检索结果-南通市图书馆

兰州大学学报（自然科学版） 2009年第F6期45卷 34-38页

作者：艾对元兰州大学化学化工学院兰州730000

病毒基因组中的重复序列比率很低,因为其核酸序列大都是编码区域.如果出现一段同向对称或者是反向对称序列在病毒基因组中,它往往代表一个调控元件,或者是一个信号因子.我们总结了病毒中的一些对称序列,并阐明它的特点,分布及功能.

关键词：重复序列病毒基因组比较基因组学

非洲猪瘟病毒E301R蛋白在病毒基因组复制过程中发挥滑动夹功能

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中国预防兽医学报 2023年第9期45卷 985-985页

作者： LI SU GE HAI-LIANG LI YAN-HUA State Key Laboratory for Animal Disease Control Prevention National African Swine Fever Para-Reference Laboratory National High-Containment Facilities for Animal Disease Control Prevention Harbin Veterinary Research Institute Chinese Academy of Agricultural Sciences Harbin China College of Animal Sciences Yangtze University Jingzhou China Multidiscipline Research Center Institute of High Energy Physics Chinese Academy of Sciences Beijing China

非洲猪瘟(ASF)是由非洲猪瘟病毒(ASFV)感染猪引起的一种发热性和广泛出血性的高度接触传染性疾病,是养猪业的“头号杀手”。ASF作为严重危害全球养猪业健康发展的动物疫病,亟需研发安全有效的抗病毒策略,这有赖于对ASFV复制和致病机制... 详细信息

非洲猪瘟(ASF)是由非洲猪瘟病毒(ASFV)感染猪引起的一种发热性和广泛出血性的高度接触传染性疾病,是养猪业的“头号杀手”。ASF作为严重危害全球养猪业健康发展的动物疫病,亟需研发安全有效的抗病毒策略,这有赖于对ASFV复制和致病机制的深入研究。作为核质大DNA病毒,ASFV利用自身编码的多种蛋白参与病毒的基因组复制和病毒粒子组装,当前的研究主要集中于病毒蛋白拮抗宿主天然免疫信号通路方面,然而,病毒复制的分子调控机制尚不明确。

关键词：高度接触传染非洲猪瘟病毒病毒基因组养猪业病毒蛋白动物疫病 DNA病毒复制过程

病毒基因组的反式调控及其在抗病毒基因治疗方案设计中的应用

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国外医学（流行病学．传染病学分册） 1994年第6期21卷 241-244页

作者：成军北京医科大学第一医院传染病教研室

病毒基因组有顺式和反式调节两种。病毒启动子序列控制目的基因的表达已得到基因治疗研究的广泛应用。依据反式调节机制,设计细胞内免疫机制的抗病毒基因治疗方案,控制目的基因基础表达水平,提高目的基因表达水平等都具有重要的实际应... 详细信息

病毒基因组有顺式和反式调节两种。病毒启动子序列控制目的基因的表达已得到基因治疗研究的广泛应用。依据反式调节机制,设计细胞内免疫机制的抗病毒基因治疗方案,控制目的基因基础表达水平,提高目的基因表达水平等都具有重要的实际应用前景,也是抗病毒基因治疗研究中具有普遍意义的途径。

关键词：病毒基因组基因治疗抗病毒

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逆转录病毒基因组RNA的二聚作用

病毒学报 2008年第6期24卷 487-491页

作者：高旭沈荣显相文华周建华中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室大动物传染病研究室哈尔滨150001 延边大学农学院动物医学系延吉133400

逆转录病毒科(Retroviridae)是一成员众多、易变异的RNA病毒科。在逆转录病毒复制周期内,所有逆转录病毒均将两拷贝的单股正链RNA带入病毒粒子[1,2]。在此过程中,遗传物质——基因组RNA能顺利包装入病毒粒子是病毒复制与繁衍的关键,而... 详细信息

逆转录病毒科(Retroviridae)是一成员众多、易变异的RNA病毒科。在逆转录病毒复制周期内,所有逆转录病毒均将两拷贝的单股正链RNA带入病毒粒子[1,2]。在此过程中,遗传物质——基因组RNA能顺利包装入病毒粒子是病毒复制与繁衍的关键,而基因组RNA通过二聚作用(Di mer-ization)形成二聚体(Di mer)是包装逆转录病毒的前提。在自然条件下两条单股正链RNA经靠近基因组5′末端的二聚作用起始位点(Di merizationinitiation site,DIS)结合成二聚体后才能被包装入病毒粒子,而经外界手段人为拯救出包含单链RNA的病毒粒子则不具有感染性和复制能力,由此可以通过导入DIS的反义DNA寡核苷酸,使病毒基因组RNA失去形成二聚体的能力,以达到抗病毒的目的。在子代病毒产生过程中,伴随逆转录病毒的成熟,基因组RNA二聚体也经历了一次重排,形成更稳定的延展二聚体,说明延展二聚体形成与逆转录病毒成熟存在着一定相关性。此外,逆转录病毒复制过程中基因组RNA先逆转录成DNA,然后以病毒基因组cDNA形式整合到宿主基因组内,作为宿主基因组的一部分,随宿主基因组的复制和细胞分裂而传代。

关键词：逆转录病毒科 RNA病毒病毒基因组二聚作用病毒复制病毒粒子遗传物质二聚体

严重急性呼吸道综合征(SARS)病毒基因组比较分析与进化研究

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华中农业大学学报 2003年第6期22卷 523-528页

作者：马相如郭爱珍肖少波金梅林陈焕春华中农业大学动物医学院武汉430070

“严重急性呼吸道综合征”(SARS)由于危害严重,引起人们的高度重视,在各国科研人员努力下,目前已完成了十几个毒株的分离与全基因组测序工作。本研究对世界各地分离的SARS毒株的基因组全序列进行比较,发现不同毒株的同源性在99.8％以上,... 详细信息

“严重急性呼吸道综合征”(SARS)由于危害严重,引起人们的高度重视,在各国科研人员努力下,目前已完成了十几个毒株的分离与全基因组测序工作。本研究对世界各地分离的SARS毒株的基因组全序列进行比较,发现不同毒株的同源性在99.8％以上,SARS病毒的遗传稳定性较高;将SARS病毒与其它冠状病毒基因组以及编码蛋白质序列进行比较分析,证实SARS病毒是一种新的冠状病毒,可能进化起源较早,并发现SARS病毒和牛冠状病毒同源程度最高。SARS病毒orflab、orfla、S、M、N编码区氨基酸序列和牛冠状病毒同源程度最高,鼠肝炎病毒次之。

关键词：严重急性呼吸道综合征 SARS 病毒基因组冠状病毒比较基因组

水产动物的病毒基因组及其病毒与宿主的相互作用

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中国科学：生命科学 2014年第12期44卷 1236-1252页

作者：张奇亚桂建芳中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室武汉430072

水产养殖是近30年来世界上增长最快的农业生产方式,但病毒已成为严重威胁水产养殖可持续发展的传染性病原.近10年来,已从水产动物中鉴定出大量不同的病原病毒,解析了100多株水产动物病毒的基因组及其遗传特征,并开始对这些病毒与宿主的... 详细信息

水产养殖是近30年来世界上增长最快的农业生产方式,但病毒已成为严重威胁水产养殖可持续发展的传染性病原.近10年来,已从水产动物中鉴定出大量不同的病原病毒,解析了100多株水产动物病毒的基因组及其遗传特征,并开始对这些病毒与宿主的相互作用有了系统和深入的认识.本文在作者20多年研究积累的基础上,重点评述水产动物的重要病毒如虹彩病毒、疱疹病毒、呼肠孤病毒和弹状病毒的基因组遗传信息特征以及这些病毒-宿主相互作用的研究进展.

关键词：水产动物病毒基因组抗病毒防御虹彩病毒呼肠孤病毒弹状病毒疱疹病毒病毒与宿主相互作用

1b型丙型肝炎病毒基因组不同区域基因变异对干扰素疗效的影响

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中华实验和临床病毒学杂志 2007年第1期21卷 83-84页

作者：张琳白菡黄芬赵桂珍李颖中国医科大学附属二院传染科辽宁沈阳 110004

本研究对14例基因型1b型慢性丙型肝炎患者血清HCV基因组中E2／NS1（含HVR1和HVR2）、NSSA区准种异质性进行了检测，对HVR区准种异质性程度与干扰素（IFN）疗效的关系、NS5A2209-2248区是否存在干扰素敏感决定区（ISDR）等热点问题进行... 详细信息

本研究对14例基因型1b型慢性丙型肝炎患者血清HCV基因组中E2／NS1（含HVR1和HVR2）、NSSA区准种异质性进行了检测，对HVR区准种异质性程度与干扰素（IFN）疗效的关系、NS5A2209-2248区是否存在干扰素敏感决定区（ISDR）等热点问题进行了探讨，为1b型慢性丙型肝炎患者应用IFN抗病毒治疗时进行疗效预测提供理论依据。

关键词：干扰素敏感决定区丙型肝炎患者疗效预测 1b型病毒基因组基因变异 E2/NS1 HCV基因组

一株对虾病毒基因组的Finishing方法探讨

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中国水产 2003年第12期 53-54页

作者：曾首英上海水产大学 200090

随着大规模测序技术日益成熟和人类基因组计划的顺利完成,许多重要生物如:酵母、果蝇、拟南芥、水稻和人类自身等基因组全长序列已被测定,而玉米、家猪和小鼠等生物全基因组序列正在加紧完成和分析之中.因此,全基因组生物信息势必成为... 详细信息

随着大规模测序技术日益成熟和人类基因组计划的顺利完成,许多重要生物如:酵母、果蝇、拟南芥、水稻和人类自身等基因组全长序列已被测定,而玉米、家猪和小鼠等生物全基因组序列正在加紧完成和分析之中.因此,全基因组生物信息势必成为生命科学研究和开发的重要工具.

关键词：对虾病毒基因组 FINISHING方法载体屏蔽污染数据生物信息

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一株烟芽夜蛾囊泡病毒基因组全序列解析

一株烟芽夜蛾囊泡病毒基因组全序列解析

作者：魏永路湖南农业大学

学位级别：硕士

囊泡病毒具有闭合双链环状DNA基因组,是一类主要感染鳞翅目、膜翅目和鞘翅目昆虫的病原物,随着结构基因组学、功能基因组学、比较基因组学及生物信息学的发展,囊泡病毒基因组学研究取得了很大进步。烟芽夜蛾囊泡病毒Heliothis virescens... 详细信息

囊泡病毒具有闭合双链环状DNA基因组,是一类主要感染鳞翅目、膜翅目和鞘翅目昆虫的病原物,随着结构基因组学、功能基因组学、比较基因组学及生物信息学的发展,囊泡病毒基因组学研究取得了很大进步。烟芽夜蛾囊泡病毒Heliothis virescens ascovirus 3a (HvAV-3a)作为一个世界分布和变种最多的囊泡病毒,对其进行基因组学研究显得尤为重要。本文对HvAV-3a的首个美国变种HVAV-3a进行全基因组测序,首次测定了来自美洲的HvAV-3a的毒株全基因组序列,并从核酸和密码子两方面对其序列进行解析,与所有已知囊泡病毒基因组进行比较,其为囊泡病毒基因组变异及演化的研究提供参考,其基因组信息将为通过基因工程手段提高囊泡病毒杀虫活性提供基础数据。本研究主要内容包括：(1) HvAV-3f全基因组测序和注释。用Illumina's Solexa高通量测序技术对HvAV-3f进行了全基因组序列测定,对测序所得的原始数据进行过滤后,获得了6,244,397 clean pair-end (PE) reads,采用Edena和Abyss等软件拼接组装,最终获得了HvAV-3f全基因组草图。通过使用GeneMarkS, ORF finder (NCBI)以及Geneious等软件对基因组ORFs进行了预测,并采用了NCBI和UniProt等数据库进行了注释。通过生物信息学研究分析表明：HvAV-3f基因组全长为198,157bp。G+C含量为46.0%。全基因组序列提交GenBank,登录号为KJ755191。(2) HvAV-3f全基因组核酸序列分析。预测ORFs共有190个,编码区域占整个基因组的85.46%,其中与DNApolymerase基因具有相同转录方向ORFs有107个,而与其转录反向的ORFs有83个;HvAV-3f基因组结构中存在同源重复序列和基因重叠现象,其中含有2个同源重复区hrs,29个bros基因,还有1个基因含五个拷贝,即iap-like基因。3个与鳞翅目昆虫存在高度同源的基因,9个ique基因和25个参与基因转录,DNA复制和核酸代谢的酶。HvAV-3f基因对等排列图研究表明：HvAV-3f基因组与SfAV-1a共线性关系较好与TnAV-6a的差异性较大。(3) HvAV-3f全基因组密码子使用特性分析。通过对HvAV-3f编码区密码子组成,相对同义密码子使用度,密码子适应指数,双联碱基相对丰度,有效密码子数和对应分析等方面的分析表明：其密码子的用法特性更倾向于选择G/C;此外还可能受到宿主差异的影响。

关键词：囊泡病毒 HvAV-3f 病毒基因组核昔酸分析密码子分析

同方学位论文库评论

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鹅细小病毒基因组与致病机制研究进展

中国兽医杂志 2013年第11期49卷 48-51页

作者：朱峰伟朱新产青岛农业大学生命科学学院山东青岛266109 青岛市即墨畜牧兽医局山东青岛266200

鹅细小病毒（GPV）可引起1月龄内雏鹅和番鸭急性肠炎及肝、肾、心实质脏器炎症等病变,即小鹅瘟（GP）,是一种高度接触性、败血性传染病,病程短、致病性强、病死率高（90％～100％）.随着环境的变化GP的流行形式也发生了新的转变,易感群... 详细信息

鹅细小病毒（GPV）可引起1月龄内雏鹅和番鸭急性肠炎及肝、肾、心实质脏器炎症等病变,即小鹅瘟（GP）,是一种高度接触性、败血性传染病,病程短、致病性强、病死率高（90％～100％）.随着环境的变化GP的流行形式也发生了新的转变,易感群的发病日龄逐渐增大,呈现无规律的散发性流行,用传统方法难以确诊此类带病个体.全基因组关联研究发现了数百种与复杂疾病相关的基因突变,但这些突变大部分对增加患病风险的贡献都非常小,其大部分的遗传性无法检测到[1].因为影响较小的大量变异体尚未发现,存在一些基因型分析技术上无法检测到的罕见的结构变异或表观遗传变异,以及难以检测到的基因之间和与环境之间的调控网络作用.因此需要探索GPV与宿主“易感基因”表达的相互作用及其致病的分子基础.

关键词：病毒基因组致病机制雏鹅败血性传染病表观遗传变异基因突变鹅细小病毒基因型分析