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重症肌无力的免疫亚型和临床特点

中国神经精神疾病杂志 1991年第2期17卷 65-68页

作者：吕传真郝中顺乔健上海医科大学神经病学研究所

以ABC—ELISA法检测了220例成年人重症肌无力病者血清中IgG-Ach-Rab和IgG PrMab。根据检测抗体的阳性发现和临床特点,将重症肌无力分为四组:(Ⅰ)IgG-AchRab阳性,(Ⅱ)IgG-PrMab阳性,(Ⅲ)IgG-AchRab和IsG-PrMab均阳性,(Ⅳ)IgG-AchRab和IgG-PrMab均在正常范围。分析各组临床特点和对激素治疗反应认为:(1)型病者病程较长,激素治疗即时效果好,但易复发;(2)型病程短,激素治疗效果好,而且无复发;(3)型病程也短,激素治疗和胸腺切除效果较差,合并其它自身免疫病的机会高;(4)型激素治疗反应差,胸腺切除治疗效果好。

关键词：重症肌无力免疫亚型激素

维吾尔族和汉族弥漫性大B细胞淋巴瘤患者免疫亚型与预后的关系

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广东医学 2014年第16期35卷 2552-2555页

作者：赵盼盼胡欣郭莉刘炜李妍杨顺娥新疆医科大学附属肿瘤医院淋巴瘤与乳腺内科乌鲁木齐830011

目的探讨维吾尔族、汉族弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者不同免疫亚型的预后及影响预后的因素。方法分析确诊的维吾尔族、汉族DLBCL患者167例,应用Hans分型方法分为GCB和non-GCB型,研究维吾尔族、汉族两免疫亚型的预后及影响预后的相关... 详细信息

目的探讨维吾尔族、汉族弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者不同免疫亚型的预后及影响预后的因素。方法分析确诊的维吾尔族、汉族DLBCL患者167例,应用Hans分型方法分为GCB和non-GCB型,研究维吾尔族、汉族两免疫亚型的预后及影响预后的相关因素。结果年龄、IPI评分、结外受侵情况、Ann Arbor分期、CD10、Mum-1及免疫亚型是影响DLBCL患者预后的因素。年龄、结外受侵及免疫亚型可独立影响DLBCL患者的预后,P值分别为0.007、0.000和0.001。结论 GCB型较non-GCB型预后好;民族与预后之间无相关性;老年、高IPI评分、有结外受侵、Ⅲ期和Ⅳ期、CD10阴性、Mum-1阳性及non-GCB型的DLBCL患者预后差;年龄、结外受侵情况和免疫亚型是DLBCL预后的独立影响因素。

关键词：淋巴瘤弥漫性大B细胞免疫亚型维吾尔族预后

放射基因组学分析头颈部鳞状细胞癌成像特征与免疫亚型的关系

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临床放射学杂志 2021年第11期40卷 2074-2078页

作者：吴林永唐业欢李晴赵羽佳郎思远林苗苗杨红何云广西医科大学第一附属医院超声科南宁530021 广西医科大学第一附属医院放射科南宁530021

目的基于放射基因组学探索头颈部鳞状细胞癌(HNSC)成像特征与免疫亚型的关系。方法对105例HNSC患者的CT增强影像和免疫相关基因数据进行分析。在Intelligence Foundry software软件对CT图像的1022个成像特征进行提取。采用k均值聚类算法... 详细信息

目的基于放射基因组学探索头颈部鳞状细胞癌(HNSC)成像特征与免疫亚型的关系。方法对105例HNSC患者的CT增强影像和免疫相关基因数据进行分析。在Intelligence Foundry software软件对CT图像的1022个成像特征进行提取。采用k均值聚类算法对1707个免疫相关基因聚类以得到最佳的免疫亚型,进一步以假设检验筛选在免疫亚型中差异显著的特征。COX回归预后模型通过差异特征进行构建并得到风险评分。分析免疫亚型、风险评分与总生存期的关系。结果免疫亚型分为A型和B型,B型提示HNSC患者预后更差。10个特征在免疫亚型中差异显著,并由5个特征构建相关成像特征预后风险评分。风险评分鉴别不同免疫亚型的曲线下面积(AUC)值为0.715,高风险评分提示HNSC患者预后更差。免疫亚型、风险评分与总生存期具有相关关系。此外,免疫亚型、风险评分与免疫检查点基因密切相关。结论本研究对HNSC的CT成像特征与免疫相关基因关联性进行分析,结果表明免疫亚型、成像特征构建的风险评分和总生存期具有一定的平行相关关系。放射基因组学分析尝试性通过成像特征非侵入性获得免疫亚型信息,可为免疫靶向治疗开拓新的视角。

关键词：放射基因组学体层摄影术 X线计算机成像特征免疫亚型预后

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基于多组学鉴定肝细胞癌新抗原及免疫亚型

基于多组学鉴定肝细胞癌新抗原及免疫亚型

作者：谢庆余南方医科大学

学位级别：硕士

背景:免疫治疗作为一种针对泛癌种的有效治疗方式,在肝细胞癌治疗中却只有部分患者能够获益。越来越多的证据表明,免疫分型可以表明肿瘤及其免疫微环境的综合免疫状态且与免疫治疗反应密切相关,新抗原疫苗也有显著的临床疗效。目的:本... 详细信息

背景:免疫治疗作为一种针对泛癌种的有效治疗方式,在肝细胞癌治疗中却只有部分患者能够获益。越来越多的证据表明,免疫分型可以表明肿瘤及其免疫微环境的综合免疫状态且与免疫治疗反应密切相关,新抗原疫苗也有显著的临床疗效。目的:本研究旨在识别肝细胞癌中有效的新生抗原,从多组学角度解析其免疫分型并构建免疫图谱。方法:我们基于159例肝细胞癌组织和癌旁组织的全外显子组测序数据,并结合RNA高通量测序、蛋白质丰度以及磷酸化丰度数据,预测了肝细胞癌患者的新抗原。联合新抗原数据与多组学数据,我们识别了预后相关新抗原基因,并分析其与免疫抗原呈递细胞浸润水平的相关性。基于随机森林方法,提取多组学最重要的特征,构建肝细胞癌多维度免疫亚型,分析免疫亚型之间的临床特征、基因组特征以及免疫活性机制。结果:我们在肝细胞癌组织中共识别9920个能够产生新抗原(neoantigen)的基因,基于新抗原产生的频率共识别185个肝细胞癌中共有的新抗原,并使用Cox回归分析,识别28个与总生存时间(Overall survival,OS)相关的基因,12个与无复发生存时间(Recurrence-free suvival,RFS)相关的基因,其中6个基因(USH2A,DNAH6,MUC5B,ZNF831,AHNAK 和 SYNE1)与 OS 和 RFS 同时相关。我们整合肿瘤中共有新抗原相关基因的RNA和蛋白质水平表达、免疫细胞浸润水平和免疫通路活性得分,利用随机森林方法筛选前30个最重要特征,并构建肝细胞癌多维度免疫亚型。基因组特征分析识别了四种亚型的特异性基因,发现基因TP53更倾向于在Subtype 1中发生突变(P=0.00073),基因CTNNB1更倾向于在Subtype 2中发生突变(P=0.00076),而基因AXIN1更倾向于在Subtype 4中发生突变(P=0.037),Subtype 1表现出更高的拷贝数变异频率和同源重组修复缺陷评分,Subtype 2和Subtype 3则表现出更高的肿瘤突变负荷和基因组不稳定性。此外,我们发现免疫原性细胞死亡调节剂、免疫检查点以及肝细胞癌预后标志物在四种免疫亚型中也有差异表达。结论:本研究中我们识别了两种新抗原基因(ZNF831和SYNE1)有望成为肝细胞癌疫苗治疗的潜在位点,同时构建了肝细胞癌多维度免疫亚型,各免疫亚型存在不同的免疫微环境,不仅能够提供预后预测作用,也能为未来指导免疫治疗提供帮助。

关键词：肝细胞癌多组学数据新抗原免疫治疗免疫亚型预后分析

结合分子亚型和免疫分型构建侵袭性膀胱癌免疫亚型

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结合分子亚型和免疫分型构建侵袭性膀胱癌免疫亚型

作者：陈自豪南方医科大学

学位级别：硕士

背景:肿瘤亚型的发现和发展是目前癌症个性化治疗的重要组成部分,准确地将侵袭性膀胱癌症患者分类到不同的肿瘤亚型能够临床决策提供重要的参考价值。随着基因测序技术的快速发展,研究者更加方便获取肿瘤患者的高通量测序数据,为人们在... 详细信息

背景:肿瘤亚型的发现和发展是目前癌症个性化治疗的重要组成部分,准确地将侵袭性膀胱癌症患者分类到不同的肿瘤亚型能够临床决策提供重要的参考价值。随着基因测序技术的快速发展,研究者更加方便获取肿瘤患者的高通量测序数据,为人们在基因水平上研究肿瘤患者的个体差异和肿瘤发生、发展及转移机制创造了机会。目前基于免疫检查点抑制剂的免疫疗法在膀胱癌治疗上逐渐受到重视,但是免疫疗法对整体膀胱癌患者反应率较低。因此建立可以预测评估免疫治疗下患者获益的免疫亚型是膀胱癌治疗的研究重点。研究方法:以403例来源于肿瘤基因图谱计划(TCGA)数据库膀胱癌患者肿瘤组织的测序数据为训练集,通过聚类分析得到肿瘤分子亚型;利用CD8+T细胞百分数以及TMB值构建免疫分型;基于得到的肿瘤分子亚型和免疫分型构膀胱癌免疫亚型。通过生存分析、免疫检查点基因和免疫相关指标评估训练集中免疫亚型与免疫的关系。下载包含192例接受PD-1免疫检查点抑制剂治疗的转移性膀胱癌患者的临床试验数据,将其设置为验证集。在验证集上验证评估免疫亚型对免疫治疗客观反应率以及患者获益情况的影响。研究结果:在TCGA数据集样本中,48%(193/403)的患者为Basal(基底)亚型,而52%(210/403)为Luminal(管腔)亚型。Basal亚型相关基因主要富集在肿瘤侵袭、转移、免疫等相关生理过程。较高的CD8+T细胞百分数、较高的TMB值与膀胱癌患者良性转归正相关(P= 0.003)。根据免疫相关特征构建免疫分型:TypeⅠ型(CD8+Thigh/TMBhigh)、TypeⅡ型(CD8+Thigh/TMBlow;CD8+Tlow/TMBhigh)、TypeⅢ型(CD8+Tlow/TMBlow)。TypeⅠ型患者总体生存显著优于TypeⅡ型和TypeⅢ型患者。基于上述得到的分子亚型以及免疫分型构建膀胱癌免疫亚型,免疫亚型中BasalⅠ亚型(Basal with TypeⅠ)亚型相比于其他免疫亚型,有着最高的客观反应率和预后,同时其客观反应率优于免疫分型TypeⅠ。研究结论:1、侵袭性膀胱癌中存在两个具有截然不同特征的两个亚型,其中Basal亚型相较于Luminal亚型有着更高的病理分级,恶性程度更高且预后更差。2、在膀胱癌组织中,CD8+T细胞分数和TMB是膀胱的独立预后因素,且两者显著相关。3、免疫分型中,TypeⅠ型对免疫治疗客观反应率及预后显著优于TypeⅡ型和TypeⅢ型。4、免疫亚型中BasalⅠ亚型对免疫治疗客观反应率及预后显著优于其他亚型,其客观反应率达到60%,因此可以将免疫亚型作为免疫检查点抑制剂治疗前评估方案。

关键词：膀胱癌亚型肿瘤突变负荷免疫治疗免疫亚型

一致性聚类鉴定两种不同的胰腺导管腺癌免疫亚型

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临床医学进展 2023年第7期13卷 10787-10795页

作者：洪叶枫王凤娇王帅帅张文忠青岛大学医学部山东青岛青岛大学附属医院心血管内科山东青岛

胰腺导管腺癌早期诊断困难,容易发生肝转移,致死率极高。肿瘤微环境内免疫细胞,纤维细胞与肿瘤细胞之间相互的作用形成了胰腺癌复杂的肿瘤微环境并在其进展过程中发挥了重要作用。免疫治疗在黑色素瘤,结直肠癌,胃癌等晚期肿瘤取得重大突... 详细信息

胰腺导管腺癌早期诊断困难,容易发生肝转移,致死率极高。肿瘤微环境内免疫细胞,纤维细胞与肿瘤细胞之间相互的作用形成了胰腺癌复杂的肿瘤微环境并在其进展过程中发挥了重要作用。免疫治疗在黑色素瘤,结直肠癌,胃癌等晚期肿瘤取得重大突破,显著延长了病人生存周期。然而在胰腺癌中,免疫检查点抑制剂应答率仅为5%,疗效有限。大量研究表明,免疫细胞丰度与病人预后,免疫治疗疗效相关。了解不同胰腺癌免疫亚型之间潜在的调节机制,有助于开发免疫治疗新靶点,指导临床精准用药并预测免疫治疗疗效。本研究通过对145例胰腺癌患者免疫评分,基质评分及肿瘤纯度一致性聚类,鉴定出两种不同的胰腺癌免疫亚型。差异分析,富集分析及蛋白互作网络发现了30个调控肿瘤微环境的hub基因。随后单细胞测序数据分析发现这些hub基因在肿瘤细胞中密度最高,这些基因可能是调控肿瘤细胞与免疫细胞,纤维细胞的关键基因。在形成胰腺癌免疫抑制的肿瘤微环境时发挥了重要作用,可能是胰腺癌免疫治疗的新靶点。

关键词：胰腺导管腺癌免疫亚型一致性聚类单细胞测序

血浆ctDNA与弥漫大B细胞淋巴瘤免疫亚型及预后相关性

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分子诊断与治疗杂志 2023年第10期15卷 1728-1732页

作者：刘京伟许风霞周倩山东省临沂市中心医院(山东第一医科大学附属临沂医院)检验科山东临沂276400

目的探讨血浆ctDNA与弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)免疫亚型及预后的相关性。方法选取2018年4月至2021年4月山东省临沂市中心医院94例DLBCL患者为研究对象,检测ctDNA表达,分析血浆ctDNA表达与病理特征及免疫亚型的关系,COX回归分析DLBCL患... 详细信息

目的探讨血浆ctDNA与弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)免疫亚型及预后的相关性。方法选取2018年4月至2021年4月山东省临沂市中心医院94例DLBCL患者为研究对象,检测ctDNA表达,分析血浆ctDNA表达与病理特征及免疫亚型的关系,COX回归分析DLBCL患者预后影响因素,并分析ctDNA、免疫亚型评估DLBCL患者预后的交互作用。结果 DLBCL患者ctDNA阳性率达82.98%(78/94);IPI评分高风险患者ctDNA阳性表达率高于IPI评分低风险患者,ⅡB~Ⅳ患者ctDNA阳性表达率高于Ⅰ~ⅡA患者,Bcl-2/MYC双表达患者ctDNA阳性表达率高于无Bcl-2/MYC双表达患者,差异有统计学意义(P免疫亚型对DLBCL患者不良预后存在正向交互作用。结论 DLBCL患者ctDNA检测阳性率较高,且与病理特征、免疫亚型及预后有关,有望成为疗效与预后预测标志物。

关键词：弥漫大B细胞淋巴瘤循环肿瘤DNA 免疫亚型

免疫化疗时代弥漫大B细胞淋巴瘤免疫学亚型的预后意义

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肿瘤研究与临床 2015年第11期27卷 748-753页

作者：李燕刘虹木合塔拜尔安利王晓敏新疆维吾尔自治区人民医院血液科乌鲁木齐830001

目的探讨弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者免疫学亚型在预后评价中的意义，以及利妥昔单抗对免疫组织化学标志预后意义的影响。方法回顾性分析186例初治DLBCL患者的病例资料，按照国际预后指数分为相对高危组及相对低危组，两组分别根据... 详细信息

目的探讨弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者免疫学亚型在预后评价中的意义，以及利妥昔单抗对免疫组织化学标志预后意义的影响。方法回顾性分析186例初治DLBCL患者的病例资料，按照国际预后指数分为相对高危组及相对低危组，两组分别根据治疗方案分为化疗组（CHOP）及免疫化疗组（R—CHOP），应用免疫组织化学方法及Hans分型对各组患者进行免疫分型，采用***检验比较免疫学亚型在不同预后分组及不同治疗方案DLBCL患者中的预后意义。结果186例DLBCL患者中，化疗组中生发中心型（GCB型）5年总生存（OS）率明显高于非生发中心型（non—GCB型）（58．82％比32．00％，X2=8．482，P=0．004），而免疫化疗组中GCB型与non-GCB型5年0s率差异无统计学意义（72．97％比61．54％，X2=2．694，P=0．101）。免疫化疗组中non—GCB型的5年OS率较化疗组升高，差异有统计学意义（61．54％比32．00％，x2=7．385，P=0．007）。低危组107例中，化疗组及免疫化疗组中GCB型和nod—GCB型5年OS率差异均无统计学意义（均P〉0．05），GCB型及non—GCB型中化疗组与免疫化疗组5年OS率差异均无统计学意义（均P〉0．05）。高危组79例中，化疗组中GCB型和non-GCB型的5年0s率差异有统计学意义（40．00％比22．72％，X2=3．978，P=O．045）；免疫化疗组中GCB型和non—GCB型的5年OS率差异无统计学意义（62．50％比42.31％．X2=2．072．P=0．150）。结论采用免疫组织化学方法将初治DLBCL分为两种免疫学亚型，对于早期判断预后、指导治疗具有一定的意义。在利妥昔单抗时代，免疫组织化学分型的预后预测价值可能较以往有所降低。利妥昔单抗可显著提高non-GCB型DLBCL患者的疗效，但是对GCB型患者生存期的影响还需进一步探讨。

关键词：淋巴瘤,大B细胞,弥漫型免疫亚型预后利妥昔单抗

肺腺癌免疫微环境特征基因对患者生存时间及ICB疗效的预测价值

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中国医科大学学报 2023年第5期52卷 438-446页

作者：刘烨妹李梦玲吴胜男李思宇赵闯中国医科大学附属盛京医院药学部沈阳110004 中国医科大学附属第一医院临床流行病学与循证医学教研室沈阳110001 中国医科大学附属第一医院肿瘤内科二病房沈阳110001 中国医科大学附属第一医院全科医学教研室沈阳110001 中国医科大学附属盛京医院普通外科沈阳110004

目的探讨肺腺癌免疫微环境特征基因以及相关基因对患者生存时间及免疫检查点抑制剂(ICB)疗效的预测价值。方法使用非负矩阵分解(NMF)聚类分析在癌症基因图谱(TCGA)数据库肺腺癌患者测序数据集(TCGA-LUAD)中鉴定不同的免疫亚型,并对免疫... 详细信息

目的探讨肺腺癌免疫微环境特征基因以及相关基因对患者生存时间及免疫检查点抑制剂(ICB)疗效的预测价值。方法使用非负矩阵分解(NMF)聚类分析在癌症基因图谱(TCGA)数据库肺腺癌患者测序数据集(TCGA-LUAD)中鉴定不同的免疫亚型,并对免疫亚型进行肿瘤纯度评估、免疫应答评分(TIDE评分)、肿瘤突变负荷(TMB)分析以及基因组DNA拷贝数变异(CNV)分析。对GSE136961数据集和TCGA-LUAD数据集中的基因表达进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)。使用R语言中ClusterProfiler包对获得的基因进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路分析;利用Cytoscape的regulon模块进行转录调控网络分析;使用SPSS 25.0统计软件绘制Kaplan-Meier曲线进行生存分析。结果TCGA-LUAD数据集中鉴定出C1、C22种免疫亚型。2种免疫亚型中,C2免疫亚型的免疫应答评分显著高于C1免疫亚型(P免疫亚型TIDE评分、TMB低于C1免疫亚型(均P免疫耐受以及生存相关的基因。GO富集分析和KEGG通路分析结果显示10种基因主要与DNA损伤以及细胞周期通路相关。转录调控网络分析结果显示E2F4是与免疫耐受相关5个基因(BRCA1、BRCA2、FOXM1、MELK、TUBB)的转录调控因子。2种免疫亚型中进行E2F4及与免疫耐受相关5种基因的表达及生存分析结果显示,E2F4、BRCA1、BRCA2、FOXM1、MELK、TUBB在免疫活性低以及免疫应答差的C1亚型显著高表达。结论转录调控因子E2F4及与免疫耐受相关5个基因(BRCA1、BRCA2、FOXM1、MELK、TUBB)高表达预测肺腺癌患者具有较短的生存时间和较差的免疫疗效。

关键词：肺腺癌肿瘤免疫微环境免疫亚型免疫微环境特征基因生物信息学分析

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