绒山羊胚胎期次级毛囊发生发育相关miRNA的筛选及靶基因验证

作     者：尚方正 马荣 戎友俊 潘剑锋 王敏 牛舒冉 齐云鹏 李彦伯 李金泉 张燕军 SHANG Fangzheng;MA Rong;RONG Youjun;PAN Jianfeng;WANG Min;NIU Shuran;QI Yunpeng;LI Yanbo;LI Jinquan;ZHANG Yanjun

作者机构：内蒙古农业大学动物科学学院/农业农村部肉羊遗传育种重点实验室/内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室/内蒙古自治区山羊遗传育种工程技术研究中心呼和浩特010018 

出 版 物：《中国农业大学学报》 (Journal of China Agricultural University)

年 卷 期：2023年第28卷第2期

页      面：90-103页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家重点研发计划资助(2021YFD1200902) 内蒙古自治区科技重大专项项目(2021ZD0012) 研究生科研创新项目(B20210175Z)。 

主　　题：绒山羊 次级毛囊 miRNA 靶基因 

摘      要：为筛选绒山羊次级毛囊发生发育相关microRNA(miRNA)及靶基因验证,本研究基于课题组前期高通量测序技术得到绒山羊胎儿期(45、55、65、75、95、115和135 d)皮肤组织miRNA表达谱的基础上,鉴定各比对组中差异表达的miRNA并根据毛囊形态发生规律筛选次级毛囊发生发育相关的miRNA,运用RNAhybrid、miRanda和TargetScan软件预测筛选到的miRNA靶基因并与次级毛囊发育相关基因取交集,所得基因进行GO和KEGG富集分析,筛选毛囊发生发育重要通路中的关键基因构建miRNA-mRNA调控网络,进而运用双荧光素酶报告验证关键miRNA-mRNA的靶向关系。结果表明:1)筛选到次级毛囊发生发育相关miRNA 153个,共预测到32 978个靶基因;2)取交集后得到1 352个靶向的次级毛囊发生发育相关的基因,且显著富集在29条KEGG通路中,其中毛囊发生发育重要通路TGF-β同样显著富集;3)构建了chi-miR-26b-5p-SMAD1和chi-miR-495-3p-SMAD1等232对次级毛囊发生发育可能相关的miRNA-mRNA关系对,双荧光素酶报告系统进一步验证了关键靶向关系。本研究为解析miRNA在绒山羊次级毛囊发育过程中的分子机制奠定了前期基础。