检索结果-南通市图书馆

环境与职业医学 2024年第3期41卷 243-250页

作者：廖萍严沁张奕何欣朱佩云齐健刘茶珍刘桐施燕王文静上海市疾病预防控制中心/上海市预防医学研究院慢性非传染病与伤害防治所上海200336 上海健康医学院附属卫生学校上海200237

[背景]多项研究表明肠道微生物菌群组成上的变化与肥胖关系密切,但儿童研究较少,且研究结果受到种族、地理位置等因素的影响。[目的]在上海市2~6岁儿童人群中进行肠道微生物菌群多样性分析,观察肥胖/超重与正常体重儿童之间肠道微生物... 详细信息

[背景]多项研究表明肠道微生物菌群组成上的变化与肥胖关系密切,但儿童研究较少,且研究结果受到种族、地理位置等因素的影响。[目的]在上海市2~6岁儿童人群中进行肠道微生物菌群多样性分析,观察肥胖/超重与正常体重儿童之间肠道微生物菌群分布特点及物种差异,探讨肥胖/超重与肠道菌群多样性的关联。[方法]采集上海市74例2~6岁儿童粪便样本,其中肥胖/超重18人,男性6人,女性12人(男女比例为1∶2);正常体重56人,男性18人,女性38人(男女比例约为1∶2)。提取粪便样品中细菌的16s rdna,进行PCr扩增、文库构建和高通量测序。采用Naive Bayes算法对扩增子序列变异(AsV)的代表序列及丰度信息进行物种分类学分析(门、纲、目、科、属、种)、群落多样性(sobs指数、shannon指数、shannoneven指数、Coverage指数、PD指数、主坐标分析)分析等。运用Wilcoxon秩和检验、P值多重检验校正、相似性分析检验等对两组进行差异分析,获得儿童肠道菌群组成分布特点及物种差异信息。[结果]共计完成74个粪便样本的测序并对测序结果进行质控和过滤,获得优化序列4905306条,得到1860个AsVs。对AsVs进行多样性数据分析,得到8个分类学水平的物种注释结果889个。α多样性分析表明肥胖/超重儿童群落丰富度(sobs指数)、多样性(shannon指数)、均匀度(shannoneven指数)、谱系多样性(PD指数)均比正常体重儿童有所上升,但是两组无统计学差异(P>0.05)。β多样性分析显示两组微生物物种组成组间差异不大,未见明显聚类。从门、目、科、属四种分类学水平上对74例样本进行物种组成分析,结果显示两组肠道菌群都存在一致的核心菌群结构,但是菌群组成有差异。两组间菌群组成差异表现在目、科、属这三个分类学水平上,其中厚壁菌门下的丹毒丝菌目丹毒荚膜菌科的丹毒丝菌属UCG003、链型杆菌属在OB_OW组中显著富集,且对肥胖/超重这一表型差异贡献较大[线性判别分析值(LDA)=3.72,P<0.01;LDA=3.29,P<0.05]。变形菌门下的肠杆菌目肠杆菌科未分类肠杆菌属在体重正常组中显著富集,且对体重正常这一表型差异贡献较大(LDA=3.93,P<0.05)。[结论]上海2~6岁肥胖/超重儿童肠道菌群的丰富度和多样性增高,但与正常体重儿童相比无差异。肥胖/超重组和正常体重组存在肠道菌群组成差异。

关键词：肠道微生物菌群儿童超重肥胖 16s r dna测序

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

肠道微生物在绿僵菌感染黑翅土白蚁过程中的作用机制研究

肠道微生物在绿僵菌感染黑翅土白蚁过程中的作用机制研究

引用

作者：吴辰雨江苏科技大学

学位级别：硕士

黑翅土白蚁Odontotermes formosanus属于蜚蠊目Blattodea下的白蚁科Termitidae的大白蚁亚科Macrotermitinae,是大白蚁亚科中物种丰富度最高的属,主要分布在非洲和亚洲。它作为高密度群居的社会性昆虫,在整个生活史中会面临各种病原的侵... 详细信息

黑翅土白蚁Odontotermes formosanus属于蜚蠊目Blattodea下的白蚁科Termitidae的大白蚁亚科Macrotermitinae,是大白蚁亚科中物种丰富度最高的属,主要分布在非洲和亚洲。它作为高密度群居的社会性昆虫,在整个生活史中会面临各种病原的侵害,因此进化出了一系列独特的免疫机制。已有研究表明肠道共生菌群可以促进宿主的先天免疫,协同宿主来建立免疫体系以增强在自然界的生存能力。白蚁肠道共生菌群在纤维素降解方面的作用已得到确认,但是其在白蚁免疫中的作用及其机制还未见报道。白蚁后肠内有多种共生菌,是一个丰富又复杂的生态内环境。揭示绿僵菌感染宿主后肠道菌群的变化,可以了解到绿僵菌感染过程中肠道菌群是如何应对绿僵菌感染的不利环境的,更为重要的是,通过对昆虫重要免疫活动的研究,会提供更多靶标基因供生物防治利用。本研究利用罗伯茨绿僵菌感染黑翅土白蚁。在解剖镜、光学显微镜和电子显微镜观察到白蚁肠道内变化的基础上,通过16s rdna测序和宏基因组测序的方法,对其感染前后的肠道菌群结构变化进行分析,鉴定高等白蚁在抵抗绿僵菌感染过程中可能起关键作用的细菌类群,利用宏基因组测序构建感染前后肠道共生菌群的代谢通路,揭示发生显著变化的信号通路,以解析肠道共生菌群在高等白蚁免疫中的具体作用及其分子机制。基于宏基因组数据组装单菌基因组对未培养细菌的代谢潜能做了探讨,揭示了未知微生物对绿僵菌入侵的潜在措施。本研究一方面将对白蚁的免疫机制有新的理解,可以从另一角度理解白蚁共生体的共生机理,丰富共生理论,另一方面有望对白蚁的生物防治提供理论和实践指导。全文主要结果如下:1.本研究分别在解剖镜、光学显微镜和电子显微镜下观察绿僵菌入侵后白蚁肠道内情况。首先绿僵菌的感染会导致白蚁的死亡,而且在感染初期绿僵菌进入了肠道内,并抵达了微生物聚集最多的区域——后肠。绿僵菌的入侵导致了肠道微生物的紊乱,体现为肠道微生物密度的增加。但是到感染末期,也就是群体濒临死亡时,肠道上皮屏障却未遭到破坏,这体现了肠道微生物保护肠道组织不受绿僵菌的感染。2.基于16s rdna测序对其感染前后的肠道菌群结构变化进行分析,共获得1938个OTU(Operational Taxonomic Units)。其中,能够注释到数据库的OTU数量为1865个。主要研究了肠道菌落整体水平的多样性和相对丰度的变化,以及绿僵菌感染期间显著变化的菌门的变化趋势。本研究发现,在感染初期,白蚁肠道微生物群落的丰度和多样性发生了降低,之后缓慢恢复,最终趋于平衡。体现了菌落水平上,肠道菌群为了应对绿僵菌感染的不利环境所做出的措施。大部分的菌门变化并不明显,说明大部分菌门对于绿僵菌的抵抗能力较强,而存在三种显著变化的菌门脱铁杆菌门Deferribacteres、变形菌门Proteobacteria和螺旋体门spirochaetes,体现了它们对于绿僵菌感染的敏感性。3.采用Illumina Hiseq平台进行宏基因组测序,质控后进行基因预测,得到792 038个OrF,总长度为472.72 Mbp,其中完整基因数为214 957个。在KEGG数据库中进行通路的注释,发现整体功能在感染中期内有了显著的下调,包括了能量代谢子系统(固碳途径、甲烷代谢、氮代谢、氧化磷酸化和硫代谢)以及细胞运动(细菌趋化性、细菌运动蛋白和鞭毛装配,子系统ABC转运体、磷酸转移酶系统(PTs)和转运体(功能类:膜转运))。但是蛋白质输出和核糖体相关通路在感染初期被激活,暗示了这方面抵抗绿僵菌的手段。同时,本研究注释到了3个免疫通路:NOD样受体信号通路、抗原加工提呈和Th17细胞分化。分析显示,这些免疫通路主要由肠道共生菌中的厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes、变形菌门Proteobacteria、螺旋体门spirochaetes参与了,且三条通路中均发现了Hsp90基因的表达,暗示了Hsp90是白蚁肠道共生菌参与先天免疫的保守基因。此外,本研究使用分箱法(binning)进行了单菌基因组的组装,共分离出了218个微生物基因组草图,其中高质量的基因组草图有36个,通过系统发育分析探讨了白蚁肠道微生物的进化模式。根据物种级基因组仓sGB数据库对每个分箱与其最接近的物种进行注释,得到了两个已知的菌株Trabulsiella odontotermitis,Acinetobacter oleivorans,而绝大多数的微生物基因组属于未知物种,并对高质量微生物基因组进行代谢功能注释,挖掘了未培养菌株的潜在功能。

关键词：黑翅土白蚁绿僵菌 16s r dna测序宏基因组肠道微生物

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：