检索结果-南通市图书馆

水稻协优9308重组自交系群体白叶枯病抗性的全基因组关联分析

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作物学报 2022年第1期48卷 121-137页

作者：赵海涵练旺民占小登徐海明张迎信程式华楼向阳曹立勇洪永波中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室/浙江省超级稻重点实验室/国家水稻改良中心浙江杭州311401 中国水稻研究所北方水稻研究中心黑龙江宝清155600 浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所浙江杭州310058

白叶枯病是水稻生产最严重的细菌性病害,挖掘新的白叶枯病抗性基因资源并培育抗病品种是控制该病害的重要方法。本研究利用父母本抗性差异较大的协优9308衍生的139个重组自交系群体作为遗传材料,人工接种不同白叶枯菌后的病斑长度作为... 详细信息

白叶枯病是水稻生产最严重的细菌性病害,挖掘新的白叶枯病抗性基因资源并培育抗病品种是控制该病害的重要方法。本研究利用父母本抗性差异较大的协优9308衍生的139个重组自交系群体作为遗传材料,人工接种不同白叶枯菌后的病斑长度作为连续型表型,结合经DNA深度测序获得的476,505个单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)标记进行全基因组关联分析(genome-wide associated study,GWAS)。结果表明在P抗病相关基因(LOC_Os11g43420和LOC_Os11g45930)。表达分析验证发现该2个基因在抗性亲本中恢9308的表达量分别为感病母本协青早B的4.42倍和8.86倍,表明其可能在正调控白叶枯病抗性机制中发挥重要作用。进化树分析发现这2个候选基因与已克隆的抗性基因属于不同的亚组,表明可能是新基因。本研究为进一步挖掘白叶枯抗性基因和培育抗病品种提供了理论基础和基因资源。

关键词：水稻白叶枯病全基因组关联分析 NBS-LRR 抗病育种

番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV)研究进展

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园艺学报 2024年第2期51卷 439-452页

作者：韦建明黄鑫李云洲梁燕贵州大学农学院贵阳550025 西北农林科技大学园艺学院陕西杨凌712100

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)为帚状病毒科(Virgaviridae)烟草花叶病毒属(Tobamovirus)RNA病毒,可侵染包括番茄在内的多个科属植物,严重威胁安全生产。ToBRFV于2014年首次在以色列发现,随后蔓延至多个... 详细信息

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)为帚状病毒科(Virgaviridae)烟草花叶病毒属(Tobamovirus)RNA病毒,可侵染包括番茄在内的多个科属植物,严重威胁安全生产。ToBRFV于2014年首次在以色列发现,随后蔓延至多个国家和地区。2021年4月中国将该病毒列为检疫性病毒。本文中对该病毒的基因组结构、寄主范围、发病症状、传播方式、检测方法、寄主抗性以及防御措施等的研究进展进行了归纳总结,以期为防控和抗ToBRFV育种提供参考和借鉴。

关键词：番茄番茄褐色皱纹果病毒抗病育种

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猪繁殖与呼吸综合征抗病育种研究进展

畜牧兽医学报 2023年第2期54卷 434-442页

作者：刘铃王丹丹崔凯马月辉蒋琳中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 青岛农业大学动物科技学院青岛266109

猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRS virus,PRRSV)引起的一种高度接触性传染病,严重危害我国乃至世界养猪业。然而由于PRRSV抗原的多变性,目前包括疫苗接种、药... 详细信息

猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRS virus,PRRSV)引起的一种高度接触性传染病,严重危害我国乃至世界养猪业。然而由于PRRSV抗原的多变性,目前包括疫苗接种、药物治疗等在内的防治措施效果不佳。因此,随着现代分子生物学技术的不断发展,基于基因编辑技术对猪PRRS的抗病育种逐渐发展起来。本文简述了PRRS的临床症状,重点回顾了国内外PRRS抗病育种研究进展,通过分析PRRS的致病机制,重点阐述了PRRSV受体及针对不同受体进行编辑的体内及体外抗病毒效果,以期为未来深入研究PRRSV致病机制、开发PRRS抗病品种提供理论依据。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征致病机制抗病育种 CD163 HDAC6 基因编辑

基于CRISPR/Cas9技术的SIRT3基因敲除猪肺泡巨噬细胞系的构建与鉴定

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江西农业大学学报 2024年

作者：王宝鑫张文华董霞郑好张晶陈洪波周傲湖北省家畜种业技术创新中心武汉轻工大学动物科学与营养工程学院/动物遗传繁育与精准养殖实验室

【目的】旨在构建稳定敲除SIRT3基因的猪肺泡巨噬细胞系，分析SIRT3敲除对病毒诱导的炎症反应的调控作用，为探究SIRT3基因在宿主抗病毒感染中的作用奠定试验基础。【方法】本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术，针对猪SIRT3基因第2号外... 详细信息

【目的】旨在构建稳定敲除SIRT3基因的猪肺泡巨噬细胞系，分析SIRT3敲除对病毒诱导的炎症反应的调控作用，为探究SIRT3基因在宿主抗病毒感染中的作用奠定试验基础。【方法】本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术，针对猪SIRT3基因第2号外显子设计sgRNA，连接pb-U6-puro-BFP质粒后转染3D4/21细胞，筛选单克隆细胞，结合Sanger测序、qPCR和Western blot技术对获得的单克隆细胞进行鉴定，进而获得SIRT3基因敲除的猪肺泡巨噬细胞系（3D4/21-SIRT3-KO），并以流感病毒A/WSN/33为研究对象，感染野生型和3D4/21-SIRT3-KO猪肺泡巨噬细胞，利用qPCR方法检测炎症相关因子IL-6、IL-8的表达水平，初步分析SIRT3基因在流感病毒感染诱导炎症反应的影响。【结果】Sanger测序结果显示，在挑选获得的敲除SIRT3基因的猪肺泡巨噬细胞克隆中，SIRT3基因第2号外显子位点产生了碱基缺失，并导致移码突变；同时，利用qPCR和Western blot检测猪肺泡巨噬细胞中SIRT3 mRNA和蛋白水平的表达，结果显示与野生型细胞相比，3D4/21-SIRT3-KO细胞中SIRT3 mRNA和SIRT3蛋白均不表达；流感病毒感染SIRT3基因敲除的猪肺泡巨噬细胞时发现，敲除SIRT3能显著加剧流感病毒感染诱导的炎症反应。【结论】本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术成功构建了SIRT3基因敲除的猪肺泡巨噬细胞细胞系，并初步分析SIRT3在流感病毒感染中作用。

关键词： SIRT3 CRISPR/Cas9 炎症反应抗病育种

抗猪繁殖与呼吸障碍综合征基因编辑猪研究进展

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生物技术通报 2023年第10期39卷 50-57页

作者：李双喜华进联西北农林科技大学动物医学院陕西省干细胞工程技术研究中心杨凌712100

猪繁殖与呼吸障碍综合征是由猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起的一种病毒性传染病。该病是影响我国生猪产业健康发展的最重要的三大疫病之一。目前对于该病的防控主要依赖... 详细信息

猪繁殖与呼吸障碍综合征是由猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起的一种病毒性传染病。该病是影响我国生猪产业健康发展的最重要的三大疫病之一。目前对于该病的防控主要依赖于养殖场内外部生物安全体系,采取合理措施降低病毒的污染,切断病毒传播途径。从保护易感动物的角度而言,抗病育种也是疫病防控的重大策略之一。近年来,随着基因编辑技术的发展和成熟,分子育种作为猪抗病育种的核心技术,已显示出其独特的优势。国内外多个研究团队已利用分子育种技术在抗PRRS育种方面取得很多突破性进展。本文以PRRSV受体为切入点,综述当前猪抗PRRS育种的研究现状,以期为PRRS的防控和猪的抗病育种研究提供参考和线索。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征猪抗病育种 CRISPR/Cas9 CD163

杏NBS基因家族鉴定及其对果实抗病性的影响

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果树学报 2022年第3期39卷 321-331页

作者：秦兆辉张俊环杨丽张美玲王玉柱姜凤超孙浩元北京市农林科学院林业果树研究所北京100093 农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室北京100093

【目的】探讨杏果实发育过程中NBS基因家族的表达规律,为果实抗病机制研究提供理论指导。【方法】运用生物信息学方法进行NBS基因家族鉴定与转录组分析。【结果】在串枝红杏基因组中共鉴定到155个NBS抗病基因,主要分为CNL型(126个)和NL... 详细信息

【目的】探讨杏果实发育过程中NBS基因家族的表达规律,为果实抗病机制研究提供理论指导。【方法】运用生物信息学方法进行NBS基因家族鉴定与转录组分析。【结果】在串枝红杏基因组中共鉴定到155个NBS抗病基因,主要分为CNL型(126个)和NL型(29个),45%的基因主要分布在1号与2号染色体上,顺式作用元件较多且大多属于激素调控元件,发现1个杏特有的基序CNBS-1。NBS基因在不同品种发育过程中的基因表达模式类似,但在表达量上存在较大差异。8个NBS基因在串枝红果实发育的4个时期表达量均显著高于同时期大白杏,表明这些基因可能与串枝红果实抗病性高于大白杏有关。【结论】获得8个NBS差异表达基因,主要与抗致病疫霉病原与霜霉病原有关,为杏果实抗病育种提供理论指导。

关键词：杏(Prunus armeniaca L.) NBS基因家族抗病育种生物信息学

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基于黄褐棉导入系群体定位抗黄萎病QTL

棉花学报 2023年第1期35卷 29-38页

作者：常鑫燚李轩照唐秉晖潘振远吴元龙沈超努日曼古丽·艾尼林忠旭尤春源聂新辉石河子大学农学院/新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室新疆石河子832003 石河子农业科学院棉花研究所新疆石河子832011 广东石油化工学院生物与食品工程学院广东茂名525000 华中农业大学植物科学技术学院/作物遗传改良国家重点实验室武汉430070

【目的】黄萎病(Verticillium wilt)是棉花生产中的最主要病害,且棉花黄萎病的致病机理尚不清楚。通过构建黄褐棉导入系群体定位棉花黄萎病抗性相关的数量性状位点(quantitative trait loci,QTL),为抗黄萎病分子标记开发和辅助育种提供... 详细信息

【目的】黄萎病(Verticillium wilt)是棉花生产中的最主要病害,且棉花黄萎病的致病机理尚不清楚。通过构建黄褐棉导入系群体定位棉花黄萎病抗性相关的数量性状位点(quantitative trait loci,QTL),为抗黄萎病分子标记开发和辅助育种提供参考。【方法】以陆地棉(Gossypium hirsutum)B0011为轮回亲本、黄褐棉(G.mustelinum)为供体亲本,构建有71个株系的BC_(5)S_(5)群体。利用2 839个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记结合表型值进行黄萎病抗性相关QTL定位。【结果】共检测到15个与黄萎病抗性相关的QTL,可解释4.21%~26.77%的表型变异。加性效应分析表明:其中6个QTL的有利等位基因来源于黄褐棉,9个QTL有利等位基因来自B0011。同时,qVW-A01-1、q VW-A02-2和qVW-A07-2在2个及以上环境中被检测到,表型变异解释率分别为15.56%~16.56%、11.95%~24.62%和13.22%~16.73%。利用BC5S5群体黄萎病抗性的最佳线性无偏预测值(best linear unbiased prediction,BLUP)进行QTL定位,共检测到5个QTL,其中qVW-A01-1B、q VW-A02-1B分别与加性效应分析稳定检测到的qVW-A01-1、qVW-A02-2物理位置一致,分别解释23.67%和17.90%的表型变异。【结论】本研究发现2个稳定的QTL即qVW-A01-1和qVW-A02-2,可为抗黄萎病分子标记辅助选择育种及候选基因功能鉴定奠定基础。

关键词：陆地棉抗病育种黄萎病数量性状位点分子标记辅助育种

南方水稻黑条矮缩病抗病遗传资源与分子机理研究进展

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广东农业科学 2023年第12期50卷 43-51页

作者：陈建松周炼张师睿杨武秦碧霞赵均良广东省农业科学院水稻研究所/广东省水稻育种新技术重点实验室/广东省水稻工程实验室广东广州510640 仲恺农业工程学院农业与生物学院广东广州510225 广西壮族自治区农业科学院植物保护研究所/农业农村部华南果蔬绿色防控重点实验室/广西作物病虫害生物学重点实验室广西南宁530007

南方水稻黑条矮缩病(Souther rice black-streaked dwarf virus disease,SRBSDVD)是依靠白背飞虱(Sogatella furcifera)为传播介体,由南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)侵染引起的一种水稻病毒病。该病害于2001年在我国华南地区首次被发现,随后发生面积不断扩大,危害逐年加重,已成为近年来危害中国南方稻区水稻生产的重要病害之一。白背飞虱迁飞性强、种群数量大、传毒持久等特点,导致化学农药防虫治病效果并不理想,至今还未有可持续和绿色控制SRBSDVD的手段。根据病原病毒的爆发性及其传播介体白背飞虱的生物学特性,预计该病害在未来较长的一段时期内将是我国最严重的水稻病害之一,很有可能再次暴发流行。因此,当前生产上急需培育出能够抵御SRBSDVD的抗性水稻品种。本文综述了SRBSDVD的发病规律、抗病种质资源的收集与评估、抗病基因或数量性状位点(QTL)的精确定位,以及这些抗性基因的分子作用机制,进一步探讨了利用现代分子生物学技术,包括分子标记辅助选择、基因沉默(RNAi)和基因编辑等技术加快SRBSDVD抗病品种的选育,可为今后有效控制SRBSDVD提供基础。

关键词：南方水稻黑条矮缩病毒白背飞虱水稻病毒病害抗性基因抗病育种

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四川抗赤霉病小麦品种(系)抗病基因检测

西南农业学报 2023年第3期36卷 575-583页

作者：邓清燕罗江陶郑建敏万洪深李式昭杨漫宇夏先全蒲宗君四川省农业科学院作物研究所成都610066 农业农村部西南地区小麦生物学与遗传育种重点实验室成都610066 粮油作物绿色种质创新与遗传改良四川省重点实验室成都610066 四川省农业科学院植物保护研究所成都610066

【目的】旨在研究四川小麦抗赤霉病的基因资源,培育赤霉病综合抗性中抗以上的小麦品种。【方法】利用土表接种法鉴定出156份赤霉病达中抗水平的小麦品种或高代品系,通过已知赤霉病抗性基因Fhb1、Fhb2、Fhb4和Fhb5以及部分抗条锈病基因... 详细信息

【目的】旨在研究四川小麦抗赤霉病的基因资源,培育赤霉病综合抗性中抗以上的小麦品种。【方法】利用土表接种法鉴定出156份赤霉病达中抗水平的小麦品种或高代品系,通过已知赤霉病抗性基因Fhb1、Fhb2、Fhb4和Fhb5以及部分抗条锈病基因和抗白粉病基因的分子标记检测抗性基因的组成。【结果】经抗病基因分子标记检测,在供试的156份赤霉病抗性材料中仅检测出2份材料(20引979和20间2506-10)分别含有抗赤霉病基因Fhb1和Fhb5。同时,检测出含小麦条锈病抗性基因Yr5、Yr15、Yr18、Yr26和YrAs2388的材料分别为4、63、9、3、14份,在供试材料中的分布频率分别为2.56%、40.38%、5.77%、1.92%和8.97%。检测出含白粉病抗性基因Pm21的材料44份,在供试材料中的分布频率为28.21%。抗病基因的分布表明,122份供试材料含有至少1个抗病基因,其中6份材料含有条锈病和白粉病2种抗病基因,9份材料中聚合了2个抗条锈病基因,剩余的106份材料仅含有1个抗病基因。仅1份供试材料(20间2506-10)同时含有赤霉病、条锈病和白粉病3种抗病基因。【结论】四川小麦缺乏遗传背景明确的抗赤霉病资源,因此四川小麦抗赤霉病育种在充分利用本地抗赤霉病资源的同时应加强引进已知抗源的资源加以利用。

关键词：小麦小麦赤霉病 Fhb基因分子检测抗病育种