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手足口病柯萨奇病毒A10和a6型的分子鉴定及其VP1区3′端序列分析

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中国病原生物学杂志 2011年第8期6卷 561-564,570页

作者：任倩张乐海马丽霞王世富吕欣张忠于爱莲山东大学齐鲁儿童医院山东济南250022 泰山医学院病原生物学教研室

目的鉴定手足口病患儿咽拭子病原体柯萨奇病毒A10（CVA10）和a6（CVa6）,并对其VP1编码区3′端序列进行分析。方法合成对肠道病毒VP1区3′端序列具有较高特异性的兼并引物040-011,RT-PCR方法测定其VP1区3′端基因序列,通过BLAST程序比对... 详细信息

目的鉴定手足口病患儿咽拭子病原体柯萨奇病毒A10（CVA10）和a6（CVa6）,并对其VP1编码区3′端序列进行分析。方法合成对肠道病毒VP1区3′端序列具有较高特异性的兼并引物040-011,RT-PCR方法测定其VP1区3′端基因序列,通过BLAST程序比对,鉴定病毒的基因型;与GenBank中其他已知病毒基因型序列进行同源性分析,构建遗传进化树。结果 38例非EV71非CVA16引起的手足口病患儿咽拭子,5例检测到CVA10,1例检测到CVa6。在进化关系上CVA10与D基因型最为密切,核苷酸和氨基酸同源性分别为92.7%~94.2%、91.7%~100%;CVa6与2003~2009年报告的部分毒株核苷酸同源性为86.8%~90.2%,其中与2008年台湾EU908148的毒株同源性最高;氨基酸同源性为85.2%~89.0%。结论兼并引物040-011对CVA10和CVa6有良好的基因扩增特异性;引起手足口病的肠道病毒除EV71和CVA16外,CVA10和CVa6也是重要的病原;鉴于2008年芬兰和2009年山东省文登市CVA10引起的手足口病暴发,应加强对手足口病病原的检测和分型,以了解柯萨奇病毒在手足口病中的位置,掌握其遗传进化特征。

关键词：手足口病柯萨奇病毒A10型柯萨奇病毒A6型 VP1区域基因序列分析

检测柯萨奇病毒a6、A10型的双重荧光定量RT-PCR方法及应用

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检测柯萨奇病毒A6、A10型的双重荧光定量RT-PCR方法及应用

2013年南京市柯萨奇病毒A6型基因特征分析

2014年浙江省检验医学学术年会

作者：崔大伟谢国良杨先知楼剑洲陈瑜浙江大学医学院附属第一医院检验科分子实验室

目的为柯萨奇病毒a6、A10型引起的手足口病疫情提供快速准确的检测。方法运用一步法双重实时荧光定量RT-PCR,采用柯萨奇病毒A6型和柯萨奇病毒A10型高度特异的引物和荧光标记探针,在同一个反应管内检测患者粪便标本中柯萨奇病毒a6、A10... 详细信息

目的为柯萨奇病毒a6、A10型引起的手足口病疫情提供快速准确的检测。方法运用一步法双重实时荧光定量RT-PCR,采用柯萨奇病毒A6型和柯萨奇病毒A10型高度特异的引物和荧光标记探针,在同一个反应管内检测患者粪便标本中柯萨奇病毒a6、A10型的核酸。结果成功建立了柯萨奇病毒a6、A10型的RT-PCR检测方法和定量标准曲线。实验结果表明,本检测方法特异性强,与其他肠道病毒如肠道病毒71型、柯萨奇病毒A16型、柯萨奇病毒A2型、柯萨奇病毒A5型、柯萨奇病毒B1型、柯萨奇病毒B3型、埃克病毒30型,及甲型流感病毒、呼吸道合胞病毒、博卡病毒的阳性核酸均无交叉反应;该方法检测灵敏度高,分别达到102、102copies/ml;对已标定拷贝数(copies/ml)的柯萨奇病毒A6型合成片段(107copies/ml)和柯萨奇病毒A10型合成片段(107copies/ml)分别稀释后对每一个指定浓度的阳性核酸稀释液进行重复性实验,变异系数均低于1.38%。结论本方法能同时对a6、A10型柯萨奇病毒进行快速检测,且灵敏度高、特异性强、重复性好,并可应用于柯萨奇病毒a6、A10型引起暴发疫情的实验室应急诊断、快速筛查、临床诊断及手足口病的流行病学的研究。

关键词：柯萨奇病毒A6型柯萨奇病毒A10型双重荧光定量RT-PCR

来源： cnki会议评论

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中国卫生检验杂志 2016年第10期26卷 1449-1451页

作者：乔梦凯雍玮王璇石利民何敏丁洁南京医科大学公共卫生学院江苏南京211166 南京市疾病预防控制中心微检科江苏南京210003

目的研究2013年南京市手足口病（HFMD）病例中柯萨奇病毒A6型（Ca6）的基因特征。方法从2013年采集的HFMD病例标本中挑选Ca6阳性标本,选取VP1区进行扩增,并测定基因序列,对比其他参考序列进行进化分析。结果中国南京市Ca6流行株与中国... 详细信息

目的研究2013年南京市手足口病（HFMD）病例中柯萨奇病毒A6型（Ca6）的基因特征。方法从2013年采集的HFMD病例标本中挑选Ca6阳性标本,选取VP1区进行扩增,并测定基因序列,对比其他参考序列进行进化分析。结果中国南京市Ca6流行株与中国泰州、中国福建、中国上海、中国山西、中国台湾等地区和日本的流行株亲缘关系较近,而与中国山东流行株（JQ364886.1-SD1992）和美国原型株（AF081297）亲缘关系较远。序列比对发现南京市Ca6病毒核苷酸序列同源性为92.8%~100.0%,氨基酸同源性为94.7%~100.0%;与Ca6原型株和1992年山东流行株JQ364886的核苷酸同源性分别为82.9%和84.3%。结论 Ca6型柯萨奇病毒是2013年南京地区手足口病的重要病原。

关键词：柯萨奇病毒A6型基因特征进化分析

柯萨奇病毒A6型小儿手足口病的临床特征分析

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中国实用医刊 2018年第22期45卷 79-80页

作者：李占忠李爱山东省新泰市第二人民医院儿内科 271219 山东省新泰市第二人民医院骨科 271219

目的探讨柯萨奇病毒-a6(CV-a6)小儿手足口病的临床特征。方法回顾性分析研究组CV-a6型手足口病患儿、对照1组肠道病毒-71(EV-71)手足口病患儿、对照2组柯萨奇病毒-A16型(CV-A16)手足口病患儿的临床资料,内容包括性别、年龄、临床表现、... 详细信息

目的探讨柯萨奇病毒-a6(CV-a6)小儿手足口病的临床特征。方法回顾性分析研究组CV-a6型手足口病患儿、对照1组肠道病毒-71(EV-71)手足口病患儿、对照2组柯萨奇病毒-A16型(CV-A16)手足口病患儿的临床资料,内容包括性别、年龄、临床表现、实验室检查结果、疗效及预后等,将所得上述各项资料经统计学检验后得出结论。结果研究组CV-a6型手足口病患儿年龄偏小,男性患儿所占比例高于女性,该组高热、齿龈疱疹、多形态皮疹患儿所占比例较高,皮疹好发于躯干,多数患儿表现出异常升高的白细胞计数(WBC)、C-反应蛋白(CRP),随访可知患儿脱甲率较高,上述项目研究组与对照1组、对照2组数据比较,差异有统计学意义(P均0.05);三组手足口病患儿治疗总有效率比较,差异有统计学意义(Pa6型手足口病患儿的临床特征,在今后实际工作中接诊疑似患儿后积极予以致病菌培养,明确具体病毒类型,并予以针对性的临床治疗。

关键词：小儿手足口病柯萨奇病毒A6型临床特征

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柯萨奇病毒A6型所致手足口病流行特征分析

影像研究与医学应用 2018年第10期2卷 250-251页

作者：李静王坤潘香丽青岛市黄岛区食品药品监督管理局山东青岛266555 青岛市黄岛区中心医院山东青岛266555

目的:探讨柯萨奇病毒A6型所致手足口病流行特征。方法:选择2017年1月—12月在我院诊断为柯萨奇病毒A6型所致的手足口病90例患者进行分析,观察其流行特征。结果:患者发病平均年龄为(3.0±1.6)岁,发热率为77.8%,齿龈部疱疹率7.8%。口腔疱... 详细信息

目的:探讨柯萨奇病毒A6型所致手足口病流行特征。方法:选择2017年1月—12月在我院诊断为柯萨奇病毒A6型所致的手足口病90例患者进行分析,观察其流行特征。结果:患者发病平均年龄为(3.0±1.6)岁,发热率为77.8%,齿龈部疱疹率7.8%。口腔疱疹发生部位最常见咽峡部、上腭以及颊黏膜。所有患者均有皮疹,皮疹发生部位最常见为手、足以及臀部。患者白细胞数异常,对症治疗后症状明显改善。结论:柯萨奇病毒A6型是手足口病最常见的一种流行病原,临床上需要及早发现、及早诊断、及早治疗,促进患儿的健康发育。

关键词：柯萨奇病毒A6型手足口病流行特征

云南省2013年柯萨奇病毒A6型基因特征分析

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中国病毒病杂志 2016年第4期6卷 265-269页

作者：寸建萍田子颖徐闻尹洁姜黎黎周晓芳田炳均云南省疾病预防控制中心云南昆明650022

目的对2013年云南省22株柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus a6,CV-a6)VP1区基因特征进行分析。方法对云南省2013年手足口病实验室监测系统分离到的22株CV-a6病毒VP1区基因进行基因扩增和测序;按参考文献下载基因库中CV-a6病毒VP1区基因参... 详细信息

目的对2013年云南省22株柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus a6,CV-a6)VP1区基因特征进行分析。方法对云南省2013年手足口病实验室监测系统分离到的22株CV-a6病毒VP1区基因进行基因扩增和测序;按参考文献下载基因库中CV-a6病毒VP1区基因参考序列,用MEGA 5.0软件计算不同毒株的核苷酸和氨基酸差异率,并构建系统进化树,进行基因特征和分子流行病学分析。结果 2013年云南省在711份非肠道病毒71型(EV-A71)、非柯萨奇病毒A16型(CV-A16)肠道病毒中共检出CV-a6病毒22份,占3.09%(22/711),CV-a6的阳性总检出率为0.32%(22/6 912)。基因特征分析表明,云南22株CV-a6均为基因1型(Genotype 1)。它们分为3个不同的进化分支,1株为China cluster,6株为Yunnan cluster 1,15株为Yunnan cluster 2。结论除原型株Gdula(AF081297)外,国内外CV-a6病毒存在两个基因型,基因型2又分为8个进化分支,云南分离株分布在3个不同的进化分支,2013年云南省CV-a6的流行存在3个传播链。

关键词：柯萨奇病毒A6型 VP1基因基因特征分析

柯萨奇病毒a6引起的一起手足口病暴发疫情感染情况和排毒时长研究

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南京医科大学学报（自然科学版） 2022年第4期42卷 573-577页

作者：马涛孙红敏何敏周沁易汪君君林其洲乔梦凯李德林谢国祥丁洁张敏南京市疾病预防控制中心急性传染病防制科江苏南京210003 南京市疾病预防控制中心微生物检验科江苏南京210003 南京市浦口区疾病预防控制中心传染病防制科江苏南京211800

目的:了解柯萨奇病毒a6(coxsackievirus a6,CV-a6)感染情况和排毒时长,指导科学制定防控策略和措施。方法:制定病例定义,搜索病例。经过知情同意,采集某幼儿园所有病例和罹患率较高的小1班、中2班全体儿童的咽拭子和肛拭子标本,RT-PCR... 详细信息

目的:了解柯萨奇病毒a6(coxsackievirus a6,CV-a6)感染情况和排毒时长,指导科学制定防控策略和措施。方法:制定病例定义,搜索病例。经过知情同意,采集某幼儿园所有病例和罹患率较高的小1班、中2班全体儿童的咽拭子和肛拭子标本,RT-PCR检测肠道病毒核酸,对检测阳性的儿童,每间隔1周再次采集标本开展检测,直至连续两次均为阴性时终止采样。结果:儿童罹患率为8.2%(17/208),发现隐性感染者17例。小1班和中2班流行曲线都呈现单峰分布,卫生学调查排除饮食和饮水传播。病原检测显示为CV-a6型肠道病毒核酸阳性。检测阳性者中隐性感染比例为52%(95%CI:34%~69%)。排毒时长中位数为18 d(95%CI:16~25 d),最短为1周内(4 d),最长为5.5周(39 d),Log-rank检验显示病例与隐性感染者、男性与女性、咽部与肠道排毒时长差异无统计学意义(P> 0.05)。结论:此轮由CV-a6肠道病毒引起的手足口病暴发疫情中,CV-a6隐性感染比例高,排毒时间长。建议提高监测敏感性,病例解除隔离返园(校)、班级复课后应开展持续的健康监测和防控措施。

关键词：柯萨奇病毒A6型手足口病暴发排毒时长幼儿园

2017-2019年广东省Cox a6感染手足口病流行特征分析

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疾病监测 2021年

作者：吴燕飞陈旭光刘东妹李剑森谭小华杨芬广东省现场流行病学培训项目深圳市光明区疾病预防控制中心广东省疾病预防控制中心清远市佛冈县疾病预防控制中心

目的了解2017-2019年广东省柯萨奇病毒A6型（Coxa6）感染手足口病流行特征。方法在广东省21个地市及佛山顺德区（省直管区）共选取22家哨点医院开展手足口病普通病例Coxa6感染监测，结合手足口病个案及暴发数据，估算Coxa6感染手足口... 详细信息

目的了解2017-2019年广东省柯萨奇病毒A6型（Coxa6）感染手足口病流行特征。方法在广东省21个地市及佛山顺德区（省直管区）共选取22家哨点医院开展手足口病普通病例Coxa6感染监测，结合手足口病个案及暴发数据，估算Coxa6感染手足口病发病情况并分析人群和时间分布特征。结果 Coxa6感染阳性率分别为57.1%、23.0%、47.4%。暴发构成比为18.5%（12/65），仅次于CoxA16，主要发生在9月和6月。估算发病率随年龄升高呈下降趋势(趋势χ;=2683320.620，P＜0.001)，高发年龄组依次为0～（1650.29/10万）、1～（4092.17/10万）、2～（2057.02/10万）和3～岁组（1530.23/10万）；随月龄增加呈上升趋势(趋势χ;=771.582，P＜0.001)，高发月龄依次是11～（4982.7/10万）、10～（4150.7/10万）、9～（3523.2/10万）、8～（2684.97/10万）和7～月龄组（1813.01/10万）。高发月份依次是9（34.99/10万）、7（30.98/10万）、10（28.88/10万）、8（24.18/10万）和6月（22.04/10万）。重症及死亡病例构成比为25.2%（86/341），仅次于肠道病毒A71型（EV-A71）(35.5%，121/341)。结论Cox a6已成为广东省手足口病病原的主要型别之一，各年份流行强度不同；暴发疫情强度仅次于Cox a66，Cox a6感染水平高时，暴发疫情增多，主要发生在托幼机构，9月和6月常见；6～10月是高发季节，0～3岁儿童是高危人群，6～11月龄为高发月龄；重症及死亡强度低于EV-A71，高于Cox A16，但其重症及死亡比例较以往研究增加。

关键词：柯萨奇病毒A6型肠道病毒A71型手足口病流行特征发病率病原学监测

我国手足口病分子流行病学及防控管理措施探讨

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中华微生物学和免疫学杂志 2018年第2期38卷 139-148页

作者：樊晔田新贵张日新广州医科大学附属第一医院呼吸疾病国家重点实验室 510230 华南农业大学广州510642

目的分析汇总公开发表的＂2013—2017年＂间我国手足口病流行病学及病原学相关数据,浅析手足口病分子流行病学特征,为完善我国手足口病防控管理措施提供科学依据.方法检索中国知网、万方数据库、维普网、PubMed数据库,以及中华人民共... 详细信息

目的分析汇总公开发表的＂2013—2017年＂间我国手足口病流行病学及病原学相关数据,浅析手足口病分子流行病学特征,为完善我国手足口病防控管理措施提供科学依据.方法检索中国知网、万方数据库、维普网、PubMed数据库,以及中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会、世界卫生组织网站发布的2013—2017年份我国大陆地区手足口病疫情的相关监测数据,采用描述性统计学分析方法对数据进行综合整理分析.结果 2013—2017年我国手足口病发病率分别为134.37/10万、203.16/10万、145.30/10万、176.62/10万、140.46/10万;2013—2017年上半年间导致手足口病的病原主要有肠道病毒71型（enterovirus 71,EV71）、柯萨奇病毒A16型（coxsackievirus A16,CA16）、Ca6、CA10等,Ca6已成为我国大部分地区的主要流行株.重症病例中EV71仍为主要的病原,Ca6、CA10、CA16也是重要致病原;而不同年份、不同地区手足口病的优势株有所不同.结论 2016年中EV71疫苗正式上市,但目前我国手足口病尚未得到完全控制,仍需加强防控管理,并加强肠道病毒分型监测,以正确评估我国手足口病流行趋势,加快多价疫苗研发进程,以完善我国对手足口病的防控管理措施.

关键词：手足口病分子流行病学其他肠道病毒柯萨奇病毒A6型防控管理