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低氧胁迫下鲢miR-17a-5p及其靶基因分析

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水产学报 2023年第1期47卷 138-151页

作者：李晓晖冯翠王巧欣邹桂伟梁宏伟中国水产科学研究院长江水产研究所华中农业大学湖北洪山实验室

为了探究miR-17a-5p在鲢低氧胁迫下的功能，在前期鲢small RNA测序的基础上对鲢miR-17a-5p进行靶基因预测及功能富集分析，通过双荧光素酶活性验证其与HIF-1α的靶向关系，并检测低氧胁迫下miR-17a-5p和其靶基因在鲢肝脏、脑、心脏和鳃... 详细信息

为了探究miR-17a-5p在鲢低氧胁迫下的功能，在前期鲢small RNA测序的基础上对鲢miR-17a-5p进行靶基因预测及功能富集分析，通过双荧光素酶活性验证其与HIF-1α的靶向关系，并检测低氧胁迫下miR-17a-5p和其靶基因在鲢肝脏、脑、心脏和鳃四个组织中的动态表达特征。结果显示，鲢miR-17a-5p在不同物种间高度保守，预测出381个miR-17a-5p的潜在靶基因显著富集在硫代谢、mTOR信号通路以及萜类骨架的生物合成3个KEGG信号通路上。miR-17a-5p可与HIF-1α mRNA的3′UTR结合，并降低HIF-1α mRNA水平，低氧胁迫下miR-17a-5p的表达呈下降趋势，而HIF-1α表达则呈上升趋势；3个显著富集KEGG通路中的11个miR-17a-5p潜在靶基因在低氧胁迫过程中的不同组织中的表达，尤其是肝脏中的表达，除SGK1外，均呈显著上升趋势。研究表明，低氧胁迫下鲢各组织中miR-17a-5p的表达下调减弱了其对靶基因的抑制作用，进而导致HIF-1α、ddit4和Lrp5等响应低氧胁迫的基因表达上调。本研究为低氧胁迫下鲢miRNA的表达与调控机制提供新见解，也为培育耐低氧的鲢新品系(种)提供了参考。

关键词：鲢 miR-17a-5p 低氧双荧光素酶靶基因信号通路

以鲢、鳙放养为主的武山湖后生浮游动物群落结构特征

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长江流域资源与环境 2021年第8期30卷 1848-1857页

作者：张佳敏高健杨诚焦一滢廖明军熊文赵以军湖北工业大学土木建筑与环境学院河湖生态修复与藻类利用湖北省重点实验室湖北武汉430068

武山湖是紧邻长江的通江型富营养湖泊。为了解该湖在以鲢、鳙放养为主的情况下后生浮游动物结构特征,于2017年9月至2018年8月对其后生浮游动物群落结构特征开展了监测。结果表明,武山湖共采集浮游动物61种(属),其中轮虫24种,枝角类23种... 详细信息

武山湖是紧邻长江的通江型富营养湖泊。为了解该湖在以鲢、鳙放养为主的情况下后生浮游动物结构特征,于2017年9月至2018年8月对其后生浮游动物群落结构特征开展了监测。结果表明,武山湖共采集浮游动物61种(属),其中轮虫24种,枝角类23种和桡足类14种;优势种共有13种,其中轮虫12种和桡足类1种。轮虫丰度全年有11个月占比超过70%,而桡足类和枝角类全年占比均较小。就生物量而言,轮虫全年有10个月占比超过80%,但桡足类生物量占比在实施冬季捕捞期间即12月、1月和2月占比分别为20.1%、79.2%和51.8%,明显比其他月份高,表明减少鲢、鳙能够减缓浮游动物被捕食压力。冗余分析结果显示温度、叶绿素a和pH是影响武山湖浮游动物群落结构的关键因子。研究结果表明武山湖后生浮游动物以小型轮虫为主,枝角类和桡足类数量少且仅为小型种类。

关键词：武山湖后生浮游动物群落结构鲢鳙

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基于微卫星分析的长丰鲢种质资源遗传监测

水生生物学报 2022年第5期46卷 725-734页

作者：罗相忠覃维敏梁宏伟沙航邹桂伟中国水产科学研究院长江水产研究所武汉430223

长丰鲢(CF)为我国人工培育的鱼类新品种,自推广应用以来取得了良好的效果。开展长丰鲢种质资源遗传监测,对其优良性状保持具重要作用。研究采用18对微卫星引物分析了鲢(L)和长丰鲢世代间(CF_(1)、CF_(2)和CF_(3))的遗传多样性和遗传结... 详细信息

长丰鲢(CF)为我国人工培育的鱼类新品种,自推广应用以来取得了良好的效果。开展长丰鲢种质资源遗传监测,对其优良性状保持具重要作用。研究采用18对微卫星引物分析了鲢(L)和长丰鲢世代间(CF_(1)、CF_(2)和CF_(3))的遗传多样性和遗传结构。结果表明:鲢遗传多样性指数高于长丰鲢,遗传多样性也较长丰鲢丰富。而长丰鲢子代间CF_(1)到CF_(3)平均等位基因数(N_(a))从5.7222下降到5.0556;平均有效等位基因数(N_(e))从3.2551下降到3.1461;平均观测杂合度(H_(o))从0.6975下降到0.5407;平均期望杂合度(H_(e))从0.6422下降到0.6235;多态信息含量(PIC)从0.5784下降到0.5609。CF_(1)到CF_(3)的遗传参数是逐渐下降,遗传多样性逐渐降低,但群体间遗传多样性仍较高。长丰鲢子代间F_(st)在0.0160—0.0315,表明其群体已出现了遗传分化,但分化程度较低。长丰鲢各世代间遗传距离逐渐增加,遗传相似度逐渐减小。研究表明经过连续3代利用,长丰鲢CF_(1)到CF_(3)的遗传结构发生了改变,遗传多样性呈下降趋势,但遗传多样性水平仍较高。研究结果为长丰鲢进一步优良性状的维持提供了依据。

关键词：遗传多样性种质遗传监测遗传结构微卫星鲢长丰鲢

不同体型大小的鲢对富营养化水体中浮游植物的影响

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生态科学 2023年第3期42卷 98-105页

作者：靳晓彤唐雅丽郭佳林秋奇暨南大学水生生物研究中心广州510632

浮游植物生物量及群落结构的变化是水体富营养程度的重要表征。鲢是典型的滤食性鱼类,不同大小的鲢会因鳃耙间距的不同对浮游植物进行选择性滤食。为研究不同体型大小的鲢对富营养化水体中浮游植物的影响,于2016年秋季在广东省流溪河水... 详细信息

浮游植物生物量及群落结构的变化是水体富营养程度的重要表征。鲢是典型的滤食性鱼类,不同大小的鲢会因鳃耙间距的不同对浮游植物进行选择性滤食。为研究不同体型大小的鲢对富营养化水体中浮游植物的影响,于2016年秋季在广东省流溪河水库进行了模拟富营养化条件的室外围隔(体积约为85 m^(3))实验,设置了三个实验组:无鱼对照组、大白鲢组(625.00±25.00)g·ind^(–1)和小白鲢组(10.10±0.50)g·ind^(–1),每组3个重复,以7 g·m^(–3)的密度放养鲢2周后,分别采集浮游植物样品。研究结果显示,实验结束时有鱼组浮游植物生物量均显著低于对照组,其中小白鲢组浮游植物的生物量显著低于大白鲢组,且主要差距为20μm以下的浮游植物。同时,小白鲢组、大白鲢组和对照组的浮游植物群落结构差异显著,冗余分析(RDA)显示微囊藻和隐藻是造成大白鲢组与小白鲢组群落差异的关键藻属。研究发现小白鲢对浮游植物,尤其是微型浮游植物(鲢更好。此结果对水体管理具有一定的参考意义。

关键词：鲢体型大小浮游植物富营养化围隔实验

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光环境对鲢幼鱼行为特性与上溯趋势影响

水产学报 2024年

作者：张金玉石小涛林晨宇向露露黄婕石尚上杨梓静李卫东魏浪湖北省当阳市河道堤防管理局三峡大学湖北省鱼类过坝技术国际科技合作基地三峡大学三峡库区生态环境教育部工程研究中心中国电建集团贵阳勘测设计研究院有限公司三峡大学鱼类保护研究所

为帮助鱼类洄游过坝，提高我国过鱼设施内鱼类的上溯效率，本实验旨在研究鱼类在不同光照水平下的趋光性和行为特征对上溯积极性的影响。实验以我国主要经济鱼种鲢幼鱼为实验对象，根据其在不同波长和照度水平下的趋光性、应激程度、活... 详细信息

为帮助鱼类洄游过坝，提高我国过鱼设施内鱼类的上溯效率，本实验旨在研究鱼类在不同光照水平下的趋光性和行为特征对上溯积极性的影响。实验以我国主要经济鱼种鲢幼鱼为实验对象，根据其在不同波长和照度水平下的趋光性、应激程度、活跃性和趋光积极性，分析各因素对不同流速下上溯积极性的影响。结果显示，（1）红光中，鲢的偏好照度为3.268～5.444 lx；蓝光中，鲢的可接受照度范围为0.033～10.511 lx；绿光中，鲢可接受照度和偏好照度为0.367～74.489 lx和3.776～9.833 lx；白光中，鲢不存在偏好与可接受照度范围。（2）鲢的应激程度在红、绿光条件下随照度增加先增后减，在蓝光条件下单调递增；鲢的活跃性在红、绿光条件下随照度增加单调递增，在蓝光条件波动上升。（3）鲢的上溯趋势主要受光偏好特性和应激程度影响，当应激程度较低时，上溯积极性随趋光积极性增大而增大；当应激程度较高时，上溯积极性随趋光积极性增大而减小。综合已获结果，在过鱼设施进口处布设10 lx红色光源可吸引鱼群，在通道内进行避光处理并间隔架设1 000 lx绿色光源可保障鱼群持续上溯，于水轮机上游危险区域设置蓝光1 000 lx和0.35 m/s流速组合可减少鱼群靠近。本研究为护鱼工程针对不同过鱼场景的优化提供了理论和数据支撑。

关键词：鲢光环境流速上溯效率过鱼设施

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鲢生长性状的全基因组关联分析

鲢生长性状的全基因组关联分析

作者：何国玉华中农业大学

学位级别：硕士

鲢(Hypophthalmichthys molitrix)是我国重要的水产养殖经济鱼类,作为“四大家鱼”之一,有着病害少、肉质好等特点。然而,鲢的养殖繁育中还存在着不耐低氧、生长周期长、良种率低的问题。作为重要的经济性状,鱼类的生长直接影响着养殖... 详细信息

鲢(Hypophthalmichthys molitrix)是我国重要的水产养殖经济鱼类,作为“四大家鱼”之一,有着病害少、肉质好等特点。然而,鲢的养殖繁育中还存在着不耐低氧、生长周期长、良种率低的问题。作为重要的经济性状,鱼类的生长直接影响着养殖产量。为促进鲢养殖产业的发展,提高育种效率,本研究首次通过全基因组关联分析(GWAS)对鲢的生长性状进行遗传定位,筛选与生长相关的SNP位点,鉴定相关候选基因,从而为良种的选育提供理论基础。主要研究结果如下:1、鲢表型性状的采集和对比分析从来自湖北、湖南、江苏、重庆等地的10个鲢原良种场及养殖场采集了300尾鲢群体样本,对不同群体的体重、全长、体长等形态指标各自进行了统计分析,结果显示各类性状水平差异较大,其中体重的变异系数最大,最高达51.17%,其次是吻长和尾柄长。为了探究不同群体各生长性状间的关系,对300尾鲢的生长性状数据进行了相关性分析,结果显示各生长性状间的相关系数介于0.51.99之间,具有较高的相关性。随后,从10个群体中筛选了6个年龄相近的群体,对其各生长指标进行对比分析,结果显示湖北和湖南群体、天津和江西群体之间的差异不显著,吴江和重庆群体与其他群体差异显著。最后,将10个群体300尾鱼的数据一起进行统计分析,发现这些群体鱼的各生长性状均不符合正态分布,根据其分布情况剔除掉15尾显著离群个体后,数据分布满足了正态性。2、鲢生长性状的全基因组关联分析通过重测序方法对上述筛选后得到的285尾鲢个体进行基因分型,并用得到的7458562个高质量SNP位点,对上述9个生长性状进行全基因组关联分析,最终在24条染色体上定位到了149个显著的SNP位点,其中体重、全长、体高、头长、吻长、眼间距分别鉴定到10个、1个、4个、49个、3个、82个位点。在这些位点上下游20Kb范围内进行扫描,初步注释到了146个潜在相关的基因(含33个重复),经Uniprot数据库和文献查找,最终鉴定到了stac3、nlrc3、ppargcla、prrx1、smurf1、ptprf、cacna1d、lrfn2、e2f3等16个与生长相关的候选基因,它们主要参与细胞因子响应、骨骼肌生长、蛋白质合成、细胞增殖和凋亡、脂肪形成等生物学过程。综上所述,从10个鲢原良种场及养殖场表型数据的分析来看,我国关于鲢的养殖情况存在差异,进行GWAS分析鉴定到了与生长性状相关联的149个位点,并且注释到146个潜在相关基因和16个候选基因。本研究结果有助于我们了解国内主养区鲢遗传资源生长状况和特点,鉴定到的位点和基因也可为鲢新品种的培育提供参考,进而加快我国鲢养殖产业良种化的进程。

关键词：全基因组关联分析生长性状 SNP 鲢

鲢EST-SSR标记的开发及其与生长性状关联性分析

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水生生物学报 2020年第3期44卷 494-500页

作者：王丹邹桂伟罗相忠中国水产科学研究院长江水产研究所武汉430223

研究采用Illumina高通量测序技术对鲢(Hypophthalmichthys molitrix)卵组织进行转录组测序分析,筛选多态EST-SSR标记并与生长性状进行关联性分析。研究结果显示:(1)测序组装总Unigene 77129个, SSR共24458个,占所测EST数据的31.7%。鲢包... 详细信息

研究采用Illumina高通量测序技术对鲢(Hypophthalmichthys molitrix)卵组织进行转录组测序分析,筛选多态EST-SSR标记并与生长性状进行关联性分析。研究结果显示:(1)测序组装总Unigene 77129个, SSR共24458个,占所测EST数据的31.7%。鲢包含SSR的EST序列主要有二碱基、三碱基、四碱基和五碱基组成。二碱基中, AC含量最丰富;(2)随机挑选175条EST序列设计SSR引物,筛选出多态EST-SSR标记36个, Blast结果显示有10条已知基因功能;(3)全同胞家系检测结果显示有两个标记与鲢的生长性状相关。SCE26与体长和体重显著相关(P鲢的分子标记辅助育种的应用提供基础理论指导。

关键词：鲢 EST-SSR 分子标记家系生长性状

鲢蛋白酶解物理化特性及其对益生菌增殖的影响

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广东海洋大学学报 2022年第3期42卷 72-78页

作者：黄馨柔张慧娟王凯罗永康中国农业大学食品科学与营养工程学院北京100083

【目的】探究不同酶解方式所得的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)鱼肉蛋白酶解物的理化特性及对鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)、动物双歧杆菌(Bifidobacterium animalis)的潜在益生元活性。【方法】分别用复合酶Ⅰ(中性蛋白... 详细信息

【目的】探究不同酶解方式所得的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)鱼肉蛋白酶解物的理化特性及对鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)、动物双歧杆菌(Bifidobacterium animalis)的潜在益生元活性。【方法】分别用复合酶Ⅰ(中性蛋白酶、碱性蛋白酶活性比1∶1)和复合酶Ⅱ(中性蛋白酶、碱性蛋白酶、风味蛋白酶活性比1∶1∶0.5)水解鲢鱼肉,获取不同酶解时长的酶解物,测定其水解度、分子质量分布和感官评价,经胃肠模拟消化(GID)处理后添加于培养基中培养两种益生菌,测定培养基的浊度。【结果】用复合酶Ⅱ水解4 h所得鲢鱼酶解物的水解度(DH)显著高于复合酶Ⅰ(P鲢鱼肉蛋白酶解物有作为益生元的潜质。

关键词：鲢酶解产物水解度分子质量分布益生菌

盐酸四环素浸泡与投喂标记鲢的效果比较及其浸泡标记对肝脏生理指标的影响

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海洋与湖沼 2020年第5期51卷 1175-1181页

作者：段必成张薪叶勤何春邓华堂陈辙聿李云西南大学水产学院重庆三峡生态渔业产业技术研究院重庆400715 中国水产科学研究院长江水产研究所农业农村部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站武汉430233 西南大学化学化工学院重庆400715

本研究以淡水天然水体主要放流鱼类鲢鱼种为实验材料,采用盐酸四环素(TCH)浸泡和药饵投喂两种方式对鲢进行荧光标记,比较这两种TCH处理方法对鲢微耳石的标记效果;测定150、250和350mg/L的浓度条件下浸泡24h鲢血液转氨酶以及肝脏氧化损... 详细信息

本研究以淡水天然水体主要放流鱼类鲢鱼种为实验材料,采用盐酸四环素(TCH)浸泡和药饵投喂两种方式对鲢进行荧光标记,比较这两种TCH处理方法对鲢微耳石的标记效果;测定150、250和350mg/L的浓度条件下浸泡24h鲢血液转氨酶以及肝脏氧化损伤和抗氧化指标的变化。结果显示,TCH浸泡处理比投喂处理对耳石的标记效果更好,在150—350mg/L浓度范围内,浓度越高标记效果越好;TCH浸泡处理24h会引起鲢血清的谷草转氨酶(AST)、谷丙转氨酶(ALT)活性在处理后1d显著升高,2d后降低到对照水平。肝脏氧化损伤指标丙二醛(MDA)水平,抗氧化酶超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)活性均呈现先快速极显著升高,然后下降直至恢复正常水平。表明TCH浸泡对鲢肝脏造成了短暂的功能异常和氧化应激胁迫,但在2—5d后即可恢复正常,TCH浸泡方法是鲢标记放流有效、安全、可靠的方法。本研究结果可为鲢的增殖放流、跟踪监测和效果评估工作提供技术支撑,为其他鱼类的标记放流提供参考。

关键词：鲢荧光标记微耳石盐酸四环素肝脏氧化损伤