检索结果-南通市图书馆

A型塞尼卡病毒3′非编码区潜在吻环基序突变对微型基因组蛋白表达的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

青岛农业大学学报（自然科学版） 2022年第2期39卷 90-95页

作者：刘拂晓王宁赵地李静孟海蓝李紫薇于永乐董雅琴尼博青岛农业大学动物医学院山东青岛266109 内蒙古农业大学兽医学院内蒙古呼和浩特010018 青岛市黄岛区市场监督管理局山东青岛266500 中国动物卫生与流行病学中心山东青岛266032

A型塞尼卡病毒(Senecavirus A,SVA),可导致猪的口吻部、口腔黏膜、蹄冠部出现水疱样病变,其临床症状与其他水疱型疫病所导致的症状难以区分。该病毒属于小RNA病毒科(Picornaviridae)、塞尼卡病毒属(Senecavirus)成员,其基因组含有5′非... 详细信息

A型塞尼卡病毒(Senecavirus A,SVA),可导致猪的口吻部、口腔黏膜、蹄冠部出现水疱样病变,其临床症状与其他水疱型疫病所导致的症状难以区分。该病毒属于小RNA病毒科(Picornaviridae)、塞尼卡病毒属(Senecavirus)成员,其基因组含有5′非编码区(5′untranslated region,5′UTR)、多聚蛋白的开放阅读框及3′非编码区(3′untranslated region,3′UTR)。过去有报道预测该病毒的3′UTR含有一个三碱基配对的潜在RNA吻环结构,但未被试验证实。构建了7个不同吻环基序突变的SVA微型基因组,将其分别与另一荧光报告质粒共转染细胞后,进行双荧光素酶报告分析。结果证明潜在吻环结构的破坏未能干扰5′UTR启动蛋白的表达。

关键词： A型塞尼卡病毒 3′非编码区吻环微型基因组双荧光素酶报告分析

猪源牛病毒性腹泻病毒SD0803株3′非编码区的克隆及结构分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国兽医科学 2013年第9期43卷 958-962页

作者：邓宇袁世山童武单同领文心田童光志郑浩中国农业科学院上海兽医研究所上海200241 西昌学院动物科学学院四川西昌615000 四川农业大学动物医学院四川雅安625014

为了研究猪源牛病毒性腹泻病毒(BVDV)SD0803株3′非编码区(3′-UTR)的结构及其在病毒复制与转录中的作用,采用病毒RNA 3′末端加Poly(A)尾的方法与3′RACE技术对SD0803株3′末端序列进行了扩增、克隆与测序,并应用Clustal W、CLC RNA Wo... 详细信息

为了研究猪源牛病毒性腹泻病毒(BVDV)SD0803株3′非编码区(3′-UTR)的结构及其在病毒复制与转录中的作用,采用病毒RNA 3′末端加Poly(A)尾的方法与3′RACE技术对SD0803株3′末端序列进行了扩增、克隆与测序,并应用Clustal W、CLC RNA Workbench 4软件对3′-UTR一级与二级结构进行分析。结果表明,SD0803株3′-UTR由186nt组成,与ZM-95、NADL、SD-1株核苷酸同源性分别为85.4%、53.8%、57.5%;SD0803与其他BVDV株一样,其一级结构均存在1个高变区与1个相对保守区;在高变区缺失约40nt;在RNA 3′末端二级结构方面,SD0803株与ZM-95株均具有3个茎-环结构,而与具有4个茎-环结构的牛源BVDV差异较大。

关键词：牛病毒性腹泻病毒 3′非编码区 3′RACE 结构分析

法洛四联症与NOTCH1和JAG1基因3′非编码区变异的相关性研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

重庆医学 2021年第10期50卷 1715-1720页

作者：杨小芳崔芬芬李元敏周文君党国琴胡源路宁兰州大学第一医院心血管外科兰州730000

目的探讨法洛四联症(TOF)与NOTCH1和JAG1基因3′非编码区(3′UTR)变异的相关性,为TOF患者临床诊断提供遗传依据。方法采用民族-病例-对照的研究方法,收集20例汉族TOF患者及14例回族TOF患者,并分别以20名汉族及20名回族健康体检者为对照... 详细信息

目的探讨法洛四联症(TOF)与NOTCH1和JAG1基因3′非编码区(3′UTR)变异的相关性,为TOF患者临床诊断提供遗传依据。方法采用民族-病例-对照的研究方法,收集20例汉族TOF患者及14例回族TOF患者,并分别以20名汉族及20名回族健康体检者为对照组,筛选出TOF患者在两个民族人群中,NOTCH1和JAG1基因3′UTR存在的变异。通过PCR技术,结合DNA序列测序,测定、验证、确定样本人群中这些变异位点;进一步运用TargetScan、PicTar和***等软件对变异位点可能结合miRNA进行分析,推测其和TOF发生、发展的相关性。结果检测出TOF患者NOTCH1基因3′UTR存在3个单核苷酸多态性(SNP),JAG1基因3′UTR存在6个SNP位点。9个SNP位点在4组对象中的分布频数存在差异,但差异无统计学意义(P>0.05)。其中JAG1基因3′UTR rs542746042位点在汉族对照组与汉族病例组之间的分布,差异有统计学意义(P3′UTR有差异的SNP位点(486delT)可与miRNA结合。结论NOTCH1和JAG1基因3′UTR的核苷酸变异可能与TOF的发生相关。

关键词：法洛四联症 NOTCH1基因 JAG1基因 3′非编码区单核苷酸多态性

小RNA病毒基因组3′非编码区结构与功能研究进展

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

动物医学进展 2011年第4期32卷 86-90页

作者：娄慧吕建亮张永光中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室国家口蹄疫参考实验室甘肃兰州730046

小RNA病毒属于单股正链RNA病毒,包括肠道病毒属、鼻病毒属、心脏病毒属、口疮病毒属和肝病毒属等几个主要的属。口蹄疫病毒(FMDV)、脊髓灰质炎病毒(PV)、丙型肝炎病毒(HCV)、脑心肌炎病毒(EMCV)是该科病毒的典型代表。小RNA基因组的末... 详细信息

小RNA病毒属于单股正链RNA病毒,包括肠道病毒属、鼻病毒属、心脏病毒属、口疮病毒属和肝病毒属等几个主要的属。口蹄疫病毒(FMDV)、脊髓灰质炎病毒(PV)、丙型肝炎病毒(HCV)、脑心肌炎病毒(EMCV)是该科病毒的典型代表。小RNA基因组的末端具有非编码区(UTR),是病毒基因组复制的主要调控位点,3′非编码(3′UTR)区是复制酶的第一结合位点,其二级结构在病毒的翻译与复制过程中具有重要作用,该区是病毒复制酶识别并结合的位点,主要起始负链RNA的合成,3′UTR在病毒的翻译过程及感染性病毒粒子的形成过程中起着十分重要的作用。因此,研究小RNA基因组的3′端结构和功能可为确定复制与表达位点在非编码区的具体位置和主要特征,以及其他正链小RNA病毒基因组复制的研究奠定了理论基础。

关键词：小RNA病毒 3′非编码区结合位点复制转录翻译

猪瘟病毒Thiverval株3′非编码区插入片段对病毒拯救的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国预防兽医学报 2009年第6期31卷 420-423页

作者：范运峰赵启祖赵耘邹兴启张仲秋王琴宁宜宝中国兽医药品监察所北京100081 中国动物疫病预防控制中心北京100026

猪瘟病毒(CSFV)疫苗株Thiverval株与亲本病毒Alfort株相比,最明显的区别就是其3'-UTR含有一定长度的插入序列。本研究通过反向遗传学操作,构建了3'-UTR含有19nt、32nt以及插入片段完全缺失的CSFV Thiverval株全长cDNA感染性克隆,将突变... 详细信息

猪瘟病毒(CSFV)疫苗株Thiverval株与亲本病毒Alfort株相比,最明显的区别就是其3'-UTR含有一定长度的插入序列。本研究通过反向遗传学操作,构建了3'-UTR含有19nt、32nt以及插入片段完全缺失的CSFV Thiverval株全长cDNA感染性克隆,将突变病毒基因组进行体外转录,利用BHK-21细胞转染、PK-15细胞传代增殖的方式成功的从3种重组突变感染性克隆中拯救出活病毒粒子,表明CSFV疫苗株3'-UTR插入片段并不影响病毒的拯救。通过3'-UTR二级结构模拟,发现疫苗株的插入片段导致3'-UTR空间构型发生改变、自由能升高、影响二级结构的稳定性,可能是导致疫苗株毒力减弱的原因之一。

关键词：猪瘟病毒 3′非编码区插入片段病毒拯救二级结构分析

HIF-1α基因3′非编码区多态性与胰腺癌发生发展的相关研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

山东医药 2013年第20期53卷 1-3页

作者：张圣杰王秀超贾玲玲任贺郝继辉天津医科大学附属肿瘤医院天津300060

目的探讨缺氧诱导因子1α(HIF-1α)基因3′非编码区多态性与胰腺癌发生、发展的关系。方法以病例对照研究方法,采用聚合酶链扩增(PCR)和DNA序列测定分析技术,对291例胰腺癌患者(病例组)和247例健康对照者(对照组)的HIF-1α基因多态性位... 详细信息

目的探讨缺氧诱导因子1α(HIF-1α)基因3′非编码区多态性与胰腺癌发生、发展的关系。方法以病例对照研究方法,采用聚合酶链扩增(PCR)和DNA序列测定分析技术,对291例胰腺癌患者(病例组)和247例健康对照者(对照组)的HIF-1α基因多态性位点进行特异扩增检测,分析HIF-1α3′非编码区SNP位点rs2057482基因型分布与胰腺癌发病风险的关系和对胰腺癌患者临床病理特征的影响。结果 HIF-1α基因rs2057482位点C/C基因型在病例组和对照组的频率分别为73.5%和61.9%,rs2057482位点C/T+T/T在病例组和对照组的频率分别为26.5%和38.1%,两者差异有统计学意义(P314)。通过Logistic回归分析,胰腺癌中C/C基因型患者生存时间为(14.0±2.1)个月,低于C/T+T/T基因型患者的(25.2±6.3)个月(P=0.01),且该位点在是否淋巴结转移者间基因型分布差异有统计学意义(P3'非编码区rs2057482位点的单核苷酸多态性在胰腺癌发生、发展过程中发挥作用。

关键词：胰腺癌缺氧诱导因子1α 基因多态性 3′非编码区

中国大陆1b型丙型肝炎病毒3’非编码区序列变异研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华肝脏病杂志 2002年第6期10卷 469-470页

作者：秦兆习丛旭蒋栋哈明昊陈红松魏来北京大学人民医院北京大学肝病研究所北京100044 北京大学人民医院北京大学肝病研究所北京100044

丙型肝炎病毒(HCV)是一类有包膜的单股正链RNA病毒,其基因组全长约9 600bp,5'端和3'端各有一非编码区,3'非编码区(3'UTR)长约220～272 bp[1].

关键词：终止密码子 RT-PCR 中国大陆 1b型丙型肝炎病毒 3′非编码区序列变异

4株SARS冠状病毒中国分离株3′非编码区的序列测定及分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国生物化学与分子生物学报 2003年第3期19卷 273-277页

作者：范宝昌姜涛于曼邓永强彭文明常国辉司炳银刘伯华杨保安祝庆余秦鄂德军事医学科学院微生物流行病研究所北京100071

分别对 4株SARS冠状病毒中国株基因组 3′非编码区序列进行测定和分析 ,然后应用Blast、DNAstarGeneQuest等软件对中国株的这段序列与其它SARS和非SARS冠状病毒的序列进行比较 .结果显示 ,所测 4株SARS冠状病毒中国分离株的 3′非编码... 详细信息

分别对 4株SARS冠状病毒中国株基因组 3′非编码区序列进行测定和分析 ,然后应用Blast、DNAstarGeneQuest等软件对中国株的这段序列与其它SARS和非SARS冠状病毒的序列进行比较 .结果显示 ,所测 4株SARS冠状病毒中国分离株的 3′非编码区长度均为 339nt,与其它已测序SARS冠状病毒的相应序列完全一致 .SARS冠状病毒的非编码区含有冠状病毒保守的“伪结”结构 .在距末端 138nt处还存在 1个长约 32nt的Ⅱ型茎环结构的序列 ,该序列在其它已知人冠状病毒中并不存在 ,而与禽传染性支气管炎病毒和星状病毒中的对应序列高度同源 .

关键词： SARS冠状病毒中国分离株序列测定 3′非编码区重症急性呼吸综合征非典型肺炎

从基因组3′非编码区看黄病毒科各成员的进化关系

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物学通报 2006年第10期41卷 10-12页

作者：张舒蕾肖明上海市省吾高级中学上海200042 上海师范大学生命与环境科学学院上海200042

利用生物信息学的方法,分析黄病毒科成员的进化关系,为研究病毒的重组机制、起源、为研制有效的抗病毒药物提供理论基础。

关键词：黄病毒科 3′非编码区进化树生物信息学