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基于三代测序技术的藏猪与dly猪回肠菌群结构对比研究

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畜牧与兽医 2022年第3期54卷 59-66页

作者：陆益商振达谭占坤段艳珍刘锁珠西藏农牧学院动物科学学院西藏林芝860000 西藏高原词料加工工程研究中心西藏林芝860000

旨在探究藏猪与瘦肉型猪(杜×长×大,dly猪)回肠菌群结构差异,为藏猪功能性菌株的挖掘奠定基础。试验选取月龄相近的藏猪和dly猪各5头,饲喂期间,藏猪和dly猪均饲喂玉米-豆粕型日粮。采用第三代高通量测序技术测定藏猪和dly猪回肠的微生... 详细信息

旨在探究藏猪与瘦肉型猪(杜×长×大,dly猪)回肠菌群结构差异,为藏猪功能性菌株的挖掘奠定基础。试验选取月龄相近的藏猪和dly猪各5头,饲喂期间,藏猪和dly猪均饲喂玉米-豆粕型日粮。采用第三代高通量测序技术测定藏猪和dly猪回肠的微生物多样性及菌群结构。结果表明:从藏猪回肠中共获得259个OTUs,而在dly猪回肠中共获得317个OTUs,2种猪所获OTUs数量不同,6种Alpha多样性指数在藏猪和dly猪中均没有显著差异,但PCA分析得到藏猪和dly猪回肠菌群结构存在差异。变形菌门、厚壁菌门和拟杆菌门为藏猪和dly猪回肠的主要菌门,3种菌门在藏猪回肠中的相对丰度依次为85.29%、8.26%和5.31%,而在dly猪中3种菌门的相对丰度依次为79.18%、13.87%和3.25%,3种菌门在两种猪回肠中没有显著差异。藏猪回肠中埃希菌属、格拉菌属、梭菌属、梭杆菌属和放线杆菌属显著低于dly猪。此外,本研究还鉴定到了59个菌种,其中8个菌种在藏猪和dly猪中存在显著差异,依次为大肠埃希菌、副猪格拉菌、豚放线杆菌、猪链球菌、苏黎世杆菌、胚胎弯曲杆菌、幽门螺杆菌和牛月形单胞菌。由此说明,猪种不同,其回肠中优势菌群的相对丰度和特定菌群种类不同,这可能与猪种不同,其肠道生理功能存在一定差异有关。

关键词：藏猪 dly猪回肠菌群结构

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dly猪育肥性能的初步观察

四川畜牧兽医 2000年第5期27卷 24-25页

作者：胡成军刘长玉四川省仁寿县畜牧局 612560

为在仁寿县大面积推广外引猪的三元杂交技术 ,对dly猪肥育性能进行了初步观测 ,结果表明 :dly猪达 1 0 0kg体重的日龄为 1 82 2天 ,育肥期日增重 70 3 1g ,耗料指数2 95 ,胴体瘦肉率 6 0 77% ,比同等饲养条件下的大长本和长本猪。

关键词： dly猪育肥性能胴体品质经济效益三元杂交

滇南小耳猪与dly商品猪背最长肌营养成分比较分析

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中国畜牧兽医 2016年第7期43卷 1743-1748页

作者：周选武黄伟曹志勇杨秀娟张曦甘文斌陶琳丽云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 云南农业大学基础与信息工程学院昆明650201 云南农业大学云南省动物营养与饲料重点实验室昆明650201 云南省兽药饲料检测所昆明650201

本试验为比较研究滇南小耳猪与dly商品猪肉的营养价值,分别检测了53头滇南小耳猪和58头dly猪背最长肌肉的水分、粗蛋白质、粗脂肪、灰分、氨基酸及脂肪酸等营养成分含量,比较分析其差异性。结果显示,滇南小耳猪背最长肌的水分含量极显... 详细信息

本试验为比较研究滇南小耳猪与dly商品猪肉的营养价值,分别检测了53头滇南小耳猪和58头dly猪背最长肌肉的水分、粗蛋白质、粗脂肪、灰分、氨基酸及脂肪酸等营养成分含量,比较分析其差异性。结果显示,滇南小耳猪背最长肌的水分含量极显著低于dly商品猪背最长肌(Pdly商品猪(P0.05);其中滇南小耳猪背最长肌的7种必需氨基酸(苏氨酸、缬氨酸、蛋氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、苯丙氨酸)、肉豆蔻酸、棕榈酸、油酸、顺式异油酸、11-顺-二十碳烯酸,饱和脂肪酸、单不饱和脂肪酸、总脂肪酸含量均极显著高于dly商品猪(P猪与dly猪相比具有更高的营养价值和开发价值。

关键词：滇南小耳猪 dly猪背最长肌营养成分

生长期迪庆藏猪肌纤维组成及其肌肉转录组学分析

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生长期迪庆藏猪肌纤维组成及其肌肉转录组学分析

作者：芦家凯云南农业大学

学位级别：硕士

猪肉是人类动物蛋白质的主要来源之一,人工选育方式、遗传背景的差异,导致猪肉品质存在很大不同。其中肌纤维类型是影响猪肉品质的重要因素之一,猪肌肉纤维类型的组成会随生理阶段的变化而变化,影响后期猪肉品质。迪庆藏猪(TP)是我国独... 详细信息

猪肉是人类动物蛋白质的主要来源之一,人工选育方式、遗传背景的差异,导致猪肉品质存在很大不同。其中肌纤维类型是影响猪肉品质的重要因素之一,猪肌肉纤维类型的组成会随生理阶段的变化而变化,影响后期猪肉品质。迪庆藏猪(TP)是我国独有的猪种资源,具有肉质优良的种质特性,然而,关于生长期迪庆藏猪肌肉肌纤维类型组成及其调控机制的研究鲜见报道。因此,本研究以生长期迪庆藏猪为研究对象,以商品肉猪“杜×长×大”(dly)猪为对照,选取4月龄的去势公猪各15头于同一栋舍、单笼饲养,饲养28d进行屠宰,取背最长肌制作免疫荧光石蜡切片,检测肌纤维类型,并计算其组成比例;同时对背最长肌进行转录组学测序,采用生物信息学分析技术比较肌纤维发育相关基因,筛选肌纤维发育差异表达基因,并预测其功能。结果显示:1.迪庆藏猪背最长肌指数极显著低于dly猪(Pdly猪(Pdly猪(Pdly猪(Pdly猪(P猪和dly背最长肌的8个样本中共获得55.07G的有效序列,每个样本的有效数据量分布均在6.68～7.09G,Q30碱基分布在94.45～94.86%,平均GC含量为53.92%。3.迪庆藏猪和dly猪背最长肌有618个差异表达基因,与dly猪相比,迪庆藏猪上调基因293个,包括SFRP1、FRZB和DKK1等调节肌肉发育的基因;下调基因325个,包括IGF2、NFATC1和KIT等调节肌肉发育的基因。***功能分析显示差异表达基因主要富集在细胞过程和单生物过程等生物学过程;KEGG富集到40个信号通路,其中上调差异基因主要富集在AMPK信号通路、轴突导向、胰岛素信号通路等信号通路。下调差异基因主要富集在MAPK信号通路、细胞粘附分子、流感和造血细胞系等信号通路。5.迪庆藏猪背最长肌MAPK信号通路中与肌纤维发育相关的IGF2、NFATC1、KIT基因相对表达量极显著低于dly猪(P猪背最长肌肌纤维发育受到抑制、Ⅱ型向Ⅰ型转化率较低;促进肌纤维发育的IGF2、NFATC1、KIT基因表达降低,可能通过抑制MAPK信号通路调控肌纤维发育。结果为解析迪庆藏猪肉质发育特性提供了基础数据,有利于该优良种质资源进一步地开发利用。对促进迪庆藏猪产业发展,生产优质肉提供了理论依据。

关键词：迪庆藏猪 dly猪背最长肌肌纤维 RNA-seq

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川藏黑猪和dly猪肉质风味比较研究

川藏黑猪和DLY猪肉质风味比较研究

中国地方猪种保护与利用协作组第十一届年会

作者：钟志君顾以韧杨雪梅梁艳陶璇杨跃奎曾凯陈晓晖吕学斌四川省畜牧科学研究院养猪研究所

采用常规表型测定技术研究川藏黑猪和杜×长×大(dly)猪背最长肌肉质风味差异。结果显示,川藏黑猪配套系在非挥发性(滋味——IMF含量,硫胺素,脂肪酸和氨基酸)和挥发性呈味物质(香味——醛类、酮类和呋喃类)及其他影响肉质风味的主要表... 详细信息

采用常规表型测定技术研究川藏黑猪和杜×长×大(dly)猪背最长肌肉质风味差异。结果显示,川藏黑猪配套系在非挥发性(滋味——IMF含量,硫胺素,脂肪酸和氨基酸)和挥发性呈味物质(香味——醛类、酮类和呋喃类)及其他影响肉质风味的主要表型指标上(肉色、肌纤维和嫩度)均优于dly猪,这些物质经过复杂的化学变化及彼此间的协同作用,使得川藏黑猪配套系猪肉风味比dly猪更加优美和浓郁、口感更好,食用品质更佳。本研究系统的阐明了川藏黑猪配套系的肉质风味特点及其肉质风味显著优于dly猪的物质基础。

关键词：川藏黑猪 dly猪背最长肌肉质风味

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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藏猪小肠形态、消化酶及微生物多样性研究

微生物学报 2021年第3期61卷 655-666页

作者：商振达商鹏刘锁珠谭占坤王宏辉孔庆辉西藏农牧学院动物科学学院西藏林芝860000 西藏高原饲料加工工程研究中心西藏林芝860000 藏猪协作研究中心西藏林芝860000

【目的】肠道是动物的主要消化器官,同时也是机体抵抗外源病原菌的重要屏障,已有研究表明,动物的品种、饲养方式、生长阶段均会影响动物的肠道菌群结构,但对舍饲和放牧饲养条件下藏猪的肠道菌群结构,以及藏猪和长白、约克与杜洛克三元... 详细信息

【目的】肠道是动物的主要消化器官,同时也是机体抵抗外源病原菌的重要屏障,已有研究表明,动物的品种、饲养方式、生长阶段均会影响动物的肠道菌群结构,但对舍饲和放牧饲养条件下藏猪的肠道菌群结构,以及藏猪和长白、约克与杜洛克三元杂交猪(dly猪)的肠道菌群结构是否有差异,尚未见报道。【方法】本研究选取6–7月龄的放牧藏猪、舍饲藏猪和dly猪的小肠组织,分别采用组织切片法测定各试验猪的肠道形态、酶活性测定试剂盒测定肠道内容物的消化酶活性,高通量测序法测定肠道微生物。【结果】dly猪小肠的肌层厚度和绒毛高度高于藏猪,而隐窝深度低于藏猪;舍饲藏猪和放牧藏猪的小肠形态没有显著变化。dly猪小肠的胰蛋白酶活性高于藏猪,而淀粉酶活性低于藏猪。三组猪小肠微生物的优势菌门均为Proteobacteria、Firmicutes和Bacteroidetes;藏猪的优势菌属为Ralstonia和Escherichia,而dly猪的优势菌属为Ralstonia和Bradyrhizobium,但含量却存在显著性差异。舍饲藏猪与放牧藏猪肠道菌群结构相似度较高,而藏猪与dly猪肠道菌群结构相似度较低。【结论】放牧藏猪、舍饲藏猪和dly猪的小肠形态、消化酶活性和肠道菌群结构均存在显著性差异。

关键词：藏猪 dly猪小肠形态消化酶活性肠道微生物多样性

西藏高原藏猪盲肠微生物群落结构与多样性的研究

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畜牧兽医学报 2020年第9期51卷 2147-2155页

作者：谭占坤商振达刘锁珠商鹏强巴央宗西藏农牧学院高原生态研究所林芝860000 西藏农牧学院动物科学学院林芝860000 西藏高原饲料加工工程研究中心林芝860000

本研究旨在探讨西藏高原放牧藏猪、舍饲藏猪与瘦肉型猪(杜×长×大,dly猪)盲肠微生物的群落组成及多样性,从而部分揭示西藏高原藏猪肠道微生物的特异性。选用日龄相近的放牧藏猪、舍饲藏猪及dly猪各5头,放牧藏猪由林芝本地农牧民采用传... 详细信息

本研究旨在探讨西藏高原放牧藏猪、舍饲藏猪与瘦肉型猪(杜×长×大,dly猪)盲肠微生物的群落组成及多样性,从而部分揭示西藏高原藏猪肠道微生物的特异性。选用日龄相近的放牧藏猪、舍饲藏猪及dly猪各5头,放牧藏猪由林芝本地农牧民采用传统方式放牧养殖,舍饲藏猪及dly猪圈养并饲喂相同饲粮,160日龄时前腔静脉放血屠宰,采集盲肠食糜于液氮速冻待测。采用高通量测序技术测定样品16S rRNA V3-V4区域的基因序列。结果表明,在15个样本的16S rRNA基因V3-V4区测序共获得了659904条有效序列,其中放牧藏猪213031条、舍饲藏猪219417条、dly猪227456条。放牧藏猪盲肠微生物OTU总数、Chao1指数、ACE指数及香农(Shannon)指数均显著高于舍饲藏猪与dly猪(P猪与dly猪无显著差异(P>0.05)。3个类型猪盲肠微生物共划分为13个门,56个属。厚壁菌门(Firmicutes)是3个类型猪相对丰度共同最高的门。放线菌门(Actinobacteria)与疣微菌门(Verrucomicrobia)在放牧藏猪中相对丰度显著高于其他2个类型猪(P猪拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度显著高于放牧藏猪与dly猪(P猪共有11个属相对丰度显著高于舍饲藏猪与dly猪(P猪盲肠微生物群落结构与多样性具备自身独特性,为进一步开发藏猪资源提供参考。

关键词：放牧藏猪舍饲藏猪 dly猪盲肠微生物群

日粮碳水化合物/蛋白质水平对240日龄不同品种猪肌内脂肪含量和胃肠道重量、长度及消化酶活性的影响

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动物营养学报 2009年第4期21卷 447-453页

作者：刘宏伟王康宁四川农业大学动物营养研究所雅安625014

本试验旨在研究日粮碳水化合物/蛋白质水平对240日龄不同品种猪肌内脂肪(IMF)含量和胃肠道重量、长度及消化酶活性的影响,并探讨IMF含量与胃肠道重量、长度及消化酶活性的关系。试验采用2×2因子试验设计,即杜洛克×长白×大约克三元杂... 详细信息

本试验旨在研究日粮碳水化合物/蛋白质水平对240日龄不同品种猪肌内脂肪(IMF)含量和胃肠道重量、长度及消化酶活性的影响,并探讨IMF含量与胃肠道重量、长度及消化酶活性的关系。试验采用2×2因子试验设计,即杜洛克×长白×大约克三元杂交猪(dly)和太湖猪2个品种,每个品种分别饲喂高碳水化合物/低蛋白(HC/LP)和低碳水化合物/高蛋白(LC/HP)2种日粮。选用150日龄的dly猪和太湖猪各12头,按体重相近、性别一致的原则共分为4个试验组,每个试验组6个重复,每个重复1头猪。饲养90 d后屠宰取样。结果表明:与LC/HP日粮相比,HC/LP日粮极显著提高了dly猪的IMF含量(IMF为5.83%)(P猪有提高的趋势(P>0.05),但2种日粮对2品种猪眼肌面积和背膘厚没有显著影响(P>0.05);HC/LP日粮显著(P猪的胰重和胰指数;无论在何种日粮下,太湖猪的胃、胰、小肠指数都极显著高于dly猪(P猪的消化酶活性,但对dly猪的胰淀粉酶单位活性有所升高(P>0.05),其中对太湖猪的胃蛋白酶和胰脂肪酶活性的影响达到极显著水平(P猪胰脂肪酶活性极显著高于dly猪(Pdly猪的胰淀粉酶活性显著高于太湖猪(P猪眼肌面积和背膘厚影响较小的情况下,可大幅度提高240日龄dly猪的IMF含量,而大幅度降低了2品种猪的胰重和太湖猪的胃蛋白酶和胰脂肪酶活性,对2品种猪的胃、肝和小肠的重量或长度影响不大。

关键词：碳水化合物/蛋白质 dly猪太湖猪肌内脂肪胃肠道

生长激素释放肽-2对生长猪生长激素分泌模式的影响

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中国兽医杂志 2009年第12期45卷 17-19页

作者：兰云贤彭莉西南大学荣昌校区动物科学系重庆荣昌402460 四川省兽药监察所四川成都610041

为弄清生长激素释放肽-2（GHRP-2）对生长猪生长激素（GH）分泌模式的影响,选择25 kg体重的去势公猪,通过外科手术安装颈静脉插管,试验猪随机分为两组,每组4头,一组为对照,一组为处理组,处理组肌肉注射30μg/kg体重GH-RP-2,于注射后的0... 详细信息

为弄清生长激素释放肽-2（GHRP-2）对生长猪生长激素（GH）分泌模式的影响,选择25 kg体重的去势公猪,通过外科手术安装颈静脉插管,试验猪随机分为两组,每组4头,一组为对照,一组为处理组,处理组肌肉注射30μg/kg体重GH-RP-2,于注射后的0、15、30、45、60、90、120、180 min,以及6、9、12 h通过插管采取5 mL血样,分离血清,用放免法测定GH含量。结果显示血中GH的含量在处理组的30-90 min,与对照组存在极显著的差异（P〈0.01）,并在60 min达到分泌的峰值,120 min后回落到对照组水平。表明肌肉注射30μg/kg体重GHRP-2能够促进GH分泌,血中GH在30-90 min极显著地大于对照组,并在60 min达到分泌峰值。

关键词： dly猪颈静脉插管 GHRP-2 GH