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广州市聋校听力障碍学生线粒体DNA12S rRNA A1555G突变调查分析

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中华耳科学杂志 2013年第2期11卷 272-275页

作者：周枫林颖刘静梁剑敏罗琼王海涛广州市耳鼻咽喉头颈外科医院耳鼻咽喉科广州510620 广州市康都临床检验所广州511442

目的调查广州市非综合征性耳聋高危人群中线粒体DNA12S rRNA A1555G的突变情况,为我市防聋宣教提供理论依据。方法利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对188例聋校听力障碍学生、100例听力正常的健康体检者进行临床评... 详细信息

目的调查广州市非综合征性耳聋高危人群中线粒体DNA12S rRNA A1555G的突变情况,为我市防聋宣教提供理论依据。方法利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对188例聋校听力障碍学生、100例听力正常的健康体检者进行临床评估及基因检测。结果 188例聋校听力障碍学生及100例听力正常的健康体检患者均未发现线粒体DNA A1555G位点突变,突变率为0,明显低于全国平均水平。结论虽然在经济较为发达的广州地区线粒体DNA A1555G突变检出率较低,但仍为预测我市耳聋高危人群耳毒性风险、合理使用氨基糖甙类抗生素提供分子学依据,为进一步研究我市耳聋基因易感性奠定基础。

关键词：线粒体DNA 非综合征性耳聋氨基糖甙类抗生素限制性片段长度多态性

纳米金基因芯片技术快速鉴定常见浅部致病真菌

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中华皮肤科杂志 2013年第6期46卷 437-439页

作者：江文董玲玲陈兴平华中科技大学同济医学院附属同济医院皮肤科武汉430030

浅部真菌病是临床常见的感染性疾病，能简便快速鉴定出致病真菌对疾病的治疗至关重要。传统的鉴定方法主要依据真菌的形态、细胞生理和生化特征，这些方法阳性率低，操作复杂费时。一些免疫学和分子生物学技术如PCR，以及以PCR为基础的... 详细信息

浅部真菌病是临床常见的感染性疾病，能简便快速鉴定出致病真菌对疾病的治疗至关重要。传统的鉴定方法主要依据真菌的形态、细胞生理和生化特征，这些方法阳性率低，操作复杂费时。一些免疫学和分子生物学技术如PCR，以及以PCR为基础的限制性片段长度多态性PCR（PCR—RFLP）、随机扩增多态性DNAPCR（PCR—RAPD）、单链构象多态性PCR（PCR—SSCP）等也应用于真菌病的诊断，但这些技术也存在操作复杂、实验设备要求高等缺陷。因此，我们尝试建立一种可目视化、快速简便、准确鉴定常见浅部致病真菌的方法。

关键词：浅部致病真菌快速鉴定基因芯片技术限制性片段长度多态性纳米金分子生物学技术随机扩增多态性单链构象多态性

hTERT基因多态性与结肠癌易感性关系的研究

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中国现代普通外科进展 2021年第8期24卷 604-607,611页

作者：徐保华崔世超崔京远袁志丽司君圣刘杰烟台业达医院消化科山东烟台264000 青岛市立医院血管外科山东青岛266011 青岛市立医院普外科山东青岛266011

目的:探讨人端粒酶逆转录酶(hTERT)基因rs2736098、rs2075786和rs2736100位点单核苷酸多态性(SNP)与结肠癌遗传易感性的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCRRFLP)方法对186例结肠癌患者和194例结肠腺瘤患者(病例组)... 详细信息

目的:探讨人端粒酶逆转录酶(hTERT)基因rs2736098、rs2075786和rs2736100位点单核苷酸多态性(SNP)与结肠癌遗传易感性的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCRRFLP)方法对186例结肠癌患者和194例结肠腺瘤患者(病例组)以及随机匹配的406例健康体检行结肠镜检查未见明显异常者(对照组)进行基因多态性分析。结果:rs2736098、rs2075786位点各基因型在病例组和对照组中的频率分布差异无统计学意义(P>0.05),结肠癌组rs2736100位点GG基因型频率显著高于健康对照组及结肠腺瘤组(29.03%vs 16.50%、18.04%,P多态性与结肠癌遗传易感性相关。

关键词：结肠肿瘤端粒,末端转移酶多态性,单核苷酸限制性片段长度多态性

三种不同的DNA分型技术在158株结核杆菌研究中的应用

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中华流行病学杂志 2005年第5期26卷 361-365页

作者：郭艳玲刘洋王甦民李传友北京市结核病胸部肿瘤研究所 101149

目的评价IS6110限制性片段长度多态性(RFLP)、间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)及分枝杆菌散在重复单位(MIRU)三种分型方法在结核病流行病学研究中的应用。方法对158株结核分枝杆菌临床分离株应用IS6110RFLP、Spoligotyping及MIRU三... 详细信息

目的评价IS6110限制性片段长度多态性(RFLP)、间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)及分枝杆菌散在重复单位(MIRU)三种分型方法在结核病流行病学研究中的应用。方法对158株结核分枝杆菌临床分离株应用IS6110RFLP、Spoligotyping及MIRU三种分型方法进行鉴定。结果应用三种分型方法产生的类型数分别为118、20和105个。IS6110RFLP的分辨率大于Spoligotyping,MIRU的分辨能力与IS6110RFLP接近。在MIRU的12个区中,重复区4、10、26、40具有较高的多态性。广东地区与其他地区成簇率和北京基因型所占比例差异有统计学意义(P<0.05),广东地区成簇率和北京基因型所占比例均显著低于其他地区。结论应用IS6110RFLP、Spoligotyping及MIRU三种分型方法进行结核病流行病学研究具有重要意义且非常有效,可以发现中国不同地区菌株的不同特点。

关键词： DNA分型技术 Spoligotyping 结核杆菌限制性片段长度多态性流行病学研究分型方法寡核苷酸分型结核分枝杆菌广东地区临床分离株分辨能力重要意义不同地区结核病基因型间隔区分辨率统计学比例北京成簇

IL-27基因多态性与变态反应性鼻炎的相关性研究

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IL-27基因多态性与变态反应性鼻炎的相关性研究

作者：袁小东重庆医科大学

学位级别：硕士

目的：变态反应性鼻炎的发生率逐年升高，严重影响患者的生活质量，其发病主要受环境和遗传因素的影响。白细胞介素27（IL-27）在变态反应性鼻炎的发生中起着重要作用，本实验对IL-27单核苷酸多态性(SNP)与变态反应性鼻炎的相关性进行... 详细信息

目的：变态反应性鼻炎的发生率逐年升高，严重影响患者的生活质量，其发病主要受环境和遗传因素的影响。白细胞介素27（IL-27）在变态反应性鼻炎的发生中起着重要作用，本实验对IL-27单核苷酸多态性(SNP)与变态反应性鼻炎的相关性进行研究。方法：本实验中实验组有445例变态反应性鼻炎患者，对照组有691例健康人。变态反应性鼻炎的诊断按照ARIA (2001)标准进行，获得实验对象的外周静脉血，采用DNA提取试剂盒提取外周静脉血中DNA。以聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（polymerase chainreaction-restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP）方法进行基因分型。本实验选取IL-27的rs153109，rs17855750，rs181206三个多态性位点进行相关性研究。结果：实验组与对照组的年龄和性别无统计学差异(P﹥0.05)，基因分型符合哈迪温伯格平衡，χ2检验发现实验组与对照组rs153109和rs17855750两个SNPs多态性均有统计学差异。实验组rs153109的TT基因型和T等位基因频率明显高于对照组（Pc=7.72×10-10，Pc=2.97×10-11），CT、CC基因型和C等位基因频率明显低于对照组（Pc=7.46×10-5;Pc=9.54×10-5，Pc=2.97×10-11）;rs17855750的TT基因型和T等位基因频率亦明显高于对照组（Pc=1.10×10-13，Pc=4.42×10-13），GT基因型和G等位基因频率明显低于对照组(Pc=1.10×10-13，Pc=4.42×10-13);而rs181206的TT、CT基因型频率在两组间无统计学差异（P﹥0.05）。单体型中实验组CGT、CTC、CTT频率明显低于对照组（P﹤0.001），而TTC、TTT频率显著高于对照组（P﹤0.001）。结论：IL-27两个SNPs位点rs153109和rs17855750与变态反应性鼻炎均有相关性。

关键词： IL-27 单核苷酸多态性变态反应性鼻炎限制性片段长度多态性

ERCC1基因C19007T多态性与大肠癌中MRP、GST-π、P-gp和LRP表达的相关研究

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ERCC1基因C19007T多态性与大肠癌中MRP、GST-π、P-gp和LRP表达的...

作者：孔易承德医学院

学位级别：硕士

目的: 大肠癌是我国高发的消化系统的恶性肿瘤之一，近些年来，其发病率及死亡率均逐渐上升，且发病年龄有年轻化的趋势。手术结合化疗是临床上治疗大肠癌的主要措施，而对于那些已经错失手术机会的晚期患者来说，化疗可能成为其唯... 详细信息

目的: 大肠癌是我国高发的消化系统的恶性肿瘤之一，近些年来，其发病率及死亡率均逐渐上升，且发病年龄有年轻化的趋势。手术结合化疗是临床上治疗大肠癌的主要措施，而对于那些已经错失手术机会的晚期患者来说，化疗可能成为其唯一的治疗手段。化疗能够有效地抑制大肠癌的复发、防止发生转移，故化疗的成败与否直接将影响患者的预后情况。近年研究显示，多药耐药相关蛋白（Multidrug resistance-associated protein, MRP）、谷胱甘肽-巯基-转移酶-π（glutathione-s-transferase-π, GST-π）、P-糖蛋白（P-glycoprotein, P-gp）和肺耐药蛋白（Lung resistance protein, LRP）可以诱导肿瘤细胞发生多药耐药，改变肿瘤细胞对化疗药物的敏感性，从而影响化疗的疗效。同时，核苷酸切除修复交叉互补基因1（excision repair crosscompletion gene1, ERCC1）的多态性与铂类药物的耐药、化疗疗效的预测及预后的判定密切相关。我们试图通过研究确定ERCC1基因C19007T位点不同基因型的大肠癌患者中多药耐药相关蛋白、谷胱甘肽-巯基-转移酶-π、P-糖蛋白和肺耐药蛋白的表达情况，阐明ERCC1基因C19007T多态性与大肠癌中多种耐药蛋白之间的关系，以期为临床上判定ERCC1基因C19007T位点的不同基因型大肠癌患者的化疗敏感性提供客观的参考指标，也为制定合理的个体性化疗方案提供理论依据。方法: 随机选取86例大肠癌患者手术后的切除标本和52例远端正常组织（距癌灶＞10cm），采用免疫组织化学技术（S-P法）检测86例大肠癌组织和52例远端正常组织（距癌灶＞10cm）中MRP、GST-π、P-gp和LRP的表达情况，分析其与大肠癌的各临床病理特征间（包括性别、年龄、肿瘤大小、分化程度、发病部位、有无淋巴结转移）的关系;同时将获取的86例组织标本于-80℃保存，使用TIANamp Genomic DNA提取试剂盒提取标本中的DNA，采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（polymerasechain reaction-restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP）技术检测86例大肠癌患者ERCC1基因C19007T位点的基因型，并分析ERCC1基因C19007T多态性与大肠癌中MRP、GST-π、P-gp和LRP表达情况的关系。结果: PCR-RFLP分析技术结果显示：ERCC1基因C19007T位点基因型频率分别为C/C型占53.49%（46/86）、C/T型占40.70%（35/86）以及T/T型占5.81%（5/86）。免疫组化结果显示：86例大肠癌组织中，MRP阳性表达率为45.3%，GST-π阳性表达率为72.09%，P-gp阳性表达率为79.07%，LRP阳性表达率为76.7%，四者在大肠癌组织中表达均高于在远端正常组织中的表达（P＜0.05）。MRP的表达与大肠癌分化程度有关，分化较低组的阳性率（61.0%）高于分化较高组的阳性率（31.1%），两组比较差异有显著性（P＜0.01）。P-gp的表达与淋巴结转移有关，有淋巴结转移组的阳性率（87.76%）高于无淋巴结转移组的阳性率（67.57%），两组比较差异有显著性（P＜0.05）。其中，GST-π在C/T+T/T基因型组的阳性表达率为85.00％，高于在C/C基因型组的阳性表达率60.87％，差异具有统计学意义（P＜0.05）。LRP在C/T+T/T基因型组的阳性表达率为90.00％，高于在C/C基因型组的阳性表达率65.22％，差异有统计学意义（P＜0.05）。比较MRP、P-gp在两组间的表达，差异均无统计学意义（P＞0.05）。结论: 1. MRP、GST-π、P-gp和LRP在大肠癌组织中均有不同程度的高表达，可能与大肠癌原发性多药耐药有关。 2.大肠癌组织中MRP的表达可能与患者的性别、年龄、肿瘤大小、发病部位、有无淋巴结转移均无关（P＞0.05），但可能与分化程度有关，分化较低组的阳性率高于分化较高组（P＜0.01）。 3.大肠癌组织中P-gp的表达可能与患者的性别、年龄、肿瘤大小、发病部位、分化程度均无关（P＞0.05），但可能与淋巴结转移有关，有淋巴结转移组的阳性率高于无淋巴结转移组（P＜0.05）。 4. ERCC1基因多态性与大肠癌化疗敏感性有关，临床检测ERCC1C19007T位点基因型可能有助于早期预测大肠癌的化疗疗效。

关键词：大肠癌核苷酸切除修复交叉互补基因1 多药耐药相关蛋白谷胱甘肽-巯基-转移酶-π P-糖蛋白和肺耐药蛋白免疫组织化学限制性片段长度多态性

青海地区汉、藏族人群类风湿关节炎的Tim-3基因多态性研究

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青海地区汉、藏族人群类风湿关节炎的Tim-3基因多态性研究

作者：李晓凤青海大学

学位级别：硕士

目的：分析青海地区汉、藏族人群T细胞免疫球蛋白黏蛋白域蛋白-3（Tim-3）基因-574、-882、-1541和4259位点单核苷酸多态性（SNP），探讨其与类风湿关节炎（RA）易感性之间的关系，为青海地区RA的早期预防提供理论依据。方法：采用限... 详细信息

目的：分析青海地区汉、藏族人群T细胞免疫球蛋白黏蛋白域蛋白-3（Tim-3）基因-574、-882、-1541和4259位点单核苷酸多态性（SNP），探讨其与类风湿关节炎（RA）易感性之间的关系，为青海地区RA的早期预防提供理论依据。方法：采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应（PCR-RFLP）方法检测青海地区101例汉族RA患者、111例汉族健康者和60例藏族RA患者、102例藏族健康者Tim-3基因-574G>T、-882C>T、-1541C>T和4259G>T的SNP，并计算其基因型和等位基因频率。结果：①青海汉族健康人群及RA患者中-1541位点和4259位点基因型频数和等位基因频数分布差异有统计学意义(P0.05);②青海藏族健康人群及RA患者Tim-3中-882位点、-574位点、-1541位点和4259位点基因型频数和等位基因频数分布差异无统计学意义(P>0.05);③青海藏族、汉族健康人群中-1541位点和4259位点基因型频数和等位基因频数分布差异有统计学意义(P0.05);④青海藏族、汉族RA患者中-882位点、-574位点、-1541位点和4259位点基因型频数和等位基因频数分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论: Tim-3基因-574、-882、-1541和4259位点在青海汉族人群中存在SNP变异，并与青海地区汉族RA的易感性有关。

关键词： T细胞免疫球蛋白黏蛋白域蛋白-3 单核苷酸多态性限制性片段长度多态性类风湿关节炎

中国北方汉族人群TRIB1基因rs2235108多态性与2型糖尿病合并冠心病的相关性

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临床检验杂志 2012年第5期30卷 343-346页

作者：林文涛李琳鄢盛恺夏良裕程歆琦仙桃市第一人民医院检验科湖北仙桃433000 郑州大学第三附属医院检验科郑州450052 卫生部中日友好医院检验科北京100029 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院检验科北京100730

目的探讨中国北方汉族人群TRIB1基因rs2235108多态性与2型糖尿病(T2DM)合并冠心病(CHD)的关系。方法用PCR-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测了147例健康人对照组、96例T2DM组和75例T2DM合并CHD组TRIB1基因rs2235108多态性基因型和等... 详细信息

目的探讨中国北方汉族人群TRIB1基因rs2235108多态性与2型糖尿病(T2DM)合并冠心病(CHD)的关系。方法用PCR-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测了147例健康人对照组、96例T2DM组和75例T2DM合并CHD组TRIB1基因rs2235108多态性基因型和等位基因频率分布,分析基因多态性对T2DM和T2DM合并CHD的影响。结果我国北方汉族人群TRIB1基因rs2235108多态性CC基因型频率为81.8%,CT+TT为18.4%,C、T等位基因频率分别为90.5%、9.5%。3组研究对象的TRIB1基因rs2235108多态性基因型和等位基因频率分布差异无统计学意义(P>0.05)。3组内不同基因型间各项生化指标差异均无统计学意义(P>0.05)。logistic回归分析显示,年龄、HDL-C、高血压病史是T2DM合并CHD的独立危险因素。结论 TRIB1基因rs2235108多态性与T2DM合并CHD无明显关联性,不是我国北方汉族人群T2DM合并CHD发病的独立危险因素。

关键词： TRIB1 基因多态性 2型糖尿病冠心病聚合酶链反应限制性片段长度多态性

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刚地弓形虫分子生物学检测技术应用研究进展

中国病原生物学杂志 2012年第10期7卷 794-795,777页

作者：吴松霏金炫佚陈蓉史俊岩中国医科大学94K七年制辽宁沈阳110001 中国医科大学基础医学院病原生物学教研室辽宁沈阳110001

本文综述了刚地弓形虫的分子生物学检测技术,主要包括PCR技术、限制性片段长度多态性分析技术和环介导等温扩增技术,以及各种技术在实验及临床上的应用和发展前景。

关键词：刚地弓形虫和PCR 限制性片段长度多态性环介导等温扩增技术综述