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capn1和CAST基因在牦牛不同组织中的表达差异研究

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河南农业科学 2014年第3期43卷 139-141,149页

作者：姚慧陈智华钟金城曾贤彬柴志欣西南民族大学青藏高原研究院动物遗传育种学国家民委-教育部重点实验室四川成都610041

为检测钙蛋白酶基因(capn1)和钙蛋白酶抑制基因(CAST)在牦牛心、肝、脾、肺、肾、胃、眼肌、腹肌等不同组织中的表达水平,采用实时荧光定量PCR技术分析这2个基因的表达规律。结果显示,capn1和CAST基因在牦牛的8种组织中均有表达,但在不... 详细信息

为检测钙蛋白酶基因(capn1)和钙蛋白酶抑制基因(CAST)在牦牛心、肝、脾、肺、肾、胃、眼肌、腹肌等不同组织中的表达水平,采用实时荧光定量PCR技术分析这2个基因的表达规律。结果显示,capn1和CAST基因在牦牛的8种组织中均有表达,但在不同组织的表达量存在差异。capn1基因在眼肌中的表达量最高,其次为腹肌,在肌肉中的表达量显著高于内脏组织,内脏组织中,在肝脏的表达量最高,其次为肾脏,胃中的表达量最低;CAST基因在胃中的表达量最高,其次为眼肌、腹肌,在肾脏中的表达量最低。

关键词：牦牛 capn1基因 CAST基因实时荧光定量PCR 基因表达差异

伊犁马MTOG、capn1和MSTN基因多态性及其与肉质相关性研究

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伊犁马MTOG、CAPN1和MSTN基因多态性及其与肉质相关性研究

作者：李云霞新疆农业大学

学位级别：硕士

为了研究伊犁马MYOG、capn1和MSTN基因的多态性及其对肉质性状的影响,以38匹伊犁马为试验对象,利用PCR扩增和DNA测序技术,对目的基因的多态性及群体遗传学进行分析;测定三角肌、背阔肌、臂三头肌、腹外斜肌和臀中肌的肉品质指标:剪切力... 详细信息

为了研究伊犁马MYOG、capn1和MSTN基因的多态性及其对肉质性状的影响,以38匹伊犁马为试验对象,利用PCR扩增和DNA测序技术,对目的基因的多态性及群体遗传学进行分析;测定三角肌、背阔肌、臂三头肌、腹外斜肌和臀中肌的肉品质指标:剪切力、失水率、熟肉率和肌纤维横截面积等,利用SAS软件分析不同基因型间肉品质指标差异性,寻找有利突变位点,为探究伊犁马肉质性能分子选育提供前期基础,研究结果如下:（1）伊犁马MYOG基因外显子1检测出SNP1（g.31187343A＞C）、SNP2（g.31187333G＞A）、SNP3（g.31187132C＞T）、SNP4（g.31187105C＞G）、SNP5（g.31187099C＞T）共5个突变位点。其中SNP1为错义突变,其他位点均为无义突变,SNP3和SNP4为中度多态位点,SNP1和SNP2为低度多态位点,4个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。SNP1和SNP4呈强连锁不平衡,存在AACC、ACCG和AACG三种组合基因型,差异性分析结果:背阔肌、腹外斜肌和臀中肌剪切力AACG组合基因型显著小于AACC组合基因型（P＜0.05）。（2）伊犁马capn1基因第5外显子、第9内含子、第10外显子各检测到1个多态位点分别为:SNP6（g.28970528T＞A）、SNP7（g.28972795T＞A）、SNP8（g.28972849A＞C）。其中SNP6和SNP8为错义突变、SNP7为内含子突变,3个突变位点均为低度多态位点,处于Hardy-Weinberg平衡状态。差异性分析结果:SNP6位点腹外斜肌失水率AT基因型显著小于TT基因型（P＜0.05）,三角肌和腹外斜肌粗脂肪AT基因型极显著高于TT基因型（P＜0.01）,臂三头肌剪切力AT基因型极显著小于TT基因型（P＜0.01）;SNP7位点背阔肌、腹外斜肌和臀中肌失水率AT基因型显著低于TT基因型（P＜0.05）,腹外斜肌和臀中肌熟肉率AT基因型显著大于TT基因型（P＜0.05）,腹外斜肌粗脂肪和肌纤维密度AT基因型显著大于TT基因型（P＜0.05）、肌纤维直径显著小于TT基因型（P＜0.05）。SNP8位点三角肌失水率AC基因型显著小于AA基因型（P＜0.05）。（3）伊犁马MSTN第3外显子检测到1个多态位点SNP9（g.66605255T＞C）,为同义突变,是低度多态位点,处于Hardy-Weinberg平衡状态。差异性分析结果:三角肌和腹外斜肌失水率CT基因型显著低于TT基因型（P＜0.05）,三角肌和臀中肌剪切力CT基因型极显著小于TT基因型（P＜0.01）。结论:SNP1和SNP4组合基因型中,AACG组合基因型、SNP9突变位点CT基因型、SNP6突变位点AT基因型剪切力低;SNP7突变位点AT基因型熟肉率高;SNP6和SNP7突变位点AT基因型粗脂肪高;SNP6和SNP7突变位点AT基因型、SNP8突变位点AC基因型、SNP9突变位点CT基因可用于失水率低;SNP7突变位点AT基因型可用于肌纤维直径小和肌纤维密度大,在伊犁马肉质性状分子选择时可针对三个目的基因以上位点和基因型进行选育。

关键词：伊犁马 MYOG基因 capn1基因 MSTN基因

牦牛capn1和CAST基因克隆及其序列分析

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牦牛CAPN1和CAST基因克隆及其序列分析

作者：费春红甘肃农业大学

学位级别：硕士

钙激活蛋白酶(Calpains)是一类特异性依钙激活的中性半胱氨酸内肽酶,其广泛地分布于绝大多数动物细胞中。其中μ-calpain是在体内由微摩尔钙激活的无组织特异性的钙蛋白酶,其大亚基蛋白编码基因为capn1基因。钙蛋白酶抑制蛋白(CAST)是... 详细信息

钙激活蛋白酶(Calpains)是一类特异性依钙激活的中性半胱氨酸内肽酶,其广泛地分布于绝大多数动物细胞中。其中μ-calpain是在体内由微摩尔钙激活的无组织特异性的钙蛋白酶,其大亚基蛋白编码基因为capn1基因。钙蛋白酶抑制蛋白(CAST)是高效的,专一的钙激活蛋白酶活性抑制剂。研究表明,μ-calpain对于肌原纤维的降解和肉在冷冻贮藏过程中的嫩化具有重要作用,其大亚基的编码基因capn1可作为影响肌肉嫩度的数量性状位点(QTL)的候选基因。其抑制剂CAST可抑制蛋白酶活性,降低蛋白质水解,它的活性比值与嫩度高度相关。本研究根据GenBank发表的普通牛capn1和CAST基因序列设计特异性引物,以天祝白牦牛cDNA为模板,分段进行RT-PCR扩增,克隆,测序。应用生物软件BioEdit对各测序结果进行序列拼接共获得牦牛capn1 cDNA片段2267bp,其中包含一个2151bp的完整的开放阅读框(ORF),以及3’和5’末端非编码区的部分序列(77bp和166bp)。获得牦牛CAST基因片段2445bp,其中包含一个2361bp的完整的开放阅读框(ORF)(含一个起始密码子ATG和终止密码子TAA)。分析表明:牦牛capn1基因编码区全长2151bp,共编码716个氨基酸。与已报道的牛、猪、人、小鼠的序列进行比较,核苷酸同源性分别为99.3%,93.9%,90.0% ,85.5%。预测氨基酸的同源性分别为99.4%,96.1%,94.6%,89.0%,并且对牦牛capn1四个结构域分别进行NCBI BLAST发现四个结构域在以上四个物种中都显示出很好的保守性,最为保守的在结构域Ⅳ(>96%)。牦牛与牛产生的14个核苷酸突变位点中,有3个产生了氨基酸突变,均发生在结构域Ⅲ。牦牛CAST基因的编码区全长2361bp,编码786个氨基酸。同源性分析表明其核酸和蛋白质序列在不同哺乳动物之间也有很高的同源性,一些亲水性的氨基酸在不同物种间具有高度的保守性。分别对两个基因构建分子系统进化树表明:聚类结果与传统分类学相符。

关键词：牦牛 capn1基因 CAST基因克隆序列分析

鸡肉嫩度候选基因capn1多态性的检测研究

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家畜生态学报 2010年第2期31卷 16-20页

作者：束婧婷李慧芳张莹陈宽维苏一军邝智祥朱文奇韩威中国农业科学院家禽研究所国家地方禽种资源基因库江苏扬州225003 广东天农食品有限公司广东清远511827

建立基于聚合酶链反应-连接酶检测反应的基因多态性并行检测系统,探讨鸡肉嫩度候选基因钙蛋白酶I(capn1)基因的多态性,并分析其在优良地方鸡种-清远麻鸡和快大型隐性白羽鸡中的分布差异。用PCR-LDR方法检测capn1 2546、capn1 3535和capn... 详细信息

建立基于聚合酶链反应-连接酶检测反应的基因多态性并行检测系统,探讨鸡肉嫩度候选基因钙蛋白酶I(capn1)基因的多态性,并分析其在优良地方鸡种-清远麻鸡和快大型隐性白羽鸡中的分布差异。用PCR-LDR方法检测capn1 2546、capn1 3535和capn19950的基因型作单倍型分析,进行各组间基因型分布和等位基因频率x2检验。结果capn12546位点未检测到多态,其他两个位点的结果同直接测序分型结果一致,其基因型分布在不同品种中均存在差异,并且在capn1 3535位点上达到显著水平,两个位点的单倍型分布在不同品种间也存在较大差异。

关键词：连接酶检测反应 capn1基因基因多态性肌肉嫩度鸡

基于连接酶检测反应的并行分型系统检测鸡肉嫩度候选基因capn1的多态性

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基于连接酶检测反应的并行分型系统检测鸡肉嫩度候选基因CAPN1的...

GH、capn1和CAST基因的多态性与雪龙黑牛生长性能和胴体性状的相关性研究

第十四次全国家禽科学学术讨论会

作者：束婧婷李慧芳张莹邝智祥朱文奇韩威陈宽维中国农业科学院家禽研究所广东天农食品有限公司

基因多态性蕴藏着大量遗传信息,分型技术是研究多态性的主要研究手段。本文建立了一个基于聚合酶链反应——连接酶检测反应的基因多态性并行检测系统,探讨鸡肉嫩度候选基因钙蛋白酶Ⅰ(capn1)基因的多态性,并分析其在优良地方鸡种——清... 详细信息

基因多态性蕴藏着大量遗传信息,分型技术是研究多态性的主要研究手段。本文建立了一个基于聚合酶链反应——连接酶检测反应的基因多态性并行检测系统,探讨鸡肉嫩度候选基因钙蛋白酶Ⅰ(capn1)基因的多态性,并分析其在优良地方鸡种——清远麻鸡和快大型隐性白羽鸡中的分布差异。应用PCR-LDR方法检测capn1 2546、capn1 3535和capn1 9950的基因型,并进行了单倍型分析,进行各组间基因型分布和等位基因频率的χ检验。结果capn1 2546位点未检测到多态,其他两个位点的结果同直接测序分型结果一致,其基因型分布在不同品种中均存在差异,在capn13535位点上达到显著水平,两个位点的单倍型分布在不同品种间也存在较大差异,说明capn1 3535和capn1 9950基因型可能是鸡肉嫩度性状的遗传标记。

关键词：连接酶检测反应 capn1基因基因多态性鸡肉嫩度鸡

来源： cnki会议评论

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GH、CAPN1和CAST基因的多态性与雪龙黑牛生长性能和胴体性状的相...

capn1和CAST基因多态性与肉品质相关研究进展

中国畜牧兽医学会养牛学分会2011年学术研讨会

作者：陈晓杰吴蒙张立敏陈翠周正奎张猛黄萌刘利高雪许尚忠李俊雅高会江张路培李姣中国农业科学院北京畜牧兽医研究所大连雪龙产业集团有限公司

【目的】研究雪龙黑牛GH、capn1和CAST基因的遗传多肽以及各多态位点对生长性能和胴体性状的相关性,为分子育种提供科学依据。【方法】本试验究采用了分子标记辅助选择技术,以大连雪龙集团的F1代商品雪龙黑牛为试验动物,利用PCR-RFLP技... 详细信息

【目的】研究雪龙黑牛GH、capn1和CAST基因的遗传多肽以及各多态位点对生长性能和胴体性状的相关性,为分子育种提供科学依据。【方法】本试验究采用了分子标记辅助选择技术,以大连雪龙集团的F1代商品雪龙黑牛为试验动物,利用PCR-RFLP技术研究生长激素(GH)基因、钙激活蛋白酶(capn1)基因、钙蛋白酶抑制蛋白(CAST)基因的遗传多态性,并用最小二乘法拟合线性模型对各标记基因型与肉牛生长性能和胴体性状进行关联分析。【结果】结果发现:GH-P3位点与与肉色等级、脂色等级极显著相关(pcapn1 316位点与研究的胴体性状之间无明显的相关性。UoG-CAST位点与三角牛腩厚显著相关(p基因第五外显子位点突变形成的AB杂合基因型是肉色等级和脂色等级的优势基因型;CAST基因第五内含子位点突变形成的AA基因型是三角牛腩厚的优势基因型。

关键词：雪龙黑牛 GH基因 capn1基因 CAST基因胴体性状生长性能

来源： cnki会议评论

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中国畜禽种业 2015年第6期11卷 65-69页

作者：万红玲雒林通甘肃省天水师范学院生物工程与技术学院 741001

目前认为主要是钙蛋白酶I(Calpain 1,capn1)和钙蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin,CAST)参与了畜禽屠宰后肌肉蛋白的水解,从而导致肉的嫩化。钙蛋白酶I大亚基由capn1基因编码,钙蛋白酶抑制蛋白由CAST基因编码,二者被认为是影响肉嫩度的潜在... 详细信息

目前认为主要是钙蛋白酶I(Calpain 1,capn1)和钙蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin,CAST)参与了畜禽屠宰后肌肉蛋白的水解,从而导致肉的嫩化。钙蛋白酶I大亚基由capn1基因编码,钙蛋白酶抑制蛋白由CAST基因编码,二者被认为是影响肉嫩度的潜在候选基因。文章综述近年来有关capn1和CAST基因多态性与肉品质的相关性研究,并指出存在的问题,以期为今后开展更多的科学研究提供参考依据。

关键词： capn1基因 CAST基因多态性肉品质研究进展综述

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藜麦对芦花鸡肉质相关基因表达的影响

中国饲料 2024年

作者：江小帆吴涛杨发荣魏玉明陈国顺蔡原焦婷顾玲荣赵生国定西职业技术学院甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省农业科学院畜草与绿色农业研究所甘肃农业大学草业学院

为研究藜麦籽实对芦花鸡肉品质及肉质相关基因表达水平的影响,试验选用49日龄体重为(1476.21±101.39)g且健康状况良好的雌性芦花鸡120只,将其随机分成4个处理组,每个处理3个重复,每个重复包含10只鸡。对照组(CK组)饲喂藜麦籽实添加量为... 详细信息

为研究藜麦籽实对芦花鸡肉品质及肉质相关基因表达水平的影响,试验选用49日龄体重为(1476.21±101.39)g且健康状况良好的雌性芦花鸡120只,将其随机分成4个处理组,每个处理3个重复,每个重复包含10只鸡。对照组(CK组)饲喂藜麦籽实添加量为0的基础饲粮,各试验组(Q4、Q8、Q12组)饲喂藜麦籽实添加量为4%、8%、12%的试验饲粮,整个试验期为75 d,包括3 d预试期和72 d正试期。饲喂结束后屠宰并测定肉品质及肉质相关基因的表达量。结果表明:(1)与CK组相比,Q4、Q12组胸肌组织中capn1基因mRNA相对表达量显著提高(P基因及Q4组LRP1基因mRNA在胸肌中的相对表达量显著降低(Pcapn1基因、Q4组CAST基因及Q8、Q12组LRP1基因mRNA的相对表达量显著提高(P1基因表达水平与肌肉剪切力呈显著正相关(Pcapn1基因的表达水平与滴水损失呈显著负相关(P1基因的表达水平与蒸煮损失、剪切力呈显著正相关(P capn1基因表达水平与熟肉率呈显著正相关(P1、capn1基因的表达量有一定影响,且LRP1、CAST、capn1基因与嫩度相关肉品质指标存在显著相关性。

关键词：肉质相关基因 CAST基因 capn1基因 LRP1基因关联性分析藜麦

散养黄羽肉鸡capn1、H-FABP基因表达的发育性变化及其肌内脂肪含量的研究

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中国畜牧兽医 2019年第5期46卷 1413-1420页

作者：朱梦婷解一凡王晓路赵宗胜石河子大学动物科技学院石河子832003

为探讨在散养条件下黄羽肉鸡capn1、H-FABP基因与其生长发育和肌内脂肪(IMF)含量的关系,试验以130羽3周龄体重接近,健康商品代黄羽肉鸡母鸡为试验材料,随机分为笼养组(对照组)和散养组(试验组),采集在不同周龄(3、4、6、8、10、13 w)的... 详细信息

为探讨在散养条件下黄羽肉鸡capn1、H-FABP基因与其生长发育和肌内脂肪(IMF)含量的关系,试验以130羽3周龄体重接近,健康商品代黄羽肉鸡母鸡为试验材料,随机分为笼养组(对照组)和散养组(试验组),采集在不同周龄(3、4、6、8、10、13 w)的胸肌、腿肌和腹脂组织样品共360份,采用实时荧光定量PCR法对不同生长阶段组织中capn1和H-FABP基因mRNA表达量进行检测,同时采用索氏抽提法测定胸肌和腿肌的IMF含量。结果表明:黄羽肉鸡的capn1、H-FABP基因在胸肌、腿肌和腹脂中均有不同程度的表达。随着周龄的增加,散养肉鸡capn1基因表达的整体变化趋势为增加—减少—增加—减少,且3～6 w其在胸肌和腹脂中的表达量均表现为笼养显著高于散养(P基因的整体表达趋势随着周龄的增加而降低,在胸肌和腿肌中变化趋势相同,且均表现为散养显著高于笼养(P0.05)。与散养鸡相比,笼养鸡生长速度较快,腹脂率、IMF含量较高。本试验结果可为散养黄羽肉鸡capn1和H-FABP基因分子选育提供一定参考。

关键词：黄羽肉鸡 capn1基因 H-FABP基因肌内脂肪