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EGFR基因非翻译区单核苷酸多态性与胃癌遗传易感性之间的关系

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肿瘤 2013年第4期33卷 321-326页

作者：张军峰张春兵姚学权杨亚平吴娟杨学文赵旺胜佟书娟邱红詹瑧南京中医药大学基础医学院病原与免疫学教研室江苏南京210023 南京中医药大学中西医结合学科江苏南京210023 江苏省中医院检验科江苏南京210029 江苏省中医院消化肿瘤外科江苏南京210029 江苏省人民医院检验科江苏南京210029 中国人民解放军第八一医院检验科江苏南京210002

目的:分析表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因非翻译区单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与江苏省胃癌患者遗传易感性之间的关系。方法:收集387例胃癌患者和392例健康体检者(正常对照)的... 详细信息

目的:分析表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因非翻译区单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与江苏省胃癌患者遗传易感性之间的关系。方法:收集387例胃癌患者和392例健康体检者(正常对照)的外周血,采用聚合酶链式反应-连接酶检测反应检测EGFR基因非翻译区rs6965469、rs884225、rs884904和rs763317等4个SNPs位点,分析其与胃癌遗传易感性之间的关系。结果:EGFR基因非翻译区rs6965469、rs884225、rs884904和rs763317的等位基因在胃癌组和健康对照组间的分布差异无统计学意义(P>0.05)。rs6965469TC基因型在胃癌组和正常对照组间的分布差异有统计学意义(P区间(condence interval,CI)=2.34～5.29],而单倍型TAG则显著降低胃癌的患病风险(OR=0.41,95%CI=0.26～0.64)。结论:EGFR基因非翻译区T等位基因可能是胃癌发生的风险因素,联合检测rs6965469、rs884225和rs884904的SNPs有助于评估江苏地区胃癌的遗传易感性。

关键词：胃肿瘤表皮生长因子受体非翻译区多态性单核苷酸

中国汉族人群UGT1A1基因非翻译区序列分析

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中国实验血液学杂志 2015年第2期23卷 522-525页

作者：孙顺昌陈群蓉陈曦彭运生深圳市宝安区人民医院中心实验室广东深圳518101 深圳市宝安区人民医院输血科广东深圳518101

目的:对中国汉族人群尿苷二磷酸葡糖醛酸基转移酶1A1(uridine diphosphate glucuronosyltransferase 1A1,UGT1A1)基因的5'和3'-非翻译区序列进行分析,寻找非翻译区的多态性变异。方法:收集220例健康汉族个体的外周血,并抽提基因组DNA,... 详细信息

目的:对中国汉族人群尿苷二磷酸葡糖醛酸基转移酶1A1(uridine diphosphate glucuronosyltransferase 1A1,UGT1A1)基因的5'和3'-非翻译区序列进行分析,寻找非翻译区的多态性变异。方法:收集220例健康汉族个体的外周血,并抽提基因组DNA,通过聚合酶链反应扩增UGT1A1基因的5'和3'-非翻译区,通过测序确定DNA序列。结果:在中国汉族人群中UGT1A1基因的5'非翻译区存在2个多态性位点:-64(G/C)和TATAA盒区A(TA)6TAA/A(TA)7TAA;-64位G频率为98.4%,C频率为1.6%。TATAA盒中A(TA)6TAA频率为93.4%,A(TA)7TAA频率为6.6%。3'非翻译区也存在2个多态性位点:1813C/T和1941C/G,所有个体在1813和1941位点均呈纯合性,且1813C和1941C呈遗传共分离(单倍型频率为73.6%),1813T和1941G(单倍型频率为26.4%)呈遗传共分离。结论:中国汉族人群UG T1A1基因的3'-非翻译区1813和1941纯合多态性位点呈遗传共分离可能是基因组自然选择的结果,其机制有待进一步研究。

关键词：中国汉族人群 UGT1A1基因非翻译区

真核生物mRNA非翻译区结构特征与mRNA翻译

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中国生物化学与分子生物学报 2016年第9期32卷 990-993页

作者：潘昱婷徐麒麟康波四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室成都611130

真核生物中蛋白质合成通常在翻译水平受到调控,而mRNA非翻译区与mRNA翻译之间关系密切。真核生物mRNA非翻译区长度、mRNA二级结构、GC含量、顺式作用元件与反式作用因子、mRNA帽端结构和多聚腺苷酸尾等结构对翻译具有重要的调控作用。... 详细信息

真核生物中蛋白质合成通常在翻译水平受到调控,而mRNA非翻译区与mRNA翻译之间关系密切。真核生物mRNA非翻译区长度、mRNA二级结构、GC含量、顺式作用元件与反式作用因子、mRNA帽端结构和多聚腺苷酸尾等结构对翻译具有重要的调控作用。本文就真核生物mRNA非翻译区结构特征对其翻译的影响做一综述。

关键词： mRNA 非翻译区翻译

来源于砂梨和桃的苹果褪绿叶斑病毒分离物部分CP基因和3'端非翻译区的序列分析

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植物病理学报 2013年第1期43卷 104-109页

作者：王利平洪霓宋艳苏王俊珍马小方胡国君王国平华中农业大学植物科学技术学院武汉430070 华中农业大学湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室武汉430070

苹果褪绿叶斑病毒（Apple chlorotic leaf spot virus，ACLSV）是引起果树病害的一种重要病毒。ACLSV寄主范围广、发生较普遍，可侵染苹果、梨等仁果类果树和桃、扁桃、李、樱桃、杏等核果类果树，据报道我国梨产区感染ACLSV达80％以上。

关键词：苹果褪绿叶斑病毒序列分析非翻译区 CP基因砂梨分离物 ACLSV 核果类果树

人组织型纤溶酶原激活剂(t-PA)mRNA5′端非翻译区(UTR)对其表达的调控

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科学通报 1995年第10期40卷 950-953页

作者：欧阳应斌黄培堂黄翠芬军事医学科学院生物工程研究所北京100850

人组织型纤溶酶原激活剂(t-PA)在人体纤溶与凝血的平衡调控中发挥重要作用,而且在治疗心血管栓塞性疾病方面具有广阔的应用前景.t-PA在人体内的表达受严格调控,其mRNA具有较长的非翻译区序列.我们曾报道了t-PA mRNA 3′-UTR对其表达的调... 详细信息

人组织型纤溶酶原激活剂(t-PA)在人体纤溶与凝血的平衡调控中发挥重要作用,而且在治疗心血管栓塞性疾病方面具有广阔的应用前景.t-PA在人体内的表达受严格调控,其mRNA具有较长的非翻译区序列.我们曾报道了t-PA mRNA 3′-UTR对其表达的调控,为研究长约209nt的5′-UTR序列对t-PA表达的影响.本文采用反转录-PCR技术从黑色素瘤细胞中克隆出t-PA cDNA 5′端序列,在体外和体内2个系统中研究了5-′UTR序列对t-PA表达的影响.

关键词：纤溶酶原激活剂非翻译区 RNA t-PA

TMV-RNA非翻译区对外源基因在整体植物中表达水平的影响

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科学通报 2000年第6期45卷 617-622页

作者：秦红敏郭洪年贾燕涛李利红田颖川中国科学院微生物研究所北京100080

利用ＧＵＳ基因及ＴＭＶ－ＲＮＡ非翻译区序列构建了４种ＧＵＳ基因的植物表达载体，即ｐＢＧ４３７，ｐＢＧ４３８，ｐｓＧ４４０和ｐＢＧ４４０△ＮＯＳ．在这４种表达载体中带双增强子的３５５启动子的下游分别由ＧＵＳ－ＮＯＳ， ... 详细信息

利用ＧＵＳ基因及ＴＭＶ－ＲＮＡ非翻译区序列构建了４种ＧＵＳ基因的植物表达载体，即ｐＢＧ４３７，ｐＢＧ４３８，ｐｓＧ４４０和ｐＢＧ４４０△ＮＯＳ．在这４种表达载体中带双增强子的３５５启动子的下游分别由ＧＵＳ－ＮＯＳ， Ω－ＧＵＳ－ＮＯＳ， Ω－ＧＵＳ－３＇ＵＴＲ组成４个不同的表达框架．转基因烟草ＧＵＳ活性检测表明，转ｐＢＧ４４０植株的ＧＵＳ活性是转ｐＢＧ４３７的５倍，是转ｐＢＧ４３８的１．６倍；转ｐＢＧ４３８的ＧＵＳ活性是转ｐＢＧ４３７的３．２倍；转ｐＢＧ４４０△ＮＯＳ的植株均没有检测到活性．在前３组植物之间ＧＵＳ表达水平的差异达显著水平．同样载体在另一种烟草中进行瞬间表达的结果与上述基本一致．以上结果在整体植株水平上证明Ω片段能显著提高外源基因的表达水平，但与用原生质体体系所得的结果有所不同，在转基因植物中３＇ＵＴＲ似乎不能起ｐｏｌｙ（Ａ）的作用，也不能作为转录终止子．Ω片段与ＴＭＶ３＇ＵＴＲ区共同作用时，提高外源基因表达水平的效果更好．

关键词： TMV-RNA 非翻译区外源基因基因表达

白纹伊蚊细胞色素P450 CYP6N亚家族新成员5’-及3’-非翻译区序列功能分析

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中国人兽共患病杂志 2001年第4期17卷 36-39,53页

作者：周国理黄炯烈吴瑜王玲中山医科大学寄生虫学教研室广州510080

目的　获得白纹伊蚊细胞色素P45 0CYP6N亚家族新成员 5’ -及 3’ -非翻译区 (untranslatedregion ,UTR)核苷酸序列 ,并进行功能分析。方法　以本文作者已获得的白纹伊蚊溴氰菊酯抗性株一新的细胞色素P45 0CYP6基因cDNA片段 ,设计 1对... 详细信息

目的　获得白纹伊蚊细胞色素P45 0CYP6N亚家族新成员 5’ -及 3’ -非翻译区 (untranslatedregion ,UTR)核苷酸序列 ,并进行功能分析。方法　以本文作者已获得的白纹伊蚊溴氰菊酯抗性株一新的细胞色素P45 0CYP6基因cDNA片段 ,设计 1对特异性引物 ,以反向引物 ,进行 5’ -cDNA末端快速扩增 (rapidamplificationofcDNAends ,RACE) ,以正向引物进行 3’ -RACE。然后分别进行克隆、测序和鉴定 ,以获得 5’ -UTR和 3’ -UTR ,并运用PC/GENE软件分析其功能。结果　获得CYP6N亚家族中两个新成员 5’ -UTR及 3’ -UTR ;其结构特征包括 :两个新成员前导序列均为 46个核苷酸 ;起始密码子ATG两侧核苷酸 - 3位是A、+ 4位是T ;5’ -UTR区域无稳定性的发卡结构 ;终止密码子在CYP6N3为TAA、在CYP6N4为TAG ,紧挨其 3’端核苷酸分别为A和G ,翻译产物羧基端均为亮氨酸。结论　成功地获得了白纹伊蚊细胞色素P45 0CYP6N亚家族两个新成员 5’ -及 3’ -非翻译区序列 ,进一步分析表明该两个新成员均能进行有效翻译 ,昆虫细胞色素P45 0基因翻译起始调控与翻译终止调控有部分类似于脊椎动物mRNA的翻译调控 ,但具有多态性的特点。

关键词：白纹伊蚊细胞色素 P450 CYP6N亚家族非翻译区

SARS-CoV-2非翻译区结构与宿主蛋白相互作用研究

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SARS-CoV-2非翻译区结构与宿主蛋白相互作用研究

作者：马斐越河北大学

学位级别：硕士

目前全球范围内新冠疫情肆虐,严重威胁人类的生命健康,阻碍人们正常生活和社会经济发展。充分了解SARS-CoV-2病毒的生命周期和致病机制有助于获得针对性的疫苗和治疗药物。迄今关于SARS-CoV-2在细胞中复制转录的具体分子机制尚不清楚,... 详细信息

目前全球范围内新冠疫情肆虐,严重威胁人类的生命健康,阻碍人们正常生活和社会经济发展。充分了解SARS-CoV-2病毒的生命周期和致病机制有助于获得针对性的疫苗和治疗药物。迄今关于SARS-CoV-2在细胞中复制转录的具体分子机制尚不清楚,已证实宿主蛋白在病毒基因组的表达调控中起着重要作用,鉴定分析其功能有助于了解病毒的致病机制。SARS-CoV-2病毒感染进入细胞后,全长正链基因组RNA充当复制和转录的模板,产生全长负链RNA和负链亚基因组RNA。已知冠状病毒5’和3’UTR在病毒复制、翻译以及逃避细胞抗病毒过程中发挥重要作用,亚基因组RNA与基因组RNA具有相同的5’先导序列和3’UTR,并且复制、转录中间体负链RNA和负链亚基因组RNA的UTR也是复制转录复合物结合启动合成正链RNA的重要区域,而目前对与之结合的宿主蛋白的种类和功能了解甚少。因此,本文将探究与SARS-CoV-2正链和负链UTR相互作用的宿主蛋白,并将UTR作为抗病毒药物的靶点设计合成筛选靶向切割RNA的脱氧核酶,以期更深入地了解新冠病毒的作用机制,为新冠药物的研发提供理论依据。本文采用pGM-T载体构建SARS-CoV-2正链和负链5’UTR、3’UTR的克隆载体,酶切四种pGM-T-UTR载体后通过体外转录合成RNA,将RNA的3’末端连接生物素化分子,利用RNA pulldown技术分别获得与正链和负链5’UTR、3’UTR相互作用的宿主蛋白,采用蛋白质谱技术鉴定与之结合的蛋白分子并进行分析,结果显示不同UTR结合的宿主蛋白存在差异,与正链或负链3’UTR结合的蛋白分子明显多于5’UTR。SARSCoV-2正链5’UTR、3’UTR分别鉴定得到5个、36个潜在结合的宿主蛋白,负链3’UTR鉴定得到62个潜在结合的宿主蛋白。与UTR结合的蛋白涉及翻译调控、肌动蛋白丝组装、细胞骨架调节等生物过程。利用药物基因相互作用数据库对上述103种蛋白进行分析,其中14种蛋白存在具有抑制作用的药物。同时预测了SARS-CoV-2正链和负链5’UTR、3’UTR二级结构,对其二级结构进行初步解析,选取四条RNA序列中AU碱基作为切割位点,设计并合成61条特异的脱氧核酶分子。通过体外切割实验和双荧光素酶报告基因实验评估其在体外和细胞内的作用效果,综合评价得到切割活性显著的22条脱氧核酶作为进一步研究对象。本研究结果为深入揭示宿主蛋白与SARS-CoV-2RNA的相互作用、进一步阐明SARS-CoV-2的致病机理提供了实验依据,为以RNA为靶点的SARS-CoV-2药物研究提供基础。

关键词：严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型非翻译区宿主蛋白脱氧核酶

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原癌基因LMO2 5’非翻译区序列研究

云南大学学报（自然科学版） 1999年第S3期21卷 325-326页

作者：张立冬刘志霈张杰朱天慧南开大学医学院天津300071