大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂沉积差异基因及其调控通路分析

作     者：王琳 严达伟 马黎 张博 王莉兴 张浩 董新星 WANG Lin;YAN Da-wei;MA Li;ZHANG Bo;WANG Li-xing;ZHANG Hao;DONG Xin-xing

作者机构：云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 云南农业职业技术学院畜牧兽医学院昆明650212 中国农业大学动物科学技术学院北京100193 云南省畜牧总站昆明650224 

出 版 物：《西南农业学报》 (Southwest China Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期：2023年第36卷第4期

页      面：845-853页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：云南省重大科技专项计划(202202AE090005) 云南省农业联合专项-面上项目(202101BD070001-103) 云南省乡村振兴科技专项(202104BI090021) 

主　　题：大型迪庆藏猪 背脂沉积 RNA-Seq 差异表达基因 调控通路 

摘      要：【目的】筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂沉积差异的关键基因并分析其调控途径。【方法】对体重长至40、80、120 kg的大型迪庆藏猪背脂组织进行转录组测序,测序数据进行拼接、比对、注释并进行功能富集分析、STEM趋势分析和互作网络分析。【结果】10~40 kg(S1阶段)与40~80 kg(S2阶段)、S2阶段与80~120 kg(S3阶段)比较分别筛选到845、558个显著差异表达基因(DEGs);差异表达基因STEM趋势分析显示,模块0、模块3和模块4的基因随大型迪庆藏猪体重增加而下调表达,模块14的基因先上调后轻微下调;显著差异基因互作网络显示,在模块0、模块3和模块4的基因互作网络中,PTGER3、CPT1B、LPIN3基因位于核心位置,PTGER3下调抑制脂肪分解、促进脂肪细胞增大,CPT1B下调降低脂肪酸氧化能力、导致甘油三酯增多,LPIN3下调维持脂质稳态;在模块14的基因互作网络中,AACS、SOCS3、AQP3、RPS6KA1位于核心位置,AACS上调促进脂肪细胞分化、脂肪细胞数量增多,SOCS3、RPS6KA1上调促进脂肪生成,AQP3上调促进脂肪细胞内甘油三酯增多,这与大型迪庆藏猪随体重增加背膘厚显著增加,但S1阶段与S2阶段背膘厚的增幅大于S2阶段与S3阶段的结果一致;对PTGER3、AACS等15个差异基因进行qPCR验证,定量结果与转录组结果一致。【结论】本研究筛选到15个调控大型迪庆藏猪背膘厚的潜在候选基因,可为迪庆藏猪的遗传改良提供参考。