就诊和收治入院患儿552例为病例组,病种包括荨麻疹、多形红斑、过敏性紫癜、系统性红斑狼疮、虫咬皮炎、皮肌炎及丘疹性肢端皮炎等,儿童保健科体检119例患儿为对照组。回顾性分析病例组和对照组血清中代表eb病毒近期感染的指标衣壳抗原IgM抗体(VCA-IgM)和反映机体内病毒的复制情况eb-DNA的水平,比较这两个指标在两组之间差异。结果:与对照组相比,荨麻疹、多形红斑、过敏性紫癜、系统性红斑狼疮、虫咬皮炎、皮肌炎及丘疹性肢端皮炎这几类皮肤病eb感染率较高,差异均有统计学意义。结论:eb病毒感染可能参与多种皮肤病发病过程,在这些疾病治疗时需考虑eb病毒感染的因素。

关键词： eb病毒儿童皮肤病

异基因造血干细胞移植治疗Wiskott-Aldrich综合征继发eb病毒相关平滑肌肉瘤1例

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中华儿科杂志 2023年第5期61卷 464-466页

作者：玄立田冯顺乔杨吉刚李君惠张朝霞刘嵘首都儿科研究所附属儿童医院血液内科北京100020 首都医科大学附属北京友谊医院核医学科北京100050

患儿男,1月龄出现湿疹,4月龄时发现血小板减少,1岁5月龄全外显子测序发现WAS基因半合子突变,WAS蛋白阴性,诊断Wiskott-Aldrich综合征(WAS),间断予糖皮质激素及丙种球蛋白等治疗5年余。6岁余出现肝脏肿大,影像学提示为肝脏多发结节,肺、... 详细信息

患儿男,1月龄出现湿疹,4月龄时发现血小板减少,1岁5月龄全外显子测序发现WAS基因半合子突变,WAS蛋白阴性,诊断Wiskott-Aldrich综合征(WAS),间断予糖皮质激素及丙种球蛋白等治疗5年余。6岁余出现肝脏肿大,影像学提示为肝脏多发结节,肺、脾、淋巴结同时受累,完善肝脏结节穿刺活检,诊断为eb病毒相关平滑肌肉瘤;7岁余予后置环磷酰胺方案单倍体异基因造血干细胞移植治疗,随访1年,患儿免疫功能恢复,肿瘤得到控制。

关键词：平滑肌肉瘤异基因造血干细胞移植 eb病毒半合子糖皮质激素穿刺活检全外显子测序丙种球蛋白

eb病毒潜伏感染的HIV/AIDS患者临床特点及免疫特征分析

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中国艾滋病性病 2023年第4期29卷 383-387页

作者：王大刚李韦杰金方方宋淑静郭晶晶刘颖李晓慧王雅杰首都医科大学附属北京地坛医院检验科北京100015

目的通过分析HIV/AIDS患者eb病毒(ebV)潜伏感染的临床特点和免疫特征,探讨ebV潜伏感染对HIV/AIDS患者的影响。方法收集确诊HIV/AIDS患者的血液标本进行检测,并回顾性分析患者的临床资料。ebV DNA的检测分别采用全血标本和血清标本进... 详细信息

目的通过分析HIV/AIDS患者eb病毒(ebV)潜伏感染的临床特点和免疫特征,探讨ebV潜伏感染对HIV/AIDS患者的影响。方法收集确诊HIV/AIDS患者的血液标本进行检测,并回顾性分析患者的临床资料。ebV DNA的检测分别采用全血标本和血清标本进行实时定量PCR检测,血清ebV抗体的检测采用酶联免疫吸附法,淋巴细胞亚群的检测采用流式细胞分析,eb病毒编码RNA(Epstein-Barr virus-encoded RNA,ebERs)检测采用原位杂交的方法。结果共收集168例患者的血清和全血标本,所有患者的血清ebV DNA载量均ebV DNA阳性率显著高于HIV RNAebV抗体检测发现全部患者ebV-CA-IgG均为阳性,但只有血清ebV-EA-IgG抗体的阳性率在全血ebV DNA阳性患者和阴性患者中表现出显著性差异(25.64%vs. 3.92%,χ^(2)=10.866,P=0.01)。CD4细胞计数ebV DNA的阳性率明显高于CD4细胞≥200个/μL的患者(81.25%vs. 54.17%,χ^(2)=16.62,PebV DNA高载量(>103copies/mL)的患者占比为68.99%。全血ebV DNA阳性患者的CD4细胞数量、CD4/CD8细胞比值均显著低于全血ebV DNA阴性患者(PebERs原位杂交结果阳性且同时具有较高的全血ebV DNA载量。结论全血标本ebV DNA高载量的HIV/AIDS患者免疫功能更为低下,潜伏感染的ebV更容易再激活,并可能增加艾滋病相关淋巴瘤的发生风险。

关键词： eb病毒艾滋病病毒 CD4淋巴细胞淋巴瘤

eb病毒相关性嗜血细胞淋巴组织细胞增生症诊治进展

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中国感染与化疗杂志 2022年第3期22卷 366-370页

作者：张小慧席亚明兰州大学第一临床医学院兰州730000 兰州大学第一医院血液科

嗜血细胞淋巴组织细胞增生症(hemophagocytic lymphohistiocytosis,HLH)是淋巴细胞和巨噬细胞失控增殖,炎性细胞过度产生,引起炎性因子风暴,最终导致多脏器功能衰竭的临床综合征。发热、肝脾大、血细胞减少等为其主要特征。该病与淋巴... 详细信息

嗜血细胞淋巴组织细胞增生症(hemophagocytic lymphohistiocytosis,HLH)是淋巴细胞和巨噬细胞失控增殖,炎性细胞过度产生,引起炎性因子风暴,最终导致多脏器功能衰竭的临床综合征。发热、肝脾大、血细胞减少等为其主要特征。该病与淋巴瘤、白血病、传染性单核细胞增多症、严重感染等有相似临床表现,易导致误诊或诊断延迟。根据病因,HLH可分为原发性和继发性,前者源于家族遗传史或免疫功能缺陷者,后者与感染、肿瘤、自身免疫病等密切相关,其中eb病毒(ebV)感染是最常见的感染相关亚型及重要死亡原因,加强对ebV相关性HLH(ebV-HLH)的认识十分重要。本文对近些年ebV-HLH相关研究进展作一综述。

关键词： eb病毒嗜血细胞淋巴组织细胞增生症治疗预后

eb病毒伴肺炎支原体感染致IM的临床特征及发病的危险因素分析

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中国病原生物学杂志 2022年第3期17卷 344-347页

作者：陈建琴吴建刚王朝晖陈美元高翔沈燕陈玉梅沈建强苏州市第九人民医院儿内科江苏苏州215200

目的探讨eb病毒伴肺炎支原体感染致传染性单核细胞增多症(IM)的临床特征与转归,分析影响发病的危险因素。方法选择2018年12月-2021年4月本院收治的112例eb病毒伴肺炎支原体感染所致的IM患者为观察组,以由单独ebV感染导致的98例IM患者... 详细信息

目的探讨eb病毒伴肺炎支原体感染致传染性单核细胞增多症(IM)的临床特征与转归,分析影响发病的危险因素。方法选择2018年12月-2021年4月本院收治的112例eb病毒伴肺炎支原体感染所致的IM患者为观察组,以由单独ebV感染导致的98例IM患者作为对照组,比较两组患者临床表现及转归情况,并采用单因素分析及Logistic回归分析发病的独立危险因素。结果两组患者住院时间、总体发热率、发热≥3 d或≥39℃比例差异均无统计学意义(均P>0.05),但观察组发热≥3 d,且≥39℃患者以及肝、脾肿大比例显著高于对照组(均P0.05),但观察组患者继发血小板减少症、肺炎和贫血比例显著高于对照组(均P0.05);观察组异形淋巴细胞比例、CRP、ESR以及ALT水平相比对照组显著升高(均PebV和MP双重感染所致IM的独立危险因素,该类患者的临床症状更为严重,发热持续时间以及住院时间均较长,肺炎、血小板减少症以及贫血等并发症发生率更高。

关键词：传染性单核细胞增多症 eb病毒肺炎支原体临床特征影响因素

eb病毒阳性弥漫大B细胞淋巴瘤的临床病理特征

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华中科技大学学报（医学版） 2023年第1期52卷 83-87页

作者：叶明李泽霖闫淑芳李新霞新疆医科大学第三临床医学院附属肿瘤医院病理科乌鲁木齐830011

目的探讨新疆医科大学附属肿瘤医院病理科10余年间确诊为eb病毒阳性的弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的临床病理特征。方法收集2010年1月至2022年4月期间所有在新疆医科大学附属肿瘤医院经组织学活检确诊为DLBCL的623例患者的临床及病... 详细信息

目的探讨新疆医科大学附属肿瘤医院病理科10余年间确诊为eb病毒阳性的弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的临床病理特征。方法收集2010年1月至2022年4月期间所有在新疆医科大学附属肿瘤医院经组织学活检确诊为DLBCL的623例患者的临床及病理资料,将其中eb病毒阳性的DLBCL患者15例纳入本研究,应用苏木精-伊红染色了解eb病毒阳性的DLBCL患者的形态学特点,应用免疫组化检测相关蛋白的表达水平,电话随访患者。结果623例DLBCL患者,男性332例,女性291例,中位年龄为59岁。eb病毒阳性的DLBCL的患者15例,占比为2.4%,男女比例为1.14∶1;形态学以免疫母细胞型为主;Han’s分型GCB型2例,non-GCB型13例;15例eb病毒阳性的DLBCL的患者中Ann Arbor分期早期4例,晚期11例;随访期间死亡6例,均为Ann Arbor分期晚期(Ⅲ~Ⅳ),生存时间在(5~54)个月之间,中位生存期为23.5个月。结论新疆地区eb病毒阳性的DLBCL患者形态学特征以免疫母细胞型为主,免疫分型以non-GCB型为主,晚期患者占多数,且死亡率高,采取综合治疗的患者例数少,值得临床及病理医生重视。

关键词： eb病毒弥漫大B细胞淋巴瘤临床病理特征