检索结果-南通市图书馆

基于单细胞转录组测序技术对鄂尔多斯细毛羊次级毛囊形态发生诱导期的研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国畜牧兽医 2022年第11期49卷 4296-4306页

作者：赫雪谷英斯登丹巴德德玛窦骁宁吴怡雷志惠潘和平岳耀敬西北民族大学生命科学与工程学院兰州730030 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所兰州730050 鄂尔多斯市农牧业科学研究院鄂尔多斯017100

【目的】试验旨在解析鄂尔多斯细毛羊胚胎期次级毛囊诱导期形态发生过程中主要细胞类型的分子特征和分化过程。【方法】对采集的3只鄂尔多斯细毛羊(胎龄87 d)体侧部(肩胛骨后缘处)的皮肤样本进行HE染色,鉴定毛囊的发育时期;部分皮肤样... 详细信息

【目的】试验旨在解析鄂尔多斯细毛羊胚胎期次级毛囊诱导期形态发生过程中主要细胞类型的分子特征和分化过程。【方法】对采集的3只鄂尔多斯细毛羊(胎龄87 d)体侧部(肩胛骨后缘处)的皮肤样本进行HE染色,鉴定毛囊的发育时期;部分皮肤样本经过混样后进行单细胞转录组测序(scRNA-Seq),应用t-分布随机近邻嵌入(tSNE)分析细胞簇,分别使用胶原Ⅰ型α1链(Col1a1)和角蛋白15(Krt15)鉴定真皮谱系细胞和表皮谱系细胞,并使用皮肤组织不同细胞的标记基因进行细胞类型分析;对测序数据进行拟时序分析,探究其分化过程中差异基因的表达;通过GO功能富集分析进一步验证基因的功能。【结果】HE染色结果发现,鄂尔多斯细毛羊在胎龄87 d处于次级毛囊诱导期。通过scRNA-Seq在胎龄87 d的细毛羊体侧部皮肤细胞样品中获得10603个细胞和18704个基因的scRNA-Seq数据可用于下游分析。tSNE分析发现,皮肤组织中共有15个细胞簇;Col1a 1和Krt 15标记基因鉴定表明,真皮细胞和表皮细胞具有高度异质性。拟时序分析构建毛囊形态发生过程中真皮/表皮细胞谱系细胞的分化轨迹和基因动态表达图谱表明,在真皮谱系细胞由成纤维细胞(Fb)向成熟真皮聚凝物(DC)的分化过程中,多个不同阶段的标记基因FST重组蛋白(Fst)、抑制素亚基βα(Inhba)和转录阻遏物GATA结合1(Trps1)均在拟时序轨道上特异性表达,并富集了Wnt、Noggin和骨形态发生蛋白(BMP)等与毛囊形态发生相关的信号通路;在表皮谱系细胞分化过程中,基质和毛囊间表皮(IFE)的标记基因角蛋白10(Krt10)、同源基因C13(HOXC13)和音猬因子信号(SHH)在表皮谱系细胞拟时序轨道的2个分支上均特异性表达,且富集在细胞增殖和细胞黏附等相关通路。【结论】在细毛羊次级毛囊诱导期,真皮谱系细胞由成纤维细胞分化至真皮聚凝物,表皮谱系细胞处于基质和毛囊间表皮细胞增殖分化阶段,结果可加深人们对细毛羊次级毛囊形态发生过程的了解,为鄂尔多斯细毛羊育种研究提供有力的理论和技术支持。

关键词：鄂尔多斯细毛羊次级毛囊单细胞转录组测序(scRNA-Seq) 毛囊发育

辽宁绒山羊次级毛囊退行期转向休止期的关键蛋白筛选及调控网络研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

辽宁绒山羊次级毛囊退行期转向休止期的关键蛋白筛选及调控网络研...

作者：沈金澄沈阳农业大学

学位级别：硕士

辽宁绒山羊因产绒量高、绒品质优良、适应性强、遗传性能稳定、改良效果显著,被誉为“中华国宝”。绒山羊的皮肤毛囊分为初级毛囊和次级毛囊,初级毛囊生长有髓毛,即羊毛;次级毛囊生长无髓毛,即羊绒。毛囊在发育成熟之后,其一生都在经历... 详细信息

辽宁绒山羊因产绒量高、绒品质优良、适应性强、遗传性能稳定、改良效果显著,被誉为“中华国宝”。绒山羊的皮肤毛囊分为初级毛囊和次级毛囊,初级毛囊生长有髓毛,即羊毛;次级毛囊生长无髓毛,即羊绒。毛囊在发育成熟之后,其一生都在经历有规律的退化和再生周期性循环。蛋白质作为遗传信息的终点和构成生命体的基本单位,在毛囊生长发育和周期性循环的过程中发挥了十分重要的作用。但在辽宁绒山羊毛囊的周期性循环过程中的关键调控蛋白的筛选及其功能相关的研究还相对较少。本研究以辽宁绒山羊退行期与休止期皮肤次级毛囊为研究对象,利用蛋白质组学的研究方法筛选出了辽宁绒山羊次级毛囊退行期转向休止期的关键蛋白并进行验证。本研究基于蛋白质组学对辽宁绒山羊次级毛囊退行期转向休止期的差异蛋白进行鉴定。通过GO功能注释、KEGG富集分析、蛋白互作网络,挑选处于关键信号通路并位于互作网络中高位的蛋白作为关键蛋白,并通过对蛋白对接界面预测揭示了关键蛋白之间存在直接或间接的相互作用,随后对部分关键蛋白进行了定量研究。获得研究结果如下:1.基于串联质谱技术及数据非依赖性采集技术鉴定得到228个退行期vs休止期的差异蛋白,其中124个蛋白在休止期表达上调,104个蛋白在休止期表达下调。对所有差异蛋白进行GO功能注释,差异蛋白主要注释于细胞死亡、生物黏合过程、节律过程、对刺激的反应、生物过程的调节、生物相等24个生物过程;分子传感器活性、结构分子活性、黏合、催化活性等10个分子功能;细胞结、细胞外基质、大分子复合体、细胞器、和细胞外区域等16个细胞成分中。在差异蛋白的KEGG信号通路富集分析中,休止期上调的差异蛋白富集在了细胞外基质-受体相互作用、Wnt、粘着斑、m TOR、PI3K-Akt等信号通路上,休止期下调的差异蛋白富集在了细胞凋亡、p53、转化生长因子-β、粘着斑、c AMP等信号通路上。通过对休止期上调及下调的差异蛋白分别构建蛋白互作网络,并对网络中的蛋白进行聚类,结合GO功能注释和KEGG富集分析筛选出COL1A1、COL1A2、THBS1、CTSL、SERPINH1、SPARC、PCOLCE、SLC4A1、TNXB、CD44、LAMC2、LAMB3为辽宁绒山羊次级毛囊退行期转向休止期的关键蛋白。这些关键蛋白在GO功能注释中显著注释于:解剖结构形态发生、多细胞生物发育、动物器官形态发生、细胞成分组织、细胞迁移、细胞运动的正调控,细胞外空间、细胞外基质、胞外体等3级GO条目中,在KEGG信号通路富集分析中显著富集于细胞外基质-受体相互作用、吞噬体、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B、转化生长因子-β、p53、Rap1、细胞凋亡、自噬、粘着斑等信号通路中。GSEA分析显示在细胞外基质-受体相互作用显著地作用于休止期,转化生长因子-β、p53、Rap1、细胞凋亡和自噬显著地作用于退行期。随后推测THBS1和CTSL在退行期的高表达是因为THBS1可以在毛囊退行期生成导致血管退缩的主要抗血管生成刺激因子,CTSL可以产生血管生成抑制因子内皮抑素,从而参与毛囊循环过程中的血管生成的调节循环。2.关键蛋白的互作网络中SLC4A1和CTSL与另外10个关键蛋白没有预测到任何互作关系,但另外10个关键蛋白都有相应的互作关系。利用Modeller对关键蛋白的三维模型进行构建,并利用Zdock对部分具有相互作用的关键蛋白进行对接的预测并使用Ligplus进行对接界面分子间作用力的标注。预测结果显示COL1A1vs PCOLCE的对接界面有12个氢键,4个盐桥;COL1A1vs SERPINH1的对接界面有10个氢键,3个盐桥;COL1A1vs SPARC的对接界面有4个氢键;PCOLCEvs THBS1的对接界面有7个氢键,2个盐桥。3.对部分关键蛋白:COL1A1、COL1A2、SERPINH1、SPARC、THBS1进行了Western-blot验证,结果显示COL1A1、COL1A2、SERPINH1、SPARC在休止期的表达量显著的高于退行期,THBS1在退行期的表达量显著的高于休止期,这与蛋白质组学测序结果一致。综上所述,本研究筛选出了部分绒山羊次级毛囊退行期转向休止期的关键蛋白,预测了部分关键蛋白对接界面,并利用Western-blot对蛋白质组测序数据进行了验证,这为后续探寻绒山羊次级毛囊周期性循环的规律及调控机制的深层次研究提供了部分实验基础。

关键词：辽宁绒山羊次级毛囊蛋白质组学蛋白对接 Western-Blot

蛋氨酸和生物素对体外培养绒山羊次级毛囊生长的影响

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

动物营养学报 2020年第9期32卷 4222-4229页

作者：林颖王文楠刘海英朱延旭张晓鹰王占红沈阳农业大学畜牧兽医学院沈阳110866 辽宁省现代农业生产基地建设工程中心辽阳111000

本研究旨在探讨蛋氨酸和生物素对绒山羊次级毛囊体外生长和形态的影响及作用。采用酶法和体外机械分离技术分离绒山羊次级毛囊,挑选出形态完整的次级毛囊用于毛囊体外培养。试验1:采用单因素试验设计,将分离出来的完整毛囊随机分为5组,... 详细信息

本研究旨在探讨蛋氨酸和生物素对绒山羊次级毛囊体外生长和形态的影响及作用。采用酶法和体外机械分离技术分离绒山羊次级毛囊,挑选出形态完整的次级毛囊用于毛囊体外培养。试验1:采用单因素试验设计,将分离出来的完整毛囊随机分为5组,每组4个重复,每个重复12根毛囊,共240根次级毛囊,对照组为Williams E基础培养液,试验组在基础培养液中依次添加7.5、15.0、30.0和60.0 mg/L蛋氨酸。试验2:采用单因素试验设计,将分离出来的完整毛囊随机分为4组,每组3个重复,每个重复10根毛囊,共120根次级毛囊,对照组为Williams E基础培养液,试验组在基础培养液中依次添加0.25、0.50和1.00 mg/L生物素。2个试验的毛囊均培养7 d,培养期间每隔24 h测量毛囊生长长度,并拍照测定其形态,试验结束后测定毛囊DNA合成量。试验1结果表明:与对照组比,15.0 mg/L蛋氨酸组次级毛囊累计长度和生长速度显著提高(P次级毛囊DNA含量最高。试验2结果表明:与对照组相比,0.50 mg/L生物素组次级毛囊累计长度和生长速度显著提高(P次级毛囊DNA含量最高。由此可见,培养基中添加15.0 mg/L蛋氨酸或0.50 mg/L生物素能显著提高毛囊生长长度以及生长速度;且次级毛囊DNA含量最高。

关键词：蛋氨酸生物素次级毛囊体外培养绒山羊

miR-1-3p对乾华肉用美利奴羊次级毛囊发育相关基因的调控研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

家畜生态学报 2023年第10期44卷 9-13页

作者：张桂山张英楠杨树宝徐晶姜怀志吉林医药学院公共卫生学院吉林吉林132013 吉林医药学院基础医学院吉林吉林132013 吉林农业大学动物科学技术学院吉林长春130118

为了探讨miR-1-3p及其靶基因与乾华肉用美利奴羊次级毛囊发生发育关系,该研究采集2周岁乾华肉用美利奴羊皮肤样品,利用生物信息学方法预测miR-1-3p的靶基因,荧光定量PCR检测miR-1-3p及其靶基因相对表达量,通过Western blot对miR-1-3p的... 详细信息

为了探讨miR-1-3p及其靶基因与乾华肉用美利奴羊次级毛囊发生发育关系,该研究采集2周岁乾华肉用美利奴羊皮肤样品,利用生物信息学方法预测miR-1-3p的靶基因,荧光定量PCR检测miR-1-3p及其靶基因相对表达量,通过Western blot对miR-1-3p的靶基因成纤维细胞生长因子14(fibroblast growth factor 14,FGF 14)进行蛋白定量检测,并利用双荧光素酶报告基因试验验证miR-1-3p与候选靶基因的靶向关系。结果表明:通过Targetscan v7.0、miRanda和RNA223个靶基因预测软件确定FGF 14为miR-1-3p的候选靶基因;miR-1-3p在毛囊生长期低表达,在休止期高表达;FGF 14基因mRNA在毛囊生长期高表达,休止期低表达,与FGF 14蛋白表达规律一致。双荧光素酶报告基因试验结果表明miR-1-3p的靶基因为FGF 14。可见,乾华肉用美利奴羊次级毛囊miR-1-3p与FGF 14存在靶向调控关系,miR-1-3p可能是通过负调控FGF 14实现对乾华肉用美利奴羊次级毛囊发生发育进行调控。

关键词：乾华肉用美利奴羊次级毛囊 miR-1-3p FGF 14

MicroRNA调控辽宁绒山羊次级毛囊周期生长发育的研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

MicroRNA调控辽宁绒山羊次级毛囊周期生长发育的研究

作者：代含沈阳农业大学

学位级别：硕士

羊绒是由山羊皮肤的次级毛囊生长发育而来。次级毛囊呈季节周期性生长,包括休止期、生长期、退行期。本论文旨在研究次级毛囊周期生长发育过程中参与调控的micro RNAs的分子特征以及可能的调控机制。首先,通过高通量转录组测序,获得了... 详细信息

羊绒是由山羊皮肤的次级毛囊生长发育而来。次级毛囊呈季节周期性生长,包括休止期、生长期、退行期。本论文旨在研究次级毛囊周期生长发育过程中参与调控的micro RNAs的分子特征以及可能的调控机制。首先,通过高通量转录组测序,获得了在绒山羊次级毛囊三个生长时期表达的micro RNAs;其次,对高表达的mi RNA进行了定量和组织定位分析;最后,我们着重研究了mi R-143对次级毛囊生长发育的调控机制。本研究取得主要结果如下:（1）通过高通量转录组测序和生物信息学分析,得到579个表达的mi RNAs,其中418个为山羊中已知mi RNAs,161个为新的mi RNA候选基因。（2）q RT-PCR结果显示,mi RNAs在表皮和毛囊中的表达有显著差异。mi RNA-143在初级或者次级毛囊中的表达显著高于表皮,而mi R-92b和mi R-203在表皮组织中表达更高一些。原位杂交定位结果显示mi R-203定位在毛乳头上部的毛母质细胞（matrix）和毛干位置,在毛干部位表达量高于毛母质细胞。（3）测序结果显示mi RNA-143在次级毛囊中高表达,并且在不同时期表达差异显著。在生长期早期,mi R-143表达较低,随后表达量升高。原位杂交结果显示mi R-143在毛母质细胞中表达量高,毛干部位表达量略低,表明mi R-143可能在毛母质细胞发育分化成其他细胞群体的过程中起到重要调控作用。（4）生物信息分析预测mi R-143所有可能的靶基因,并确定ITGA6为mi R-143在次级毛囊调控过程中的潜在靶基因之一。免疫组化试验结果显示ITGA6在隆突部高表达,而mi RNA-143此部位相对表达较低,在mi RNA-143高表达的毛母质细胞部位,ITGA6表达很微弱,表明它们之间具有潜在负调控的关系。（5）荧光素酶报告结果揭示mi R-143和ITGA6具有靶向作用关系。结果显示mi R-143作用于ITGA6的3’UTR的靶位点,可能抑制基因ITGA6的翻译,从而调控次级毛囊由退行期向休止期的转变。

关键词：山羊绒发育周期次级毛囊 miRNA

COL 1A1在绒山羊次级毛囊生长周期中的表达模式

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

兽医导刊 2023年第1期 1-5页

作者：冯娟王东王笑冰张茹夏慧岩常嘉乐刘雨静肖红梅内蒙古农业大学生命科学学院内蒙古呼和浩特010018 内蒙古自治区生物制造重点实验室内蒙古呼和浩特010018

COL1A1为I型α1胶原蛋白(Collagen type I alpha 1),在动物体内广泛存在。为了解其在绒山羊次级毛囊生长周期中的表达模式,利用实时荧光定量PCR技术、免疫组化技术、蛋白质印迹技术,从基因和蛋白水平分别对次级毛囊生长3个不同时期的COL... 详细信息

COL1A1为I型α1胶原蛋白(Collagen type I alpha 1),在动物体内广泛存在。为了解其在绒山羊次级毛囊生长周期中的表达模式,利用实时荧光定量PCR技术、免疫组化技术、蛋白质印迹技术,从基因和蛋白水平分别对次级毛囊生长3个不同时期的COL1A1基因表达量及表达差异、表达部位进行了检测。结果表明,COL1A1基因在绒山羊次级毛囊的生长期(9月)表达量最高,退行期(12月)表达量其次,休止期(2月)表达量相对最低。COL1A1主要表达于次级毛囊的外根鞘。由此说明,COL1A1通过调控绒山羊次级毛囊生长从而促进绒毛的生长。

关键词：绒山羊 COL1A1 次级毛囊免疫组化蛋白质印迹

辽宁绒山羊次级毛囊lncRNAs鉴别、表达特征及功能调控网络研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

辽宁绒山羊次级毛囊lncRNAs鉴别、表达特征及功能调控网络研究

作者：焦倩沈阳农业大学

学位级别：硕士

辽宁绒山羊是我国独特的畜禽品种资源,其皮肤组织次级毛囊（SHFs）产生的绒能给广大牧民带来可观的经济效益。长链非编码RNA（Long non-coding RNA,lncRNAs）是一类长度超过200bp的真核生物的转录本,在皮肤细胞的增殖、分化以及SHFs的... 详细信息

辽宁绒山羊是我国独特的畜禽品种资源,其皮肤组织次级毛囊（SHFs）产生的绒能给广大牧民带来可观的经济效益。长链非编码RNA（Long non-coding RNA,lncRNAs）是一类长度超过200bp的真核生物的转录本,在皮肤细胞的增殖、分化以及SHFs的重建过程中调节着基因的表达。其中包括,从HOXC基因簇内的反义链转录而来的lnc RNA-HOTAIR。本文以辽宁绒山羊SHFs为研究对象,根据NCBI数据库中的表达序列标签（ESTs）鉴定了SHFs中16个lncRNAs以及lnc RNA-HOTAIR转录本,并分析了它们的分子表达特征和转录模式。再通过构建不同的调控网络揭示了它们与潜在靶分子的复杂调控关系。具体研究内容如下:1.本研究根据NCBI数据库中的表达序列标签（ESTs）鉴定了辽宁绒山羊SHFs中16个lncRNAs。分析了它们的分子表达特征和转录模式,并构建了新鉴定的lncRNAs及其潜在靶分子的ce RNA调控网络。研究发现,有4个lncRNAs（lnc RNA-475074、-052149、-052140和-051789）在生长期显著上调,9个lncRNAs（lnc RNA-711032,-475083,-475070,-052139,-052127,-052037,-051903,-051847,-051804）在休止期显著上调。Ce RNA调控网络揭示了新鉴定的lncRNAs与其潜在的靶分子:mi RNAs、m RNAs之间存在着复杂的调控关系。再基于生物信息学技术对新鉴定的lncRNAs的潜在靶基因进行了KEGG通路分析,结果表明,在生长期和休止期差异表达的lncRNAs可能直接或间接地调控着潜在靶基因。2.从辽宁绒山羊SHFs中分离并鉴定了lnc RNA-HOTAIR转录本,并分析了HOTAIR基因启动子在SHFs中的转录模式和甲基化水平。核苷酸组成分析显示,在辽宁绒山羊SHFs的lnc RNA-HOTAIR转录本中,腺嘌呤（A）和胸腺嘧啶（T）的含量高于鸟嘌呤（G）和胞嘧啶（C）,AG碱基对频率分布最高（8.06%）。Ce RNA调控网络显示,lnc RNA-HOTAIR与其潜在的靶分子mi RNAs、m RNAs和蛋白之间存在直接或间接的复杂调控关系。转录模式研究发现,lnc RNA-HOTAIR转录本在辽宁绒山羊SHFs生长期的表达量显著高于休止期,这表明lnc RNA-HOTAIR转录本很可能参与了羊绒纤维生长和毛囊发育的调控。HOTAIR基因的启动子甲基化分析表明,HOTAIR基因的启动子甲基化很可能参与了对辽宁绒山羊SHFs的转录抑制。本研究对新鉴定的lncRNAs和lnc RNA-HOTAIR转录本在绒山羊SHFs中的潜在功能及调控特性进行了研究,为阐明非编码转录本参与绒山羊SHFs调控提供了理论基础,为高品质绒用山羊的分子选育工作提供了科学依据。

关键词：辽宁绒山羊次级毛囊 LncRNAs 调控网络 LncRNA-HOTAIR

半胱氨酸、蛋氨酸对体外培养绒山羊次级毛囊生长及毛乳头细胞增殖的影响

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

畜牧兽医学报 2024年第2期55卷 515-527页

作者：康佳段香茹尹雪姣杨若晨李太春单新雨陈美静张英杰刘月琴河北农业大学动物科技学院保定071000

旨在探讨半胱氨酸(Cys)、蛋氨酸(Met)对体外培养燕山绒山羊次级毛囊(SF)生长及毛乳头细胞(DPCs)增殖凋亡的影响。本研究选取1只1周岁左右健康雄性燕山绒山羊皮肤若干,完整分离的次级毛囊随机分成Cys试验组和Met试验组,每组各浓度3个重复... 详细信息

旨在探讨半胱氨酸(Cys)、蛋氨酸(Met)对体外培养燕山绒山羊次级毛囊(SF)生长及毛乳头细胞(DPCs)增殖凋亡的影响。本研究选取1只1周岁左右健康雄性燕山绒山羊皮肤若干,完整分离的次级毛囊随机分成Cys试验组和Met试验组,每组各浓度3个重复,每个重复8根毛囊,Cys试验组添加浓度分别为0、40、80、120、160和200μg·mL^(-1);Met试验组添加浓度分别为0、10、15、20、25和30μg·mL^(-1)。毛囊培养7 d,每隔24 h观察毛囊生长形态并测量毛囊生长长度。从燕山绒山羊次级毛囊中提取、纯化DPCs,细胞计数并绘制DPCs生长曲线,将DPCs随机分为Cys试验组和Met试验组,每组各浓度6个重复,Cys试验组添加浓度分别为0、20、40、60、80、100μg·mL^(-1);Met试验组添加浓度分别为0、2、4、6、8、10μg·mL^(-1)。培养2 h后用CCK-8试剂盒进行细胞增殖活力测定,确定燕山绒山羊DPCs中Cys和Met的最适培养浓度,利用qRT-PCR技术检测不同浓度Cys和Met的DPCs增殖相关基因(PCNA、CCND1、CDC42、CDK 4)、凋亡相关基因(P21、P53、Bax、Caspase-3、Bcl-2)、皮肤细胞分化相关基因(IVL)及角蛋白相关基因(K10、K 14)mRNA表达水平。结果表明,与对照组相比,添加80和120μg·mL^(-1) Cys与10、15、20和25μg·mL^(-1) Met均可显著影响次级毛囊生长速率和累计生长长度(P次级毛囊生长,最适添加量分别为120μg·mL^(-1)和20μg·mL^(-1);添加Cys和Met可通过上调细胞增殖、分化、角蛋白等基因mRNA、下调细胞凋亡基因mRNA表达,促进乳头细胞增殖、抑制细胞凋亡进而促进燕山绒山羊次级毛囊生长。

关键词：半胱氨酸蛋氨酸绒山羊次级毛囊毛乳头细胞基因表达

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

绒山羊次级毛囊生长调控基因的筛选

畜牧兽医学报 2015年第10期46卷 1733-1740页

作者：李晓燕张璐王乐乐邬娇宋慧子涂藩镜张燕军内蒙古农业大学动物科学学院动物遗传育种与繁殖自治区重点实验室呼和浩特010018

旨在筛选绒山羊次级毛囊生长调控基因。本研究以遗传背景相似,有次级毛囊的绒山羊和无次级毛囊的奶山羊为试验动物,利用Illumina Hiseq2000对4只绒山羊与4只奶山羊3、6、9、12月的32个皮肤样品进行RNASeq测序。测序共获得38G数据,共筛选... 详细信息

旨在筛选绒山羊次级毛囊生长调控基因。本研究以遗传背景相似,有次级毛囊的绒山羊和无次级毛囊的奶山羊为试验动物,利用Illumina Hiseq2000对4只绒山羊与4只奶山羊3、6、9、12月的32个皮肤样品进行RNASeq测序。测序共获得38G数据,共筛选出20 780个基因。差异表达基因分析表明,绒山羊与奶山羊之间在不同时期共有2 409个差异表达基因,其中上调差异表达基因1 175个,下调差异表达基因1 234个,绒山羊之间在不同生长时期差异表达基因共550个,其中上调差异表达基因302个,下调差异表达基因248个。GO功能注释分类显示,差异表达基因主要在细胞与细胞部分、细胞器部分、结合、催化、生物调控、细胞过程、代谢过程等功能富集。KEGG pathway分析发现,42个差异表达基因富集在与毛囊生长相关的WNT、SHH、TGFβ、TNF、MAPK和Notch信号通路中,由此推测其可能为次级毛囊生长相关基因。本研究为深入开展次级毛囊生长相关基因功能验证提供丰富的资源,为揭示次级毛囊生长调控机制提供重要基础,为绒毛产量及品质的提升提供理论依据。

关键词：绒山羊次级毛囊调控基因筛选