大竹蛏和长竹蛏线粒体基因组的比较研究

作     者：远洋 李琪 孔令锋 YUAN Yang;LI Qi;KONG Ling-Feng

作者机构：中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室山东青岛266003 

出 版 物：《中国海洋大学学报（自然科学版）》 (Periodical of Ocean University of China)

年 卷 期：2013年第43卷第9期

页      面：33-38页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31072207) 国家海洋公益性行业科研项目(201205023)资助 

主　　题：大竹蛏 长竹蛏 线粒体基因组 

摘      要：大竹蛏(Solen grandis)和长竹蛏(Solen strictus)是2种重要的经济贝类。对大竹蛏和长竹蛏的线粒体全基因组进行比较分析。结果表明,2种竹蛏的线粒体基因组具有相似的组成结构、AT含量、基因大小和相同的基因排列顺序,然而两者的蛋白质编码基因的序列以及起始、终止密码子存在较大差异。非同义替换率与同义替换率的比值(Ka/Ks)显示,蛋白质编码基因cox1,cox2和cox3承受较强的选择压力,而nad2,nad3和nad6则承受较小的选择压力。2种竹蛏最长非编码区序列并不保守,但都含有发卡结构和(TA)12微卫星序列。长竹蛏最长非编码区中还存在另外一段串联重复序列。结果显示,2种竹蛏线粒体基因组存在明显差异,线粒体基因组可以做为区分大竹蛏和长竹蛏的重要分子标记。