检索结果-南通市图书馆

Development of an efficient expression system with large cargo capacity for interrogation of gene function in bamboo based on bamboo mosaic virus

引用

Journal of Integrative Plant Biology 2023年第6期65卷 1369-1382页

作者： Yandong Jin Baijie Wang Mingchuan Bao Yujie Li Shengwu Xiao Yuhua Wang Jun Zhang Liangzhen Zhao Hangxiao Zhang Yau-Heiu Hsu Mingjie Li Lianfeng Gu College of Forestry Fujian Agriculture and Forestry UniversityFuzhou 350002China Basic Forestry and Proteomics Research Center School of Future TechnologyCollege of ForestryFujian Agriculture and Forestry UniversityFuzhou 350002China Graduate Institute of Biotechnology Chung Hsing UniversityTaichung 40227China College of crop science Fujian Agriculture and Forestry UniversityFuzhou 350002China

Bamboo is one of the fastest growing plants among monocotyledonous species and is grown extensively in subtropical regions.Although bamboo has high economic value and produces much biomass quickly,gene functional research is hindered by the low efficiency of genetic transformation in this species.We therefore explored the potential of a bamboo mosaic virus(BaMV)-mediated expression system to investigate genotype-phenotype associations.We determined that the sites between the triple gene block proteins(TGBps)and the coat protein(CP)of BaMV are the most efficient insertion sites for the expression of exogenous genes in both monopodial and sympodial bamboo species.Moreover,we validated this system by individually overexpressing the two endogenous genes ace1 and DEC1,which resulted in the promotion and suppression of intemode elongation,respectively.In particular,this system was able to drive the expression of three 2A-linked betalain biosynthesis genes(more than 4 kb in length)to produce betalain,indicating that it has high cargo capacity and may provide the prerequisite basis for the development of a DNA-free bamboo genome editing platform in the future.Since BaMV can infect multiple bamboo species,we anticipate that the system described in this study will greatly contribute to gene function research and further promote the molecular breeding of bamboo.

关键词： ace1 bamboo BaMV-mediated overexpression DEC1 expression virus-mediated genome editing

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

抗性和敏感小菜蛾（Plutella xylostella）及菜蛾啮小蜂（Oomyzus sokolowskii）ace1基因克隆与序列分析

抗性和敏感小菜蛾（Plutella xylostella）及菜蛾啮小蜂（Oomyzus...

引用

作者：李长伟福建农林大学

学位级别：硕士

乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase , AChE,EC3.***.1.7.)是昆虫神经传导中的一种关键酶,在神经传导中起着重要的功能,在胆碱能神经突触间,通过催化神经递质乙酰胆碱(acetylcholine, ATCh)来维持神经冲动的正常传递。AChE是有机磷和氨基... 详细信息

乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase , AChE,EC3.***.1.7.)是昆虫神经传导中的一种关键酶,在神经传导中起着重要的功能,在胆碱能神经突触间,通过催化神经递质乙酰胆碱(acetylcholine, ATCh)来维持神经冲动的正常传递。AChE是有机磷和氨基甲酸酯类杀虫剂的作用靶标。小菜蛾是重大害虫,也是重要的模式昆虫,研究小菜蛾的AChE基因,不仅有助于探讨昆虫对杀虫剂抗性机制,也有助于为开发对害虫高效而对环境没有污染的新型药剂提供科学依据,并指导害虫抗性治理决策。本研究主要研究温度对小菜蛾乙酰胆碱酯酶基因(ace1)频率的影响及抗性、敏感菜蛾啮小蜂ace1基因部分序列及其氨基酸结构改变与抗药性的关系。根据报道的小菜蛾ace1突变位点,设计bi-PASA检测引物,分别检测高温和常温处理对抗性、敏感小菜蛾后代ace1。计算出检测样本中ace1不同基因型的比列和ace1基因频率,从分子水平上证明了温度对小菜蛾抗性和敏感小菜蛾后代ace1基因型和ace1频率的影响。菜蛾啮小蜂(Oomyzus sokolowskii)是小菜蛾(Plutella xylostella)幼虫至蛹期的跨期寄生蜂,是目前报道的小菜蛾主要寄生天敌之一。本研究以菜蛾啮小蜂ace1作为研究对象,分别设计了简并和特异性的引物,首次扩增得到抗性、敏感性菜蛾啮小蜂的ace1基因片段,通过比较抗性、敏感性菜蛾啮小蜂乙酰胆碱酯酶片段发现两个突变位点,并与已报道的其他昆虫、电鳐等生物的乙酰胆碱酯酶序列比较分析,得出有一个突变位点可能与菜蛾啮小蜂抗性有关。本研究的主要结果如下:1.通过比对扩增出的小菜蛾ace1片段序列,得出该序列与已报道的抗丙硫磷小菜蛾ace1序列同源性较高,突变的位点也与报道的一致(G to C)。因此,可以得出本实验中所用材料为抗性小菜蛾。2.bi-PASA检测实验,要求设计四条引物:两条外侧引物(allele-nonspecific-F和allele-nonspecific-R),两条内侧引物(allele-specific-F和allele-specific-R)。allele- specific-F的3’端对应突变型,allele -specific-R的3’端则对应敏感型。外侧引物allele-nonspecific-F和allele-nonspecific-R扩增的片段长度348bp;allele-nonspecific-F和allele -specific-R扩增的片段长度144bp;allele- specific-F和allele-nonspecific-R扩增的片段长度254bp。3.采用bi-PASA技术检测田间小菜蛾F1代成虫G227A突变情况,常温处理F0代作为对照:31.8%突变纯合子、63.6%的杂合子和4.6%的野生型。常温处理的比高温处理的突变纯合子由35.5%降至8.8%,杂合子由61.3 %上升至76.9%,而最明显就是野生型比例由3.2%升高到14.3%。4.常温处理的室内敏感小菜蛾F1代成虫比高温处理的杂合子由32.3%降至30.0%,野生型比例由67.7%升高到70.0%,两种处理中都没有检测到突变纯合子。常温处理F0代作为对照: 33.3%的杂合子和66.7%的野生型,没有检测到突变纯合子。5.常温处理的室内抗性小菜蛾F1代成虫比高温处理的突变纯合子由62.5 %降至22.6%,杂合子比例由37.5%升高到61.3%,常温处理中都没有检测到野生型,而高温处理后F1代中野生型占到16.1%。常温处理F0代作为对照: 68.4%的突变纯合子,32.6%的杂合子,没有检测到野生型。6.计算温度处理抗性和敏感小菜蛾F1代成虫ace1基因频率,常温(25.0℃)处理的田间小菜蛾与高温处理的比较,抗性基因(R)的基因频率从66.1%降至47.1%,敏感基因(S)的基因频率则从33.9%升至52.9%。对于室内筛选敏感小菜蛾(经过相同处理)抗性基因(R)的基因频率从16.1%降至15.0%,敏感基因(S)的基因频率则从83.9%升至85.0%,而室内筛选抗性小菜蛾抗性基因(R)的基因频率从81.3%降至53.2%,敏感基因(S)的基因频率则从18.7%升至46.8%。对比常温处理的抗性、敏感小菜蛾F0代,高温处理后抗性基因(R)的基因频率都降低。7.得到的抗性、敏感菜蛾啮小蜂的ace1序列和其他昆虫、电鳐等生物的乙酰胆碱酯酶氨基酸序列进行比对分析,有分析结果证明了我们克隆到的是ace1基因序列。并发现两个突变位点即:Phe272Leu(TTT to CTT)、Lys303Arg(AAG to AGG)。通过与其他昆虫比较分析,可知Phe272Leu(TTT to CTT)和菜

关键词：抗性敏感小菜蛾菜蛾啮小蜂 ace1 克隆

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

抗性与敏感龟纹瓢虫ace1基因cDNA全长的克隆与表达

抗性与敏感龟纹瓢虫ace1基因cDNA全长的克隆与表达

引用

作者：王萌萌福建农林大学

学位级别：硕士

龟纹瓢虫属鞘翅目瓢虫科,对环境适应性较强,发生代数多,繁殖率高,捕食蚜虫、叶蝉、飞虱等,是一种有利用前途的优良天敌昆虫。近年来,有关天敌昆虫的生物学、田间毒性评价、生态学特性的研究越来越多,较多的天敌防治害虫渐渐应用到实际... 详细信息

龟纹瓢虫属鞘翅目瓢虫科,对环境适应性较强,发生代数多,繁殖率高,捕食蚜虫、叶蝉、飞虱等,是一种有利用前途的优良天敌昆虫。近年来,有关天敌昆虫的生物学、田间毒性评价、生态学特性的研究越来越多,较多的天敌防治害虫渐渐应用到实际生产中,但对其分子生物学方面的研究则较少。乙酰胆碱酿酶(acetylcholinestrase，AChE)是一种主要存在于神经元和神经肌肉接头处的丝氨酸水解酶,也是神经毒剂、有机磷和氨基甲酸酯类杀虫剂的作用靶标。由于近年来农药的广泛使用,导致大量昆虫对有机磷、氨基甲酸酯和等杀虫药剂产生了不同程度的抗药性。目前鞘翅目ace1基因已经克隆出来的只有赤拟谷盗与马铃薯甲虫,而龟纹瓢虫的分子机制研究至今还没有报道。本文以抗性和敏感龟纹瓢虫为材料,首次克隆出一条全长是2928 bp的敏感龟纹瓢虫的ace1基因(PJ-S)(Gene Bank:KP403801)序列,包含1938 bp的完整开放阅读框(ORF),编码645个氨基酸,同样也克隆出一条全长2098 bp的抗性龟纹瓢虫的ace1基因(PJ-R)(Gene Bank:KT779500),包括1938 bp的完整开放阅读框(ORF)，编码645个氨基酸。通过将敏感与抗性龟纹瓢虫的ace1氨基酸序列与其他物种进行比对,与赤拟谷盗ace1的同源性高达85.4%,与马铃薯甲虫ace1同源性达78.8%,发现与其他物种ace 1的同源性在63.5-85.4%之间,与ace2的同源性在33.4-39.7%之间,进化树结果显示与其它物种的ace1聚为一支,并且与鞘翅目昆虫亲缘关系最近。通过将敏感与抗性龟纹瓢虫的ace1氨基酸序列进行比对,结果发现在PJ-S和PJ-R之间有五个氨基酸残基发生了替换(Phe 358 Ser,Lys 493 Glu，Ile 538 Val，Gly 571Arg and Thr 576 Ala),与其它物种的蛋白进行比较发现,龟纹瓢虫敏感与抗性的ace1都存在FGESAG(位点266～271)高度保守区域。而通过比较发现,在龟纹瓢虫敏感与抗性的AchE中,活性中心催化三联体、氧阴离子洞、胆碱结合位点、外周阴离子位点(PAS)、后门这些位置的氨基酸与电鳐中的相一致,而Pj-S ace1酰基口袋口是由Phe 358和Phe 360组成,与电鳐中Phe 290 and Phe 292相一致,而Pj-R ace1酰基口袋口是由Ser358和Phe360组成,此处Pj-Race1发生了突变,而14个芳香族氨基酸残基中有11个是保守的。由于酰基口袋口结构变化将显著影响AChE功能,推测抗性龟纹瓢虫对有机磷杀虫剂的抗性产生可能主要与酰基口袋口是由Ser 358突变有关。本文通过实时荧光定量研究敏感和抗性龟纹瓢虫的ace1的相对表达水平,结果显示抗性ace1的表达量是敏感的5.1倍,ace1表达量的增加,使昆虫抗药性有所增强,ace1表达量的降低使昆虫抗药性降低。由此我们推测龟纹瓢虫的ace1在抗性品系中表达量高于敏感的,可能与抗药性有关。本文成功克隆出抗性和敏感龟纹瓢虫的ace1基因,为研究龟纹瓢虫的抗药性机理及抗药性分子机制提供了理论依据。也可以为研究合理利用害虫天敌进行防治害虫,减少杀虫剂的使用打下基础。

关键词：龟纹瓢虫 AChE 基因克隆 ace1

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

转录因子CRE1及ace1在嗜热毁丝霉纤维素酶基因表达调控中的作用

转录因子CRE1及ACE1在嗜热毁丝霉纤维素酶基因表达调控中的作用

引用

作者：杨帆深圳大学

学位级别：硕士

在自然界中,木质纤维素广泛存在,是最适合生产生物能源的廉价原料。木质纤维素能被许多微生物所产生的纤维素酶系所降解。嗜热真菌由于其产生的酶具有耐高温、稳定性强和不易受污染等优势,在工业应用上具有较高开发潜力。本论文利用RNA... 详细信息

在自然界中,木质纤维素广泛存在,是最适合生产生物能源的廉价原料。木质纤维素能被许多微生物所产生的纤维素酶系所降解。嗜热真菌由于其产生的酶具有耐高温、稳定性强和不易受污染等优势,在工业应用上具有较高开发潜力。本论文利用RNAi技术研究了嗜热毁丝霉（Myceliopthora thermophila）中两转录因子CRE1、ace1对降解木质纤维素降解酶基因的调控作用。本论文的主要研究内容如下:（1）在多种丝状真菌中,葡萄糖代谢阻遏蛋白CRE1所产生的碳源代谢阻遏作用已经被研究得比较清楚。但是它在嗜热毁丝霉（ATCC 42464）中的作用尚未报道。本论文通过RNAi技术证实了CRE1在嗜热毁丝霉中的调控作用。在诱导培养144h时,cre1沉默菌株C88的滤纸酶活性和内切β-1.4-葡萄糖苷酶活分别是野生型菌株Mt的3.76和1.31倍。在120h时,cre1沉默菌株C88中的β-葡萄糖苷酶活和外切β-1.4-葡萄糖苷酶活分别是野生型菌株Mt的2.64和5.59倍。荧光定量分析结果发现菌株C88中的egl1、cbh1和cbh2的m RNA表达量显著高于出发菌株Mt。上述结果显示,在嗜热毁丝霉中CRE1调控因子对纤维素酶相关基因有显著抑制作用。（2）ace1是丝状真菌中另一重要调控因子。该转录因子在嗜热毁丝霉中的作用同样还未被报道。本论文利用RNAi技术证实了ace1在嗜热毁丝霉（ATCC42464）中的调控作用。相比野生型菌株Mt,ace1基因沉默转化菌株A98的滤纸酶活性、内切β-1,4-葡萄糖苷酶活、β-葡萄糖苷酶活、外切β-1,4-葡萄糖苷酶和木聚糖酶活分别高出4.23,3.43,2.30,7.99和3.33倍。该结果表明在嗜热毁丝霉中,ace1同样对纤维素酶基因表达有显著抑制作用。（3）另外,为了进一步提高ace1干扰菌株A98中纤维素酶的产量,我们把重组质粒p UC19-Cre1转入菌株A98中,利用高浓度潮霉素B（100μg/m L）抗性平板筛选出共转化菌株AC8。共转化菌株AC8比A98在滤纸酶活、内切β-1,4-葡萄糖苷酶活、β-葡萄糖苷酶活和外切β-1,4-葡萄糖苷酶活分别高11.47%、24.67%、2.44%和254%,但其木聚糖酶活性未发生变化。本研究结果表明,通过基因工程技术,沉默嗜热毁丝霉菌株中的cre1和ace1基因的表达,提高纤维素酶产量是一种方便快捷的途径。同一菌株中同时干扰两种转录因子ace1和CRE1可进一步提升纤维素酶活性及发酵液总蛋白含量。

关键词：嗜热毁丝霉 RNAi 纤维素酶 CRE1 ace1

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

解淀粉芽孢杆菌barnase-barstar分子调控系统的构建及在烟草花发育调控中的应用研究

解淀粉芽孢杆菌barnase-barstar分子调控系统的构建及在烟草花发...

引用

作者：杨丽丽郑州大学

学位级别：硕士

Barnase是一种来源于解淀粉芽孢杆菌（Bacillus amyloliquefaciens）的细胞致死因子，Barstar是Barnase的抑制因子，barnase-barstar构成一对分子开关可以应用于基因表达调控研究。barnase在花序分生组织中由花序分生组织特异启动子AtR... 详细信息

Barnase是一种来源于解淀粉芽孢杆菌（Bacillus amyloliquefaciens）的细胞致死因子，Barstar是Barnase的抑制因子，barnase-barstar构成一对分子开关可以应用于基因表达调控研究。barnase在花序分生组织中由花序分生组织特异启动子AtREM1启动表达能够使花序分生组织细胞死亡从而抑制植物开花，使植物不能进入生殖生长而长期处于营养生长状态。barstar的表达可以阻止barnase的致死作用，从而使植物恢复其育性进入生殖生长状态产生种子。Barstar由一个嵌合启动子MRE35S90启动，该基因的表达受到人工施加化学诱导剂铜离子的控制，当无化学诱导剂时该基因并不转录表达，当人工添加诱导剂时，该诱导剂与诱导剂作用基因ace1结合，从而使响应启动子启动barstar的表达。本试验所构建的植物生殖器官调控系统可以在特定的时间和空间进行表达，可以根据人们不同的需要来进行人工控制。本试验通过培养解淀粉芽孢杆菌，提取基因组，设计引物，通过PCR的技术手段获得了目的基因barnase及其抑制基因barstar;通过种植培养野生型拟南芥（Arabidopsis thaliana），并通过提取其总基因组DNA，设计目的基因引物，获得花序分生组织特异型启动子AtREM1启动barnase的表达;通过培养野生豌豆（Vicia Linn），提取总基因组，设计引物，得到豌豆rbcs3A终止子;培养农杆菌通过PCR手段获得NOS终止子;培养酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）通过PCR获得ace1基因;人工合成MRE35S90启动子和CaMV35S启动子分别启动barstar和ace1的表达。将获得的各基因组合获得重组表达质粒命名为RBCu，并将该重组质粒转化根癌农杆菌LBA4404，使用农杆菌侵染法转化优质烟草品种NC89从而获得转基因烟草。转基因烟草的检测采用抗除草剂的筛选、普通PCR检测目的基因、Southernblot检测以及实时荧光定量PCR目的基因拷贝数等技术手段，从而在整合水平、转录水平和表达水平上对目的基因进行检测。论文试验完成了解淀粉芽孢杆菌barnase-barstar调控系统的克隆，并构建了植物花发育受阻系统以及化学诱导植物花发育受阻恢复系统，证实了该分子调控系统的有效性。将该系统应用于其他植物中可以达到保护环境和提高经济作物或农作物产量的目的，在一定程度上推动经济的发展和人类社会的可持续发展。

关键词：解淀粉芽孢杆菌 barnase barstar AtREM1启动子 ace1 植物生殖器官发育调控

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

禾谷镰刀菌转录因子ace1与微管蛋白TUA1的功能相关性研究

禾谷镰刀菌转录因子ACE1与微管蛋白TUA1的功能相关性研究

引用

中国植物病理学会2019年学术年会

作者：王欢王晨芳许金荣西农-普度大学联合研究中心旱区作物逆境生物学国家重点实验室西北农林科技大学植物保护学院美国普渡大学植物及植物病理系

禾谷镰刀菌是引起小麦赤霉病的主要病原菌,其产生DON等毒素能严重危害人畜健康。微管是目前我国生产上广泛使用的苯并咪唑类杀菌剂的作用靶标,同时也是重要细胞骨架,在真菌极性生长,物质运输、细胞器定位、有丝分裂和维持细胞形态等众... 详细信息

禾谷镰刀菌是引起小麦赤霉病的主要病原菌,其产生DON等毒素能严重危害人畜健康。微管是目前我国生产上广泛使用的苯并咪唑类杀菌剂的作用靶标,同时也是重要细胞骨架,在真菌极性生长,物质运输、细胞器定位、有丝分裂和维持细胞形态等众多生物学过程中具有重要功能。禾谷镰刀菌具有2个α-微管蛋白基因（FgTUA1,FgTUA2）,课题组前期研究过程中发现,FgTUA1与营养生长和有性生殖密切相关,而FgTUA2无明显表型缺陷。微管发挥作用可能依赖于其微管相关蛋白（microtubule associated proteins）,这种功能分化可能与两个微管蛋白各自的微管相关蛋白调控有关。FgTUA1突变体生长不稳定,容易形成角变子。角变子的产生可能与FgTUA1相关基因上发生突变有关。通过对FgTUA1角变子进行重测序分析,发现有8个角变子在转录因子ace1上发生了终止突变。笔者课题组研究发现,ace1和TUA1双敲突变体和其角变子的菌落形态类似,证明ace1基因的缺失可以回复tua1突变体的生长缺陷。与野生型相比,ace1基因缺失突变体,在生长,产毒,压力筛选和致病方面没有明显缺陷,主要影响有性生殖,其子囊壳较小,没有成型的子囊和子囊孢子。ace1基因定位在细胞质,用10mmol/L氯化钙处理之后,可以进入细胞核。同时,ace1基因缺失不影响4个微管蛋白的定位。另外,课题组研究发现在ace1突变体和其角变子中,TUB1和TUA2基因的表达量明显上升,这说明ace1转录因子主要调控有性生殖,并且通过调控TUB1和TUA2两个基因的表达量来调控微管基因的表达。

关键词：禾谷镰刀菌微管相关蛋白微管辅因子 TUA1 ace1 有性生殖

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

ace1及倍他乐克联用治疗围产期心肌病10例观察

引用

苏州医学院学报 1998年第6期18卷 591-592页

作者：钱定革范丽莉王育林太仓市沙溪人民医院 215421 苏州医学院附属一院

回顾观察联合应用血管紧张素转换酶抑制剂（ace1）及倍他乐克治疗围产期心肌病10例．5个月内心脏结构及功能恢复正常．随访1－2年无复发。

关键词：围产期心肌病 ace1 倍他乐克药物疗法

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

肾性高血压的降压疗法

引用

临床荟萃 1998年第1期13卷 29-31页

作者：马中民鲁玉修马素青河北张家口251医院 075000 张家口通信学院门诊部北京科学教育电影制片厂

肾脏不仅是调节血压的重要脏器,也是高血压的成因,而且是因高血压容易受损害的脏器。高血压治疗的首要目标是预防高血压性脏器损害的进展,减少因心功能不全、肾功能不全、脑卒中等兼症引起的死亡率。目前降压疗法巳明显改善了心功能不... 详细信息

肾脏不仅是调节血压的重要脏器,也是高血压的成因,而且是因高血压容易受损害的脏器。高血压治疗的首要目标是预防高血压性脏器损害的进展,减少因心功能不全、肾功能不全、脑卒中等兼症引起的死亡率。目前降压疗法巳明显改善了心功能不全及脑卒中的死亡率,但并未阻止高血压性肾功能不全患者的增加。为了减少末期肾功能不全患者,目前急需确立肾实质性高血压的降压疗法。本文主要是对肾炎性高血压的降压目标、药物的选择、最新药物及最近动态做一简述。供临床用药参考: 1

关键词：肾性高血压降压疗法药物疗法 ace1

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

siRNA干扰内源性TM9SF1基因对人脐静脉内皮细胞炎症因子及血管紧张素转化酶1表达的影响

引用

广西医科大学学报 2017年第8期34卷 1127-1130页

作者：张国英杨朵高娜娜唐子华李娜仝永娟肖娟首都医科大学附属北京世纪坛医院中心实验室北京100038 湖北文理学院附属襄阳市中心医院神经内科襄阳441021

目的:探讨siRNA干扰内源性TM9SF1基因对人脐静脉内皮细胞(HUVEC)炎症因子及血管紧张素转化酶1(ace1)表达的影响。方法:将HUVEC分为阴性对照组(si-NC组)和转染组(si-TM9SF1组)。以脂质体Lipofectamine 3000将TM9SF1基因特异性siRNA转染至... 详细信息

目的:探讨siRNA干扰内源性TM9SF1基因对人脐静脉内皮细胞(HUVEC)炎症因子及血管紧张素转化酶1(ace1)表达的影响。方法:将HUVEC分为阴性对照组(si-NC组)和转染组(si-TM9SF1组)。以脂质体Lipofectamine 3000将TM9SF1基因特异性siRNA转染至HUVEC细胞,采用实时荧光定量PCR(qPCR)方法检测特异性siRNA对TM9SF1基因的干扰效果,并比较两组白介素(IL)-1β、IL-8和ace1基因的相对表达量。结果:转染TM9SF1基因特异性siRNA 48h后,si-TM9SF1组细胞中TM9SF1基因相对表达量明显低于si-NC组(P1组IL-1β、IL-8和ace1基因相对表达量亦明显低于si-NC组(P1)。结论:干扰内源性TM9SF1可明显抑制HUVEC中炎症因子IL-1β、IL-8及血管收缩相关基因ace1的表达。

关键词： TM9SF1 内皮细胞 RNA干扰炎症相关基因 ace1

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

用权重基因共表达网络分析识别心脏重构关键节点基因

用权重基因共表达网络分析识别心脏重构关键节点基因

引用

共铸医药学术新文明——2012年广东省药师周大会

作者：钟诗龙伍虹杨敏刘晓颖郑志伟林秋雄符永恒麦丽萍周志凌余细勇广东省人民医院医学研究中心广东省心血管病研究所广东省医学科学院广东省临床药理研究所中山大学孙逸仙纪念医院

目的:心肌梗死后的心脏重构是是发生慢性心力衰竭的主要病理基础,而ace1和ace2平衡在慢性心力衰竭的发病机制及其治疗中扮有极其重要作用,然而它们的上游调控机制还不清楚。本课题在采用权重基因共表达网络分析方法(WGCNA)挖掘心肌梗死... 详细信息

目的:心肌梗死后的心脏重构是是发生慢性心力衰竭的主要病理基础,而ace1和ace2平衡在慢性心力衰竭的发病机制及其治疗中扮有极其重要作用,然而它们的上游调控机制还不清楚。本课题在采用权重基因共表达网络分析方法(WGCNA)挖掘心肌梗死后心脏重构的关键节点基因,并研究其与ace1和ace2的关系。方法:从NCBI的GEO下载2个心肌梗死后心脏重构的全基因组表达数据GSE14267和GSE738;数据初处理后,用WGCNA构建基因共表达网络,识别与心脏重构相关的模块与关键节点基因,分析关键节点基因与ace1的关联性;进一步在动物模型中验证RCAN1与ace1和ace2的相关性。结果:分析发现在GSE14267,17个模块中有6个模块与心脏重构显著相关,模块基因显著富集于16条KEGG信号通路。在GSE738,5个模块与心脏重构显著相关,模块基因显著富集于15条KEGG信号通路,其中有10条信号通路与第一组数据结果相同,这些信号通路涉及心肌肥厚病理、氧化磷酸化、代谢等。两组数据结果的高度一致显示WGCNA方法的健壮性和准确性。进一步利用模块内连通性和基因重要性找到了一些心脏重构的关键调控基因,如钙依赖磷酸酶调节子(RCAN1)。RCAN1表达与ace1表达高度相关(r=0.749,Pace2不相关(r=0.144,P=0.532)。在动物模型中验证结果与上述结果一致,ace1在心脏重构中表达增加,而ace2表达基本没改变。结论:权重基因共表达网络分析方法是一个高效的系统生物学方法,应用本方法发现了心脏重构的关键节点基因,其中RCAN1可能影响ace1-ace2在肾素血管紧张素系统中的平衡。

关键词：权重基因共表达网络分析心脏重构关键节点基因RCAN1 ace1

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：