检索结果-南通市图书馆

生物多样性 2021年第8期29卷 1050-1057页

作者：刘童祎陈静姜立云乔格侠中国科学院动物研究所动物进化与系统学重点实验室北京100101 中国科学院大学生命科学学院北京100049

以中国半翅目等29目昆虫类群(除鞘翅目、双翅目、鳞翅目、膜翅目之外的其他目)为研究对象,基于2020年度发表的新分类单元与文献资料,编制了物种名录,分析了新分类单元的地理分布与模式标本存放情况等。2020年,中国半翅目等29目昆虫共描... 详细信息

以中国半翅目等29目昆虫类群(除鞘翅目、双翅目、鳞翅目、膜翅目之外的其他目)为研究对象,基于2020年度发表的新分类单元与文献资料,编制了物种名录,分析了新分类单元的地理分布与模式标本存放情况等。2020年,中国半翅目等29目昆虫共描述349个新分类单元,包括新属35个,新种311个,新亚种3个;新种发表的热点地区在我国的西南山地及其邻近地区。模式标本存放单位多达69家,其中正模标本主要存放在国内保藏机构,而境外机构保藏的标本较少且以副模标本为主。本年度描述的349个新分类单元由356位作者所贡献,共发表文献182篇;Zootaxa和Zoo Keys是发表的主要期刊。本次调查为进一步深入研究物种演化的时空格局及生物多样性保护提供了基础数据。同时,由于人类面临生物多样性急剧下降的威胁,应加快大数据平台的建设及其多样化信息的挖掘,支撑生物多样性的研究和保护。

关键词：生物多样性信息学半翅目直翅目新分类单元中国

中国哺乳动物形态、生活史和生态学特征数据集

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生物多样性 2022年第2期30卷 87-96页

作者：丁晨晨梁冬妮信文培李春旺 Eric I.Ameca 蒋志刚北京师范大学生命科学学院生物多样性与生态工程教育部重点实验室北京100875 中国科学院动物研究所北京100101 中国科学院大学北京100049 河北大学生命科学学院河北保定071002

物种特征是生物对生存环境适应和响应的表现,反映了物种的生态位、适合度和生态功能。特征数据库的建立和共享是研究生物多样性维持与丧失、物种进化与适应、生态过程与生态系统功能、物种对气候变化和人类干扰响应、种内与种间关系等... 详细信息

物种特征是生物对生存环境适应和响应的表现,反映了物种的生态位、适合度和生态功能。特征数据库的建立和共享是研究生物多样性维持与丧失、物种进化与适应、生态过程与生态系统功能、物种对气候变化和人类干扰响应、种内与种间关系等的基础。中国是世界哺乳动物物种数最多的国家之一,然而目前中国还没有包含哺乳动物形态、生活史、生态学和地理分布等物种特征的数据库。我们系统查阅了文献和各种数据资料,共收集整理出中国有分布记录的754种哺乳动物(包括近些年野外绝灭种、分布存疑种)的体重、脑容量、体长、尾长、前臂长(翼手目)、后足长、耳长、性成熟时间、妊娠期、窝崽数、年窝数、世代长度、食性、活动模式、是否特有种、濒危等级、海拔范围、栖息地类型、栖息地宽度、动物地理界、生物群系、分布型、动物地理区划和分布省份或水域等24个生态特征数据。在这些特征中,除了分布省份或水域及是否特有种外,其余特征数据均存在不同程度的缺失,数据的完整度为30%‒100%。本数据库收录的哺乳动物种数为目前中国哺乳动物种数的上限,为中国哺乳动物研究提供了基础数据,推进中国哺乳动物多样性信息共享和深度挖掘。

关键词：哺乳动物形态特征生活史特征繁殖特征生态特征地理分布生物多样性信息学

中国生物多样性e-Science平台建设构想

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生物多样性 2010年第5期18卷 480-488页

作者：许哲平崔金钟覃海宁马克平中国科学院植物研究所生物多样性信息学重点实验室北京100093

本文结合国际生物多样性信息学发展趋势和生物多样性e-Science相关平台,在分析我国前期工作成果和相关问题的基础上,提出了基于服务架构(Service-Oriented Architecture,简称SOA)和国际空间标准服务ISO19119的中国生物多样性e-Science... 详细信息

本文结合国际生物多样性信息学发展趋势和生物多样性e-Science相关平台,在分析我国前期工作成果和相关问题的基础上,提出了基于服务架构(Service-Oriented Architecture,简称SOA)和国际空间标准服务ISO19119的中国生物多样性e-Science平台的三层结构(资源层、服务层和应用层),并对e-Science平台建设的几个重要方向进行阐述:组建强有力的协调组织、数据规范化和扩展、海量数据存储和计算、本体构建和语义分析、专题分析和领域建模、服务标准和服务内容以及科学社区的建设,为我国进行生物多样性e-Science平台建设提供理论依据。

关键词：生物多样性生物多样性信息学 e-Science ISO19119 面向服务架构(SOA)

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海洋生物多样性信息资源

生物多样性 2014年第3期22卷 253-263页

作者：邵广昭李瀚林永昌赖昆祺中研院生物多样性研究中心台北11529

海洋生物多样性甚高,但却饱受人为的破坏及干扰。目前全球最大的含点位数据的在线开放性数据库是海洋生物地理信息系统(OBIS),共约12万种3,700万笔资料;另一个较大的数据库世界海洋生物物种登录(WoRMS)已收集全球22万种海洋生物之物种... 详细信息

海洋生物多样性甚高,但却饱受人为的破坏及干扰。目前全球最大的含点位数据的在线开放性数据库是海洋生物地理信息系统(OBIS),共约12万种3,700万笔资料;另一个较大的数据库世界海洋生物物种登录(WoRMS)已收集全球22万种海洋生物之物种分类信息。除此之外,以海洋生物为主的单一类群的数据库只有鱼库(FishBase)、藻库(AlgaeBase)及世界六放珊瑚(Hexacorallians of the World)3个。跨类群及跨陆海域的全球性物种数据库则甚多,如网络生命大百科(EOL)、全球生物物种名录(CoL)、整合分类信息系统(ITIS)、维基物种(Wikispecies)、ETI生物信息(ETI Bioinformatics)、生命条形码(BOL)、基因库(GenBank)、生物多样性历史文献图书馆(BHL)、海洋生物库(SeaLifeBase);海洋物种鉴定入口网(Marine Species Identification Portal)、FAO渔业及水产养殖概要(FAO Fisheries and Aquaculture Fact Sheets)等可查询以分类或物种解说为主的数据库。全球生物多样性信息网络(GBIF)、发现生命(Discover Life)、水生物图库(AquaMaps)等则是以生态分布数据为主,且可作地理分布图并提供下载功能,甚至于可以改变水温、盐度等环境因子的参数值,利用既定的模式作参数改变后之物种分布预测。谷歌地球(Google Earth)及国家地理(National Geographic)网站中的海洋子网页,以及珊瑚礁库(ReefBase)等官方机构或非政府组织之网站,则大多以海洋保育的教育倡导为主,所提供的信息及素材可谓包罗万象,令人目不暇给。更令用户感到方便的是上述许多网站或数据库彼此间均已可交互链接及查询。另外,属于搜索引擎的谷歌图片(Google Images)与谷歌学术(Google Scholar)透过海洋生物数据库所提供的直接链接,在充实物种生态图片与学术论文上亦发挥极大帮助,让用户获得丰富多样的信息。为了保育之目的,生物多样性数据库除了整合与公开分享外,还应鼓励并推荐大家来使用。本文乃举Rainer Froese在巴黎演讲之内容为例,介绍如何使用海洋生物多样性之数据来预测气候变迁对鱼类分布的影响。最后就中国大陆与台湾目前海洋生物多样性数据库的现况、两岸的合作及如何与国际接轨作介绍。

关键词：海洋生物生物多样性信息学数据库整合分类信息生态分布

运用聚类分析与Google Maps于大量物种出现记录之研究

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生物多样性 2012年第1期20卷 76-85页

作者：赖昆祺郑又华陈岳智李佑升邵广昭中研院生物多样性研究中心台北11529 中研院信息科技创新研究中心台北11529

物种出现记录包含博物馆动物标本、植物标本、生态调查与物种观察等资料。在台湾生物多样性信息机构(Taiwan Biodiversity Information Facility,TaiBIF)物种出现记录整合平台中,已整合台湾26个数据集,包含超过150万笔物种出现记录,其... 详细信息

物种出现记录包含博物馆动物标本、植物标本、生态调查与物种观察等资料。在台湾生物多样性信息机构(Taiwan Biodiversity Information Facility,TaiBIF)物种出现记录整合平台中,已整合台湾26个数据集,包含超过150万笔物种出现记录,其中约有85%的数据具有地理信息。我们利用数据库中所汇整的鲤科数据,包括11个数据集、超过8,800笔出现记录数据,利用网格式、切割式与密度式3种聚类分析算法分别绘制出不同的空间可视化结果,藉此解决大量物种出现记录于Google Maps上呈现效能与可视化不佳之问题。同时我们也探讨了3种聚类分析法之结果与鲤科的专家意见范围地图(expertopinion range maps)比对的差异。期望透过本研究可快速且有效地呈现物种分布资料,进而帮助研究者挖掘出大量数据所隐含的知识,并为生态保育提供重要参考。

关键词：物种出现记录聚类分析生物多样性信息学可视性分析

Scratchpads 2.0:互联网时代的生物多样性虚拟研究环境

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生物多样性 2014年第3期22卷 264-276页

作者：王利松 Vincent S Smith 张红瑞张宪春中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室北京100093 Biodiversity Informatics Group Natural History MuseumCromwell roadLondonsw7 5BDUK

Scratchpads 2.0系统是支持在线环境下生物多样性基础数据的创建、管理和高效利用的虚拟研究平台。本文对该系统的研发背景和现状、系统使用的关键特征(包括个人数据和在线资源的动态整合机制、多语言内容的创建和管理、系统使用授权、... 详细信息

Scratchpads 2.0系统是支持在线环境下生物多样性基础数据的创建、管理和高效利用的虚拟研究平台。本文对该系统的研发背景和现状、系统使用的关键特征(包括个人数据和在线资源的动态整合机制、多语言内容的创建和管理、系统使用授权、动态数据追踪、团队协作,以及数据论文的发表机制),以及系统开发和管理者关心的主要技术问题(包括系统安装和高效维护管理、分布式系统架构、模块化开发和管理机制、相关的技术标准)进行了介绍。并针对与Scratchpads 2.0相关的生物多样性信息工具研发和应用的问题进行了讨论。Scratchpads准确的角色定位、学科业务需求的深度挖掘和优越的技术实现,决定了它是网络时代分类学研究的重要基础设施之一,将为世界在线植物志的实现提供重要的技术基础。

关键词：生物多样性信息学数据发表在线植物志虚拟研究环境

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台湾生物多样性资料整合之经验与策略

生物多样性 2010年第5期18卷 444-453页

作者：邵广昭赖昆祺林永昌柯智仁李瀚洪铃雅陈岳智陈丽西台湾中研院生物多样性研究中心台北市南港区11529

台湾生物多样性数据库之整合从2001年开始,是因为数位典藏计划、生物多样性推动方案,及台湾加入全球生物多样性信息网络(Global Biodiversity Information Facility,GBIF),均在这一年启动。2002年"中研院"开始建置台湾物种名录数据库(Ta... 详细信息

台湾生物多样性数据库之整合从2001年开始,是因为数位典藏计划、生物多样性推动方案,及台湾加入全球生物多样性信息网络(Global Biodiversity Information Facility,GBIF),均在这一年启动。2002年"中研院"开始建置台湾物种名录数据库(TaiBNET),GBIF之台湾入口网TaiBIF则是在2004年时建置,用来整合台湾生物多样性的资料并与国际接轨。所采用之方法及格式均依循GBIF所发展的交换标准,一来可以整合台湾的数据,二来可及时与国际交换数据。虽然TaiBNET及TaiBIF已突破智慧财产权(知识产权)的障碍,可搜集整合数位典藏各子计划逐年累积的资料,但跨部门间及非数位典藏计划所产生的数据,仍因各单位及个人的本位主义而难以整合分享,特别是生态分布原始数据。因此2008年在"中研院"成立了跨主管部门的委员会,制订可行之资料搜集、整合与公开的政策,并要求各主管部门在委办合约中纳入。无人否认数据库整合的重要,但在现行对研究人员考评制度下,研究人员大多不愿投入数据库建置的学术服务工作,所获得的人力与经费亦日益短缺而难以永续经营。亟需相关部门的重视与支持。TaiBIF在过去6年来的推动成果虽未臻理想,但所获的经验和心得仍有可供外界参考与借镜之处。

关键词：生物多样性信息学 GBIF TaiBNET TaiBIF 数据库

国家标本资源共享平台(NSII)支撑生物多样性科学研究的成效分析

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广西植物 2023年第8期43卷 1501-1515页

作者：金冬梅杨灵许哲平肖翠罗茂芳马克平中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验室北京100093 国家植物园北京100093 中国科学院文献情报中心北京100190 学术期刊新型出版与知识服务重点实验室北京100190 北京林业大学生态与自然保护学院北京100083 中国科学院生物多样性委员会北京100093 中国科学院大学北京101408

随着生物多样性信息学的迅速发展,越来越多开放的生物数据可供科研人员使用。以一个公开数据平台为例分析我国生物多样性领域的研究热点与发展趋势,有助于生物多样性工作者和决策者及时了解我国生物研究的现状及动向,为生物多样性建设... 详细信息

随着生物多样性信息学的迅速发展,越来越多开放的生物数据可供科研人员使用。以一个公开数据平台为例分析我国生物多样性领域的研究热点与发展趋势,有助于生物多样性工作者和决策者及时了解我国生物研究的现状及动向,为生物多样性建设提供决策支持。该文以“国家标本资源共享平台(NSII)”及相关词为检索对象,对中国知网和谷歌学术上2013—2023年间的文献进行全文检索,共检索出1070篇NSII支撑的文献,包括期刊论文(822篇)、学位论文(233篇)、科普文章(5篇)、会议文章(6篇)和报道(4篇)。基于NSII支撑的822篇期刊论文,通过文献计量学的手段和方法,从发文情况、研究主题与热点、研究机构等方面探究NSII支撑的生物多样性研究现状、热点与态势。关键词共现网络图谱分析结果显示,基于数据平台的生物多样性研究热点集中在物种分布分析和建模、气候变化、分类学、生物多样性研究、研究平台建设五个方面。当前我国生物多样性信息学领域发展较快,未来仍需从数据源建设、资源整合、共享能力、业务能力和国际合作等方面努力提升,持续推动生物多样性科学研究的发展。

关键词：生物多样性信息学生物多样性研究国家标本资源共享平台(NSII) 数据文献计量学

基于SOA的中国生物多样性e-Science平台设想和建设

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数据与计算发展前沿 2010年第3期 3-12页

作者：许哲平崔金钟覃海宁马克平中国科学院植物研究所生物多样性信息学重点实验室

中国有着非常丰富的生物多样性资源,但是目前的破坏程度也越来越严重。政府决策和科研工作都迫切需要快速便捷地获取相关数据,包括标本、图片、科学文献、野外观测数据、实验室数据和空间数据等。近年来,随着科技部"标本资源平台"项目... 详细信息

中国有着非常丰富的生物多样性资源,但是目前的破坏程度也越来越严重。政府决策和科研工作都迫切需要快速便捷地获取相关数据,包括标本、图片、科学文献、野外观测数据、实验室数据和空间数据等。近年来,随着科技部"标本资源平台"项目的启动和Web 2.0思想的逐步影响,数据共享工作取得了很大的进步,通过与国际项目的合作,也极大地促进了生物多样性信息学相关技术在国内的发展和应用。但是,在此过程中也伴随着数据不符合规范、质量低、没有进行标准化整理等问题,影响了数据的集成应用和深度挖掘。本文结合国际生物多样性信息学发展趋势,在分析前期工作的基础上,提出了基于服务架构(SOA)和国际空间标准服务ISO 19119的中国生物多样性e-Science平台的体系结构,并对服务内容进行了说明。这些相对通用的IT技术也能为其他行业的e-Science建设积累经验,为我国e-Science平台的整体发展和提高起到一定的借鉴意义。

关键词：生物多样性生物多样性信息学 e-Science ISO 19119 面向服务架构(SOA)