检索结果-南通市图书馆

相邻碱基组分与产生SNP的转换或颠换在植物基因组中的研究

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中国科学（C辑） 2006年第1期36卷 1-8页

作者：赵辉李启寨李俊曾长青胡松年于军中国科学院北京基因组研究所暨北京华大基因研究中心

碱基替换突变是形成物种多态性和造成生物进化的根本原因之一.近年的研究表明:基因组的碱基组分在不同程度上与碱基替换突变的发生相关.以水稻全基因组3611007个SNPs(包括45462个编码区SNPs和242811个内含子区SNPs)和拟南芥全基因组3201... 详细信息

碱基替换突变是形成物种多态性和造成生物进化的根本原因之一.近年的研究表明:基因组的碱基组分在不同程度上与碱基替换突变的发生相关.以水稻全基因组3611007个SNPs(包括45462个编码区SNPs和242811个内含子区SNPs)和拟南芥全基因组32019个SNPs为研究对象,研究突变位点周围的碱基A&T(A和T)的使用频率和点突变类型的相关性,结果表明:水稻和拟南芥全基因组上转换和颠换的比值(Ts/Tv)以及紧邻突变位点(上下游各1个碱基)上A&T碱基的个数负相关.统计了6种SNP的AT2(直接相邻的碱基是A或T的个数)和AT0(直接相邻碱基是C或G的个数),发现水稻和拟南芥都是C/G型SNP的AT2/AT0值最大,说明C/G型SNP可能受直接临近区域上A&T碱基的影响最大.在水稻全基因组SNPs中,A&T碱基影响突变的范围局限在突变位点上下游2个碱基内.拟南芥A&T碱基影响其全基因组SNPs的范围不超过上下游4个碱基.

关键词：点突变单碱基多态性替换替换偏差转换颠换

小麦和水稻叶绿体基因组进化中核苷酸替代的种属特异性

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西北植物学报 2010年第7期30卷 1302-1308页

作者：唐萍彭程杨四海连云港师范高等专科学校连云港市应用生物技术重点实验室江苏连云港222006 南京大学生命科学学院南京210093

以玉米叶绿体基因组为参照序列,采用三序列比较法系统分析了小麦和水稻分化过程中叶绿体基因组核苷酸替代的发生方式.结果表明,小麦中存在(A+T)/(G+C)替代偏差,水稻则无,该差异对小麦和水稻分化后叶绿体基因组G+C含量产生不同的影响,替... 详细信息

以玉米叶绿体基因组为参照序列,采用三序列比较法系统分析了小麦和水稻分化过程中叶绿体基因组核苷酸替代的发生方式.结果表明,小麦中存在(A+T)/(G+C)替代偏差,水稻则无,该差异对小麦和水稻分化后叶绿体基因组G+C含量产生不同的影响,替代使小麦叶绿体基因组G+C含量降低、水稻叶绿体基因组G+C含量表现增加.无论在编码区、非编码区,还是不同功能基因区,小麦叶绿体基因组转换与颠换的比值都显著低于水稻.小麦和水稻叶绿体基因组进化中核苷酸替代呈现种属特异性.

关键词：叶绿体基因组转换颠换种属特异性

6种鳗鲡(Anguilla)线粒体DNA COⅡ基因序列分析及其系统发育

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海洋与湖沼 2011年第2期42卷 279-283页

作者：田鑫江吴宁黎中宝林小云张志红陈晓姣陈丽娜集美大学水产学院厦门361021 集美大学水产生物技术研究所厦门361021

采用基因测序的方法,对6种鳗鲡的COⅡ基因片段进行了PCR扩增和测序。结果表明,6种鳗鲡COⅡ基因片段的长度都为412bp,4种碱基组成非常相似,并且A+T的含量都大于G+C的含量。6种鳗鲡COⅡ基因片段核苷酸序列之间有46bp的差异,其中有6处发生... 详细信息

采用基因测序的方法,对6种鳗鲡的COⅡ基因片段进行了PCR扩增和测序。结果表明,6种鳗鲡COⅡ基因片段的长度都为412bp,4种碱基组成非常相似,并且A+T的含量都大于G+C的含量。6种鳗鲡COⅡ基因片段核苷酸序列之间有46bp的差异,其中有6处发生碱基颠换,40处发生碱基转换。非洲鳗鲡(Anguilla mossambic)和日本鳗鲡(***)COⅡ基因片段核苷酸序列差异最大为27bp,同源性为93.45%,而日本鳗鲡和菲律宾鳗鲡(***)COⅡ基因片段核苷酸序列差异最小为5bp,同源性为98.79%。

关键词：鳗鲡 mtDNACOⅡ基因序列差异颠换转换

6种鳗鲡(Anguilla)线粒体DNA COⅠ序列的比较研究

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海洋与湖沼 2010年第6期41卷 930-934页

作者：吴宁黎中宝林小云张志红田鑫江陈晓姣陈丽娜集美大学水产学院厦门361021 集美大学水产生物技术研究所厦门361021

采用基因测序的方法,对6种鳗鲡的COⅠ基因片段进行了PCR扩增和测序。结果表明,6种鳗鲡COⅠ基因片段的长度都为652bp,4种碱基组成非常相似,并且A+T的含量都大于G+C的含量。6种鳗鲡COⅠ基因片段核苷酸序列之间有105bp的差异,其中有18处发... 详细信息

采用基因测序的方法,对6种鳗鲡的COⅠ基因片段进行了PCR扩增和测序。结果表明,6种鳗鲡COⅠ基因片段的长度都为652bp,4种碱基组成非常相似,并且A+T的含量都大于G+C的含量。6种鳗鲡COⅠ基因片段核苷酸序列之间有105bp的差异,其中有18处发生碱基颠换,87处发生碱基转换。非洲鳗鲡和欧洲鳗鲡COⅠ基因片段核苷酸序列差异最大为54bp,同源性为91.72%,而美洲鳗鲡与欧洲鳗鲡COⅠ基因片段核苷酸序列差异最小为24bp,同源性为96.32%。

关键词：鳗鲡 COⅠ基因序列差异颠换转换

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基于全长cDNA序列的小麦cSNP发掘

作物学报 2006年第12期32卷 1836-1840页

作者：毛新国汤继凤周荣华景蕊莲贾继增中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室北京100081

以测序得到的来自小麦不同基因组的基因序列为源序列,用AutoSNP软件,在GenBank中的小麦EST库中检测到一批cSNP,开辟了一条发掘小麦基因组特异候选cSNP的新途径。在2089个源序列中,检测到1296个cSNP,其中有397个来自A基因组,322个来自S... 详细信息

以测序得到的来自小麦不同基因组的基因序列为源序列,用AutoSNP软件,在GenBank中的小麦EST库中检测到一批cSNP,开辟了一条发掘小麦基因组特异候选cSNP的新途径。在2089个源序列中,检测到1296个cSNP,其中有397个来自A基因组,322个来自S基因组,420个来自D基因组;另外,A和D基因组共有的SNP有154个,A和S,S和D,A、S和D基因组共有的SNP各仅有1个,这一结果也同时表明,小麦的3个基因组供体种中,A、D基因组关系比较近,而它们与S基因组的关系比较远。统计分析表明,小麦中SNP出现的频率约为0.914‰。

关键词：单核苷酸多态性基因组供体转换颠换单体型

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遗传距离的错误观点和病毒进化踪迹的探索

中国病毒学 2005年第3期20卷 335-339页

作者：杜念兴潘芹芹张素芳南京农业大学动物医学院南京210095 江苏省人民医院HLA实验室南京210029

通过对病毒基因序列的遗传距离(K)的演算,发现公式中的p和q应理解为转换率和颠换率;计算所得的K值是一个百分率,更适合于显示生物进化的时间概念。因此建议将遗传距离改名为进化率。并从进化率计算中的规律性变化,探索了病毒进化的信息。

关键词：遗传距离进化率进化速率转换颠换

大麦胰凝乳蛋白酶抑制子-2（CI-2）基因的SNP分析和单倍型鉴定

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大麦胰凝乳蛋白酶抑制子-2（CI-2）基因的SNP分析和单倍型鉴定

作者：曾祥辉四川农业大学

学位级别：硕士

谷类作物中必须氨基酸--赖氨酸的缺乏，限制了人类和家畜对其营养品质的利用，这就必须在食品和饲料中添加额外的赖氨酸，如此一来就造成成本高昂且吸收效率有限。因此，改良谷物的内在品质就显得格外重要。过去，传统的作物改良手段在... 详细信息

谷类作物中必须氨基酸--赖氨酸的缺乏，限制了人类和家畜对其营养品质的利用，这就必须在食品和饲料中添加额外的赖氨酸，如此一来就造成成本高昂且吸收效率有限。因此，改良谷物的内在品质就显得格外重要。过去，传统的作物改良手段在增加谷物赖氨酸的同时难以获得优良的农艺性状，随着转基因技术的进步，现代生物技术方法恰好可以克服这个瓶颈。对赖氨酸生物合成路径的操作增加游离赖氨酸含量;体外设计合成高赖氨酸蛋白，通过辐射使作物蛋白质发生自然变异等都是增加赖氨酸含量的重要手段。大麦胰凝乳蛋白抑制因子2(CI-2)与其它储藏蛋白相比，因富含赖氨酸而被认为是增加其它谷物赖氨酸含量，提高作物营养品质的最佳侯选。本文的实验目的是研究CI-2基因序列的变异情况，特别是编码区及其由单核苷酸多态性(SNP)导致的变异，旨在从分子水平更深入的了解CI-2，为以后更好地利用CI-2增加谷物赖氨酸含量和抗病虫育种打下基础。结果表明：CLZ基因序列存在丰富的变异，其单倍型类型也极为丰富，这为我们未来利用CI-2增加谷物氨基酸含量、改变氨基酸残基比例和进行转基因抗病虫研究提供了丰富的基因资源。

关键词： CI-2 SNP分析胰凝乳蛋白酶抑制子编码区单倍型 wheat 蛋白水解酶 Triticum 颠换

同方学位论文库评论

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基因突变的机理

原子能农业译丛 1980年第2期 1-10页

作者：郭宝江华南师范学院

诱变是育种的主要手段之一,其目的在于诱发遗传物质的突变,为育种工作提供丰富的原始材料。研究突变在分子水平上如何产生、形成和修复,是突变育种的一个重要课题。现代分子遗传学研究表明:脱氧核糖核酸(DNA)是生物体主要的遗传物质,一... 详细信息

诱变是育种的主要手段之一,其目的在于诱发遗传物质的突变,为育种工作提供丰富的原始材料。研究突变在分子水平上如何产生、形成和修复,是突变育种的一个重要课题。现代分子遗传学研究表明:脱氧核糖核酸(DNA)是生物体主要的遗传物质,一切生物体的遗传信息大多以遗传密码的形式贮存在 DNA 的碱基顺序中。基因就是具有特定碱基序列的 DNA 节段,是决定和调节遗传性的基本单位。生物体通过 DNA 的自我复制把遗传信息一代一代地传下去。在后代的个体发育过程中,以密码形式贮存的遗传信息,经过转录

关键词：密码子碱基顺序遗传信息二聚体 ATG 碱基对颠换 DNA 基因突变点突变

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分子进化的速率问题

自然杂志 1988年第4期 243-247+318页

作者：陈建华同济大学

生物在其漫长的进化过程中,不仅从低级向高级进化,而且伴随着分子进化。生物界虽然千姿百态,但其基本构成都是蛋白质和核酸。经过研究,发现亲缘关系越近的生物,氨基酸差异数越小,反之则越大。这种蛋白质分子差异为揭示生物进化提供了有... 详细信息

生物在其漫长的进化过程中,不仅从低级向高级进化,而且伴随着分子进化。生物界虽然千姿百态,但其基本构成都是蛋白质和核酸。经过研究,发现亲缘关系越近的生物,氨基酸差异数越小,反之则越大。这种蛋白质分子差异为揭示生物进化提供了有力的佐证。《分子进化的速率问题》一文或许对此感兴趣的读者有所裨益。

关键词：进化速率进化距离密码子氨基酸氨基羧酸哺乳动物自然选择学说保守替换颠换生物大分子中性学说同义替换分子进化