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基于tAP分子亲和力模型预测MHCⅠ类分子提呈短肽的免疫原性

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生物化学与生物物理进展 2020年第2期47卷 157-168页

作者：盛浩卢玉峰包永明辽宁石油化工大学理学院抚顺113001 大连理工大学数学科学学院大连116023 大连理工大学生命科学与技术学院大连116023

主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)Ⅰ类分子亲和力模型有助于筛选出候选短肽,为实验确定可以与MHCⅠ类分子形成复合物从而激活细胞毒性t细胞的短肽提供帮助;抗原处理相关转运体(transporter associated with ... 详细信息

主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)Ⅰ类分子亲和力模型有助于筛选出候选短肽,为实验确定可以与MHCⅠ类分子形成复合物从而激活细胞毒性t细胞的短肽提供帮助;抗原处理相关转运体(transporter associated with antigen processing,tAP)分子亲和力模型也可用于筛选候选短肽;如何更好利用两类亲和力模型筛选出候选短肽、这两类亲和力模型对短肽选择性的异同以及这种选择性异同的生物学机制尚不清楚.本文重新整理了tAP亲和力测试集,使训练样本达到699个;使用核函数平衡矩阵算法建立的tAP亲和力模型预测精度高于同类算法,5折交叉检验Pearson相关系数0.89;结合HLA A3分子亲和力模型、tAP亲和力模型显著提高免疫原性短肽预测精度,AUC值从~0.82上升到0.87.提高的原因是两个亲和力模型对第2、9位置"最佳"氨基酸不同偏好性和这种不同偏好的互补性造成的.tAP分子与短肽模拟对接结果反映了这个结论.tAP亲和力可在线预测(http://www.***.top/mbtwo/major.aspx).

关键词：免疫原性细胞毒性t细胞 MHCⅠ类分子抗原处理相关转运体核函数平衡矩阵方法

HCV螺旋酶N端HLA-A2限制性CtL表位的变异和CtL免疫应答

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细胞与分子免疫学杂志 2004年第3期20卷 325-327页

作者：郭华章王文亮汪涛第四军医大学西京医院病理科陕西西安710032

目的 :研究丙型肝炎病毒 (HCV)螺旋酶N端HLA A2限制性细胞毒性t细胞 (CtL)表位的变异及其增殖反应。方法 :对两例慢性HCV感染者随访 7年 ,用第 1年和第 5年的外周血提取病毒RNA ,再以Rt PCR扩增HCV螺旋酶N端基因 ,并亚克隆及测序。根据... 详细信息

目的 :研究丙型肝炎病毒 (HCV)螺旋酶N端HLA A2限制性细胞毒性t细胞 (CtL)表位的变异及其增殖反应。方法 :对两例慢性HCV感染者随访 7年 ,用第 1年和第 5年的外周血提取病毒RNA ,再以Rt PCR扩增HCV螺旋酶N端基因 ,并亚克隆及测序。根据测序结果 ,合成CtL抗原表位肽段。用血清学方法进行HLA分型。从感染者第 7年外周血中分离淋巴细胞 ,检测CtL对抗原肽的增殖反应。结果 :在具有HLA A2表型的感染者中 ,第 1年病毒抗原表位的起始氨基酸均存在琥珀突变 ,5年后该突变消失。在无HLA A2表型的感染者中 ,其感染后 5年病毒抗原表位肽段既无共有序列的变异 ,也无琥珀突变。HCV感染后 7年 ,两例感染者的淋巴细胞对该抗原表位肽段均无增殖反应。结论 :螺旋酶N端抗原表位出现的无义突变 ,可能与病毒的免疫逃避有关。在慢性感染的后期 ,病毒感染者对螺旋酶N端的CtL表位肽不出现免疫应答。

关键词：丙型肝炎病毒表位细胞毒性t细胞螺旋酶淋巴细胞增殖

PD-1单抗联合化疗治疗皮下脂膜炎样t细胞淋巴瘤一例报告并文献复习

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中华血液学杂志 2021年第11期42卷 959-961页

作者：曲双廖丽昇谢颖郑志海陈碧云福建医科大学附属省立临床医学院福建省立医院血液科福州350001

皮下脂膜炎样t细胞淋巴瘤(subcutaneous panniculitis-like t-cell lymphoma,SPtCL)是一种罕见的皮肤t细胞淋巴瘤,为αβ细胞毒性t细胞浸润皮下脂肪组织,在所有原发皮肤t细胞淋巴瘤中所占比例不足1%[1]。临床上SPtCL可表现为无痛性皮下... 详细信息

皮下脂膜炎样t细胞淋巴瘤(subcutaneous panniculitis-like t-cell lymphoma,SPtCL)是一种罕见的皮肤t细胞淋巴瘤,为αβ细胞毒性t细胞浸润皮下脂肪组织,在所有原发皮肤t细胞淋巴瘤中所占比例不足1%[1]。临床上SPtCL可表现为无痛性皮下结节,部分晚期患者发热、肝脾及淋巴结肿大。

关键词：皮肤t细胞淋巴瘤细胞毒性t细胞皮下结节皮下脂膜炎样t细胞淋巴瘤皮下脂肪组织淋巴结肿大联合化疗治疗无痛性

诱导原发免疫性血小板减少症t细胞免疫耐受的新途径

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中华血液学杂志 2014年第9期35卷 862-865页

作者：冀学斌侯明山东大学齐鲁医院血液科济南250012

原发免疫性血小板减少症（ItP）是一种以血小板过度破坏和（或）血小板生成减少为特点的自身免疫性出血性疾病.抗原特异性自身抗体介导的血小板破坏和（或）细胞毒性t细胞对血小板的直接溶解是血小板破坏增多的重要原因,而免疫介导的巨... 详细信息

原发免疫性血小板减少症（ItP）是一种以血小板过度破坏和（或）血小板生成减少为特点的自身免疫性出血性疾病.抗原特异性自身抗体介导的血小板破坏和（或）细胞毒性t细胞对血小板的直接溶解是血小板破坏增多的重要原因,而免疫介导的巨核细胞成熟障碍和凋亡异常则是导致ItP患者血小板生成减少的重要原因.研究表明,ItP存在t细胞免疫异常,t细胞介导对血小板自身抗原免疫失耐受是ItP发病的重要原因,主要表现为血小板自身抗原反应性t细胞的过度活化及增殖、调节性t细胞数量和功能异常、辅助性t细胞异常等.

关键词：免疫性血小板减少症 t细胞免疫耐受自身免疫性出血性疾病巨核细胞成熟障碍细胞毒性t细胞血小板破坏血小板生成细胞免疫异常

Wt1多肽特异性t细胞受体基因转导正常t细胞的抗肺癌效应

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南方医科大学学报 2014年第9期34卷 1319-1323页

作者：安军蔡松旺李昀张军航中山大学附属第三医院胸心外科广东广州510630

目的通过基因转导技术获得Wt1多肽特异性tCR基因转导的正常外周CD8+t细胞,检测其对肺癌细胞的杀伤活性,探讨tCR基因转导用于过继性细胞治疗肺癌的可行性及安全性。方法通过克隆HLA-A*2402限制性Wt1特异性细胞毒性t细胞(CtL)之tCR基因,... 详细信息

目的通过基因转导技术获得Wt1多肽特异性tCR基因转导的正常外周CD8+t细胞,检测其对肺癌细胞的杀伤活性,探讨tCR基因转导用于过继性细胞治疗肺癌的可行性及安全性。方法通过克隆HLA-A*2402限制性Wt1特异性细胞毒性t细胞(CtL)之tCR基因,经构建逆转录病毒载体后转导Wt1-tCR基因至正常外周CD8+t细胞;所获得的CD8+t细胞对靶细胞的杀伤效应经标准51Cr释放试验测定。结果 Wt1-tCR基因转导后的正常外周CD8+t细胞显示出对Wt1多肽负载的HLAA*2402+LCL细胞的特异性杀伤作用,同时tCR基因改造后的CD8+t细胞可特异性杀伤HLA-A*2402及Wt1表达阳性的肺癌细胞株而不对HLA-A*2402表达阳性的正常细胞产生杀伤作用。结论这些数据论证了Wt1-tCR基因转导正常外周t细胞具有与亲代CtL一致的特异性杀伤特性,提示该方法用于过继性细胞免疫疗法治疗肺癌具有可行性。

关键词：细胞免疫治疗 t细胞受体基因转导细胞毒性t细胞肺癌

穿孔素与颗粒酶B在乙型肝炎不同免疫状态中的作用

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传染病信息 2023年第5期36卷 458-462,468页

作者：胡林慧程浩姚甜甜钱建丹董琳菲王贵强王艳北京大学第一医院感染科 100034

穿孔素(perforin,PFN)是存在于细胞毒性细胞[又称杀伤细胞,包括自然杀伤(natural killer,NK)细胞、细胞毒性t细胞(cytotoxic t cells,CtL)等]的糖蛋白,颗粒酶(granzyme,Gzm)B是表达于杀伤细胞的小分子蛋白质。PFN和Gzm B贮存在细胞毒性... 详细信息

穿孔素(perforin,PFN)是存在于细胞毒性细胞[又称杀伤细胞,包括自然杀伤(natural killer,NK)细胞、细胞毒性t细胞(cytotoxic t cells,CtL)等]的糖蛋白,颗粒酶(granzyme,Gzm)B是表达于杀伤细胞的小分子蛋白质。PFN和Gzm B贮存在细胞毒性细胞的胞浆颗粒中,在与靶细胞接触后通过胞吐而释放。作为细胞毒性细胞所具有的2类重要效应分子,PFN和Gzm B在各种类型肝损伤免疫反应中发挥重要作用。在造成肝损伤的众多原因中,对乙型肝炎所致肝损伤研究较多。HBV复制与宿主抗病毒免疫的相互作用决定了HBV感染的最终结果,PFN和Gzm B是病毒感染的病原清除和靶细胞凋亡重要的介导物质,在HBV感染的不同阶段,PFN和Gzm B表达水平呈现不同特点:在急性HBV感染期,CtL高表达PFN、Gzm B;在慢性HBV感染期,NK细胞、CtL表达PFN、Gzm B呈下调趋势;在重症乙型肝炎阶段,CtL表达PFN、Gzm B的上调可能参与HBV感染重症化。本文主要对HBV感染免疫阶段PFN和Gzm B在不同免疫状态中具体作用特点作一介绍。

关键词：穿孔素颗粒酶B 细胞毒性t细胞自然杀伤细胞乙型肝炎肝损伤凋亡 HBV感染重症化

类风湿性关节炎患者滑液中CD4^+CD25-FOXP3^+t细胞比例增加且抑制功能缺陷

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细胞与分子免疫学杂志 2019年第11期35卷 961-966页

作者：张睿缪金林张葵郑朝晖朱平空军军医大学西京医院临床免疫科陕西西安710032 空军军医大学国家分子医学转化中心陕西西安710032

目的研究类风湿性关节炎(RA)患者外周血及关节滑液中CD4^+CD25-FOXP3^+t细胞[CD25-调节性t细胞(treg)]数量及功能分子表达情况及其与疾病活动度之间的关系。方法收集RA患者60例及健康对照者69例,采用流式细胞术对RA患者外周血和滑液(33... 详细信息

目的研究类风湿性关节炎(RA)患者外周血及关节滑液中CD4^+CD25-FOXP3^+t细胞[CD25-调节性t细胞(treg)]数量及功能分子表达情况及其与疾病活动度之间的关系。方法收集RA患者60例及健康对照者69例,采用流式细胞术对RA患者外周血和滑液(33例)以及健康对照者外周血CD25-treg比例及部分功能分子表达情况进行检测,并将相关数据与炎性指标及病情活动度进行相关性分析。采用Mann-WhitneyU检验、Spearman相关分析进行统计学分析。结果RA外周血中CD25-treg占CD4+细胞比例较健康对照者外周血无明显差异,RA滑液中CD25-treg比例较RA及健康对照者外周血均显著增高。将RA患者按疾病活动度及类风湿因子(RF)、抗环瓜氨酸肽(CCP)抗体、抗突变型瓜氨酸波形蛋白(MCV)抗体、抗角蛋白抗体(AKA)分组,RA外周血CD25-treg比例在各组间比较无显著差异,并且与血沉(ESR)和C反应蛋白(CRP)水平无明显相关性。功能分子表达上,RA滑液CD25-treg中CD39^+细胞比例显著低于健康对照者外周血,CD73^+细胞比例和转化生长因子β1阳性(tGF-β1^+)细胞比例显著低于RA患者及健康对照者外周血;细胞毒性t细胞相关蛋白4(CtLA4)和白细胞介素10(IL-10)表达水平在各组间均无明显差异。结论RA滑液中CD25-treg比例增加,但CD25-treg抑制功能分子CD39、CD73和tGF-β1表达下降,提示其抑制功能可能存在缺陷,进而导致局部炎症未得到有效控制。

关键词：细胞毒性t细胞疾病活动度局部炎症 CD25 FOXP3 炎性指标白细胞介素10 滑液

慢性乙型肝炎患者淋巴细胞及临床特征与病毒基因型的关系

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中华肝脏病杂志 2008年第9期16卷 700-701页

作者：顾锡炳蒋祥虎蒋跃明王栋华忠吴杭源陈浩坤徐月琴陆忠华无锡市传染病医院肝科 214005

对98例慢性乙型肝炎（CHB）患者作了HBV基因型的检测，对C基因型和B基因型感染者之间进行HBV特异性细胞毒性t淋巴细胞（CtL）、非特异性CtL等细胞免疫功能、HBV DNA水平、HBeAg阳性率和肝功能损害情况对比研究，探讨CHB患者不同HBV基因... 详细信息

对98例慢性乙型肝炎（CHB）患者作了HBV基因型的检测，对C基因型和B基因型感染者之间进行HBV特异性细胞毒性t淋巴细胞（CtL）、非特异性CtL等细胞免疫功能、HBV DNA水平、HBeAg阳性率和肝功能损害情况对比研究，探讨CHB患者不同HBV基因型与HBV特异性CtL、HBV复制和肝功能损害的关系，现报道如下。

关键词：肝炎,乙型,慢性基因型细胞毒性t细胞临床医学

人外周血单核细胞来源树突状细胞转染重组腺相关病毒诱导特异性t细胞的效应

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中国组织工程研究与临床康复 2007年第50期11卷 10117-10120页

作者：吴自勍黄浩尤长宣罗荣城 Paul L.Hermonat 南方医科大学附属南方医院肿瘤中心广东省广州市510515

目的:观察人外周血单核细胞来源的树突状细胞转染含前列腺特异性抗原片段的重组腺相关病毒后,其所诱导的特异性t细胞对前列腺癌细胞株LNCaP和DU145的体外杀伤抑制作用。方法:实验于2006-05/10在南方医院肿瘤科生物室完成。①对象:HLA-A... 详细信息

目的:观察人外周血单核细胞来源的树突状细胞转染含前列腺特异性抗原片段的重组腺相关病毒后,其所诱导的特异性t细胞对前列腺癌细胞株LNCaP和DU145的体外杀伤抑制作用。方法:实验于2006-05/10在南方医院肿瘤科生物室完成。①对象:HLA-A2基因亚型的健康自愿供血者1名,对本实验知情同意,实验经医院医学伦理委员会批准。作为靶细胞的前列腺癌细胞株LNCaP、DU145以及携带前列腺特异性抗原基因的重组腺相关病毒由美国阿肯色大学生物治疗中心刘勇教授惠赠。②实验方法:抽取HLA表型为A2的健康自愿供血者外周血50mL,Ficoll法分离单核细胞体外培养,磷酸盐缓冲液洗涤6孔板,收集悬浮细胞作为效应t细胞,贴壁细胞即为树突状细胞。向6孔板内加入粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子和携带前列腺特异性抗原基因的重组腺相关病毒,第4天加入白细胞介素4,第6天加入肿瘤坏死因子α,至培养第7天收获悬浮细胞即为成熟的树突状细胞。③实验评估:应用流式细胞仪检测树突状细胞表面分子标记的表达。以ELISA法检测树突状细胞分泌白细胞介素12的含量。将成熟树突状细胞与效应t细胞分别按1:10、1:20、1:40进行共培养,将未经过树突状细胞共育的t细胞设置为空白对照组,ELISA法检测效应t细胞分泌干扰素γ的含量。LNCaP、DU145靶细胞分别与效应t细胞按效靶比5:1、10:1、20:1、40:1进行共培养,Mtt法检测效应t细胞对两种靶细胞的杀伤作用。结果:①树突状细胞表面分子标记的表达:经携带前列腺特异性抗原基因的重组腺相关病毒致敏后的树突状细胞,培养8d后高表达CD83.CD40.HLA-DR,CD80,CD1a,CD86,分别为65.8%,66.0%,96.7%,70.0%,61.9%.79.0%。②树突状细胞释放白细胞介素12含量检测:与培养第1天比较,第7天成熟树突状细胞释放白细胞介素12的含量显著升高(Pt细胞释放干扰素γ含量检测:与空白对照组比较,树突状细胞:t细胞按1:10、1:20、1:40共培养后所释放的干扰素γ含量均明显升高(P细胞加入比例的提高有所增加。④效应t细胞的细胞毒性作用检测:效应t细胞可有效识别并杀伤HLA-A2阳性的LNCaP细胞,其抑制作用在效靶比为10:1、20:1、40:1时均显著强于DU145细胞株(P细胞,其细胞表型和刺激淋巴细胞增殖、分化的功能无明显改变,可诱导自体效应t细胞增殖,该效应t细胞对LNCaP细胞具有明显杀伤作用。

关键词：树突状细胞前列腺特异性抗原细胞毒性t细胞