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槐猪精液中N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶功能基团的研究

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黑龙江畜牧兽医 2015年第5期 85-88页

作者：林心宇章文沈林松张伟妮黄小红福建农林大学中西兽医结合与动物保健福建省高校重点实验室福州350002

为了研究酶活性中心功能基团的性质,从槐猪精液中提取N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(EC3.***.1.52,简称NAGase)的电泳单一纯酶制剂,试验采用动力学和化学修饰的方法进行研究。结果表明:在37℃条件下,酶活性中心解离常数p Ke值为5.29,解离热... 详细信息

为了研究酶活性中心功能基团的性质,从槐猪精液中提取N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(EC3.***.1.52,简称NAGase)的电泳单一纯酶制剂,试验采用动力学和化学修饰的方法进行研究。结果表明:在37℃条件下,酶活性中心解离常数p Ke值为5.29,解离热焓ΔHo值为30.46 k J/mol,酶活性相关的可解离基团是咪唑基;在特定条件下,通过对酶分子基团的特异性修饰可知,对酶分子链内二硫键、巯基及吲哚基的修饰会使酶的活性显著下降。说明这些氨基酸残基也是该酶的功能基团,而ε-氨基可能与维系酶分子构象有关,胍基则被修饰后对酶活性没有影响,不是此酶的功能基团。

关键词：槐猪精液 N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(NAGase) 功能基团化学修饰

槐猪和杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释

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福建农林大学学报（自然科学版） 2016年第2期45卷 192-195页

作者：杨建敏胡宇平林威敏张金耀黄守婷叶鼎承肖天放福建农林大学动物科学学院福建福州350002 福建省农业科学院畜牧兽医研究所福建福州350003

为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因,对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序,并进行生物信息学分析.结果表明,槐猪和杜洛克猪分别获得36 177 844和34 496 450条可用读段,且与猪参考基因组的比对率分别为78.71%和80.09%.... 详细信息

为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因,对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序,并进行生物信息学分析.结果表明,槐猪和杜洛克猪分别获得36 177 844和34 496 450条可用读段,且与猪参考基因组的比对率分别为78.71%和80.09%.槐猪和杜洛克猪间共有953个差异表达基因,以杜洛克猪为对照组,槐猪与之相比,有589个上调基因和364个下调基因.槐猪和杜洛克猪的差异表达基因共分类到48个基因本体(GO)条目中,其中,细胞组分13个、分子功能12个和生物学过程23个.显著富集的KEGG通路共计6个,其中,PPAR信号通路是与调节脂类代谢显著相关的通路.

关键词：槐猪杜洛克猪背最长肌差异表达转录组测序

槐猪H-FABP基因多态性及其与肌内脂肪含量相关性研究

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福建师范大学学报（自然科学版） 2014年第2期30卷 76-80页

作者：许卫华康丽珠林秀娇杨作胜高文萍王正朝龙岩学院生命科学学院福建龙岩364012 福建师范大学生命科学学院福建省发育与神经生物学重点实验室福建福州350117

利用上杭槐猪国家保种场核心群槐猪为试验材料,通过PCR-RFLP方法研究H-FABP基因5'上游区域HinfⅠ位点、第2内含子MspⅠ和HaeⅢ位点遗传多态性,并分析其与肌内脂肪含量(IMF)的相关性.结果表明,HinfⅠ位点上存在多态性,等位基因H的基因频... 详细信息

利用上杭槐猪国家保种场核心群槐猪为试验材料,通过PCR-RFLP方法研究H-FABP基因5'上游区域HinfⅠ位点、第2内含子MspⅠ和HaeⅢ位点遗传多态性,并分析其与肌内脂肪含量(IMF)的相关性.结果表明,HinfⅠ位点上存在多态性,等位基因H的基因频率为0.569 0,表现为中度多态(0.370 2),各基因型之间IMF含量差异不显著(P猪群HinfⅠ位点和MspⅠ位点各基因型频率均处于HardyWeinberg平衡状态(P>0.05).

关键词：槐猪 H-FABP基因 IMF含量

槐猪与杜洛克猪背部皮下脂肪差异表达基因的筛选与分析

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槐猪与杜洛克猪背部皮下脂肪差异表达基因的筛选与分析

作者：张兴锋福建农林大学

学位级别：硕士

槐猪和杜洛克猪分别是脂肪型猪和瘦肉型猪,两猪品种在脂肪沉积上性状反差很大,而性状表现是以微效多基因间的互作调控机制为分子基础的。寻找影响脂肪沉积关键基因,探讨脂类代谢机制,对于加速优质瘦肉型猪新品系和配套系选育及其产业化... 详细信息

槐猪和杜洛克猪分别是脂肪型猪和瘦肉型猪,两猪品种在脂肪沉积上性状反差很大,而性状表现是以微效多基因间的互作调控机制为分子基础的。寻找影响脂肪沉积关键基因,探讨脂类代谢机制,对于加速优质瘦肉型猪新品系和配套系选育及其产业化具有积极的推动作用。本试验采用高通量的RNA-seq技术检测190日龄杜洛克猪和上杭槐猪背部皮下脂肪组织产生的转录本,筛选差异表达基因,确定调控脂肪沉积的关键基因及对应的代谢通路,探讨脂肪沉积机制。杜洛克和槐猪品种可变剪接数分别为9457和9612,显示了丰富的生物性状多样性。可变剪接方式有6种,外显子跳跃剪接频率最高。杜洛克和槐猪品种SNP位点总数分别为67246和150864,主要的变异形式是转换,分别占了 74.97%、74.20%,而且杂合比例较高。槐猪的SNP位点总数、基因区SNP位点总数、基因间区SNP位点总数均是杜洛克猪的2倍以上,而且两猪品种基因区SNP位点总数均比基因间区SNP位点总数多两倍以上,说明上杭槐猪基因组中具有遗传效应的单核苷酸的变异程度比杜洛克猪大。两猪品种进行表达水平定量估计的基因数量均为23290个,其中FPKM>0.1的基因杜洛克猪为16369个,槐猪为16846个。两猪品种背部脂肪组织发现2389个新基因,其中杜洛克猪和槐猪FPKM>0.1的基因分别有2129个和2180个。经筛选两猪品种共有709个差异基因,其中槐猪对杜洛克猪上调基因有395个,下调基因有314个。得到注释的差异表达基因数量共有693个,其中GO数据库和KEGG数据库注释的差异表达基因数分别是642和402个。通过GO分析,细胞组分类注释的差异表达基因有603个,其中富集超过30个基因的基因群集有15个,P猪品种皮下脂肪组织样品间差异表达基因KEGG通路富集分析,得到191条KEGG通路,共有314个差异表达基因得到注释。超几何检验P猪品种脂肪沉积差异的分子基础。为对于加速优质瘦肉型猪新品系和配套系选育及其产业化提供了依据。

关键词：杜洛克猪槐猪背部脂肪组织转录组测序

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上杭槐猪产业发展对策研究

上杭槐猪产业发展对策研究

作者：廖勤英福建农林大学

学位级别：硕士

生猪产业不仅是中国传统农业的优势产业,更是现代农业的支柱产业,对于农村发展有着重要意义。槐猪是主产于上杭县的地方优良品种,具有极高的营养价值、极佳的口感、较高的适应性等优点。科学的上杭槐猪产业发展对策将为增强上杭槐猪产... 详细信息

生猪产业不仅是中国传统农业的优势产业,更是现代农业的支柱产业,对于农村发展有着重要意义。槐猪是主产于上杭县的地方优良品种,具有极高的营养价值、极佳的口感、较高的适应性等优点。科学的上杭槐猪产业发展对策将为增强上杭槐猪产业的持续竞争优势提供理论支持和参考,同时也将促进上杭槐猪产业全面、协调和可持续发展提供现实指导,为农民丰收致富提供可靠途径。上杭槐猪产业发展的现状分析是发展对策制定的依据与基础。本文通过结合文献法与访谈法对上杭槐猪产业的现状和发展环境做了分析,并通过SWOT分析法和案例分析法得出上杭槐猪产业发展的对策建议。上杭槐猪产业发展有着广阔的前景。在面对其他猪种产业的竞争时,上杭槐猪产业有着种质资源优势、市场需求优势、独特的区位优势和丰富的人力资源优势。在拥有巨大优势的同时,上杭槐猪产业还享受到了诸多机遇:不断增强的政策支持力度,品牌宣传受到关注,多行业进军生猪产业,科学技术不断进步创新和国内和国际市场不断开拓。但是,目前上杭槐猪产业发展中还存在诸多问题,也面临着诸多挑战。问题主要表现在科技创新体系和技术服务体系不完善;农业标准化、规模化实施程度低;龙头企业带动力不强,槐猪产业市场运作滞后;槐猪产品质量参差不齐,产品质量监管不到位;生产者文化素质较低,信息传输渠道不畅。牛、羊、禽肉等猪肉替代品和其他优良猪肉产品的冲击也挑战着上杭槐猪产业的发展。为了实现上杭县槐猪产业的可持续发展,上杭县应充分发挥优势,弥补劣势,把握机遇,迎接挑战,为促进农民增产增收、快速发展区域经济作出贡献。从政府层面,应加强政策保障,健全技术服务体系和疫病防控体系,合理规划槐猪产业布局,强化人才支撑保障、研发推广应用新技术;从企业层面,应加强种质繁育,推进产业标准化、规模化,开发深加工产品、提高产品品质,加强品牌建设、做好市场营销和联合外界资本壮大龙头企业、多产业联合技术创新;从养殖户层面,应多元化养殖,满足各方面需求。

关键词：上杭县槐猪产业发展对策 SWOT分析

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杜洛克猪与槐猪背最长肌转录组分析

杜洛克猪与槐猪背最长肌转录组分析

作者：杨建敏福建农林大学

学位级别：硕士

随着生活水平的提高,人们越来越追求优良的猪肉品质,为了满足人们的需求,培育肉质优良的猪品种至关重要。槐猪是国内有名的脂肪型猪品种,其生长速度缓慢,但肉质优良,口感好;杜洛克猪是国外典型的瘦肉型猪品种,其生长速度快,但肉质不够... 详细信息

随着生活水平的提高,人们越来越追求优良的猪肉品质,为了满足人们的需求,培育肉质优良的猪品种至关重要。槐猪是国内有名的脂肪型猪品种,其生长速度缓慢,但肉质优良,口感好;杜洛克猪是国外典型的瘦肉型猪品种,其生长速度快,但肉质不够理想。本研究对杜洛克猪和槐猪的背最长肌进行转录组测序,通过生物信息学分析技术筛选两猪品种的差异表达基因,并进行功能注释和通路富集等分析,从转录组水平上揭示国内外猪品种的遗传差异,寻找与肌内脂肪沉积相关的差异表达基因及信号通路,为进一步研究猪背最长肌肌内脂肪沉积的分子机制提供科学依据,进而为培育符合人们需求的猪品种提供理论基础。本研究主要结果如下：(1)构建了两猪品种背最长肌的cDNA测序文库,并完成转录组测序。杜洛克猪和槐猪通过测序分别获得45775612条和46337424条raw reads,raw reads经过质量控制后,分别获得34496450条和36177844条clean reads, GC含量均在49%左右,Q30均在94%以上。两猪品种的c lean reads与参考基因组的比对率均达到78%以上。(2)杜洛克猪和槐猪背最长肌分别有44582个和103583个SNP,其中碱基转换的比例均达到74%以上;此外,杜洛克猪和槐猪分别发现8216个和8608个新可变剪切,其中外显子跳跃最多,分别为4151个和4305个(3)以FPKM≥0.1作为判断基因表达的阈值,杜洛克猪和槐猪背最长肌中发生表达的基因分别有16012个和15839个,其中14943个基因在两猪品种中均有表达。以|log2FC|≥1且 FDR猪品种背最长肌共有953个差异表达基因。与杜洛克猪相比,槐猪有589个上调基因和364个下调基因。(4)差异表达基因与NR, Swiss-Prot, GO, COG和KEGG数据库进行序列比对后,分别有94.12%、82.58%、84.47%、48.58%和31.58%的差异表达基因拥有注释。对这些基因进行GO分析,发现它们共分类到48个GO条目中,其中细胞组分13个、分子功能12个和生物学过程23个,这三个GO本体分别包括747个、705个和743个基因。通过KEGG通路富集分析发现杜洛克猪和槐猪差异表达基因中的315个富集到185个KEGG通路,发现了与调节脂类代谢相关的PPAR信号通路和脂肪细胞因子信号通路。在所有富集到的KEGG通路中有6个是显著富集的通路。(5)通过qPCR方法对随机选取的8个差异表达基因进行验证,发现qPCR结果与RNA-seq结果一致;对RNA-seq和qPCR两种方法所得的差异倍数进行线性拟合后,发现相关程度很高。

关键词：差异表达基因转录组测序背最长肌槐猪杜洛克猪

上杭县槐猪产业纵向一体化项目的规划设计及运营管理研究

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上杭县槐猪产业纵向一体化项目的规划设计及运营管理研究

作者：曹永林中国农业大学

学位级别：硕士

本文就槐猪产业纵向一体化项目的规划设计及运营管理进行研究,目的是将产业纵向一体化发展理念与上杭槐猪项目开发结合起来,力争做好上杭槐猪产业这篇文章,成为上杭畜牧业经济发展中的一个亮点。具体研究策略:从本地区的两个畜牧公司产... 详细信息

本文就槐猪产业纵向一体化项目的规划设计及运营管理进行研究,目的是将产业纵向一体化发展理念与上杭槐猪项目开发结合起来,力争做好上杭槐猪产业这篇文章,成为上杭畜牧业经济发展中的一个亮点。具体研究策略:从本地区的两个畜牧公司产业化运作的实证分析中把握产业纵向一体化发展的实质,然后,结合上杭槐猪项目的实际,对槐猪产业纵向一体化运作中可能涉及的主要环节、各环节的功能及利益协调等问题进行研究,进而对上杭槐猪产业发展提出相关的政策建议。本研究得出以下结论: 1.槐猪项目开发应走纵向一体化的发展路子。纵向一体化能使产业的上、中、下游生产部门更好地连接起来,有利于提高产业的专业化、集约化的经营水平,节约交易成本,提高经济效益,形成循环经济的发展模式,实现可持续发展。 2.龙头企业是槐猪产业纵向一体化项目开发成功与否的关键。龙头企业能够架构市场营销、食品加工、技术研发、资金运筹、经营管理、服务跟踪等功能,它的存在与实力将决定着槐猪项目开发的进度、规模和成效。 3.槐猪产业链各环节之间能否协同发展是槐猪项目运营管理的核心问题。槐猪纵向一体化项目涉及饲料生产、良种选育、生猪饲养、疫病防治、屠宰加工、技术研发、市场营销及生态环保等环节,各环节之间配合、协调的好坏关系着项目开发的成败。 4.槐猪纵向一体化项目的开发以及进一步发展壮大、形成当地支柱产业,离不开政府的宏观协调、支持与扶持。

关键词：槐猪纵向一体化项目开发规划设计运营管理

槐猪和杜洛克猪瘦素及其受体基因的差异表达研究

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中国农学通报 2016年第29期32卷 4-10页

作者：叶鼎承杨建敏甘乾福董志岩刘景福建省农业科学院畜牧兽医研究所福州350013 福建农林大学动物科学学院福州350002

为了解7月龄、12月龄的槐猪和杜洛克猪5个不同部位脂肪组织瘦素基因(LEP)和瘦素受体基因(LEPR)的表达差异。采用荧光定量PCR技术,使用2-△△CT方法计算LEP和LEPR基因的相对表达量。结果表明:LEP基因在背部皮下脂肪下层的表达量最高,其... 详细信息

为了解7月龄、12月龄的槐猪和杜洛克猪5个不同部位脂肪组织瘦素基因(LEP)和瘦素受体基因(LEPR)的表达差异。采用荧光定量PCR技术,使用2-△△CT方法计算LEP和LEPR基因的相对表达量。结果表明:LEP基因在背部皮下脂肪下层的表达量最高,其次是背部皮下脂肪上层、腹部皮下脂肪和板油,在冠状动脉脂肪中表达最低;7月龄槐猪脂肪组织LEP基因的表达量与12月龄槐猪、7月龄杜洛克猪差异显著(P槐猪脂肪组织LEP基因表达量与7月龄杜洛克猪差异极显著(P槐猪脂肪组织LEPR基因的表达量与12月龄槐猪相比,只有冠状动脉脂肪差异显著(P<0.05)。

关键词：槐猪杜洛克猪瘦素基因瘦素受体基因

槐猪FTO基因遗传多态性及其与肉质性状相关性研究

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广东农业科学 2018年第1期45卷 108-113页

作者：许卫华赵殿强黄芬李虹仪张茂孙艳发福建龙岩学院生命科学学院福建龙岩364012 福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室福建龙岩364012

以上杭槐猪为试验材料,对FTO基因5′上游区域SNPg.-167T>G、第一内含子SNPc.46-139A>T和第三外显子同义突变SNPc.594C>G遗传多态性及其与肌内脂肪含量、背膘厚度、眼肌面积等肉质性状的相关性进行研究,3个突变分别产生Eco RⅠ、XapⅠ和B... 详细信息

以上杭槐猪为试验材料,对FTO基因5′上游区域SNPg.-167T>G、第一内含子SNPc.46-139A>T和第三外显子同义突变SNPc.594C>G遗传多态性及其与肌内脂肪含量、背膘厚度、眼肌面积等肉质性状的相关性进行研究,3个突变分别产生Eco RⅠ、XapⅠ和Bsh1236I等3个限制性内切酶酶切位点。结果表明:被测猪群在3个位点均存在一定的遗传多态性,PIC值分别为0.276、0.343和0.235,各位点等位基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡状态;g.-167T>G位点,等位基因G为优势等位基因,其基因频率为0.791,然而,TT基因型肌内脂肪含量显著高于GG基因型;c.46-139A>T位点,等位基因T为优势等位基因,其基因频率为0.674,相对于AA基因型,TT基因型显著降低了背膘厚度;c.594C>G位点,等位基因G为优势等位基因,其基因频率为0.837,各基因型个体之间在3个被测性状中差异均不显著。因此,FTO基因g.-167T>G和c.46-139A>T可作为槐猪肉质性状选育的潜在分子遗传标记。

关键词：槐猪 FTO基因肉质性状 PCR-RFLP