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新发现“铁死亡”调控通路为肿瘤等治疗带来新策略

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新发现“铁死亡”调控通路为肿瘤等治疗带来新策略

上海科技报

作者：吴苡婷黄艾娇

同济大学又一重要科学发现，为肿瘤、器官损伤等疾病治疗带来新思路。北京时间2月1日零点，同济大学医学院/附属第十人民医院王平教授团队在国际顶级学术期刊《自然》上发表了题为“7-脱氢胆固醇决定铁死亡敏感性”的论文，揭示胆固醇... 详细信息

同济大学又一重要科学发现，为肿瘤、器官损伤等疾病治疗带来新思路。北京时间2月1日零点，同济大学医学院/附属第十人民医院王平教授团队在国际顶级学术期刊《自然》上发表了题为“7-脱氢胆固醇决定铁死亡敏感性”的论文，揭示胆固醇合成通路关键酶能通过调控中间代谢物7-脱氢......

关键词：脱氢胆固醇器官损伤关键酶胆固醇合成调控通路研究团队

来源： cnki报纸评论

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调控通路内基因表达的相关性分析

遗传 2004年第6期26卷 929-933页

作者：李传星李霞郭政宫滨生屠康哈尔滨医科大学生物信息学系哈尔滨150086

从基因表达调控通路的角度分析了基因功能与基因表达之间的关系 ,利用 7套酿酒酵母基因芯片表达谱数据和通路数据库 (KEGG和CYGD)所提供的信息 ,应用我们研制的Genehub软件分析研究了同一基因表达调控通路内的基因在mRNA表达水平上的相... 详细信息

从基因表达调控通路的角度分析了基因功能与基因表达之间的关系 ,利用 7套酿酒酵母基因芯片表达谱数据和通路数据库 (KEGG和CYGD)所提供的信息 ,应用我们研制的Genehub软件分析研究了同一基因表达调控通路内的基因在mRNA表达水平上的相关性 ,共涉及 16条通路 ,4 95个基因。通过Pearson相关系数和Spearman相关系数两种相似性测度的分析 ,发现有 94 % (15条 )的基因表达调控通路内的基因在大于等于 4套的表达谱数据中是共表达的 ,以上结果从基因表达调控通路的角度。

关键词：调控通路基因芯片相似性测度酿酒酵母

血管加压素-水通道蛋白2调控通路与内耳膜迷路积水

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中华耳鼻咽喉头颈外科杂志 2020年第4期55卷 426-431页

作者：蒋丽元浙江中医药大学附属广兴医院针灸康复科杭州310007

在肾脏集合管,血管加压素(arginine vasopressin,AVP)通过AVP-血管加压素受体2(vasopressin type 2 receptor,V2R)-环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)-水通道蛋白2(aquaporin2,AQP2)调控通路引起AQP2表达改变,实现对肾集合管水通透性的调节,参与人体水电解质的调节机制改变。膜迷路积水是梅尼埃病的重要病理特征,AVP-AQP2调控通路功能失常与膜迷路积水的病理生理学改变密切相关。本文综述了近年来AVP-AQP2调控通路的研究进展,并重点讨论其在梅尼埃病膜迷路积水发生发展中的作用。

关键词：膜迷路积水水通道蛋白2 梅尼埃病调控通路功能失常 AQP2 血管加压素肾集合管

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褪黑素神经调控通路及镇痛机制

中国康复医学杂志 2022年第11期37卷 1586-1591页

作者：王淼雷静尤浩军延安大学感觉与运动疾病转化医学研究中心陕西省延安市716000

褪黑素作为神经内分泌激素可调节机体生命活动。早在20世纪80年代,Lakin等[1]观察小鼠血清褪黑素水平变化,发现夜晚褪黑素分泌达到高峰,而此时小鼠疼痛阈值最高,据此初步揭示了褪黑素具有抗伤害作用。临床疼痛治疗中,褪黑素镇痛效果较好... 详细信息

褪黑素作为神经内分泌激素可调节机体生命活动。早在20世纪80年代,Lakin等[1]观察小鼠血清褪黑素水平变化,发现夜晚褪黑素分泌达到高峰,而此时小鼠疼痛阈值最高,据此初步揭示了褪黑素具有抗伤害作用。临床疼痛治疗中,褪黑素镇痛效果较好,且成瘾性较低。褪黑素可通过去甲肾上腺素能系统和5-羟色胺能系统协同发挥镇痛作用[2-3]。除此之外,褪黑素亦可与δ-阿片受体结合,协同阿片肽进行镇痛;也可促进β-内啡肽释放,增强阿片类药物镇痛效果[4-7]。本文将简要综述褪黑素合成分泌、神经调控通路、镇痛不同表现及相关机制。

关键词：阿片类药物镇痛机制调控通路成瘾性褪黑素疼痛阈值抗伤害作用神经内分泌激素

权重基因共表达网络分析发现心肌梗死后心脏重构的关键调控通路与基因

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中国病理生理杂志 2010年第A10期26卷 1995-1996页

作者：钟诗龙余细勇郑志伟杨敏符永恒广东省医学科学院心血管病研究所广东省人民医院医学研究中心广东广州510080

鸭瘟病毒感染鸭十二指肠黏膜炎症相关基因及调控通路的筛选

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中国畜牧兽医 2020年第10期47卷 3323-3333页

作者：田琴张明华周碧君程振涛王开功文明贵州大学动物科学学院贵阳550025 贵州省动物疫病研究室贵阳550025 贵州大学动物疫病研究所贵阳550025

试验旨在分析鸭瘟病毒(duck plague virus,DPV)感染樱桃谷鸭后十二指肠黏膜转录组水平的变化,筛选出DPV感染后参与炎症的相关基因和调控通路。DEV-GZ株经腿部肌肉接种35日龄鸭后,于接种后24、48和72 h采集鸭十二指肠黏膜组织样本,提取总... 详细信息

试验旨在分析鸭瘟病毒(duck plague virus,DPV)感染樱桃谷鸭后十二指肠黏膜转录组水平的变化,筛选出DPV感染后参与炎症的相关基因和调控通路。DEV-GZ株经腿部肌肉接种35日龄鸭后,于接种后24、48和72 h采集鸭十二指肠黏膜组织样本,提取总RNA进行转录组测序,对数据进行质控与注释,筛选与炎症相关的差异表达基因及调控通路,并应用实时荧光定量PCR对部分差异表达基因进行验证。结果显示,对照组与试验组总计得到21.39 Gb的Clean Bases,测序样本有效序列占原始序列的99%以上,映射率高于83%。鸭接毒DPV后24 h十二指肠黏膜的差异表达基因有221个,参与炎症相关生物学过程的有3个,均为下调基因;接毒DPV后48 h差异表达基因有499个,参与炎症相关生物学过程的有17个,均为下调基因;接毒DPV后72 h差异表达基因有798个,参与炎症相关生物学过程的有20个,其中上调基因13个、下调基因7个。GO数据库分析显示,参与炎症相关的差异表达基因主要是CCR8、CCL19、CCL4、IL-17、IRF1、IFN-γ、SLC11A1等,涉及急性炎症反应、趋化因子受体活性、急性期反应、炎症反应和炎症反应的正调节等生物学过程。KEGG数据库分析显示,差异表达炎症相关基因主要富集在Toll样受体信号通路、NF-κB信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路和炎症性肠病等;实时荧光定量PCR结果显示,IFN-γ和MALT基因的相对表达倍数与转录组结果基本一致。本试验完成了DPV感染樱桃谷鸭十二指肠的转录组测序分析,获取了差异表达基因的功能注释信息,初步揭示了参与DPV感染的炎症相关通路,为深入探究DPV的致病机制提供了理论参考。

关键词：鸭瘟病毒(DPV) RNA-seq 十二指肠差异表达炎症相关基因调控通路

大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂沉积差异基因及其调控通路分析

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西南农业学报 2023年第4期36卷 845-853页

作者：王琳严达伟马黎张博王莉兴张浩董新星云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 云南农业职业技术学院畜牧兽医学院昆明650212 中国农业大学动物科学技术学院北京100193 云南省畜牧总站昆明650224

【目的】筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂沉积差异的关键基因并分析其调控途径。【方法】对体重长至40、80、120 kg的大型迪庆藏猪背脂组织进行转录组测序,测序数据进行拼接、比对、注释并进行功能富集分析、STEM趋势分析和互作网络... 详细信息

【目的】筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂沉积差异的关键基因并分析其调控途径。【方法】对体重长至40、80、120 kg的大型迪庆藏猪背脂组织进行转录组测序,测序数据进行拼接、比对、注释并进行功能富集分析、STEM趋势分析和互作网络分析。【结果】10~40 kg(S1阶段)与40~80 kg(S2阶段)、S2阶段与80~120 kg(S3阶段)比较分别筛选到845、558个显著差异表达基因(DEGs);差异表达基因STEM趋势分析显示,模块0、模块3和模块4的基因随大型迪庆藏猪体重增加而下调表达,模块14的基因先上调后轻微下调;显著差异基因互作网络显示,在模块0、模块3和模块4的基因互作网络中,PTGER3、CPT1B、LPIN3基因位于核心位置,PTGER3下调抑制脂肪分解、促进脂肪细胞增大,CPT1B下调降低脂肪酸氧化能力、导致甘油三酯增多,LPIN3下调维持脂质稳态;在模块14的基因互作网络中,AACS、SOCS3、AQP3、RPS6KA1位于核心位置,AACS上调促进脂肪细胞分化、脂肪细胞数量增多,SOCS3、RPS6KA1上调促进脂肪生成,AQP3上调促进脂肪细胞内甘油三酯增多,这与大型迪庆藏猪随体重增加背膘厚显著增加,但S1阶段与S2阶段背膘厚的增幅大于S2阶段与S3阶段的结果一致;对PTGER3、AACS等15个差异基因进行qPCR验证,定量结果与转录组结果一致。【结论】本研究筛选到15个调控大型迪庆藏猪背膘厚的潜在候选基因,可为迪庆藏猪的遗传改良提供参考。

关键词：大型迪庆藏猪背脂沉积 RNA-Seq 差异表达基因调控通路

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中药有效组分抑制心肌细胞凋亡调控通路研究进展

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辽宁中医杂志 2011年第12期38卷 2487-2489页

作者：王瑜李晓佳樊官伟王小莹天津中医药大学中医药研究中心天津300193

细胞凋亡是由体内外因素触发细胞内预存的死亡程序而致细胞主动死亡的过程,而3种细胞凋亡通路:内源性、外源性和近年来发现的内质网通路之间密切关联,发挥作用。近年来随着化学,分析等相关学科的发展,许多中药的有效成分得到分离,中药... 详细信息

细胞凋亡是由体内外因素触发细胞内预存的死亡程序而致细胞主动死亡的过程,而3种细胞凋亡通路:内源性、外源性和近年来发现的内质网通路之间密切关联,发挥作用。近年来随着化学,分析等相关学科的发展,许多中药的有效成分得到分离,中药有效成分在药理学、临床治疗等方面的应用越来越广泛。国内外学者从调控凋亡基因、抑制细胞凋亡方面入手,对许多中药有效组分在心肌细胞凋亡抑制作用的方面进行研究,并取得了长足的进展。文章就中药有效组分在抑制心肌细胞凋亡调控通路中的作用做一研究综述。

关键词：中药组分心肌细胞凋亡调控通路

let-7/lin-28调控通路在牙鲆变态发育中的作用

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let-7/lin-28调控通路在牙鲆变态发育中的作用

作者：高丽娜上海海洋大学

学位级别：硕士

牙鲆Paralichthys olivaceus属于海水鱼类,在我国的经济价值较高,其胚后发育阶段经历了剧烈的变态现象,对其变态发育机制的研究已成为热点,一些异时性基因(heterochronic genes)如let-7、lin-28a、lin-28b、lin-41和lin-29等在很多脊椎... 详细信息

牙鲆Paralichthys olivaceus属于海水鱼类,在我国的经济价值较高,其胚后发育阶段经历了剧烈的变态现象,对其变态发育机制的研究已成为热点,一些异时性基因(heterochronic genes)如let-7、lin-28a、lin-28b、lin-41和lin-29等在很多脊椎动物中呈现出保守的时空性调控表达模式,在生物发育过程中进行精准有序地调控表达,对这些基因的研究有助于牙鲆变态发育分子机制的阐明。let-7 miRNAs类似于其他的microRNAs,主要作用于靶基因的3’-UTR序列。LIN-28a及其同源分子LIN-28b是RNA结合蛋白,LIN-41是细胞质蛋白,LIN-29是多锌指结构蛋白,它们都与生物发育时空性紧密相关。本课题组在对牙鲆的变态发育研究中已鉴定得到牙鲆10个let-7 miRNAs并对其在牙鲆发育中的表达进行了相对定量检测。本论文主要研究其余四个异时性基因lin-28a、lin-28b、lin-41和lin-29的克隆、表达分析及其在牙鲆变态发育中与let-7的调控关系。本论文以牙鲆总cDNA为模板,采用PCR等克隆获得牙鲆lin-28a、lin-28b和lin-29基因cDNA全长及lin-41的编码区序列(Coding sequence,CDS),利用生物信息学方法分别分析它们的氨基酸序列、不同物种间同源性比较、构建进化树及预测蛋白三级结构;通过实时荧光定量PCR技术在牙鲆成鱼多个组织和不同发育时期的仔鱼中检测各个异时性基因的相对表达量及外源性th和tu对变态期牙鲆仔鱼各异时性基因表达水平的影响;预测得到牙鲆let-7mirnas的靶基因(lin-28a和lin-28b)并进行验证;构建牙鲆lin-28a和lin-28b基因的真核表达载体并将其和let-7mirnasmimicis在牙鲆胚胎细胞(fecs)中分别进行过表达及后续检测试验。以期初步揭示牙鲆早期发育中这些异时性基因的作用和相互关系,为进一步研究牙鲆变态发育调控通路提供基础性资料。lin-28a基因全长1617bp,包括118bp的5’-utr、890bp的3’-utr和609bp的开放阅读框,编码202个氨基酸;lin-28b基因全长2998bp,包括218bp的5’-utr、2075bp的3’-utr和705bp的开放阅读框,编码234个氨基酸;lin-29基因全长1769bp,包括112bp的5’-utr、328bp的3’-utr和1329bp的开放阅读框,编码442个氨基酸;lin-41的开放阅读框有2502bp,编码833个氨基酸。牙鲆四个异时性基因lin-28a、lin-28b、lin-41和lin-29的氨基酸序列与其他物种的同源性分别在62%4%、63%3%、70%3%和68%5%,进化树分析显示牙鲆四个异时性基因均与其他鱼类同源基因聚为一支,这些基因的氨基酸序列在不同物种间具有相同或相似的蛋白结构,进化和功能方面具有保守性。牙鲆异时性基因lin-28a、lin-28b、lin-29和lin-41在牙鲆成鱼的脑和性腺中都有较高的表达量,尤其是lin-28a和lin-28b在脑和性腺中呈现很突出的高表达(p调控关系,lin-41和lin-29在牙鲆成鱼其余各组织中也均有较高的表达量可能与其结构及功能多样性相关(p调控这些基因的表达。对牙鲆异时性micrornaslet-7的靶基因验证试验中,牙鲆lin-28a3’-utr区的三个预测靶位点中只有第二个位点受到let-7的靶控作用,其实验组的萤火虫荧光素酶相对活性明显减弱(p<0.05),且三个位点共同存在时受到let-7的靶向抑制作用最强(p<0.01),表明牙鲆lin-28a是let-7的靶基因且其3’-utr区域至少存在一个靶位点,及lin-28a受不同let-7的靶向抑制作用程度之间有差异。将重组真核过表达载体pegfp-n1-lin-28a、pegfp-n1-lin-28b和let-7mirnas在牙鲆胚胎细胞中过表达后,细胞中有绿色荧光融合蛋白表达,表明载体转染成功且在牙鲆胚胎细胞中表达;pegfp-n1-lin-28a和pegfp-n1-lin-28b重组质粒在fecs中过表达均有使

关键词：牙鲆变态发育异时性基因 lin-28a lin-28b lin-41 lin-29 let-7 microRNAs 调控通路