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p63 IHC染色2+截断值可作为骨巨细胞瘤的诊断标记

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基因组学与应用生物学 2019年第3期38卷 1423-1427页

作者：陈荣富陈诚重庆市长寿区人民医院重庆401220 重庆医科大学附属第一医院重庆401220

为评估骨巨细胞瘤(giant cell tumor of bone, GCTOB)中p63表达在鉴别骨巨细胞瘤(GCTOB)中的作用,本研究采用横断面研究,检测50个巨细胞丰富的骨病变中p63的免疫组织化学表达,并评价p63在各肿瘤中的染色强度和程度。免疫组织化学分析显... 详细信息

为评估骨巨细胞瘤(giant cell tumor of bone, GCTOB)中p63表达在鉴别骨巨细胞瘤(GCTOB)中的作用,本研究采用横断面研究,检测50个巨细胞丰富的骨病变中p63的免疫组织化学表达,并评价p63在各肿瘤中的染色强度和程度。免疫组织化学分析显示,94.12%的骨巨细胞瘤(GCTOB)、14.29%的骨肉瘤(osteosarcoma, OSA)、60.00%的非骨化性纤维瘤(non-ossifyingfibroma, NOF)、25.00%的动脉瘤样骨囊肿(aneurysmal bone cyst, ABC)、71.43%的软骨母细胞瘤(chondroblastoma, CB)、66.67%的棕色瘤(Brown tumor)为阳性,而腱鞘巨细胞瘤(giant cell tumor of the tendon sheath, GCTTS)中未检测出p63阳性。对于p63的染色强度,可以观察到58.82%的骨巨细胞瘤(GCTOB)、28.57%的软骨母细胞瘤(CB)和20.00%的非骨化性纤维瘤(NOF)呈现强染色。对于p63的染色程度:观察到58.82%的骨巨细胞瘤(GCTOB)、28.57%的软骨母细胞瘤(CB)和14.29%的骨肉瘤(OSA)尾弥漫性染色,而中等染色在骨巨细胞瘤(GCTOB)中为17.65%,非骨化性纤维瘤(NOF)为20.00%,棕色瘤(Brown tumor)为33.33%。大量骨巨细胞瘤(94.12%)为p63阳性,这比任何其他巨细胞丰富的病变多得多。然而,p63的阳性染色并不是骨巨细胞瘤(GCTOB)特异性的。本研究结论初步表明,p63是鉴别骨巨细胞瘤(GCTOB)与其他骨巨细胞瘤的一种敏感的(97.6%)和相对特异的标志物。考虑到反应的强度和程度,本研究建议采用综合评分方法对p63 IHC染色判读富含巨细胞的病灶,并将2+截断值作为骨巨细胞瘤(GCTOB)的诊断标记。

关键词： p63 IHC染色骨巨细胞瘤(GCTOB) 诊断标记

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miRNA作为结直肠癌诊断标记的潜能

健康之路 2018年第6期 2-2页

作者：李晓丹耿文艳罗冰李志发陈戎吴小兵广州医科大学附属第三医院

目的:研究微小RNA作为结直肠癌(CRC)诊断标记的潜能。方法:采用qRT-PCR方法分析miRNA在CRC肿瘤组织中的的表达情况,并分析mi其作为CRC诊断标记的敏感性和特异性,设定P<0.05。结果:miRNA相对于目前临床上常用的FOBT、CEA等指标,其敏感性... 详细信息

目的:研究微小RNA作为结直肠癌(CRC)诊断标记的潜能。方法:采用qRT-PCR方法分析miRNA在CRC肿瘤组织中的的表达情况,并分析mi其作为CRC诊断标记的敏感性和特异性,设定P诊断标记的潜能。

关键词：微小RNA 结肠癌直肠癌诊断标记

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围产期奶牛脂肪肝疾病诊断的代谢标记物筛选

围产期奶牛脂肪肝疾病诊断的代谢标记物筛选

作者：张璇山东农业大学

学位级别：硕士

脂肪肝是奶牛围产期易发的一种代谢紊乱性疾病,导致减产且影响奶牛后续的繁殖性能而导致产后的高淘汰率,给乳品行业造成了巨大的经济损失。由于奶牛个体较大,B超等辅助诊断手段都不准确。唯一可靠的诊断方法是肝活检。但是肝脏活检加倍... 详细信息

脂肪肝是奶牛围产期易发的一种代谢紊乱性疾病,导致减产且影响奶牛后续的繁殖性能而导致产后的高淘汰率,给乳品行业造成了巨大的经济损失。由于奶牛个体较大,B超等辅助诊断手段都不准确。唯一可靠的诊断方法是肝活检。但是肝脏活检加倍损害牛的健康,并对产奶量产生不利影响。当然,生产实践中人们也借助血清生化指标(如AST、ALT、GLU等)来辅助诊断发病的奶牛,但同样存在较大误差。因此,奶牛生产中亟需开发可靠、经济、实用且无害的诊断方法。为此,我们拟利用奶牛的代谢物粪、尿液和血清进行可能的诊断标记物筛选。首先对18头荷斯坦奶牛进行围产期肝活检,诊断为正常组(脂肪含量13.17%±8.20%,n=8)和脂肪肝病组(脂肪含量84.71%±4.83%,n=10),命名为“发现集”;选择一天晨饲前空腹采集其血液,尿液,粪便样品,进行GC-TOF/MS检测,数据经Xplore MET平台和SPSS软件处理,检测数据经多维V-plot火山图和单维T检验筛选,得到潜在生物标记物。同时进行血清传统生化指标检测,作为后续生物标记物诊断能力检测的对照。继而选用20头生化指标、B超等兽医诊断结果与上述发现集群体中诊断正常和(或)病牛相似的奶牛,分为疑似正常组(n=10)和疑似病组(n=10),称为“验证集”,同样空腹采集血液,尿液,粪便,验证集采用同样的方法进行二轮筛选,将筛到的标记物与发现集所得到的潜在生物标记物取交集,得到最终的生物标记物,以此进行验证。质量控制和主成分分析表明,患病组和正常组的分组情况是成功的,根据OPLS-DA分析,患病组与正常组有显著性差异。在发现集中识别出患病组和正常组中表达的候选标记。小提琴地图和ROC曲线初步验证了潜在的生物标志物的存在。这些候选差异标记也通过验证集进行了验证。发现集中,经筛选得到潜在生物标记物粪便中23个,尿液中7个血液中24个,经与验证集筛选得到的标记物取交集后,终得到生物标记物粪便中两个:L-α-氨基丁酸,山嵛酸;在尿液中1个:3-硝基酪氨酸;在血液中,保留了7个:L-天冬酰胺,棕榈油酸,L-丝氨酸,硬脂酸,十九烷酸,岩芹酸,十七烷酸。得到的生物标记物,经过上述的独立样本集验证集验证后,又继续进行方法验证,采用了ROC曲线对生物标记物和传统生化指标的诊断能力进行了检测,证实了生物标记物比传统血清生化指标(AST、GLU等)具有极显著的诊断准确性。此外,我们的血清、粪、尿代谢组学分析表明,与正常奶牛相比,发生脂肪肝的奶牛其胆汁酸、氨基酸、脂类等生物学过程均存在异常代谢调节。众所周知,这些过程都与脂肪代谢紊乱和脂肪沉积密切相关,因而这些异常的代谢调节过程可能是奶牛脂肪肝发病的内在因素。值得一提的是,本研究鉴定获得的生物标记物与这些代谢途径显著相关,这为我们研究奶牛脂肪肝的发病机制提供了一个前瞻性的理论指导。总之,所鉴定的粪便、尿液、血液生物标记物被确认为诊断奶牛脂肪肝的新型有效标记物。生物标志物的诊断效果明显优于传统的血清生化指标。而且,新型诊断标记物对围产期脂肪肝病奶牛的诊断和检测具有经济、方便、快捷以及动物福利保护等的潜在重要意义,将为提高奶牛产量和生产效率发挥潜在的重要价值

关键词：奶牛围产期脂肪肝代谢组生物标记物诊断标记

小麦抗条锈病基因YrCN19的诊断检测和遗传分析(英文)

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分子细胞生物学报 2006年第3期39卷 217-222页

作者：罗培高张怀渝张怀琼任正隆四川农业大学农学院生物技术系雅安625014

用小麦条锈病抗性基因YrCN19的诊断标记Xgwm410对19个小麦品种或品系进行PCR筛选,其中川农19、新抗5号、爱民5号和爱民6号扩增出与条锈病抗性基因YrCN19共分离的特征片断,其大小为391个碱基,而在其他的小麦品种或品系中未能检测到该片... 详细信息

用小麦条锈病抗性基因YrCN19的诊断标记Xgwm410对19个小麦品种或品系进行PCR筛选,其中川农19、新抗5号、爱民5号和爱民6号扩增出与条锈病抗性基因YrCN19共分离的特征片断,其大小为391个碱基,而在其他的小麦品种或品系中未能检测到该片断。系谱分析和抗性鉴定结果表明川农19、新抗5号、爱民5号和爱民6号含有小麦条锈病基因YrCN19。抗性遗传分析发现小麦条锈病抗性在川农19,新抗5号和爱民5号中的遗传符合单个显性基因的遗传规律(3抗:1感);杂交组合烟辐188/爱民6号的抗性遗传也符合单个显性基因的遗传规律,而另外一些杂交组合(如R25/爱民6号,鲁955159/爱民6号和苏3110/爱民6号)中的抗性分离则符合两对基因互补的遗传规律(9抗:7感)。本研究揭示了小麦条锈病抗性基因YrCN19在不同遗传背景和杂交组合的抗性表达和分离有差异,从而加速YrCN19在小麦抗条锈育种中的开发与利用。

关键词：小麦条锈病诊断标记遗传

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焦虑的脑科学研究与临床应用进展

科学通报 2023年第35期68卷 4793-4806页

作者：罗跃嘉秦绍正朱英杰李占江张治国金增亮徐鹏飞北京师范大学心理学部认知神经科学与学习国家重点实验室北京100875 深圳大学心理学院脑疾病与认知科学研究中心深圳518060 康复大学(筹)神经心理康复研究所青岛266114 中国科学院深圳先进技术研究院脑认知与脑疾病研究所深圳518055 首都医科大学附属北京安定医院北京100120 哈尔滨工业大学(深圳)计算机科学与技术学院深圳518055 首都医科大学药学院北京100069 北京师范大学心理学部心理学基础国家级实验教学示范中心应用实验心理北京市重点实验室北京100875

焦虑障碍是我国患病率最高的精神障碍,也是全球第六大致残原因.如何建立精准有效的个体化预防-诊断-治疗体系,成为当前亟须攻克的难题.焦虑障碍主要包括广泛性焦虑障碍(GAD)、惊恐障碍(PD)和社交焦虑障碍(SAD)的亚型;其发病机制和分型... 详细信息

焦虑障碍是我国患病率最高的精神障碍,也是全球第六大致残原因.如何建立精准有效的个体化预防-诊断-治疗体系,成为当前亟须攻克的难题.焦虑障碍主要包括广泛性焦虑障碍(GAD)、惊恐障碍(PD)和社交焦虑障碍(SAD)的亚型;其发病机制和分型机制尚不清楚.本文系统综述了近年来临床焦虑障碍和亚临床焦虑的研究进展,特别是本团队的研究进展,重点从神经认知机制的理论模型和临床应用方面寻求新的见解和研究线索.基于经典认知模型、杏仁核和脑岛中心神经模型,以及静态脑网络模型,我们提出了动态焦虑脑网络模型:强调突显网络、执行控制网络、默认网络和感知网络之间的动态相互作用,这是情绪和认知控制交互作用的基础;网络间的神经振荡负责资源转换和信号同步;去甲肾上腺素系统,特别是蓝斑(LC)-去甲肾上腺素(NE)系统,通过神经递质调节上述过程.本文还总结了焦虑的诊断和预测指标,包括遗传特征、认知特征和神经生物标志物,特别强调了特异频段的神经振荡模式,以及动态脑网络连接,以预测个体化焦虑症状和其他精神疾病.通过在体脑成像、神经环路示踪技术、单细胞组学等技术,全面精准解析焦虑障碍的多维度发病机制,揭示国家一类创新药物GW117抗焦虑分子环路机制及其对机体神经-内分泌-免疫系统的影响,为开发新型抗焦虑药物提供依据;通过采用多模态神经影像、神经生理生化等检测评估手段,筛选和鉴定焦虑障碍预测、识别和早期诊断的客观标记;通过融合多模态脑成像技术和光电磁等神经调控技术,开发个体化精准有效的靶点定位和参数优化方案,筛选和确定焦虑障碍治疗的新型靶标.基于多维度客观标记和新型靶标,在亚临床风险人群和焦虑障碍人群中开展队列研究,构建焦虑障碍人群预测模型,形成焦虑障碍早期预防、精确诊断和有效治疗策略方案.

关键词：焦虑动态脑网络模型诊断标记个性化预测精准干预

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微小RNA-193b在结直肠癌中的表达

中华实验外科杂志 2015年第4期32卷 695-697页

作者：徐学虎吴小兵伍尚标孙嫣刘海波陈戎广州医科大学附属第三医院普通外科 510150 广州医科大学附属第三医院消化内科 510150 广州医科大学附属第三医院妇产科研究所 510150

目的观察微小RNA（miRNA,miR）-193b在结直肠癌（CRC）中的表达水平,探讨其作为CRC诊断标记的潜能.方法采用实时荧光定量聚合酶链反应（FQ-PCR）分析miR-193b在Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期及整体CRC中的表达水平,采用t检验及受试者特征曲线（ROC）分... 详细信息

目的观察微小RNA（miRNA,miR）-193b在结直肠癌（CRC）中的表达水平,探讨其作为CRC诊断标记的潜能.方法采用实时荧光定量聚合酶链反应（FQ-PCR）分析miR-193b在Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期及整体CRC中的表达水平,采用t检验及受试者特征曲线（ROC）分析miR-193b作为CRC诊断标记的敏感性和特异性.并应用Cluster聚类法分析其表达水平与CRC分期的相关性.结果 miR-193b在Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期及整体CRC中分别下调3.860倍（P＜0.05）、2.680倍（P＜0.05）、5.280倍（P＜0.05）、3.410倍（P＜0.05）.miR-193b筛查CRC的特异性和敏感性分别是61.29％和77.42％,曲线下面积（AUC）为0.728.而其表达水平和CRC的分期无明显相关.结论 miR-193b具有作为CRC诊断标记的潜能.

关键词：结肠癌直肠癌诊断标记

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STC2基因在原发性肝癌中的表达

STC2基因在原发性肝癌中的表达

作者：邬匡杰南京医科大学

学位级别：硕士

目的:研究STC2(Stanniocalcin 2)基因在肝癌组织中的表达及其对肝癌细胞生长增殖的影响,探讨作为一个新的肿瘤标记物在肝癌中的诊断作用。方法:通过基因芯片的筛选,我们发现STC2基因在肝癌组织中的表达有明显差异,利用RT-PCR技术和实时... 详细信息

目的:研究STC2(Stanniocalcin 2)基因在肝癌组织中的表达及其对肝癌细胞生长增殖的影响,探讨作为一个新的肿瘤标记物在肝癌中的诊断作用。方法:通过基因芯片的筛选,我们发现STC2基因在肝癌组织中的表达有明显差异,利用RT-PCR技术和实时定量PCR技术(real-time PCR)进一步检测STC2基因在人类正常组织和47例肝癌和癌旁组织中的表达差异;观察分析内源性STC2基因被沉默前后的肝癌细胞生长曲线、克隆形成能力,以及外源性STC2基因过表达前后的克隆形成能力。结果:在15种正常人体组织中,STC2在成人的正常肝中低表达;与癌旁组织相比较,STC2基因在68.09%(32/47)肝癌组织中的表达量则明显上调;沉默肝癌细胞株中内源性STC2基因表达后,肝癌细胞的生长明显减慢,克隆形成能力明显降低,而过表达STC2基因后,对肝癌细胞生长作用则正好相反;STC2和AFP对诊断肝癌无明显统计学差异(P=0.1514)。结论:STC2可能是一个新的肝癌相关的原癌基因,对其进一步研究有可能发现肝癌发病的新机制,成为肝癌治疗的新靶点和诊断标记。

关键词： STC2基因原发性肝癌 RNA干扰诊断标记

对血浆白蛋白、胆红素及尿酸水平作为口腔癌及唾液腺肿瘤的潜在标记物的评价

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对血浆白蛋白、胆红素及尿酸水平作为口腔癌及唾液腺肿瘤的潜在标...

作者：戴丽山东大学

学位级别：硕士

背景:氧自由基的毒性已被认为是罹患癌症的一大重要因素。许多研究已表明血浆尿酸、白蛋白及胆红素水平与乳腺癌、前列腺癌、肺癌、直肠癌等多种癌症有一定的相关性。然而对口腔癌及唾液腺良恶性肿瘤的此方面研究较少。目的:评价患有口... 详细信息

背景:氧自由基的毒性已被认为是罹患癌症的一大重要因素。许多研究已表明血浆尿酸、白蛋白及胆红素水平与乳腺癌、前列腺癌、肺癌、直肠癌等多种癌症有一定的相关性。然而对口腔癌及唾液腺良恶性肿瘤的此方面研究较少。目的:评价患有口腔癌或唾液腺良恶性肿瘤的病人治疗前血浆白蛋白、胆红素、尿酸水平,分析肿瘤的发生及良恶性是否与治疗前血浆白蛋白、胆红素、尿酸水平相关,借此以达到辅助诊断,完善手术计划的目的。材料与方法:收集2011.1.1—2018.10.13山东大学第二医院术后病理为口腔癌或者唾液腺肿瘤的住院患者入院空腹血样,2小时内检测血浆白蛋白、胆红素、尿酸水平,根据相关标准进行筛选,作为实验组数据。其中口腔癌患者55人,恶性唾液腺肿瘤患者17人,良性唾液腺肿瘤82人。于山东大学第二附属医院查体中心,按照实验组的年龄及性别分布,随机抽取健康人群的空腹血样,同样送检,检查结果作为对照组数据。数据收集完成后,利用统计学软件STATA,SPSS进行统计学分析。结果:口腔癌患者尿酸水平及白蛋白水平明显低于对照组(P0.05)。患恶性唾液腺肿瘤的患者中,血浆白蛋白水平明显低于对照组,而尿酸及胆红素水平皆未见明显差异。对于患有唾液腺良性肿瘤患者,白蛋白水平明显低于对照组,尿酸及总胆红素差异未见统计学意义。结论:白蛋白水平在口腔癌患者及良恶性唾液腺肿瘤患者中皆低于正常人群,但是血浆胆红素水平皆未见明显差异。尿酸水平在口腔癌患者及恶性唾液腺肿瘤患者中明显低于正常人群,而在良性唾液腺肿瘤未见明显差异。

关键词：口腔癌唾液腺肿瘤诊断标记胆红素尿酸白蛋白

系统识别与分析肥厚型心肌病相关失调的miRNA-转录因子前馈环

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系统识别与分析肥厚型心肌病相关失调的miRNA-转录因子前馈环

作者：李佳瑶哈尔滨医科大学

学位级别：硕士

肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)是常见的遗传性心血管疾病之一,其致病原因不明,在一般人群中患病率约为0.2%,该病可以发生在人群的各个年龄段,患病者的男女比例大致为3:2。已有研究表明肥厚型心肌病是引发35岁以下青年... 详细信息

肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)是常见的遗传性心血管疾病之一,其致病原因不明,在一般人群中患病率约为0.2%,该病可以发生在人群的各个年龄段,患病者的男女比例大致为3:2。已有研究表明肥厚型心肌病是引发35岁以下青年人特别是运动员心源性猝死(sudden cardiac death,SCD)的首要原因。随着临床医学和生命科学的发展,尽管对于肥厚型心肌病的研究已经取得了一些成果,同时识别了一些肥厚型心肌病相关的基因,但目前对于肥厚型心肌病发生发展的分子机制的研究仍不全面。在众多遗传分子中,miRNA与转录因子(transcription factor,TF)是两种关键的基因调控因子,它们都参与许多重要的细胞过程,包括细胞分化、增殖和凋亡。miRNA是近年来发现的一类长度为18-25个核苷酸的单链小分子非编码 RNA,由茎环结构的转录前体加工而成。miRNA主要通过与靶标基因3’UTR的完全或不完全配对,降解靶标基因mRNA或抑制其翻译,从而在转录后水平对靶标基因的表达进行调控,参与调控个体发育、细胞凋亡、增殖及分化等生命活动。转录因子是一种能与基因5’端上游特定序列特异性结合的蛋白质分子,其在转录水平调控基因转录,从而可以确保目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达。已有研究证明,miRNA和转录因子可以协同调控相同的靶基因,并且它们二者之间可以相互调节,进而形成前馈环(feed-forward loops,FFLs)。miRNA-TF前馈环已经被报道在哺乳动物基因调控网络中发挥着重要的作用,因此,miRNA-TF前馈环的失调将导致疾病的发生与发展。目前,肥厚型心肌病中miRNA与转录因子之间的协同调控机制尚未被系统研究。本研究旨在探索三个问题:一是开发新的生物信息学算法,识别肥厚型心肌病相关失调的miRNA-TF前馈环;二是系统分析肥厚型心肌病相关失调的miRNA-TF前馈环,探索miRNA与转录因子之间的协同调控模式;三是基于识别的miRNA-TF前馈环进一步识别肥厚型心肌病潜在的诊断标记。本研究中,首先,我们系统整合了肥厚型心肌病相关样本配对的miRNA与基因的表达谱数据,实验证实的miRNA与靶基因以及转录因子与靶基因的互作关系数据,提出了一种新的生物信息学算法,识别肥厚型心肌病相关失调的miRNA-TF前馈环。同时,我们将本文方法与已有方法从多个层面进行比较,以表明本文方法的有效性与可靠性。其次,基于识别的肥厚型心肌病相关失调的miRNA-TF前馈环,我们构建了失调的miRNA-TF调控网络,对网络进行拓扑分析及功能分析,探索肥厚型心肌病中miRNA与转录因子的协同调控模式。最后,对于网络中关键的分子,我们应用支持向量机(support vector machine,SVM)分类模型及五倍交叉验证识别肥厚型心肌病潜在的诊断标记。基于样本配对的miRNA与基因的表达谱数据以及分子间的调控互作关系,首先,我们提出了一种新的识别肥厚型心肌病相关失调的miRNA-TF前馈环的方法。在肥厚型心肌病中,我们识别了316个显著失调的miRNA-TF前馈环,这些前馈环由118个miRNAs,102个基因和53个转录因子构成。我们从显著差异表达基因、已知的肥厚型心肌病相关分子以及显著富集的KEGG通路等层面证实了这些前馈环与肥厚型心肌病密切相关。同时,我们将本文方法与已有方法进行比较,结果表明,本文方法获得的miRNA-TF前馈环拥有更多的肥厚型心肌病相关的分子,更多的显著差异表达分子以及富集更多的肥厚型心肌病相关KEGG的子通路。其次,基于识别的miRNA-TF前馈环,我们构建了肥厚型心肌病相关失调的miRNA-TF调控网络,从全局角度系统分析了网络的拓扑属性,发现此miRNA-TF调控网络具有生物网络的特性。同时发现由hsa-miR-17-5p,FASN和STAT3构成的miRNA-TF前馈环在肥厚型心肌病中可能发挥着重要的作用。最后,我们识别了两组肥厚型心肌病潜在的诊断标记,一组是由3个转录因子(CEBPB,HIF1A和STAT3)构成,另一组是由4个miRNAs(hsa-miR-155-5p,hsa-miR-17-5p,hsa-miR-20a-5p和hsa-miR-181a-5p)构成。同时我们在独立的测试集中进行验证,结果表明我们识别的肥厚型心肌病潜在的诊断标记具有较好的分类效能。我们提出一种新的可靠的生物信息学方法用于识别肥厚型心肌病相关失调的miRNA-TF前馈环,此方法可以扩展到应用于其他疾病相关miRNA-TF前馈环的研究;我们系统研究了肥厚型心肌病中miRNA与转录因子的协同调控模式,同时识别了两组具有较高诊断效能的肥厚型心肌病潜在的诊断标记。总之,我们的结果将为深入研

关键词：肥厚型心肌病 miRNA 转录因子前馈环诊断标记