检索结果-南通市图书馆

草业学报 2022年第8期31卷 199-210页

作者：孙禄娟何建军汪军成姚立蓉司二静杨轲李葆春马小乐尚勋武孟亚雄王化俊甘肃农业大学省部共建干旱生境作物学国家重点实验室甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室甘肃兰州730070 甘肃农业大学农学院甘肃兰州730070 甘肃农业大学生命科学技术学院甘肃兰州730070

以盐生草全长转录组数据为基础,用MISA在线软件对盐生草转录组水平SSR位点进行搜索,共鉴定到29640个SSR位点,每SSR的发生频率为4.93 kb。SSR种类包含1~6核苷酸重复类型,重复次数主要为4~20次,其中,三核苷酸重复单位最多,占38.25%;四核... 详细信息

以盐生草全长转录组数据为基础,用MISA在线软件对盐生草转录组水平SSR位点进行搜索,共鉴定到29640个SSR位点,每SSR的发生频率为4.93 kb。SSR种类包含1~6核苷酸重复类型,重复次数主要为4~20次,其中,三核苷酸重复单位最多,占38.25%;四核苷酸重复单位类型最少,仅占3.26%。鉴定到的327种SSR重复类型中,A/T、AG/CT、ATC/GAT、AAG/CTT重复类型出现次数较多。进一步地,对甘肃18个不同生态点盐生草材料进行SSR标记位点的开发及遗传多样性分析。从检测到的29640个SSR标记中选择218对标记进行多态性筛选,共筛选到多态性较高的33对标记,这些标记共检测得到199个等位基因位点,等位基因数(AN)为3~13个,平均为6.03个;基因多样性指数(GD)为0.583~0.869,平均为0.698;基因型数量(GN)为2~13,平均值为5.88;多态性信息含量(PIC)值为0.527~0.856,平均值为0.623。聚类分析结果表明,18个不同生态点盐生草的遗传相似系数(GS)为0.528~0.859,平均值为0.683。在GS为0.68处,可将供试材料划分为四大类。本研究为盐生草种质资源开发及利用提供了参考依据。

关键词：全长转录组 SSR重复类型多态性筛选聚类分析

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贵紫麦1号转录组EST-SSR标记发掘与应用

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河南农业科学 2020年第5期49卷 15-30页

作者：杨帅杨喜翠何方李鲁华李振华任明见徐如宏贵州大学农学院贵州贵阳550025 国家小麦改良中心贵州分中心贵州贵阳550025

为了开发新的小麦分子标记,利用前期小麦品种贵紫麦1号的转录组测序结果,对所得序列进行EST-SSR(Expressed sequence tags-simple sequence repeat)标记开发,并对开发的标记进行了染色体定位、多态性筛选。结果表明,在119572条总Unigene... 详细信息

为了开发新的小麦分子标记,利用前期小麦品种贵紫麦1号的转录组测序结果,对所得序列进行EST-SSR(Expressed sequence tags-simple sequence repeat)标记开发,并对开发的标记进行了染色体定位、多态性筛选。结果表明,在119572条总Unigenes序列中得到8749条含SSR位点的EST序列,占7.3%,平均每8.04 kb就会出现1个SSR;EST序列中SSR类型的分布特点为三核苷酸重复类型最多,而五、六核苷酸重复类型出现频次很少,单核苷酸重复以A/T出现频次最多,二核苷酸重复以AG/CT出现频次最多,三核苷酸重复以CCG/CGG出现频次最多;对含SSR位点的EST序列进行引物设计,成功设计出引物的序列有5503条,占总EST序列的62.9%,从中筛选到341对有效性EST-SSR引物;以中国春为对照,利用16份中国春缺体-四体系材料对341对EST-SSR引物进行染色体定位,共定位153对引物、201个位点,涉及除3A、5A、3B、4B及1D外的16条染色体,其中5B染色体定位引物对最多,达23对;筛选出53对多态性EST-SSR引物,对52份小麦材料进行遗传多样性分析发现,其中18对EST-SSR引物可将52份小麦材料一一区分。

关键词：紫色小麦 EST-SSR 多态性筛选标记开发染色体定位遗传多样性

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小麦新矮源华矮01矮秆基因的SSR标记及其细胞壁成分的分析

小麦新矮源华矮01矮秆基因的SSR标记及其细胞壁成分的分析

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作者：杨悦华中农业大学

学位级别：硕士

小麦植株高矮是决定小麦产量的重要因素之一,在小麦的育种过程中,不断发现和利用矮秆基因使得世界小麦产量得到了进一步增加。因此,矮秆基因的不断探索、挖掘、鉴定、研究和利用,对小麦高产育种意义重大。本实验选用“华矮01”矮秆小麦... 详细信息

小麦植株高矮是决定小麦产量的重要因素之一,在小麦的育种过程中,不断发现和利用矮秆基因使得世界小麦产量得到了进一步增加。因此,矮秆基因的不断探索、挖掘、鉴定、研究和利用,对小麦高产育种意义重大。本实验选用“华矮01”矮秆小麦和"90592"高秆小麦为亲本进行杂交,配置基因定位群体。用简单重复序列(Sequence Simple Repeat, SSR)技术对矮秆基因进行分子标记,试图挖掘新的矮秆基因。实验中,共选用904对引物,扩增和筛选结果显示,160对引物在高、矮亲本间扩增出多态性片段,4对引物在亲本及F2群体的高秆和矮秆基因池间显示出多态性,他们分别是barc1096,Xgwm495,Xgwm513,WMC657,这表明barc1096, Xgwm495,Xgwm513,WMC657标记可能与华矮01所携带的矮秆基因存在连锁关系。而由于这4对引物均都位于小麦4B染色体的长壁上,根据这4对引物的位置,可初步断定该矮秆基因的位于小麦4B染色体上的长壁上。在25个已经发现并定名的矮秆基因中,已确定染色体位置的共有17个,其中,位于小麦4B染色体上的矮秆基因有6个,但是这些小麦4B染色体上的矮秆基因全都位于短臂上,目前没有发现且命名的矮秆基因位于小麦4B染色体的长臂上,所以本研究中的“华矮01”矮秆基因可能是一个新的矮秆基因。因此,该基因的定位及其分子标记的获得有可能丰富该连锁群的遗传图谱,为进一步深入研究该基因对小麦株高的影响和小麦辅助标记育种提供了有用信息。此外,研究过程中增加了“华矮01”细胞壁成分的探索性初步研究,因为茎秆特征影响小麦倒伏,除了与小麦矮秆基因的作用有关外,还可能与小麦茎秆细胞的细胞壁组成成分相关,通过对“农林10号”,小麦矮秆“华矮01”和小麦高秆“90592”的细胞壁成分的研究比较及分析,找出其相关性。在本研究中,比较分析了“农林10号”,小麦矮秆“华矮01”和小麦高秆“90592”三个品种的细胞壁成分。对纤维素含量来说,高秆“90592”,“农林10号”和“华矮01”中的纤维素相对含量依次增加。对半纤维素含量来说,高秆“90592",“农林10号”和“华矮01”中的半纤维素总的含量也是依次增加的。而对于木质素来说,在三个品种中,总的含量没有一定规律,但其中酸溶木质素相对含量是依次增加的,酸不溶木质素的相对含量没有一定规律。因此,小麦茎秆的机械强度可能主要与细胞壁中的纤维素的含量和半纤维素的相对含量有关,而与木质素的含量关系不明显。

关键词：小麦矮秆基因简单重复序列混合分离群体分析多态性筛选细胞壁纤维素

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