检索结果-南通市图书馆

全外显子测序检测6个囊性肾病胎儿及其核心家系的致病突变

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

现代妇产科进展 2022年第1期31卷 6-10页

作者：周静马定远吴云杨玲朱爱红李璃罗春玉张菁菁胡平许争峰南京医科大学附属妇产医院产前诊断中心南京210004

目的全外显子测序技术检测6个囊性肾病胎儿及其核心家系,寻找致病变异,为遗传咨询、产前诊断或植入前诊断提供遗传学数据支持。方法应用Illumina Hiseq2500测序平台,对超声检查提示为囊性肾病、染色体微阵列检测(CMA)未见异常的胎儿标... 详细信息

目的全外显子测序技术检测6个囊性肾病胎儿及其核心家系,寻找致病变异,为遗传咨询、产前诊断或植入前诊断提供遗传学数据支持。方法应用Illumina Hiseq2500测序平台,对超声检查提示为囊性肾病、染色体微阵列检测(CMA)未见异常的胎儿标本进行家系全外显子检测,参考数据库Human Genome 19(hg19/GRCh37),根据美国医学遗传学与基因组学学会指南(ACMG,2015)及指南应用建议评估变异致病性,对评级可疑致病位点应用Sanger测序验证。结果家系WES检出3个家系存在异常突变,其中1个家系的突变为遗传性,2个家系胎儿的突变为新发突变;余3个家系未检出明确致病突变。胎儿1 PKHD1基因c.5869G>A(父源)和c.9455delA复合杂合突变(母源),均为可能致病的变异。胎儿5 HNF1B基因c.826C>T杂合突变,为致病性新发突变。胎儿6 HNF1B基因c.1318G>T杂合突变,为可能致病性新发突变。Sanger测序验证结果与全外显子检测结果一致。结论对囊性肾病可运用家系核心成员全外显子检测,筛选出候选变异后进行Sanger测序验证,并对家系进行遗传分析,有助于遗传咨询、再次妊娠的产前诊断或辅助生殖的植入前诊断。本研究检出3个未见文献报道的可能致病突变位点,1个致病性突变位点已在个别文献报道但是未在国际公认数据库明确为致病突变位点,本研究拓宽了囊性肾病的致病基因位点谱。

关键词：全外显子测序胎儿囊性肾病 PKHD1 HNF1B

全外显子测序筛查胃癌高频突变基因的突变型与野生型在临床病理表型上的差异

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华医学杂志 2018年第28期98卷 2242-2245页

作者：丛霆刘国晓崔建新张珂诚陈志达陈凛卫勃黄晓辉解放军总医院普通外科解放军医学院北京100853

目的通过全外显子测序筛查胃癌高频突变基因，探讨这些基因的突变型和野生型在胃癌临床病理表型上的差异。方法随机收集2016年1至3月就诊于解放军总医院普通外科的30例胃癌组织及术前外周血，采用二代基因测序方法，以正常血白细胞为对... 详细信息

目的通过全外显子测序筛查胃癌高频突变基因，探讨这些基因的突变型和野生型在胃癌临床病理表型上的差异。方法随机收集2016年1至3月就诊于解放军总医院普通外科的30例胃癌组织及术前外周血，采用二代基因测序方法，以正常血白细胞为对照，识别肿瘤样本突变的基因。选取突变频率高于TP53的基因为高频突变。对比分析高频突变基因的突变型与野生型在年龄、性别、部位、分化程度、淋巴结转移数等常见临床病理表型上的差异。结果共检出27个胃癌相关高频突变基因，大多数与临床病理表型无关。TAS2R43突变型和野生型在胃体癌中差异有统计学意义（55.6%与9.5%，P＝0.022），ANKRD36C突变型和野生型在胃体癌中差异有统计学意义（62.5%与9.1%，P＝0.005），ANKRD36突变型和野生型在近端胃癌中差异也具有统计学意义（8.33%与44.4%，P＝0.049），SYNE1突变型转移淋巴结数目较野生型少（8.8±9.5与2.1±2.4, P＝0.006），ADAR突变型发病年龄较低（50.7±11.5）与（64.0±9.8）岁，P＝0.006。结论TAS2R43、ANKRD36、ANKRD36C突变与胃癌发生部位相关，SYNE1突变型与少淋巴结转移的胃癌相关，ADAR突变与低龄胃癌相关。

关键词：全外显子测序胃癌突变表型

全外显子测序技术在危重症新生儿遗传病中的应用价值

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国当代儿科杂志 2020年第12期22卷 1261-1266页

作者：陈玉兰张又祥杨秀芳陈简李晓彤黄慕华阮静维林蔷广州医科大学广东广州510000 中山市人民医院新生儿科广东中山528400 广州市第一人民医院广东广州510000

目的探讨全外显子组测序(WES)技术在危重新生儿遗传病中的应用价值。方法选取于该院新生儿重症监护室治疗的66例疑似遗传病或诊断不明的危重新生儿为研究对象。收集患儿临床资料,采集患儿及其父母静脉血行WES检测,完成遗传病因诊断。结... 详细信息

目的探讨全外显子组测序(WES)技术在危重新生儿遗传病中的应用价值。方法选取于该院新生儿重症监护室治疗的66例疑似遗传病或诊断不明的危重新生儿为研究对象。收集患儿临床资料,采集患儿及其父母静脉血行WES检测,完成遗传病因诊断。结合患儿的临床表现寻找相关的致病基因变异。结果66例疑似遗传病或诊断不明的危重新生儿中,男34例,女32例,其中通过WES检测出有基因变异14例(21%);1例患儿经WES检测未见有基因变异,但因临床表现高度怀疑为色素失禁症,联合多重连接酶探针依赖扩增技术,检测到IKBKG基因4~10号外显子的杂合缺失变异。15例检测出基因变异的患儿中,致病性基因变异10例(67%);可疑致病性基因变异1例(7%);基因变异意义未明4例(27%)。15例患儿中有13例行染色体检查,只有1例染色体异常。结论染色体检查不能作为遗传病的确诊手段,WES检测技术是寻找疑似或诊断不明的危重新生儿遗传病的重要工具,然而WES技术有一定的局限性,可联合其他测序方法进行检测。

关键词：遗传病全外显子测序染色体新生儿

全外显子测序揭示原发中枢神经系统淋巴瘤的基因突变特征

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国实验血液学杂志 2024年第3期32卷 756-762页

作者：金祺祺蒋皓云韩叶李翠翠张丽田吴重阳兰州大学第二医院血液科甘肃兰州730030 西安市中心医院血液科陕西西安710000

目的:对18例原发中枢神经系统淋巴瘤(PCNSL)患者肿瘤组织进行全外显子测序,探索PCNSL的基因突变特点。方法:收集2018年9月至2020年12月在兰州大学第二医院病理科确诊的18例免疫功能正常(无HIV及服用免疫抑制剂病史)、病理类型为弥漫大B... 详细信息

目的:对18例原发中枢神经系统淋巴瘤(PCNSL)患者肿瘤组织进行全外显子测序,探索PCNSL的基因突变特点。方法:收集2018年9月至2020年12月在兰州大学第二医院病理科确诊的18例免疫功能正常(无HIV及服用免疫抑制剂病史)、病理类型为弥漫大B细胞淋巴瘤的PCNSL患者肿瘤组织,进行基于高通量测序的全外显子测序,平均测序深度>100×。测序结果经数据处理及生物信息学分析,得到患者的基因突变全景及突变特征。结果:18例患者均检测到明显的体细胞突变,中位体细胞突变数目为321,以错义突变为主(约占90%),突变类型以C>T为主(占50.2%),反映了与年龄相关的突变模式;前15位高频突变基因中,PSD3、DUSP5、MAGEB16、TELO2、FMO2、TRMT13、AOC1、PIGZ、SVEP1、IP6K3、TIAM1为驱动基因。驱动基因通路富集结果显示,RTK-RAS、Wnt、NOTCH、Hippo、Cell-Cycle通路明显富集。各样本的肿瘤突变负荷在3.558 48/Mb-8.780 89/Mb之间,平均突变负荷4.953 32/Mb,与TCGA数据库中其他肿瘤的研究队列相比明显增高。结论:PCNSL频繁发生体细胞的错义突变,以点突变为主,突变类型主要为C>T。驱动基因主要参与RTK-RAS、Wnt、NOTCH、Hippo通路信号传导,表明以上通路可能与PCNSL发病机制相关。PCNSL有显著的高肿瘤突变负荷,这或许是PD-1抑制剂治疗PCNSL有效的原因之一。

关键词：原发中枢神经系统淋巴瘤全外显子测序体细胞突变肿瘤突变负荷

全外显子测序发现CREBBP基因突变影响卵巢癌的发生机制

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

安徽医科大学学报 2022年第5期57卷 695-701页

作者：苏丹郭晓霞岳军梅劼四川省医学科学院·四川省人民医院妇产科成都610072

目的利用全外显子测序寻找与卵巢癌发生发展相关的分子靶标,并进行体外细胞实验验证其可能影响卵巢癌发生的机制。方法本研究通过对8对浆液性卵巢癌组织进行全外显子测序,验证实验进一步对另外43个浆液性卵巢癌组织和156位正常女性的外... 详细信息

目的利用全外显子测序寻找与卵巢癌发生发展相关的分子靶标,并进行体外细胞实验验证其可能影响卵巢癌发生的机制。方法本研究通过对8对浆液性卵巢癌组织进行全外显子测序,验证实验进一步对另外43个浆液性卵巢癌组织和156位正常女性的外周血标本进行目的基因测序。在体外实验中用Lipofectamine 3000做载体,将含CREBBP基因L1850fs和P1373S突变的质粒转染人浆液性卵巢癌细胞株A2780,以含CREBBP野生型的质粒和空载体为对照,采用Western blot法检测CREBBP的L1850fs和P1373S突变对环磷腺苷效应元件(CREB)的结合蛋白(CBP)蛋白表达的影响;CCK-8检查L1850fs和P1373S突变对细胞增殖的影响;Transwell小室试验检测L1850fs和P1373S突变对细胞迁移的影响;划痕试验检测L1850fs和P1373S突变对细胞侵袭的影响。结果通过全外显子测序发现了浆液性卵巢癌的2个高频突变位点——CREBBP的L1850fs(c.5548dupC)和P1373S(c.4117C>T)。L1850f是移码突变,P1373S是非同义序列。在51例浆液性卵巢癌病例中(全外显子测序8例,目的基因测序43例),CREBBP基因的突变率为41.2%,而正常女性外周血中突变率为21.8%,差异有统计学意义(χ^(2)=7.4,P=0.007)。Western blot结果显示,L1850fs突变能降低卵巢癌细胞中其相应CBP蛋白的表达,而P1373S突变对蛋白表达无影响。CCK-8分析表明,突变型CREBBP可促进卵巢癌细胞增殖。Transwell小室试验结果显示L1850fs和P1373S突变可促进卵巢癌细胞迁移。划痕试验分析表明,CREBBP基因突变可提高卵巢癌细胞侵袭能力。结论本实验通过全外显子测序发现了浆液性卵巢癌相关的两个点突变,CREBBP L1850fs和P1373S。进一步的细胞实验表明该突变可以通过影响CBP蛋白促进卵巢癌细胞增殖、侵袭、转移等,提示CREBBP L1850fs和P1373S可能成为卵巢癌诊断及治疗的新靶点。

关键词：浆液性卵巢癌全外显子测序 CREBBP 基因突变

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology) 2014年第9期15卷 830-839页

作者： Ji-jia LIU Liang-liang FAN Jin-lan CHEN Zhi-ping TAN Yi-feng YANG Department of Cardiothoracic Surgery the Second Xiangya HospitalCentral South University Department of Cell Biology School of Life SciencesCentral South University Center of Clinical Gene Diagnosis and Therapy the State Key Laboratory of Medical Geneticsthe Second Xiangya HospitalCentral South University

研究目的:寻求该房间隔缺损家系遗传致病原因。创新要点:1.鉴定出一个全新的家族性房间隔缺损相关性TBX20突变;2.首次使用全外显子测序结合先天性心脏病相关基因过滤的方法来研究小家系遗传致病因素;3.TBX20的T-box DNA结合域的突变与... 详细信息

研究目的:寻求该房间隔缺损家系遗传致病原因。创新要点:1.鉴定出一个全新的家族性房间隔缺损相关性TBX20突变;2.首次使用全外显子测序结合先天性心脏病相关基因过滤的方法来研究小家系遗传致病因素;3.TBX20的T-box DNA结合域的突变与先天性心脏病有关。研究方法:对一个临床发现的房间隔缺损家系(图1a)的先证者进行全外显子测序,运用公共数据库过滤后,使用先天性心脏病相关基因再次过滤,得到了19个候选基因;然后,运用SIFT、Polyphen-2和MutationTaster等软件预测,排除了13个多态性位点(表2);最后,运用共分离检测(聚合酶链式反应产物直接测序),找到该家系致病的遗传因素,即TBX20基因发生了错义突变(D176N)(图2),该突变位点在ESP和dbSNP数据库中也未曾发现,且该位点在多种生物中高度保守(图1c)。重要结论:1.本研究发现的TBX20突变(D176N)是该房间隔缺损家系致病的原因,同时该突变位点为世界上首次报道;2.全外显子测序结合先天性心脏病相关基因过滤是一个分析小家系遗传致病因素的有效又经济的方法。

关键词：先天性心脏病房间隔缺损全外显子测序先天性心脏病相关基因 TBX20

全外显子测序探寻绝经后骨质疏松症脾肾阳虚证相关基因的研究

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

全外显子测序探寻绝经后骨质疏松症脾肾阳虚证相关基因的研究

作者：满艺璁辽宁中医药大学

学位级别：硕士

目的:运用全外显子测序技术筛选绝经后骨质疏松症脾肾阳虚证患者的全外显组变异位点,并通过NCBI进行文献查阅确认其可能的致病基因。材料与方法:本研究选取绝经后骨质疏松症脾肾阳虚证患者8例作为PMO病例组,健康绝经后女性8例作为健康... 详细信息

目的:运用全外显子测序技术筛选绝经后骨质疏松症脾肾阳虚证患者的全外显组变异位点,并通过NCBI进行文献查阅确认其可能的致病基因。材料与方法:本研究选取绝经后骨质疏松症脾肾阳虚证患者8例作为PMO病例组,健康绝经后女性8例作为健康对照组,均抽取外周静脉血提取DNA,DNA样本质检合格后进行全外显子捕获及高通量测序,对测序结果进行质量评估及变异分析,然后通过组间对比筛选得到与疾病相关的基因变异,最后对变异基因进行生物信息学分析及NCBI文献查阅,进一步确定可能的致病基因。结果:1.通过全外显子测序和变异位点分析,16例样本共检测出550933个SNP变异位点和36262个In Del变异位点。经过罕见突变筛选、有害性筛选、组间对比筛选及ACMG分类后,最终得到候选基因83个。2.对候选基因进行富集分析,发现其参与转录的正向调节、DNA模板化等生物学过程,参与调节蛋白质消化吸收、嘌呤代谢、ECM-受体相互作用等途径。3.对候选基因进行基因-疾病关联排序,纳入关联性前20的候选基因在NCBI中查阅相关文献,进一步确定疾病的可能致病基因为CREB1、FOXO3、WNT16。结论:1.通过全外显子测序发现绝经后骨质疏松症脾肾阳虚证患者体内存在大量基因变异位点,突变位点与健康绝经后女性对比差异性明显。2.绝经后骨质疏松症脾肾阳虚证的候选基因可能参与转录的正向调节,DNA模板化等生物学过程,参与调节蛋白质消化吸收、嘌呤代谢、ECM-受体相互作用等途径。3.CREB1、FOXO3、WNT16可能是绝经后骨质疏松症脾肾阳虚证患者的致病基因,但仍需大样本实验进行验证。

关键词：绝经后骨质疏松症脾肾阳虚证全外显子测序致病基因

全外显子测序技术在骨骼发育不良胎儿产前诊断中的应用

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国妇产科临床杂志 2023年第4期24卷 413-415页

作者：韩小亚张玢周玲娜王晶虞斌常州市妇幼保健院常州医学中心南京医科大学江苏常州213001

目的探讨全外显子测序技术(whole exome sequencing,WES)对超声提示骨骼发育不良(skeletal dysplasia,SD)胎儿进行产前诊断的临床应用价值。方法2019年1月至2021年9月,在常州市妇幼保健院经常规产前超声筛查发现的20例骨骼发育不良胎儿... 详细信息

目的探讨全外显子测序技术(whole exome sequencing,WES)对超声提示骨骼发育不良(skeletal dysplasia,SD)胎儿进行产前诊断的临床应用价值。方法2019年1月至2021年9月,在常州市妇幼保健院经常规产前超声筛查发现的20例骨骼发育不良胎儿,取羊水细胞后同时进行胎儿染色体核型、染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)及WES检测,并留取父母外周血样本进行一代测序验证。结果20例SD胎儿产前诊断结果发现1例致病性拷贝数变异(copy number variants,CNV);15例存在致病/可能致病的基因突变(FGFR3、COL2A1、COL1A1、COL1A2、RUNX2、LMX1B、GLI3、DYNC2H1和ALPL),其中8例为新发突变(FGFR3、COL2A1、COL1A1);1例为临床意义不明的TBX4基因突变;3例未见异常。结论超声发现的SD胎儿,核型检查和CMA不宜作为一线产前诊断技术,产前WES应作为其重要的分子遗传检测工具。

关键词：胎儿骨骼发育不良全外显子测序产前诊断遗传咨询

全外显子测序检测10p15.3微缺失综合征一例

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华医学遗传学杂志 2019年第4期36卷 331-335页

作者：陈文杰符娜梁晶晶秦炯北京大学人民医院儿科 100044

目的探讨1例10p15.3微缺失综合征的临床及分子遗传学特征。方法分析患儿的临床表现和全外显子测序结果;结合文献分析10p15.3微缺失相关的临床及分子生物学特征。结果患儿主要表现为智力运动发育迟滞,语言及言语发育障碍,肌张力低下等异... 详细信息

目的探讨1例10p15.3微缺失综合征的临床及分子遗传学特征。方法分析患儿的临床表现和全外显子测序结果;结合文献分析10p15.3微缺失相关的临床及分子生物学特征。结果患儿主要表现为智力运动发育迟滞,语言及言语发育障碍,肌张力低下等异常。全外显子测序发现患儿10号染色体短臂远端ZMYND11、DIP2C、LARP4B、TUBB8、GTPBP4、IDI2、IDI1、WOR37及ADARB2基因存在杂合缺失。其中ZMYND11基因已明确与发育障碍和智力损伤有关。患儿的临床表型与10p15.3微缺失综合征相吻合。结论该患儿的ZMYND11基因单倍型不足可能是导致10p15.3微缺失综合征神经精神发育障碍相关临床表型的主要原因。

关键词： 10p15.3微缺失综合征 ZMYND11基因全外显子测序神经精神发育障碍