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新疆草兔的种群遗传结构和亚种分化

Zoological Research 2011年第2期32卷 179-187页

作者：单文娟刘江马合木提.哈力克新疆大学生命科学与技术学院新疆乌鲁木齐830046 云南大学生物资源保护与利用重点实验室云南昆明650091

新疆草兔(Lepus capensis)的群体遗传结构至今无系统的研究报道,亚种水平的分类也长期存在争议。该文测定了形态分类上的新疆草兔3个亚种共87个个体的线粒体DNA(mtDNA)控制区(control region,D-Loop)592bp的序列,经分析发现148个多态性... 详细信息

新疆草兔(Lepus capensis)的群体遗传结构至今无系统的研究报道,亚种水平的分类也长期存在争议。该文测定了形态分类上的新疆草兔3个亚种共87个个体的线粒体DNA(mtDNA)控制区(control region,D-Loop)592bp的序列,经分析发现148个多态性位点,共定义了44个单倍型。新疆草兔的单倍型多样度(h,0.977±0.005)和核苷酸多样度(π,0.064±0.031)都较高,显示了较高的遗传多样性。分子变异分析(AMOVA)结果显示,4个地理群体间的显著分化可能是由地理隔离造成的。群体遗传结构分析显示,新疆草兔包含4个进化枝,并且每个进化枝都对应特定的分布区域,显示了明显的系统地理结构。该研究的结果支持形态分类上草兔西域亚种(L.c.lehmanni)的分类地位;但中亚亚种(L.c.centrasiaticus)被分为两个独立的进化枝,提示可能存在两个亚种;帕米尔亚种(L.c.pamirensis)与其他亚种间的遗传距离在13%以上,提示其可能已达到种的分化水平。

关键词：草兔线粒体DNA 控制区群体遗传多样性亚种分化

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全球虎的亚种分化及生存现状

湖北林业科技 2022年第5期51卷 52-56,17页

作者：朱舜华葛继稳杨诗雨中国地质大学(武汉)环境学院生物科学与技术系武汉430074 中国地质大学(武汉)生态环境研究所湿地演化与生态恢复湖北省重点实验室武汉430074

近年人们对虎的起源历史、亚种分化和现状愈加关注。为全面了解全球虎的各个亚种的历史和现状,结合国内外研究资料,总结了虎的历史分布、亚种分化及分布、已灭绝亚种种群的历史和现存种群的情况。

关键词：虎亚种分化历史分布区现存种群

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中国西南部明纹花鼠三个亚种的分化

Zoological Research 2005年第4期26卷 446-452页

作者：李松冯庆杨君兴王应祥中国科学院昆明动物研究所

明纹花鼠是东南亚地区的特有种,在中国有3亚种(阿萨姆亚种、滇西亚种、滇南亚种),分布于藏东南、云南西南部和南部。以往主要根据外部形态特征进行分类。为探讨3亚种头骨性状的差异,在测量15个性状的基础上,运用统计分析软件SPSS11.0对... 详细信息

明纹花鼠是东南亚地区的特有种,在中国有3亚种(阿萨姆亚种、滇西亚种、滇南亚种),分布于藏东南、云南西南部和南部。以往主要根据外部形态特征进行分类。为探讨3亚种头骨性状的差异,在测量15个性状的基础上,运用统计分析软件SPSS11.0对其可测量性状进行多变量分析。结果及推测如下:①明纹花鼠3个亚种的地位是确定的。②在头骨15个性状中,两两亚种之间具有显著差异的性状:阿萨姆亚种与滇西亚种有8个(枕鼻长、吻宽、颧宽、眶间宽、后头宽、鼻骨宽、下齿列、下颌骨高);阿萨姆亚种与滇西亚种有7个(颅全长、枕鼻长、颧宽、眶间宽、后头宽、下颌高、下颌骨高);滇西亚种与滇南亚种有4个(吻宽、后头宽、鼻骨宽、下颌高)。③滇南亚种与滇西亚种之间的亲缘关系近于两者各自与阿萨姆亚种之间的亲缘关系。

关键词：明纹花鼠亚种分化中国西南部分类

基于微卫星标记的中国大陆地区野猪种群结构分析与亚种分化

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动物学报 2008年第5期54卷 753-761页

作者：张保卫张晨岭陈建琴丁栋李崇奇周开亚常青江苏省生物多样性与生物技术重点实验室南京师范大学生命科学学院南京210097 江苏教育学院生物系南京210013

对中国大陆地区分布的野猪亚种分类尚存在争议。本研究通过对野猪11个微卫星位点的变异分析,探讨了中国大陆地区野猪的遗传结构,以期对野猪亚种分类问题有所启迪。对野猪华北、华南和东北种群的分析表明,各种群基因库中都维持了较高的... 详细信息

对中国大陆地区分布的野猪亚种分类尚存在争议。本研究通过对野猪11个微卫星位点的变异分析,探讨了中国大陆地区野猪的遗传结构,以期对野猪亚种分类问题有所启迪。对野猪华北、华南和东北种群的分析表明,各种群基因库中都维持了较高的遗传变异水平。基于遗传距离构建的系统树分析发现,研究中所涉及的所有亚种在系统树中混杂,没有任何亚种在其中构成显著的支系。基于微卫星变异的FCA分析不能区分华南、华北、东北三个种群。基于Fst检验的遗传差异分析发现,长江两侧的华南、华北种群之间的遗传差异较小(Fst=0.014),表明长江两侧的野猪可能存在着较高水平的基因流,长江并非是一个有效的空间隔离;东北地区野猪和华北、华南地区野猪之间的遗传差异相对较大(Fst=0.040、0.042),东北野猪可以作为独立的亚种S.s.ussuricus。

关键词：野猪亚种微卫星遗传结构亚种分化

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中国狼的种内系统发育关系与亚种分化

东北林业大学学报 2003年第5期31卷 81-83页

作者：罗理杨金煜杨公社西北农林科技大学杨凌712100 东北林业大学

通过对来自 5个地区、11个亚地区的 4 3个中国狼 (Canislupuschanco)样品的mtDNA分析 ,得到了 14个单倍类型。应用Mega 2 .1计算机软件包构建了NJ树。系统树的拓扑图显示 ,中国狼的母系群体来源于两个世系 ,且世系 1要比世系 2古老。此... 详细信息

通过对来自 5个地区、11个亚地区的 4 3个中国狼 (Canislupuschanco)样品的mtDNA分析 ,得到了 14个单倍类型。应用Mega 2 .1计算机软件包构建了NJ树。系统树的拓扑图显示 ,中国狼的母系群体来源于两个世系 ,且世系 1要比世系 2古老。此外 ,无论是在亚地区还是在地区的群体间 ,都存在明显的基因交流 ,使得地区间和地区内群体的遗传分化不明显。但是 ,结合序列分析、拓扑结构图和遗传距离分析认为 ,青藏和西南群体与我国其它地区群体具有等同的分类地位。

关键词：中国狼系统发育亚种分化 mtDNA分析单倍类型计算机软件包系统树拓扑图显示遗传分化

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生在树上,长在水里--中华秋沙鸭

天天爱科学 2024年第5期 12-17页

作者：徐六一不详

中华秋沙鸭是中国最古老的一种野鸭,它是第三纪冰川末期的孑遗物种,在地球上已经生存了1000多万年,被称为“鸟中活化石”。中华秋沙鸭是我国独有的珍稀鸟类,因此人们在它的名字前冠以“中华”二字。中华秋沙鸭中华秋沙鸭(Mergussquamat... 详细信息

中华秋沙鸭是中国最古老的一种野鸭,它是第三纪冰川末期的孑遗物种,在地球上已经生存了1000多万年,被称为“鸟中活化石”。中华秋沙鸭是我国独有的珍稀鸟类,因此人们在它的名字前冠以“中华”二字。中华秋沙鸭中华秋沙鸭(Mergussquamatus)是雁形目鸭科秋沙鸭属鸟类,无亚种分化。全长约49—63厘米,鼻孔位于嘴峰中部,羽冠长而明显,成双冠状。此外,像凤头一样,脑后那两簇冠羽也是它的特有标志。不过,它最为醒目的特征还是两胁羽毛上的黑色鳞纹,其早先的名字“鳞胁秋沙鸭”即由此而得。

关键词：中华秋沙鸭孑遗物种亚种分化雁形目嘴峰冠羽鸭科珍稀鸟类

沙日温都自治区级自然保护区栗斑腹鹀保护现状及建议

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内蒙古林业 2024年第4期 20-22页

作者：张静姜卫东李方祯崔楠敖门达来胡日查内蒙古自治区林业和草原保护总站内蒙古沙日温都自治区级自然保护区管理局内蒙古自治区林业科学研究院

栗斑腹鹀(Embriza jankowskii)是一种小型草原鸟类,为单型种,无亚种分化,属于雀形目鹀科鹀属,俗称红肚麻。其主要特点是腹部具有一心形的栗色大斑。雄、雌鸟均具暗褐色虹膜;暗褐色圆锥形喙,上喙颜色较深,下喙较浅;雌性体长147.58±6.8毫... 详细信息

栗斑腹鹀(Embriza jankowskii)是一种小型草原鸟类,为单型种,无亚种分化,属于雀形目鹀科鹀属,俗称红肚麻。其主要特点是腹部具有一心形的栗色大斑。雄、雌鸟均具暗褐色虹膜;暗褐色圆锥形喙,上喙颜色较深,下喙较浅;雌性体长147.58±6.8毫米,胸前栗色大斑面积较小.

关键词：栗斑腹鹀亚种分化雀形目雌鸟单型种自然保护区鹀属现状及建议

树麻雀的遗传多样性分析及亚种分化的初步研究

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树麻雀的遗传多样性分析及亚种分化的初步研究

作者：张苗苗河北师范大学

学位级别：硕士

树麻雀(Passer montanus)在自然界的分布极为广泛,适应性较强,与人类的关系较为密切。自20世纪80年代以来,我国对于树麻雀的研究较少,用分子生物学方法对其的研究几乎是空白。本文对树麻雀的遗传多样性及亚种分化进行初步研究,期望为其... 详细信息

树麻雀(Passer montanus)在自然界的分布极为广泛,适应性较强,与人类的关系较为密切。自20世纪80年代以来,我国对于树麻雀的研究较少,用分子生物学方法对其的研究几乎是空白。本文对树麻雀的遗传多样性及亚种分化进行初步研究,期望为其研究提供基础资料。论文包括两个部分,第一部分通过测定河北省62只树麻雀线粒体DNA D-loop基因的部分序列,分析河北省树麻雀的遗传多样性;第二部分通过测定来自我国四个地区的15只树麻雀线粒体Cyt b基因全序列,初步研究我国树麻雀部分亚种的分化情况。主要结论如下:1、线粒体DNA D-loop基因序列平均长度为741bp,所有序列平均A+T含量为57%,G+C含量为43%,A+T含量高于G+C含量。共检测到32个变异位点,占4.44%,其中简约信息位点6个,单核苷酸变异位点26个。2、运用MEGA软件分析树麻雀线粒体DNA D-loop基因,结果为核苷酸多样性(Pi)为0.0021±0.0004;单倍型多样性(h)为0.755±0.057。在32个变异位点中,共统计到22个单倍型。单倍型的系统发生树结果表明,河北省树麻雀种群没有发生进化分歧现象。3、核苷酸错配曲线呈现单峰泊松分布;Fu's Fs检验呈现偏离中性突变,综合这两个结果可以推测出树麻雀种群历史上曾发生过扩张现象。4、线粒体Cyt b基因全序列长度为1143bp。所有序列平均碱基组成腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)分别为27.0%、22.9%、14.8%和35.3%。嘧啶(T+C)的含量为58.2%,嘌呤(A+G)含量为41.8%,嘧啶含量高于嘌呤含量。同义密码子的使用存在着很大偏倚。5、所有线粒体Cyt b基因全序列共统计到9个缺失/插入位点,1110个保守位点、24变异位点、7个简约信息位点、17个单核苷酸变异位点。转换频率高于颠换频率,R值为2.0。其中,密码子第一、二位点核苷酸替换频率较低,远远未达到饱和;第三位点达到饱和。6、采用Jukes-Cantor方法估计所有序列间碱基替换平均值d=0.004。因此用p-距离表示遗传距离,各种群间的遗传距离为0.0038～0.0058;两两序列之间的遗传距离为0～0.010。采用MEGA软件中的非参数-Tajima法对核苷酸替代速率进行检验,结果显示主要分支的替换速率相同,存在着相对恒定的分子钟。因此估算出树麻雀的分化时间约为0.19～0.29Ma。

关键词：树麻雀 DNA D-loop基因 Cyt b基因遗传多样性亚种分化

红尾副鳅的亚种分化及其动物地理分析(英文)

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Zoological Research 1994年第S1期15卷 58-67,0页

作者：杨君兴陈银瑞 MauriceKottelat 中国科学院昆明动物研究所昆明650223 Route

红尾副鳅（Paracobitis variegtus）广泛分布于黄河、长江和南盘江水系的上游。其背鳍分枝鳍条数目、前鼻孔的形态、头部斑纹、须的长度和前躯的被鳞程度等特征均表明红尾副鳅已分化为两个亚种。两个亚种的分布在地理上是相互隔离的:红... 详细信息

红尾副鳅（Paracobitis variegtus）广泛分布于黄河、长江和南盘江水系的上游。其背鳍分枝鳍条数目、前鼻孔的形态、头部斑纹、须的长度和前躯的被鳞程度等特征均表明红尾副鳅已分化为两个亚种。两个亚种的分布在地理上是相互隔离的:红尾副鳅指名亚种（P.variegatus variegatus）的分布范围限于黄河、长江水系的上游;而新亚种长鳍副鳅（P.variegatus longidorsalis）则仅分布于南盘江的上游。亚种的分化可能与晚更新世时滇东高原的急剧抬升有关。本文还讨论了Nemachilus berezowskii Gunther 1896和Nemacheilusoxygnathus Regan 1908的分类地位。经查看其模式标本,认为上述两个名称应为红尾副鳅指名亚种的同物异名。

关键词：红尾副鳅亚种分化新亚种动物地理