检索结果-南通市图书馆

绒山羊4个多胎性状候选基因多态性及其与产羔数的关联分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国畜牧兽医 2023年第3期50卷 1037-1047页

作者：萨初拉吴铁成马跃军何云梅朱莉仙何托雅武玉平刘斌内蒙古自治区农牧业科学院呼和浩特010031 鄂托克旗农牧技术推广中心鄂尔多斯017000 阿拉善盟畜牧兽医技术推广中心阿拉善750030 鄂尔多斯市立新实业有限公司鄂尔多斯017000 杭锦旗农牧技术推广中心鄂尔多斯017400

【目的】通过对内蒙古白绒山羊4个多胎性状相关基因进行测序和生物信息学分析,深入挖掘与产羔数显著相关的单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点,为提升绒山羊高效繁育提供理论依据。【方法】选取阿拉善型、阿尔... 详细信息

【目的】通过对内蒙古白绒山羊4个多胎性状相关基因进行测序和生物信息学分析,深入挖掘与产羔数显著相关的单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点,为提升绒山羊高效繁育提供理论依据。【方法】选取阿拉善型、阿尔巴斯型绒山羊母羊244只,利用MultipSeq多重PCR结合二代高通量技术检测生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)、骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic protein 15,BMP15)、骨形态发生蛋白受体1B(bone morphogenetic protein receptor 1B,BMPR1B)和β-1,4-N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 2,B4GALNT2)基因多态性,并对不同SNP位点与绒山羊产羔数进行关联分析。【结果】通过GATK分析共预测得到172个SNPs位点,其中BMPR 1 B、B 4 GALNT 2、BMP 15、GDF 9基因相关SNPs位点分别为95、33、26和18个。GLM模型关联分析发现,10个SNPs位点与白绒山羊产羔数显著相关(PG、g.29897064 G>A、g.29897722 G>A、g.29897734 C>A和g.29938673 C>G位点的CC、GG、GA、CA和CC基因型个体产羔数分别显著高于CG、GA、GG、CC和GG基因型(PA位点的GG和GA基因型个体产羔数均显著高于AA基因型(PC位点的CC和AC基因型个体产羔数均显著高于AA基因型(P绒山羊多胎性状相关基因GDF 9、BMP 15、BMPR 1 B和B 4 GALNT 2的SNPs位点序列特征,发现了与白绒山羊产羔数显著相关的10个SNPs位点,并揭示了不同基因型产羔数间的差异,从而为内蒙古白绒山羊分子辅助育种提供了有力的SNP参考位点。

关键词：绒山羊 GDF 9基因 BMP 15基因 BMPR 1 B基因 B 4 GALNT 2基因产羔数

绒山羊源大肠杆菌噬菌体φPTK的分子生物学特性及对小鼠大肠杆菌感染的防治效果

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

微生物学通报 2023年第8期50卷 3479-3494页

作者：李托李陇平董书伟屈雷榆林学院陕西省陕北绒山羊工程技术研究中心陕西榆林719000 榆林学院生命科学学院陕西榆林719000

【背景】抗生素耐药问题是影响人类及养殖业健康的重要因素,噬菌体能特异性裂解细菌,成为抗生素替代品研究热点,是解决抗生素耐药难题、促进养殖业健康发展的新途径。【目的】通过研究绒山羊源大肠杆菌烈性噬菌体φPTK(phage target of ... 详细信息

【背景】抗生素耐药问题是影响人类及养殖业健康的重要因素,噬菌体能特异性裂解细菌,成为抗生素替代品研究热点,是解决抗生素耐药难题、促进养殖业健康发展的新途径。【目的】通过研究绒山羊源大肠杆菌烈性噬菌体φPTK(phage target of K1)的分子生物学特性,同时利用小鼠感染模型研究φPTK对小鼠大肠杆菌感染的防治效果,为绒山羊大肠杆菌病的防控提供新策略。【方法】用聚乙二醇-氯化钠(PEG 8000-NaCl)浓缩φPTK后,采用透射电子显微镜观察其超微形态结构;运用苯酚-氯仿法提取φPTK核酸后通过IlluminaHiSeq高通量测序分析其全基因组结构,使用Mauve比较基因组学分析,通过MEGA绘制噬菌体进化树;通过构建小鼠感染模型分析φPTK对小鼠感染大肠杆菌的防治效果。【结果】透射电镜显示φPTK头部为正多面体形,直径90 nm,有长约112nm、直径约18nm的可收缩长尾;φPTK基因组全长169688bp,GC含量37.72%,有264个开放阅读框,含穿孔素-裂解酶(holin-lysin)裂解系统,有抗穿孔素蛋白和裂解抑制辅助蛋白,未发现抗生素耐药基因和毒力基因;比较基因组分析表明,φPTK为一株新的绒山羊源大肠杆菌烈性噬菌体;小鼠大肠杆菌感染前和感染后分别使用φPTK进行预防和治疗的试验表明,未使用φPTK的阳性对照组小鼠全部死亡,预防组和治疗组小鼠存活率分别为80%和60%。【结论】噬菌体φPTK是一株能够在小鼠大肠杆菌感染中具有较好预防效果的有尾噬菌体目(Caudovirales)肌尾噬菌体科(Myoviridae)绒山羊源大肠杆菌烈性噬菌体,本研究为绒山羊噬菌体生物制剂的创制奠定了基础。

关键词：绒山羊大肠杆菌噬菌体φPTK 全基因组测序比较基因组分析防治效果

绒山羊胎儿期皮肤毛囊发生发育相关circRNA1800调控网络的构建

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国畜牧杂志 2023年第10期59卷 211-217页

作者：杨青林尚方正戎友俊马荣王敏潘剑锋梁丽丽牛舒冉齐云鹏李彦伯张燕军内蒙古农业大学动物科学学院内蒙古呼和浩特010018 农业部肉羊遗传育种重点实验室内蒙古呼和浩特010018 内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室内蒙古呼和浩特010018 内蒙古自治区山羊遗传育种工程技术研究中心内蒙古呼和浩特010018

内蒙古绒山羊经过了长期的自然选择和人工选择,成为了当地杰出的绒山羊品种。皮肤毛囊是绒山羊重要的产绒器官,研究毛囊的发生发育机制对绒山羊的产绒量和绒品质至关重要。近年来,circRNA逐渐成为生物学领域的热点,特别是在人类医学研... 详细信息

内蒙古绒山羊经过了长期的自然选择和人工选择,成为了当地杰出的绒山羊品种。皮肤毛囊是绒山羊重要的产绒器官,研究毛囊的发生发育机制对绒山羊的产绒量和绒品质至关重要。近年来,circRNA逐渐成为生物学领域的热点,特别是在人类医学研究方面取得了重大的突破,但在其他哺乳动物上的研究还相对匮乏。基于课题组前期的全转录组测序结果,首先结合表达量、剪切位点数筛选了绒山羊毛囊发生发育相关的circRNA1800,利用TargetScan和miRanda软件预测其靶向的chi-miR-15b-5p、chi-miR-16a-5p、chi-miR-148a-3p;然后预测了3个miRNA的靶基因,同时结合mRNA的通路富集结果,进一步确定靶向的DKK2和ZRANB3,并利用实时荧光定量PCR反应(qRT-PCR)验证了circRNA、miRNA和mRNA之间的靶向关系,从而构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。

关键词：绒山羊皮肤毛囊 circRNA 调控网络

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

绒山羊产绒性能影响因素的研究进展

中国草食动物科学 2024年第1期44卷 43-47页

作者：张兴会辽宁省现代农业生产基地建设工程中心沈阳110032 辽宁省辽宁绒山羊原种场有限公司辽阳111000

产绒性能是绒山羊重要的生产性能,受生理、环境和遗传因素的综合影响。深入研究各因素对产绒性能的影响,对改良绒山羊品种、提高绒产量和品质具有重要意义。为此,文章综述了绒山羊产绒性能影响因素的研究进展,以期为生产优质羊绒及改良... 详细信息

产绒性能是绒山羊重要的生产性能,受生理、环境和遗传因素的综合影响。深入研究各因素对产绒性能的影响,对改良绒山羊品种、提高绒产量和品质具有重要意义。为此,文章综述了绒山羊产绒性能影响因素的研究进展,以期为生产优质羊绒及改良绒山羊产绒性能提供参考。

关键词：绒山羊产绒性能生理因素环境因素遗传因素

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

绒山羊角蛋白关联蛋白基因家族研究进展

家畜生态学报 2022年第6期43卷 1-7页

作者：何兆华罗玉柱王继卿胡江刘秀李少斌甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室甘肃兰州730070

羊绒是绒山羊的主要产品,其产量和品质直接关系到绒山羊产业的经济效益。角蛋白关联蛋白(KAP)作为羊绒纤维的主要结构蛋白之一,对绒毛的物理特性起着决定性作用。角蛋白关联蛋白基因家族(KRTAPs)编码KAPs,解析该基因家族成员的结构、功... 详细信息

羊绒是绒山羊的主要产品,其产量和品质直接关系到绒山羊产业的经济效益。角蛋白关联蛋白(KAP)作为羊绒纤维的主要结构蛋白之一,对绒毛的物理特性起着决定性作用。角蛋白关联蛋白基因家族(KRTAPs)编码KAPs,解析该基因家族成员的结构、功能及其表达调控对了解羊绒性状的形成、发育和遗传改良意义重大。该文综述了山羊KRTAPs基因的种类、染色体定位、核苷酸多态性与组织表达及其对羊绒性状的影响等方面相关研究进展,以期为后续研究提供参考。

关键词：角蛋白关联蛋白绒山羊羊绒基因家族

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

绒山羊皮肤全长转录组测序及生物信息学分析

中国农业大学学报 2022年第12期27卷 170-179页

作者：罗磊乔大宽刘宇荧傅新红四川农业大学管理学院成都611130 四川省农村发展研究中心成都611130

为能够更精准地得到绒山羊皮肤mRNA全长序列和完整结构信息,并对新基因和Iso-form进行更全面的分析以对绒山羊转录组数据进行补充,以绒山羊作为试验动物,使用SMRT测序技术,对绒山羊皮肤组织混合样品进行全长转录组测序,并使用TransDeco... 详细信息

为能够更精准地得到绒山羊皮肤mRNA全长序列和完整结构信息,并对新基因和Iso-form进行更全面的分析以对绒山羊转录组数据进行补充,以绒山羊作为试验动物,使用SMRT测序技术,对绒山羊皮肤组织混合样品进行全长转录组测序,并使用TransDecoder、Astalavista和Cytoscape等分析工具对其编码区序列及其对应氨基酸序列、可变剪接类型以及基因功能富集进行预测分析。结果表明:1)测序共获得42.41Gb clean data的数据,CCS(Circular consensus sequencing)591585条,其中全长非嵌合序列466058条。2)共鉴定出6166个新基因,55875条新转录本,SSR(Simple sequence repeat)66951个、ORF(Open reading frame)序列39346条、TF(Transcription factors)5641个及10927个lncRNA,并完成49573条新转录本的功能注释。3)鉴定出25717种可变剪接,其中内含子保留为主要的剪接方式,基于功能富集分析结果和可变剪接位点信息发现黑素皮质素1受体(Melanocortin 1receptor,MC1R)与微管蛋白3类(Tubulin-β-Ⅲ,TUBB3)可发生可变剪接,共用TUBB3第一外显子。鉴定的lncRNA中新lncRNA 8251个,主要类型为内含子lncRNA。本研究更精准地得到了绒山羊皮肤mRNA全长序列及完整结构信息,为进一步研究绒山羊皮肤基因结构及互作机理奠定基础,同时为绒山羊基因组资源进行了数据补充。

关键词：绒山羊 SMRT lncRNA 可变剪接

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

绒山羊毛囊发育中非编码RNA的研究进展

中国畜牧兽医 2022年第5期49卷 1817-1827页

作者：王东梁加越王笑冰冯娟张茹夏慧岩肖红梅内蒙古农业大学生命科学学院呼和浩特010010 中国农业大学食品科学与营养工程学院北京100083 内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室呼和浩特010010 内蒙古自治区生物制造重点实验室呼和浩特010010

非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是指从基因组上转录而来,不编码蛋白质,但在RNA水平上能行使一定生物学功能的RNA。非编码RNA的种类较多,种类的不同造成功能的差异。毛囊是绒山羊皮肤特殊的附属物,位于皮肤的真皮层,发生于绒山羊胚胎... 详细信息

非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是指从基因组上转录而来,不编码蛋白质,但在RNA水平上能行使一定生物学功能的RNA。非编码RNA的种类较多,种类的不同造成功能的差异。毛囊是绒山羊皮肤特殊的附属物,位于皮肤的真皮层,发生于绒山羊胚胎期。由于真皮细胞和上皮细胞间的信号分子传递,使其发育呈周期性变化,历经生长期、退行期和休止期。近年来,有关ncRNA在绒山羊毛囊发育中作用报道较多。文章就其中的微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)及环状RNA(circRNA)的生物发生及其在绒山羊毛囊发育中的作用机制进行了归纳、总结。miRNA是真核生物中存在的一种长18~25 nt的ncRNA分子,可通过与靶信使核糖核酸mRNA特异结合,抑制转录后基因表达。在绒山羊毛囊发育中,miRNA通过抑制相关基因及相关信号通路中关键分子的表达而调控毛囊的发育周期以及毛囊的再生能力。lncRNA是长度超过200 nt的ncRNA,经过剪接,具有polyA尾巴与启动子结构,在绒山羊毛囊发育中能促进毛囊细胞增殖与分化,通过调控基因的靶向表达与多种信号通路互作调节毛囊发育及绒毛生长的周期活动。circRNA是与传统的线性RNA不同的封闭环状RNA,含有许多miRNA结合位点,在绒山羊毛囊发育与绒毛生长中起miRNA分子海绵的作用,即通过miRNA的介导,调控靶基因的表达,促进毛囊干细胞向次级毛囊分化,进而解除与毛囊发育与绒毛生长相关的miRNA对其靶基因的抑制作用提高靶基因的表达水平。笔者通过对miRNA、lncRNA及circRNA的研究进行综述,以期为构建毛囊生长发育的分子调控网络及深入探讨绒山羊毛囊发育的调控机制提供借鉴,为今后更好地利用现代分子生物学技术改善绒毛品质提供理论依据。

关键词： miRNA lncRNA circRNA 绒山羊毛囊发育

绒山羊胎儿期毛囊发生发育关键circRNA的鉴定及功能预测分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国农业大学学报 2022年第4期27卷 207-218页

作者：尚方正马荣戎友俊王敏潘剑锋梁丽丽张燕军李金泉内蒙古农业大学动物科学学院呼和浩特010018 农业部肉羊遗传育种重点实验室呼和浩特010018 内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室呼和浩特010018 内蒙古自治区山羊遗传育种工程技术研究中心呼和浩特010018

为探究调控绒山羊毛囊发生发育阶段关键circRNA及其功能,基于课题组前期得到的内蒙古绒山羊胎儿期(45、55、65和75d)皮肤组织circRNA表达谱以及各比对组中差异表达circRNA的基础,根据不同时期毛囊形态发生发育情况筛选了毛囊发生发育相... 详细信息

为探究调控绒山羊毛囊发生发育阶段关键circRNA及其功能,基于课题组前期得到的内蒙古绒山羊胎儿期(45、55、65和75d)皮肤组织circRNA表达谱以及各比对组中差异表达circRNA的基础,根据不同时期毛囊形态发生发育情况筛选了毛囊发生发育相关的circRNA,利用生物信息学分析毛囊发生发育关键circRNA,并对其进行qRT-PCR试验;运用TargetScan和miRanda预测关键circRNA靶向的miRNA以及靶向miRNA的靶基因,分析了22个内含子circRNA宿主基因的富集情况,探究circRNA的功能作用。结果表明:1)通过生物信息学分析,circRNA2049、circRNA5681、circRNA2225和circRNA3411均由外显子组成,为外显子circRNA。2)qRT-PCR显示,circRNA2049、circRNA2225、circRNA3411和circRNA5681在绒山羊胎儿期4个时期(45、55、65和75d)中均显著差异表达(P绒山羊毛囊发生发育关键circNRA,并初步探究了其功能,为解析circRNA在绒山羊毛囊发育过程中的分子机制提供了理论基础,为研究绒毛生长发育提供了新的方向。

关键词：绒山羊毛囊 circRNA 功能分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

绒山羊波形蛋白基因启动子的克隆及活性检测

吉林农业大学学报 2023年第5期45卷 609-616页

作者：胡小玉梁加越冯娟王笑冰王东肖红梅内蒙古农业大学生命科学学院呼和浩特010011 中国农业大学食品科学与营养工程学院北京100083 内蒙古自治区生物制造重点实验室呼和浩特010011

以内蒙古阿尔巴斯白绒山羊基因组为模板,采用PCR方法克隆波形蛋白基因启动子,并与载体pEGFP-N1连接构建启动子荧光表达载体重组质粒,通过转染次级毛囊成纤维细胞,在荧光镜下鉴定启动子活性,应用生物软件对其序列进行信息学分析。结果表... 详细信息

以内蒙古阿尔巴斯白绒山羊基因组为模板,采用PCR方法克隆波形蛋白基因启动子,并与载体pEGFP-N1连接构建启动子荧光表达载体重组质粒,通过转染次级毛囊成纤维细胞,在荧光镜下鉴定启动子活性,应用生物软件对其序列进行信息学分析。结果表明:波形蛋白启动子区含有转录所必需的调控元件TATAbox、CAAT-box、GC-box等以及2个CPG岛;10个与启动子结合的转录因子;荧光镜下转染的成纤维细胞具有荧光蛋白表达,揭示波形蛋白启动子具有活性,它的激活可诱导下游的波形蛋白基因的转录和表达。

关键词：绒山羊波形蛋白启动子活性转录因子