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大竹蛏Solen grandis耗氧率及排氨率响应面法分析

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水产学杂志 2021年第2期34卷 65-70页

作者：张雨陈爱华吴杨平曹奕陈素华张志东田镇李秋洁江苏省海洋水产研究所江苏南通226007 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

将平均体质量(5.42±0.23)g的大竹蛏Solen grandis放在密闭呼吸瓶中,测定盐度22、25、28、31和34,温度20℃、23℃、26℃、29℃和32℃及pH7、7.5、8、8.5和9条件下的耗氧率与排氨率,用响应面法比较不同条件下呼吸及代谢状态的差异。结果... 详细信息

将平均体质量(5.42±0.23)g的大竹蛏Solen grandis放在密闭呼吸瓶中,测定盐度22、25、28、31和34,温度20℃、23℃、26℃、29℃和32℃及pH7、7.5、8、8.5和9条件下的耗氧率与排氨率,用响应面法比较不同条件下呼吸及代谢状态的差异。结果表明:(1)在一定范围内大竹蛏耗氧率及排氨率随盐度、温度和pH的升高而增加,超过一定范围,大竹蛏耗氧率及排氨率随盐度、温度和pH的增加而降低;(2)通过响应面法优化,大竹蛏耗氧率及排氨率最高时的条件为:盐度28.13,温度25.89℃,pH7.25,此条件下大竹蛏的耗氧率及排氨率分别为0.45 mg·g^(-1)·h^(-1)和37.42μg·g^(-1)·h^(-1)。

关键词：大竹蛏耗氧率排氨率盐度温度 pH 响应面法

大竹蛏β-整合素基因SgβInt的特性分析和重组表达

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渔业科学进展 2018年第1期39卷 120-127页

作者：刘佳乐韦秀梅杨顶珑童潼刘相全广西壮族自治区海洋研究所广西海洋生物技术重点实验室北海536000 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 山东省海洋资源与环境研究院山东省海洋生态修复重点实验室烟台264006

整合素作为一种细胞粘附因子,在细胞粘附、迁移、增殖、凋亡和吞噬等过程中发挥重要作用。本研究利用分子克隆技术获得了大竹蛏(Solen grandis)β-整合素基因(SgβInt)的c DNA全长,分析了其编码氨基酸序列的进化特点,并以SWISS-MODEL预... 详细信息

整合素作为一种细胞粘附因子,在细胞粘附、迁移、增殖、凋亡和吞噬等过程中发挥重要作用。本研究利用分子克隆技术获得了大竹蛏(Solen grandis)β-整合素基因(SgβInt)的c DNA全长,分析了其编码氨基酸序列的进化特点,并以SWISS-MODEL预测了氨基酸序列的三级结构。SgβInt基因序列全长为1168 bp,5′和3′非编码区(UTR)分别为61 bp和18 bp,开放阅读框(ORF)为1089 bp,编码362个氨基酸,理论等电点约为4.98,分子量为30.0 k Da。通过荧光定量PCR法检测了SgβInt在健康大竹蛏各组织中以及大竹蛏受到脂多糖、肽聚糖和葡聚糖等微生物多糖刺激后的表达。结果显示,SgβInt在血细胞、鳃、肝胰腺、性腺、肌肉和外套膜等组织中均可表达,在鳃中的表达量最高;脂多糖、肽聚糖和葡聚糖都可以诱导SgβInt表达量上调,SgβInt的表达量分别在脂多糖和葡聚糖刺激后的3 h和48 h达到最高;肽聚糖刺激后SgβInt表达量上调幅度最大,在6 h时达到最高,证实SgβInt参与大竹蛏抵御外源微生物的免疫应答。利用基因重组技术构建了SgβInt的重组表达载体,为进一步分析软体动物整合素的功能、揭示大竹蛏先天性免疫机制奠定了基础。

关键词：大竹蛏整合素免疫应答荧光定量PCR

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大竹蛏稚贝潜砂行为的研究

水产科学 2019年第3期38卷 406-410页

作者：郝咏芳周玮曹琛张建强魏国庆李丹营口市农业农村综合发展服务中心辽宁营口115000 大连海洋大学辽宁大连116023 辽宁省海洋水产科学研究院辽宁大连116023

实验室条件下,研究大竹蛏稚贝的潜砂行为及稚贝规格对潜砂的影响。结果表明,大竹蛏稚贝的潜砂行为可分3个阶段:准备期、潜砂期及结束期。大竹蛏稚贝在壳长3.00～8.50 mm内,规格对潜砂准备时间、潜砂时间及潜砂行为的影响极显著,随着规... 详细信息

实验室条件下,研究大竹蛏稚贝的潜砂行为及稚贝规格对潜砂的影响。结果表明,大竹蛏稚贝的潜砂行为可分3个阶段:准备期、潜砂期及结束期。大竹蛏稚贝在壳长3.00～8.50 mm内,规格对潜砂准备时间、潜砂时间及潜砂行为的影响极显著,随着规格变大其潜砂准备时间逐渐降低(10.7～4.0 s);潜砂时间则表现为先降后升,壳长(6.20±0.04) mm组的稚贝潜砂时间最短,约9.7 s;各规格组稚贝的潜沙率均为100%,壳长(5.18±0.11) mm组潜砂率100%且用时最短。建议在大竹蛏增养殖过程中,投放苗种规格宜大于5.00 mm。

关键词：大竹蛏潜砂行为稚贝规格

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大竹蛏高通量转录组测序数据组装和分析

大连海洋大学学报 2017年第6期32卷 658-663页

作者：聂鸿涛姜力文郑梦鸽李东东闫喜武大连海洋大学水产与生命学院辽宁大连116023 辽宁省贝类良种繁育工程技术研究中心辽宁大连116023

为进一步开发大竹蛏Solen grandis的基因资源,采用2代Illumina Hi-seq测序技术对大竹蛏的鳃组织进行了转录组测序,构建了转录组数据库,获得338 483 476条Clean Reads数据;拼接组装后获得190 856条Unigene数据,平均长度为1147 bp;与NR、N... 详细信息

为进一步开发大竹蛏Solen grandis的基因资源,采用2代Illumina Hi-seq测序技术对大竹蛏的鳃组织进行了转录组测序,构建了转录组数据库,获得338 483 476条Clean Reads数据;拼接组装后获得190 856条Unigene数据,平均长度为1147 bp;与NR、NT、KO、Swiss Prot、PFAM、GO、KOG等数据库进行Blast信息比对(E-value为10-5),共获得63 337个注释基因;与NR数据库比对发现,大竹蛏转录组基因序列与长牡蛎Crassostrea gigas具有较高的同源性,为53.3%;将大竹蛏转录组的Unigene的功能通过与KOG数据库进行注释比对划分为25类;GO数据库注释可分为三类,即细胞组分、生物过程和分子功能,共包括65个分支;KEGG分析发现,大竹蛏转录组数据中按照代谢通路可分为92类,利用Blast蛋白库比对和Estscan软件进行ORF预测,获得长度大于300 nt的ORF共50 681个;通过SSR分析,共获得73 089个SSR标记。本研究中获得的转录组信息可为今后进行大竹蛏分子标记的开发和关键基因的克隆及功能分析等研究提供基础数据。

关键词：大竹蛏转录组高通量测序生物信息学分析

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大竹蛏5个野生群体遗传多样性的微卫星分析

中国水产科学 2015年第4期22卷 740-748页

作者：张志伟陈爱华张志勇陆勤勤张朝晖姚国兴蔡永祥吴杨平曹奕张雨江苏省海洋水产研究所

运用微卫星标记对大竹蛏(Solen grandis)辽宁丹东(DD)、河北秦皇岛(QHD)、山东日照(RZ)、江苏吕四(LS)和广西北海(BH)近海5个不同地理野生群体共计150个样品进行了遗传多样性分析。结果表明:14个位点多态信息含量范围为0.696~0.853,均... 详细信息

运用微卫星标记对大竹蛏(Solen grandis)辽宁丹东(DD)、河北秦皇岛(QHD)、山东日照(RZ)、江苏吕四(LS)和广西北海(BH)近海5个不同地理野生群体共计150个样品进行了遗传多样性分析。结果表明:14个位点多态信息含量范围为0.696~0.853,均呈现高度多态性,每个位点检测到的等位基因数8~22个,共检测到199个等位基因,平均等位基因数为14.2,等位基因丰富度为11.05,5个群体的期望杂合度分别为0.769(DD),0.791(QHD),0.826(RZ),0.815(LS),0.785(BH),观察杂合度分别为0.837(DD),0.812(QHD),0.875(RZ),0.809(LS),0.858(BH),表明各群体处于较高的遗传多样性水平。Hardy-Weinberg平衡检验显示,仅有Sg16位点在丹东群体显著偏离平衡,其余位点在5个群体均正常,表明各群体遗传较稳定,处于平衡状态。5个群体间的遗传距离在0.141 2~0.340 9,DD和QHD的遗传距离最小,DD和BH的遗传距离最大;基于Da遗传距离构建的UPGMA聚类树显示,距离相邻的DD、QHD渤海湾群体聚为一支,RZ、LS黄海群体聚为另一支,最后与南海群体BH聚在一起,聚类结果与地理位置密切联系,基于贝叶斯遗传聚类得到了相同的结果。分析群体间的Fst值可知,两两群体间的Fst值在0.039 1~0.094 7,群体间产生了中等程度的遗传分化,并且达到了极显著水平(P=0.000 1)。由此可见,中国沿海各地理群体野生大竹蛏种质遗传多样性较为丰富,但不同群体间存在显著的遗传分化,故各增殖放流海区应当加强对放流苗种及繁殖亲本的种质检测,防止异地繁养等人为因素对大竹蛏各野生种群遗传结构造成破坏。

关键词：大竹蛏微卫星野生群体遗传多样性

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大竹蛏幼贝滤水率的响应面法分析

水产科学 2016年第4期35卷 313-320页

作者：姜北董颖高杉王摆曹琛张乾郝咏芳王永波周遵春辽宁省海洋水产科学研究院辽宁大连116023 营口市水产科学研究所辽宁营口115003 营口现代渔业科技产业园辽宁营口115001

采用三因素三水平中心组合试验设计方案,研究光照度、盐度、pH及三者交互作用对大竹蛏幼贝滤水率的影响,并进行响应面分析,探寻大竹蛏幼贝最适生长条件组合,构造大竹蛏幼贝滤水率模型。试验期为30d,试验光照梯度为2000lx、1000lx、0,盐... 详细信息

采用三因素三水平中心组合试验设计方案,研究光照度、盐度、pH及三者交互作用对大竹蛏幼贝滤水率的影响,并进行响应面分析,探寻大竹蛏幼贝最适生长条件组合,构造大竹蛏幼贝滤水率模型。试验期为30d,试验光照梯度为2000lx、1000lx、0,盐度梯度为30、25、20,pH梯度为9.00、8.00、7.00。结果显示,光照度、盐度及pH三者对大竹蛏幼贝滤水率有显著交互作用(P大竹蛏幼贝滤水率y对编码自变量A(光照度)、B(盐度)和C(pH)的二次多元回归方程:y=1.62+0.084A+0.04B-0.14C-0.38A2-0.65B2-0.68C2(r2=0.9821),软件模拟最适大竹蛏幼贝生长的条件组合为光照度1109.17lx,盐度25.12,pH7.89。

关键词：大竹蛏光照度盐度 pH 滤水率响应面分析

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大竹蛏室内人工育苗技术研究

海洋湖沼通报 2015年第4期 56-60页

作者：宋贤亭于瑞海马培振张明琦王岩中国海洋大学山东青岛266003 青岛海逸帆海珍品有限公司山东青岛266100

以大竹蛏（Solen grandis Dunker）为材料,选择一定规格且处于繁殖期的亲贝采用铺砂蓄养培育,以阴干流水刺激法获得精卵,合理控制密度培育幼虫,前期6~8/mL,后期1~2/mL.育苗管理方面,严把饵料质量关,投喂新鲜无污染的饵料,科学换水与充气... 详细信息

以大竹蛏（Solen grandis Dunker）为材料,选择一定规格且处于繁殖期的亲贝采用铺砂蓄养培育,以阴干流水刺激法获得精卵,合理控制密度培育幼虫,前期6~8/mL,后期1~2/mL.育苗管理方面,严把饵料质量关,投喂新鲜无污染的饵料,科学换水与充气,使育苗生产顺利进行.不同密度下洗卵与不洗卵的孵化比较试验、无底质采苗和铺砂附着基投放的采苗等试验的结果为：在洗卵的条件下,孵化密度为30/mL时,孵化率可达80%;无底质采苗变态率较铺砂采苗高,但生长速度慢于铺砂采苗。

关键词：大竹蛏人工育苗洗卵铺砂采苗无底质采苗

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大竹蛏和长竹蛏线粒体基因组的比较研究

中国海洋大学学报（自然科学版） 2013年第9期43卷 33-38页

作者：远洋李琪孔令锋中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室山东青岛266003

大竹蛏(Solen grandis)和长竹蛏(Solen strictus)是2种重要的经济贝类。对大竹蛏和长竹蛏的线粒体全基因组进行比较分析。结果表明,2种竹蛏的线粒体基因组具有相似的组成结构、AT含量、基因大小和相同的基因排列顺序,然而两者的蛋白质... 详细信息

大竹蛏(Solen grandis)和长竹蛏(Solen strictus)是2种重要的经济贝类。对大竹蛏和长竹蛏的线粒体全基因组进行比较分析。结果表明,2种竹蛏的线粒体基因组具有相似的组成结构、AT含量、基因大小和相同的基因排列顺序,然而两者的蛋白质编码基因的序列以及起始、终止密码子存在较大差异。非同义替换率与同义替换率的比值(Ka/Ks)显示,蛋白质编码基因cox1,cox2和cox3承受较强的选择压力,而nad2,nad3和nad6则承受较小的选择压力。2种竹蛏最长非编码区序列并不保守,但都含有发卡结构和(TA)12微卫星序列。长竹蛏最长非编码区中还存在另外一段串联重复序列。结果显示,2种竹蛏线粒体基因组存在明显差异,线粒体基因组可以做为区分大竹蛏和长竹蛏的重要分子标记。

关键词：大竹蛏长竹蛏线粒体基因组

大竹蛏(Solen grandis)不同地理群体遗传多样性的AFLP分析

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海洋与湖沼 2013年第2期44卷 525-530页

作者：张滔刘相全孙振兴乔洪金孙国华刘丽娟宋向军山东省海洋水产研究所烟台264006 鲁东大学生命科学学院烟台264025 山东省海洋生态修复重点实验室烟台264006

应用AFLP分子标记技术对我国沿海大竹蛏(Solen grandis)群体的遗传多样性进行了分析,利用筛选出的7对AFLP引物,对丹东、烟台、莱州、日照和南通5个地理群体的141只大竹蛏个体进行了扩增,共得到了403个位点,片段大小在100—700bp之间。... 详细信息

应用AFLP分子标记技术对我国沿海大竹蛏(Solen grandis)群体的遗传多样性进行了分析,利用筛选出的7对AFLP引物,对丹东、烟台、莱州、日照和南通5个地理群体的141只大竹蛏个体进行了扩增,共得到了403个位点,片段大小在100—700bp之间。其中丹东、烟台、莱州、南通4个群体的大竹蛏遗传多样性水平接近,日照群体的多态位点比例高于其它4个群体,结合Shannon’s信息指数(I)和Nei’s基因多样性指数(H)看,日照群体的遗传多样性水平最高,而南通群体的遗传多样性水平最低。AMOVA分析得到群体间遗传分化系数Φst=0.2250(P<0.001),群体间的变异百分率为22.5%,群体内为77.5%,说明群体的遗传变异主要来源于群体内个体间的遗传差异,但群体间也存在一定程度的基因渗透。

关键词：大竹蛏 AFLP 遗传多样性