低氧胁迫下鲢miR-17a-5p及其靶基因分析

作     者：李晓晖 冯翠 王巧欣 邹桂伟 梁宏伟 LI Xiaohui;FENG Cui;Wang Qiaoxin;ZOU Guiwei;LIANG Hongwei

作者机构：中国水产科学研究院长江水产研究所 华中农业大学湖北洪山实验室 

出 版 物：《水产学报》 (Journal of Fisheries of China)

年 卷 期：2023年第47卷第1期

页      面：138-151页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家现代农业产业技术体系专项(CARS-45) 湖北省洪山实验室开放课题(2021hskf014) 中国水产科学研究院基本科研业务费专项(YFI202211,2020TD33)~~ 

主　　题：鲢 miR-17a-5p 低氧 双荧光素酶 靶基因 信号通路 

摘      要：为了探究miR-17a-5p在鲢低氧胁迫下的功能，在前期鲢small RNA测序的基础上对鲢miR-17a-5p进行靶基因预测及功能富集分析，通过双荧光素酶活性验证其与HIF-1α的靶向关系，并检测低氧胁迫下miR-17a-5p和其靶基因在鲢肝脏、脑、心脏和鳃四个组织中的动态表达特征。结果显示，鲢miR-17a-5p在不同物种间高度保守，预测出381个miR-17a-5p的潜在靶基因显著富集在硫代谢、mTOR信号通路以及萜类骨架的生物合成3个KEGG信号通路上。miR-17a-5p可与HIF-1α mRNA的3′UTR结合，并降低HIF-1α mRNA水平，低氧胁迫下miR-17a-5p的表达呈下降趋势，而HIF-1α表达则呈上升趋势；3个显著富集KEGG通路中的11个miR-17a-5p潜在靶基因在低氧胁迫过程中的不同组织中的表达，尤其是肝脏中的表达，除SGK1外，均呈显著上升趋势。研究表明，低氧胁迫下鲢各组织中miR-17a-5p的表达下调减弱了其对靶基因的抑制作用，进而导致HIF-1α、ddit4和Lrp5等响应低氧胁迫的基因表达上调。本研究为低氧胁迫下鲢miRNA的表达与调控机制提供新见解，也为培育耐低氧的鲢新品系(种)提供了参考。