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采用非标记定量技术对变形链球菌耐氟菌株的差异蛋白质组学研究

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采用非标记定量技术对变形链球菌耐氟菌株的差异蛋白质组学研究

基于LC-MS/MS技术研究全血和血斑蛋白组学差异及其法医学应用探索

全国第八次牙体牙髓病学学术会议

作者：张志民赵洪岩朱来宽吉林大学口腔医学院牙体牙髓病科

目的:获得变形链球菌耐氟菌株与其亲代菌株的差异蛋白。方法:制备变形链球菌和变形链球菌耐氟菌株蛋白溶液,胰蛋白酶酶解,对酶解产物进行在线色谱分离并连接质谱分析,利用Decyder MS软件和SEQ UEST软件分析质谱数据。结果:发现并鉴定了... 详细信息

目的:获得变形链球菌耐氟菌株与其亲代菌株的差异蛋白。方法:制备变形链球菌和变形链球菌耐氟菌株蛋白溶液,胰蛋白酶酶解,对酶解产物进行在线色谱分离并连接质谱分析,利用Decyder MS软件和SEQ UEST软件分析质谱数据。结果:发现并鉴定了明显差异蛋白67种,其中包括了部分致龋毒力因子。与粘附有关的2种,为葡萄糖基转移酶和细胞表面粘附素PAC,其中葡萄糖基转移酶S表达上调,葡萄糖基转移酶Ⅰ、葡萄糖基转移酶Si和细胞表面粘附素PAC表达下调;与产酸相关的一种,为乳酸脱氢酶,表达上调;与耐酸相关的4种,为F-ATP酶β-亚单位、信号识别颗粒蛋白质亚单位Ffh、分子伴侣DnaK和伴侣蛋白GroEL,表达均下调。结论:构建了变形链球菌耐氟菌株的差异蛋白质表达谱,为以后进一步研究变形链球菌和变形链球菌耐氟菌株致龋毒力因子相关基因及其编码的蛋白的功能打下基础。

关键词：变形链球菌耐氟菌株差异蛋白质组学非标记定量技术

来源： cnki会议评论

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基于LC-MS/MS技术研究全血和血斑蛋白组学差异及其法医学应用探索

作者：黄傲苏州大学

学位级别：硕士

[目的]1.探究形成干燥血斑前后蛋白组学的变化;2.讨论不同储存时间内干燥血斑蛋白质的稳定性;3.验证外周血特异性、年龄相关生物标志物在全血和血斑中的稳定性。[方法]1.根据实验目的选择具有高分辨率、高性能和高稳定性的液相色谱串联... 详细信息

[目的]1.探究形成干燥血斑前后蛋白组学的变化;2.讨论不同储存时间内干燥血斑蛋白质的稳定性;3.验证外周血特异性、年龄相关生物标志物在全血和血斑中的稳定性。[方法]1.根据实验目的选择具有高分辨率、高性能和高稳定性的液相色谱串联质谱技术(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)和非标记定量(label-free quantitative,LFQ)方法。2.经胰蛋白酶处理全血、血斑、血浆和血细胞组织裂解所得的蛋白质样本后进行质谱蛋白组学检测,得到质谱检测的原始文件后,基于样本特异性数据库配对结果进行肽段和蛋白水平的质控分析,然后根据定量结果经R软件limma包对全血和血斑蛋白组学进行组间差异性分析,再对差异蛋白质进行生物学功能、信号通路和亚细胞定位分析,从而探讨蛋白质丰度变化下的潜在机制。3.干燥血斑室温放置0天、10天、20天、1个月、2个月、3个月和6个月后超低温保存。经质谱检测后,对不同放置时间梯度间检测的蛋白质数量和丰度的差异进行统计学分析。4.通过文献检索,分别比较文献报道的12个外周血特异性和13个年龄相关生物标志物在血液和血斑中的稳定性。[结果]1.本研究使用质谱技术从外周血中检测到的肽段总数为7348个,其中特异性肽段7006个,检测蛋白质总数为758个。在错误率不低于1%、蛋白质至少含有一个特异性肽段、以及在至少两组生物学重复中被检测到的条件下,全血、血斑、血浆和血细胞中分别鉴定出623、596、258和485个蛋白质。2.全血和血斑中有572个表达的蛋白质重叠,其皮尔逊相关系数为0.9926,将表达差异倍数设置为1.5倍且校正P值小于0.05为差异蛋白质筛选标准时,有15个蛋白质其丰度在两组间有统计学差异,其中7个在血斑中上调,8个在血斑中下调。3.对储存6个月及以内血斑蛋白组学定性定量结果间的比较表明,血斑蛋白组学较为稳定,不同储存时间组间的皮尔逊相关系数均大于0.99。除了 FKBP1A外,其他蛋白质其丰度随着存储时间均无显著统计学差异。4.外周血特异性和年龄相关生物标志物在基于LC-MS/MS的全血和血斑蛋白质组中的检出率为66.7%和23.1%,可成功检出的标志物其蛋白丰度在全血和血斑中不存在显著差异。[结论]1.经质谱检测血液蛋白组学的方法灵敏度高,在蛋白组学定性定量可重复性好、一致性高,全血与血斑蛋白质丰度具有强相关性,血浆与全血、血斑和血细胞中蛋白组学差异较大。2.在外周血形成干燥血斑时,大部分蛋白质丰度均无显著性改变,其蛋白质丰度的显著性改变可能与细胞内源性蛋白质和结构蛋白的变化相关。3.室温下保存6个月及以内的干燥血斑蛋白组学统计学差异不显著,其质量基本上可满足下游实验以及法医学鉴定的要求。4.外周血特异性生物标志物在全血和血斑中检出率高,蛋白质表达水平稳定,适用于外周血与其他体液的法医学鉴定。年龄相关生物标志物检出率较低,在法医学年龄推断中,建议将其作为一种补充检测方法。

关键词：蛋白组学全血血斑液相色谱串联质谱技术非标记定量技术

应用液相色谱串联质谱技术对WHV/C-myc转基因肝癌小鼠模型的蛋白质组学研究

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应用液相色谱串联质谱技术对WHV/C-myc转基因肝癌小鼠模型的蛋白...

作者：袁新雨中国科学院研究生院（上海生命科学研究院）

学位级别：硕士

癌症是严重威胁人类健康的重大疾病,而肝癌又是在世界范围内第五位,国内第二位的恶性肿瘤。肝癌在临床上检出较晚,恶性程度较高,5年生存率只有6%左右。因而,对包括肝癌在内的绝大多数癌症来说,除了不断推进临床治疗手段的进步,其早期发... 详细信息

癌症是严重威胁人类健康的重大疾病,而肝癌又是在世界范围内第五位,国内第二位的恶性肿瘤。肝癌在临床上检出较晚,恶性程度较高,5年生存率只有6%左右。因而,对包括肝癌在内的绝大多数癌症来说,除了不断推进临床治疗手段的进步,其早期发现也是提高患者生存率的关键途径之一。因此,筛选有效的肝癌早期检测标志物具有很高的临床意义和应用前景。而转基因肝癌小鼠模型为开展癌症的早期研究提供了很好的样本,将其与大规模整体性的蛋白质组学研究手段结合,大大提高了筛选肝癌标志物的效率。以2个月的WHV/c-myc转基因小鼠和正常对照小鼠(各3只)的肝组织样品为研究样本,运用基于二维液相色谱串联质谱的蛋白质组学非标记定量技术,得到4832种含有定量信息的蛋白质。采用随机配对t检验筛选出323种具有统计学意义(p非标记定量蛋白质组学技术,结合生物信息学分析手段,在分析WHV/c-myc转基因小鼠肝组织的异常变化方面展示出很好的能力,是一种有效的针对多样本的定量蛋白质组学研究策略和思路。对筛选出的差异表达蛋白质的深入研究,在明确转基因小鼠模型癌症发生的早期生物学事件的同时,必将为发掘更加可靠和有效的肝癌早期检测标志物提供有益的线索。

关键词：原发性肝癌蛋白质组学肿瘤标志物二维液相色谱串联质谱非标记定量技术生物信息学系统聚类分析主成分分析分子功能注释

旋毛虫肌幼虫与新生幼虫、雌性成虫与雄性成虫比较蛋白质组学研究

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旋毛虫肌幼虫与新生幼虫、雌性成虫与雄性成虫比较蛋白质组学研究

作者：张萌萌南京农业大学

学位级别：硕士

旋毛虫病是由旋毛形线虫引起的一种呈全球性分布的人兽共患食源性寄生虫病,可感染人及150多种动物,通过生食或半生食感染旋毛虫的肉品而感染,严重时可导致死亡。旋毛虫的生活史包括三个主要阶段:新生幼虫、肌幼虫和成虫,成虫阶段又分为... 详细信息

旋毛虫病是由旋毛形线虫引起的一种呈全球性分布的人兽共患食源性寄生虫病,可感染人及150多种动物,通过生食或半生食感染旋毛虫的肉品而感染,严重时可导致死亡。旋毛虫的生活史包括三个主要阶段:新生幼虫、肌幼虫和成虫,成虫阶段又分为雌虫和雄虫。蛋白质组学是近年来快速发展的新型学科,它能够提供关于蛋白表达的定量信息以及翻译后蛋白修饰和蛋白定位的信息,定量蛋白质组学中的非标记定量技术(Label-freequantification)以其耗费低、对样品操作少、高通量和高精确度得到了人们越来越多的重视。本试验首次应用Label-free定量技术对旋毛虫新生幼虫、肌幼虫、雌性和雄性成虫的蛋白质组进行了定量分析和比较,鉴定到了期特异性和性别特异性蛋白,并对新生幼虫和肌幼虫间的显著差异表达蛋白果糖-1,6-二磷酸酶进行了克隆和原核表达,获得了重组蛋白,检测了其抗原性和酶活性。1.旋毛虫肌幼虫与新生幼虫的比较蛋白质组学研究应用蛋白质组学方法中的Label-free技术比较分析了旋毛虫肌幼虫与新生幼虫的虫体全蛋白。共鉴定到1936个蛋白质,其中差异性表达蛋白1180个。差异性表达蛋白包括期特异性蛋白质395个(肌幼虫期特异性蛋白291个,新生幼虫期特异性蛋白104个);丰度上有显著差异的蛋白质785个(ratio>2.0或ratio10的蛋白196个,差异倍数.>100的蛋白22个。对1180个显著性差异表达蛋白进行生物信息学分析,在Gene Ontology(GO)分析中共1003条蛋白序列被4931条GO功能条目注释;KEGG通路注释中,共提取到与574个差异蛋白序列相关的444条KEGG信号/代谢通路。2.旋毛虫雄性与雌性成虫的比较蛋白质组学研究应用Label-free定量比较蛋白质组学方法比较分析了旋毛虫雌性成虫与雄性成虫的虫体全蛋白。共鉴定到1877个蛋白质,其中差异性表达蛋白279个。差异性表达蛋白包括性别特异性蛋白92个(雌虫特异性蛋白55个,雄虫特异性蛋白37个);丰度上有显著差异的蛋白187个(ratio>2.0或ratio10的蛋白5个)。对279个显著性差异表达蛋白进行生物信息学分析,GO分析发现139条蛋白序列被540条GO功能条目注释;KEGG通路注释中,共提取到与68个差异蛋白序列相关的101条KEGG信号/代谢通路。3.旋毛虫果糖-1,6-二磷酸酶基因的克隆表达及生物学特性分析根据GenBank上公布的旋毛虫果糖-1,6-二磷酸酶(fructose-1,6-bisphosphatase,FBP)基因序列,设计一对特异性引物,以旋毛虫总RNA为模板,用RT-PCR技术扩增出一条约为1Kb的DNA片段。测序结果表明该片段包含FBP的完整ORF,长1,026 bp,编码341个氨基酸。BLAST分析发现其核酸和氨基酸序列与已知旋毛虫FBP的基因和氨基酸序列的相似性分别为99%和100%。将该ORF亚克隆到pET-32a(+)载体中,酶切鉴定正确后转化感受态大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导表达,SDS-PAGE分析,结果表明该融合蛋白大小为55.4kDa,重组蛋白主要以包涵体的形式表达。Western blot结果显示该重组蛋白能被旋毛虫感染小鼠血清识别。对纯化、复性的重组蛋白进行了酶活性测定,结果发现该重组酶的最适pH为7.0,最适温度为37℃。

关键词：旋毛虫非标记定量技术新生幼虫肌幼虫雌虫雄虫果糖-1 6-二磷酸酶

儿童先天性脊柱侧弯半椎体终板软骨的蛋白质组学研究

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儿童先天性脊柱侧弯半椎体终板软骨的蛋白质组学研究

作者：刘晶晶郑州大学

学位级别：硕士

目的运用非标记定量技术筛选出先天性脊柱侧弯（Congenital Scoliosis,CS）患者半椎体终板软骨和正常椎体终板软骨中差异表达的蛋白质,并对其进行生物信息学分析,明确其在CS中的作用,进一步探讨CS的发病机制。方法选择2019年01月～2020... 详细信息

目的运用非标记定量技术筛选出先天性脊柱侧弯（Congenital Scoliosis,CS）患者半椎体终板软骨和正常椎体终板软骨中差异表达的蛋白质,并对其进行生物信息学分析,明确其在CS中的作用,进一步探讨CS的发病机制。方法选择2019年01月～2020年10月于我院确诊并行手术治疗的CS患者作为研究对象。纳入标准:有完整的临床资料;结合病史,体格检查和辅助检查,确诊为CS;能够获得符合要求的组织样本;征得家属知情同意。排除标准:临床资料不完整;其他原因引起的脊柱侧弯畸形,如特发性脊柱侧弯、脊柱外伤、脊柱肿瘤等;无法获得符合要求的组织样本;未征得家属知情同意。本次研究已获得郑州大学第三附属医院伦理委员会审批。将手术中切除的半椎体终板软骨及相邻正常椎体终板软骨分别作为实验组及对照组。对收集到的终板软骨组织进行蛋白质提取、蛋白质酶解、肽段质谱分析等,筛选出差异表达的蛋白质,并对其进行生物信息学分析。结果对半椎体终板软骨及正常椎体终板软骨进行对比分析后得到32个显著差异表达蛋白质（Significantly Differentially Expressed Proteins,SDEPs）32,其中17个为上调蛋白质,15个为下调蛋白质。对这些筛选出来的差异表达蛋白质进行生物信息学分析,结果表明:在生物学过程方面,差异蛋白主要参与了细胞发育、迁移等生物学过程。在分子功能方面,差异蛋白主要表现在黏附、催化作用、分子功能调节、结构分子活性、转录以及翻译调节等。在细胞成分方面,主要分布于细胞质、质膜、细胞外、细胞核以及线粒体等。其主要参与的细胞通路包括:Adherens junction,Apoptosis,PI3K-Akt signaling pathway,Wnt signaling pathway以及Hippo signaling pathway。这些信号通路主要参与了骨与软骨细胞的迁移、增殖、分裂、凋亡以及分化等过程,参与了CS半椎体的形成过程,导致CS的发生。结论CS患者半椎体终板软骨与正常椎体终板软骨存在蛋白质的差异表达,且这些差异表达蛋白质所参与的功能和信号通路可能在半椎体终板软骨病变中发挥重要作用,参与CS的发生发展。

关键词：先天性脊柱侧弯终板软骨半椎体蛋白质组学非标记定量技术

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儿童终丝蛋白质组学研究

儿童终丝蛋白质组学研究

作者：张宇郑州大学

学位级别：硕士

目的运用非标记定量技术(Label Free Quantitation)分析脊髓拴系综合征(Tethered Cord Syndrome,TCS)患儿终丝和正常胎儿终丝中蛋白质的差异性表达,进一步探讨TCS的发病机制。方法本研究为随机对照研究,分为实验组(Experimental Group,... 详细信息

目的运用非标记定量技术(Label Free Quantitation)分析脊髓拴系综合征(Tethered Cord Syndrome,TCS)患儿终丝和正常胎儿终丝中蛋白质的差异性表达,进一步探讨TCS的发病机制。方法本研究为随机对照研究,分为实验组(Experimental Group,EG)和对照组(Control Group,CG)。从2018年11月-2019年6月于我院确诊并行手术治疗的TCS患儿中随机挑选3例终丝样本为EG,3例无神经系统畸形因其他原因引产胎儿终丝样本为CG。告知患儿家属并签署知情同意书,获得郑州大学第三附属医院伦理委员会批准后,所有样本均于近脊髓圆锥末端处取1cm终丝进行蛋白质提取,采用非标记定量结合液相色谱串联质谱(Liquid Chromatography Tandem Mass Spectrometry Technique,LC-MS/MS)技术对两组样本进行差异蛋白质的筛选,并利用MaxQuant数据库、Uniport数据库对差异蛋白质进行生物信息学分析。结果对两组样本进行对比后得到253个显著差异表达蛋白质(Significantly Differentially Expressed Proteins,SDEPs),其中上调蛋白质 101 个,下调蛋白质152 个。进一步对 SDEPs 进行 GO(Gene Ontology)富集分析、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析和蛋白质相互作用等生物信息学分析。结果表明SDEPs主要参与了脂质代谢、纤维变性、核糖体转化、补体和凝血级联反应和碳代谢等过程。其中,差异值较大的蛋白,如载脂蛋白A-I(APOA1)、补体C3(C3)等参与脂质代谢过程;α-烯醇化酶(ENO1)、二聚糖(BGN)等参与纤维变性过程。结论TCS患儿终丝与正常胎儿终丝组织中存在蛋白质的差异表达,且差异表达蛋白质所参与的通路和代谢途径可能在终丝病变中发挥重要作用,参与TCS的发生。

关键词：脊髓拴系综合征终丝差异蛋白质非标记定量技术

羟基红花黄色素A与丹参素/黄芪甲苷配伍抗脑缺血再灌注损伤作用及机制研究

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羟基红花黄色素A与丹参素/黄芪甲苷配伍抗脑缺血再灌注损伤作用及...

作者：许航中国人民解放军空军军医大学

学位级别：硕士

研究背景随着人们生活节奏的加快和工作压力的骤增,心脑血管疾病已经严重威胁人民生命健康,其中脑卒中的发病率、致残率和病死率逐年提高,尤其是脑缺血再灌注损伤(Cerebral ischemia-reperfusion injury,CIRI)造成的危害极为严重。目前... 详细信息

研究背景随着人们生活节奏的加快和工作压力的骤增,心脑血管疾病已经严重威胁人民生命健康,其中脑卒中的发病率、致残率和病死率逐年提高,尤其是脑缺血再灌注损伤(Cerebral ischemia-reperfusion injury,CIRI)造成的危害极为严重。目前临床仍然缺乏治疗CIRI的有效手段,因此寻找安全优效的防治药物成为研究的热点。传统中医药是我国宝贵的医疗资源,具有药物研发的独特优势。通过研究中药药效物质的作用及机制,对于抗CIRI的传统药物升级和制定治疗策略具有重要意义。中医对缺血性脑卒中的研究具有悠久历史,认为该病属于血瘀证范畴,气虚是致病的根源,血瘀是疾病发生发展的核心,因而将活血化瘀和活血益气作为治疗该病的常用方法。临床上治疗CIRI的常用中药有红花(Carthamus tinctorius L.)、丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)、黄芪(Astragalus membranaceus(Fisch.)Bunge)等,大量研究表明,这些中药的主要药效活性成分羟基红花黄色素A(Hydroxysafflor yellow A,HSYA)、丹参素(Danshensu,DSS)和黄芪甲苷(Astragaloside IV,AST-Ⅳ)对CIRI具有治疗作用。依照传统中医的整体观,临床上治疗CIRI以中药方剂和复方制剂为主,药对是中医方剂配伍的核心。红花-丹参、红花-黄芪分别作为具有活血化瘀和活血益气作用的经典药对,不仅是许多经典方剂的核心药物,而且是临床治疗心脑血管疾病的常用有效药物。虽然HSYA分别与DSS和AST-Ⅳ配伍已经有效运用于部分心脑血管疾病的防治,但是它们在CIRI的协同作用及机制研究却鲜有报道。HSYA作为目前临床用药中为数不多的中药注射剂主要成分之一,不仅是红花黄色素活血化瘀功效的主要有效成分,而且是药用红花的药理活性中最有效的水溶性成分,但是HSYA抗CIRI的作用机制至今并未充分阐明。CIRI的病理生理机制非常复杂,中药效应组分繁多,传统分子生物学的单一通路和单一效应研究策略未能充分揭示中药的脑保护作用机制。近年来,蛋白质组学技术的快速发展为本研究运用非标记定量和生物信息学技术筛选并分析HSYA抗CIRI的差异蛋白及其关键蛋白提供了良好契机,也为揭示HSYA分别与DSS和AST-Ⅳ配伍抗CIRI的作用机制研究提供了新思路。研究目的1.通过非标记定量和生物信息学技术,筛选并分析HSYA抗大鼠CIRI的差异蛋白,并采用Western blot对关键蛋白进行验证,初步确定红花组分的多效应作用,为血瘀证脑卒中的证本质研究提供实验依据;2.通过HSYA和DSS单用及配伍抗大鼠CIRI效果的对比研究,阐明HSYA和DSS的协同活血化瘀功效对CIRI的治疗作用及机制;3.通过HSYA和AST-Ⅳ单用及配伍抗大鼠CIRI效果的对比研究,阐明HSYA与AST-Ⅳ的协同活血益气功效对CIRI的治疗作用及机制。研究方法***大鼠60只随机分为假手术组、模型组和HSYA组,每组20只。采用线栓法复制MCAO模型,按照Zea Longa法进行神经功能缺损评分;脑缺血再灌注72 h,用TTC染色和Image Pro Plus 7.0计算脑梗死体积;HE染色观察病理学形态变化,TUNEL染色观察细胞凋亡变化。运用非标记定量技术筛选HSYA抗CIRI的差异蛋白;运用生物信息学技术分析这些差异蛋白的作用;通过Western blot对关键蛋白抗CIRI的作用机制进行验证。***大鼠40只随机分为假手术组、模型组、HSYA组、DSS组、HSYA和DSS配伍组,每组8只。采用线栓法复制MCAO模型,按照Zea Longa法进行神经功能缺损评分;脑缺血再灌注48 h,用TTC染色和Image Pro Plus 7.0计算脑梗死体积;HE染色观察病理学形态变化,TUNEL染色观察细胞凋亡变化;ELISA Kit检测SOD、GSH-Px和MDA指标以观察其抗氧化作用,检测TNF-α、IL-1β和IL-6指标以观察其抗炎作用;Western blot分析TLR4/NF-κB以及Nrf2/HO-1水平;MTT测定OGD诱导的神经元LDH水平。***大鼠100只随机分为假手术组、模型组、HSYA组、AST-Ⅳ组、HSYA和AST-Ⅳ配伍组,每组20只。采用线栓法复制MCAO模型,按照Zea Longa法进行神经功能缺损评分;脑缺血再灌注72 h,用TTC染色和Image Pro Plus 7.0计算脑梗死体积;HE染色观察病理学形态变化,SABC检测CD31表达;ELISA Kit检测SOD和GSH-Px指标观察其抗氧化作用,检测TNF-α和IL-1β指标观察其抗炎作用。研究结果1.通过非标记定量和生物信息学技术鉴定

关键词：羟基红花黄色素A 丹参素黄芪甲苷协同作用脑缺血再灌注损伤蛋白质组学非标记定量技术生物信息学技术

儿童Ⅰ型神经纤维瘤病合并先天性胫骨假关节光学相干层析成像及蛋白质组学的研究

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儿童Ⅰ型神经纤维瘤病合并先天性胫骨假关节光学相干层析成像及蛋...

作者：刘洋郑州大学

学位级别：硕士

目的探讨光学相干成像技术（Optical Coherence Tomography OCT）在儿童Ⅰ型神经纤维瘤病（Neurofibromatosis type1 NF1）合并先天性胫骨假关节（Congenital pseudarthrosis of the tibia CPT）患儿中的应用。运用非标记定量技术（Label Free Quantitation）对NF1合并CPT患儿和非NF1非CPT引产胎儿胫骨中的蛋白质差异性表达做以初步分析,探讨NF1合并CPT可能的发病机制。方法选取10例于我院就诊的NF1合并CPT患儿为实验组,获得胫骨组织标本后即行OCT扫描及常规病理学染色,并将二者结果做对比。并选取5例非NF1非CPT引产胎儿的胫骨进行上述检查作为对照组,对比各组OCT扫描与常规病理学染色结果。随机选取3例NF1合并CPT患儿的病变胫骨与3例非NF1非CPT引产胎儿的胫骨行对照分析,采用非标记定量集合液/相色谱串联质谱（Liquid Chromatography Tandem Mass Spectrometry Technique,LC-MS/MS）技术对两组样本对比分析得到1508个显著性差异表达蛋白质（Significantly Differentially Expressed Proteins,SDEPs）,其中上调蛋白516个,下调蛋白992个,利用Max Quant数据库、Uniport数据库分析并进行生物信息学分析。结果OCT扫描显示标本中散在的血管、脂肪及神经,对照组OCT扫描见到致密的阴影,实验组见紊乱、折光性强的破骨细胞、其中散在的血管、空泡状的脂肪及神经成分增多。SDEPs主要参与补体和凝血级联反应、蛋白质翻译后修饰、骨愈合的调节及PI3K-AKt信号通路的调节,这些通路可能在NF1合并CPT的发病机制中发挥重要作用。结论OCT直接扫描新鲜离体病变组织,进而呈现组织内部的病变结构,与同阶段的光学显微镜下成像检查重合度高;OCT在NF1合并CPT的组织学病理学诊断做以补充,也为进一步的基因学检查留存样本。NF1合并CPT患儿胫骨与非NF1非CPT胫骨中存在蛋白质的差异表达,主要参与:补体和凝血级联反应、蛋白质翻译后修饰、影响骨愈合的因素、PI3K-AKT通路,这些通路可能在NF1合并CPT的发病机制中发挥重要作用

关键词： Ⅰ型神经纤维瘤病先天性胫骨假关节光学相干显微成像病理学检查差异蛋白质非标记定量技术

带状疱疹后遗神经痛患者血清非标记定量蛋白质组学分析

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山东医药 2023年第11期63卷 58-61页

作者：吕丹栾静贺永进天津市第一中心医院疼痛科天津300162

目的采用非标记定量蛋白质组学技术检测带状疱疹后遗神经痛(PHN)患者血清差异表达的蛋白质,探讨PHN可能的发病机制。方法选择带状疱疹患者80例,经治疗后存在神经痛症状者40例(观察组)、不存在神经痛症状者40例(对照组)。收集两组治疗前... 详细信息

目的采用非标记定量蛋白质组学技术检测带状疱疹后遗神经痛(PHN)患者血清差异表达的蛋白质,探讨PHN可能的发病机制。方法选择带状疱疹患者80例,经治疗后存在神经痛症状者40例(观察组)、不存在神经痛症状者40例(对照组)。收集两组治疗前的血液,采用非标定量法蛋白质组学技术分析血清中的差异蛋白。结果与对照组比较,观察组有4种蛋白质表达下调、7种蛋白质表达上调。进一步的差异蛋白分析结果显示,表达下调的4种蛋白质分别为纤维胶凝蛋白1(FCN1)、丝氨酸蛋白酶抑制剂家族D成员1(SERPIND1)、脱脂转化酶(LPA)和蛋白二硫化物异构酶A4(PDIA4),表达上调的7种蛋白质分别为Wnt诱导信号通道蛋白2(WISP2)、免疫球蛋白λ变量1-44(IGLV1-44)、免疫球蛋白重常数γ1(IGHG1)、载脂蛋白C3(APOC3)、半乳糖凝集素1(LGALS1)、中间α-球蛋白抑制因子H1(ITIH1)和C1Q肿瘤坏死因子相关蛋白3(C1QTNF3)。结论PHN患者血清FCN1、SERPIND1、LPA、PDIA4蛋白表达下调,WISP2、IGLV1-44、IGHG1、APOC3、LGALS1、ITIH1和C1QTNF3蛋白表达上调,上述差异表达蛋白可能参与了PHN的发病。

关键词：非标记定量技术蛋白质组学分析纤维胶凝蛋白1 Wnt诱导信号通道蛋白2 神经痛带状疱疹