检索结果-南通市图书馆

作者：毛成诚南京农业大学

学位级别：硕士

青海湖裸鲤(Gymnocypris Przewalskii),隶属鲤形目、鲤科、裂腹鱼亚科、裸鲤属,为我国独有种,仅分布在青海湖及周边支流。本研究于2019年7月至2020年7月,在青海湖中布哈河口和一郎剑分别采集82和79尾,五条主要支流布哈河、黑马河、泉吉... 详细信息

青海湖裸鲤(Gymnocypris Przewalskii),隶属鲤形目、鲤科、裂腹鱼亚科、裸鲤属,为我国独有种,仅分布在青海湖及周边支流。本研究于2019年7月至2020年7月,在青海湖中布哈河口和一郎剑分别采集82和79尾,五条主要支流布哈河、黑马河、泉吉河、沙柳河和哈尔盖河分别采集81、80、80、81和83尾,共计566尾青海湖裸鲤鳍条样品,使用线粒体细胞色素氧化酶亚基I基因和线粒体控制区两种标记方式对青海湖裸鲤的遗传多样性进行分析。主要研究结果如下:(1)分析青海湖裸鲤共566尾个体的COI基因序列(725bp),共检测出变异位点数15个,单倍型17个,7个区域群体的单倍型多样性为0.50243～0.67184,核苷酸多样性为0.00079～0.00118。其中泉吉河群体的青海湖裸鲤遗传多样水平最高(Hd=0.67184,pi=0.00118),一郎剑的青海湖裸鲤遗传多样性水平最低(Hd=0.50243,pi=0.00079)。基于Kimura双参数模型计算七个群体之间的遗传距离为0.000806～0.001091,整体遗传距离相差较小。AMOVA分子变异分析,Fst值均小于0.05,青海湖裸鲤无遗传分化,亲缘关系近。(2)分析青海湖裸鲤共566尾个体的d-loop控制区序列(693bp),共检测出变异位点数为55个,单倍型66个,7个区域群体的单倍型多样性为0.91790～0.94620。核苷酸多样性为0.00509～0.00632。其中单倍型多样性上黑马河群体最高(Hd=0.94620)、布哈河群体最低(Hd=0.91790),核苷酸多样性上一郎剑群体最高(pi=0.00632)、黑马河群体最低(pi=0.00509)。基于Kimura双参数模型计算7个群体之间的遗传距离为0.005228～0.006332,整体遗传距离同样相差较小。AMOVA分子变异分析吗,Fst值均小于0.05,青海湖裸鲤无遗传分化,亲缘关系近,这与基于COI基因研究一致。(3)基于两种标记方式,分别建立对应单倍型的邻接(NJ)进化树,COI基因单倍型的进化树更为简单,分支清晰明了,而d-loop控制区单倍型的进化树分支更精细。两种标记方式研究均存在独享单倍型和共享单倍型,青海湖裸鲤整体上遗传分化不高。(4)基于两种标记方式的Tajima′s d及Fu′s FS值分析,青海湖裸鲤群体目前处于较稳定的状态,历史上经历过种群扩张。(5)对青海湖裸鲤进行序列分析,结果显示COI基因变异位点占比(2.07%)显著小于d-loop控制区(7.94%),表明青海湖裸鲤的d-loop控制区比COI基因具有更快的进化速率,更适合亲缘关系近群体的遗传变异研究。

关键词：青海湖裸鲤遗传多样性 COI基因 d-loop控制区

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从线粒体细胞色素b基因和d-loop控制区序列差异研究野牦牛和家牦牛的系统进化关系

从线粒体细胞色素b基因和D-LOOP控制区序列差异研究野牦牛和家牦...

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作者：刘强浙江大学

学位级别：硕士

野牦牛是我国青藏高原的特有物种,但多年来有关野牦牛与家牦牛的分类隶属关系意见不一,从分子水平上分析两者之间的系统进化关系具有重要意义,能为遗传育种提供可靠的理论依据。本文根据牛属动物线粒体两端的特征序列,设计特异性引物,... 详细信息

野牦牛是我国青藏高原的特有物种,但多年来有关野牦牛与家牦牛的分类隶属关系意见不一,从分子水平上分析两者之间的系统进化关系具有重要意义,能为遗传育种提供可靠的理论依据。本文根据牛属动物线粒体两端的特征序列,设计特异性引物,采用PCR技术从野牦牛基因组中扩增出线粒体细胞色素b基因和d—loop控制区序列,扩增产物经过1.0%的琼脂糖凝胶EB电泳、纯化、回收后转化,再应用抗生素筛选法随机挑取阳性克隆进行PCR检测。鉴定阳性克隆后对重组质粒进行测序。测序结果采用dNASTAR软件包(dNASTAR Inc,1996)中的MegAlign程序对同源序列进行排列,并经人工仔细核查。在此基础上,序列输入MEGA2.1软件包中计算不同序列间的变异位点、简约信息位点数、颠换百分比、转换/颠换比率、序列间的遗传距离和差异百分比,用MEGA2.1软件基于Kimura 2-parameter距离采用邻近法(Neighbor—Joining)构建分子系统树,同时也用PHYLIP3.6软件包(FelSenstein,2001)使用Heuristic功能搜寻最大简约法(Maximum Parsimony)和最大拟然法(Maximum Likehood)的系统重建。实验结果显示线粒体细胞色素b基因和d—loop控制区PCR扩增片段在琼脂糖凝胶电泳结果中显示出清晰的特异性扩增条带,经连接及转化实验,在LB固体培养基上长出较多阳性克隆。随机挑菌进行PCR检测,其结果皆为阳性克隆。说明成功克隆出野牦牛的线粒体细胞色素b基因和d—loop控制区序列,并将其重组入原核表达载体。对重组质粒进行测序的结果经 dNASTAR、MEGA2.1、PHYLIP3.6软件包的不同方法(Neighbor-Joining、Maximum Parsimony、Maximum Likehood)构建出的分子系统树基本相同。结果表明野牦牛与家牦牛有着较瘤牛、家牛、白臀野牛、野牛更近的亲源关系,两者都归于牛属,是同一种的不同亚种。野牦牛是家牦牛的近祖,它们的分歧时间大约在0.42-0.44百万年前。本实验结果为野牦牛和家牦牛的系统学研究奠定了分子水平上的基础。

关键词：野耗牛家耗牛细胞色素b d-loop控制区系统进化

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中国柽柳沙鼠线粒体dNA的地理变异及其亚种分化

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兽类学报 2011年第4期31卷 347-357页

作者：谷登芝周立志马勇宁恕龙侯银续张保卫安徽大学资源与环境工程学院生物多样性与湿地生态研究所合肥230601 中国科学院动物研究所北京100101

柽柳沙鼠广泛分布于中亚荒漠地区,在我国分布于蒙新干旱区西部。本研究采用线粒体Cytb基因和d-loop控制区两个片段共1569bp作为分子标记,对我国蒙新区西部45个柽柳沙鼠的核苷酸多样性、单倍型多样性及系统发生进行分析,并探讨其亚种分化... 详细信息

柽柳沙鼠广泛分布于中亚荒漠地区,在我国分布于蒙新干旱区西部。本研究采用线粒体Cytb基因和d-loop控制区两个片段共1569bp作为分子标记,对我国蒙新区西部45个柽柳沙鼠的核苷酸多样性、单倍型多样性及系统发生进行分析,并探讨其亚种分化。45个柽柳沙鼠线粒体dNA共定义33个单倍型,包含142个核苷酸变异位点(占全序列的9.05%),其中单态位点34个,简约信息位点108个,未发现碱基插入或缺失的现象。基于单倍型的系统发生树和网络关系图显示,柽柳沙鼠的谱系分为两大支:伊犁盆地的种群聚为独立的一支,准噶尔盆地和额济纳地区的种群聚为一支,两大支的分歧时间为0.24Ma年前,大约在庐山冰期。通过Beast模拟,柽柳沙鼠在近15000年有一次快速的种群衰退,表明柽柳沙鼠种群受到了末次盛冰期的影响。基于Cytb基因和d-loop序列的证据,我们认为分布于新疆伊犁盆地的柽柳沙鼠为哈萨克亚种(***),分布于我国新疆准噶尔盆地以及甘肃、内蒙地区的为敦煌亚种(***)。

关键词：柽柳沙鼠 Cytb基因 d-loop控制区遗传分化地理亚种

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基于线粒体dNA细胞色素b基因和控制区序列分析西藏雅鲁藏布江黄斑褶鮡种群遗传多样性

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动物学杂志 2019年第5期54卷 701-710页

作者：马清芝马波李雷金星林小婉金洪宇哈尔滨师范大学哈尔滨150025 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所哈尔滨150070 上海海洋大学上海201306

采用线粒体dNA(mtdNA)Cyt b基因和d-loop控制区为分子标记,对分布于西藏雅鲁藏布江大峡谷以上里龙段和以下墨脱段2个群体的黄斑褶(Pseudecheneis sulcata)共60个样本进行遗传多样性研究。获得联合基因有效序列长度为1 893 bp,包括Cyt b... 详细信息

采用线粒体dNA(mtdNA)Cyt b基因和d-loop控制区为分子标记,对分布于西藏雅鲁藏布江大峡谷以上里龙段和以下墨脱段2个群体的黄斑褶(Pseudecheneis sulcata)共60个样本进行遗传多样性研究。获得联合基因有效序列长度为1 893 bp,包括Cyt b基因1 060 bp和d-loop控制区833 bp。结果显示,里龙和墨脱2个群体的单倍型多样性值(Hd)均较高(0.701和0.761),核苷酸多样性值(π)均较低(0.001 00和0.001 09);高频率的单倍型Hap1和Hap2为2个群体所共享,推测为祖先单倍型;同时,里龙和墨脱群体分别存在5个和6个特有单倍型,且在2个群体中不共享;分子方差分析(AMOVA)显示遗传变异主要来源于种群内部,群体间呈中度遗传分化水平(Fst = 0.090 44,P d、Fu's Fs)和核苷酸不配对(SSd、Hir)分析结果揭示,黄斑褶种群曾经历过种群扩张现象。本研究推测,黄斑褶 2个群体间的基因流动存在障碍,雅鲁藏布大峡谷的海拔落差及水文情势等生态屏障可能是阻碍黄斑褶迁徙和交流的主要原因。

关键词：黄斑褶鮡线粒体dNA 细胞色素b基因 d-loop控制区遗传多样性雅鲁藏布江

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太湖花鳖雌雄群体形态及遗传差异分析

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江苏农业科学 2021年第1期49卷 142-145页

作者：王苗苗梅肖乐冯子偃徐建荣韩晓磊江苏省渔业技术推广中心江苏南京210036 常熟理工学院生物与食品工程学院江苏常熟215500

通过多元统计分析和线粒体dNA测序技术,对中华鳖地方特色品种——太湖花鳖雌雄群体的形态和遗传差异进行了分析研究。结果显示,在形态上,对太湖花鳖雌雄群体各项形态参数进行t检验差异分析,发现雄性尾部的生长与其体质量的增加相关显著... 详细信息

通过多元统计分析和线粒体dNA测序技术,对中华鳖地方特色品种——太湖花鳖雌雄群体的形态和遗传差异进行了分析研究。结果显示,在形态上,对太湖花鳖雌雄群体各项形态参数进行t检验差异分析,发现雄性尾部的生长与其体质量的增加相关显著,呈线性关系;对太湖花鳖雌雄群体形态参数进行主成分分析,并作出主成分1和主成分2的散点图,得出雌雄群体形态差异不明显。对太湖花鳖雌雄群体线粒体d-loop控制区序列进行差异分析,雌雄群体间遗传差异为0.0114;构建N-J聚类系统树,雌雄群体无单独聚类,群体遗传差异不明显。结果表明,太湖花鳖个体形态差异与其性别存在一定程度的相关性,特别是尾部特征,可用于雌雄性别的初步判断,但雌雄群体在外观形态和线粒体dNA上均没有明显差异。

关键词：太湖花鳖多元统计分析 d-loop控制区形态差异遗传差异

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