检索结果-南通市图书馆

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

临床轻症IgA肾病尿蛋白质组学研究

中国实用内科杂志 2010年第10期30卷 930-932页

作者：周华赵静芳孙彬钱军赵秀芬潘家荣邢昌赢苏州大学附属第三医院肾内科江苏常州213003 常熟市第一人民医院肾内科江苏常熟215500 南京医科大学第一附属医院肾内科南京210029

目前IgA肾病（IgAN）的诊断主要依赖肾活检病理检查，临床无创性检查判断IgAN进展的可靠指标很少，所以迫切需要一种可靠、无创的手段来诊断IgAN，减少重复肾活检次数，并预测疾病进展。近年来，蛋白质组学被广泛应用于人类疾病病理生... 详细信息

目前IgA肾病（IgAN）的诊断主要依赖肾活检病理检查，临床无创性检查判断IgAN进展的可靠指标很少，所以迫切需要一种可靠、无创的手段来诊断IgAN，减少重复肾活检次数，并预测疾病进展。近年来，蛋白质组学被广泛应用于人类疾病病理生理机制、治疗和药物筛选的研究，它可以同时检测标本中的所有表达蛋白，

关键词： IgA肾病尿蛋白质组二维凝胶电泳质谱

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

正常人尿蛋白质组翻译后修饰的鉴定

正常人尿蛋白质组翻译后修饰的鉴定

作者：刘浏北京协和医学院

学位级别：硕士

肾脏的主要功能之一就是对血液的超滤作用形成原尿,经肾小管重吸收后形成终尿排出体外。正常尿中含有少量的蛋白质成分,如白蛋白、转铁蛋白等,在肾脏疾病中不仅存在尿蛋白量的改变也可能存在尿蛋白成分的改变,因此,完全可以将疾病状态... 详细信息

肾脏的主要功能之一就是对血液的超滤作用形成原尿,经肾小管重吸收后形成终尿排出体外。正常尿中含有少量的蛋白质成分,如白蛋白、转铁蛋白等,在肾脏疾病中不仅存在尿蛋白量的改变也可能存在尿蛋白成分的改变,因此,完全可以将疾病状态下尿中出现的异常的蛋白成分或者数量出现极大变化的蛋白作为疾病的生物标志物,用于诊断肾脏疾病或者检测疾病的进程。尿蛋白质组学通过高通量、系统性地分析来鉴定尿液中所有的蛋白质分子并研究其生物学功能,这对尿生物标志物的鉴定及其在肾脏疾病的诊断、病情的检测和药物靶点的开发等方面具有重要的实际意义。尿蛋白质组学目前研究的绝大部分工作是在关注蛋白质表达水平的变化。然而,许多至关重要的生命进程不仅由蛋白质的相对丰度控制,更重要的是被那些时空特异分布的翻译后修饰控制的,揭示翻译后修饰的发生规律是理解蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。由于翻译后修饰蛋白质在样本中含量低且动态范围广,其相关研究极具挑战性,亲和富集、多维分离等技术与生物质谱的结合为翻译后修饰蛋白质组学的发展提供了契机。目前,有600多种蛋白质翻译后修饰的结构和大小已经被确定,但利用富集技术进行蛋白质组学规模化研究的蛋白质翻译后修饰较少,其中磷酸化和糖基化的研究较多。由于富集技术的限制,大多数翻译后修饰很难得到鉴定,在非富集的情况下,常规的质谱鉴定蛋白软件只能搜索少数几个指定可变修饰。随着生物信息学在翻译后修饰鉴定方面的发展,已经出现很多可搜索大量翻译后修饰的软件,这些软件实行开放式的修饰搜索模式,在蛋白搜索时不需要指定修饰的类型、大小以及种类。Unimod是一个公共的蛋白质翻译后修饰化学结构的数据库,里面详细全面记载了翻译后修饰的类型和大小以及化学结构。这些信息都显示不通过富集也可以全面的鉴定蛋白质的翻译后修饰。本研究中利用常规的尿蛋白质组学来鉴定尿蛋白,不利用任何的富集技术。这种非富集的方法比常规的方法不增加任何实验步骤,实验过程简单迅速,唯一区别的是在质谱鉴定之后使用专门鉴定未指定修饰蛋白的软件MODa和PEAKS6进行搜索,并通过人工查找去除了非体内翻译后修饰的蛋白,将两个软件的搜索结果进行综合发现75条含有体内翻译后修饰的多肽,一共是6种翻译后修饰类型。并与uniprot中注释的蛋白翻译后修饰的信息相比,发现其中有18种蛋白中的34种多肽上有新的体内翻译后修饰,这些新的体内翻译后修饰包括甲基化,氧化,羧化,磷酸化,脱水作用和二羟基化。这是第一次对尿蛋白质组的非富集体内翻译后修饰的一个全面鉴定。非富集的方法可以一次对多种类型修饰进行鉴定,这是相比于富集方法最大的优势,富集的方法往往只能对一种翻译后修饰进行鉴定。我们还通过人工查找去除了实验过程中引进的各种修饰并筛选出真正的体内翻译后修饰,这样也排除了实验引进的修饰对疾病标志物鉴定的干扰。这些体内翻译后修饰赋予了蛋白更多的生理功能,将尿蛋白质组描述的更加细腻更加深刻,为尿蛋白疾病标志物的发现奠定了基础。此次研究只是利用一个样本进行的初步研究,鉴定结果可能具有个体差异性,因此以后还可以做更详细更大规模的研究,比如将样本数量增加,将样本来源丰富化,这样可以鉴定更全面的尿蛋白翻译后修饰,对尿蛋白疾病标志物的发现应该具有更大的帮助。

关键词：尿蛋白质组体内蛋白质翻译后修饰 MODa软件 PEAKS6软件非富集

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

尿蛋白质组反映机体状态的边界探索

延安大学学报（医学科学版） 2023年第1期21卷 1-3页

作者：高友鹤北京师范大学北京100875

未来改变医学的一个重要方向是早期敏感地发现机体状态的变化,这样才能在不可逆的状态到达之前进行早期干预。以往总是寄予希望能够通过提高检测的敏感度来发现血液中能反映机体状态的早期微小变化。由于血液受到机体稳态机制的控制,早... 详细信息

未来改变医学的一个重要方向是早期敏感地发现机体状态的变化,这样才能在不可逆的状态到达之前进行早期干预。以往总是寄予希望能够通过提高检测的敏感度来发现血液中能反映机体状态的早期微小变化。由于血液受到机体稳态机制的控制,早期微小的变化可能被从内环境中消弭。与之相反,尿液更能反映早期内环境的微小变化,是生物标志物的更好来源。很多与疾病相关的早期变化在尿蛋白质组的变化中可被找到。下一个问题是尿蛋白质组还有多少潜力,本文将总结本研究团队最近在这一方面的一些探索。

关键词：尿蛋白质组生物标志物机体状态

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

肺腺癌患者尿蛋白质组差异表达分析

武警后勤学院学报（医学版） 2019年第1期28卷 14-18页

作者：张民陈振岗张文成史学军谢辉陈欢王广舜天津医科大学宝坻临床学院天津300070 天津医科大学宝坻临床学院肿瘤外科天津301800 天津医科大学宝坻临床学院胸外科天津301800 西南医科大学临床医学系四川泸州646000

【目的】探讨肺腺癌患者和健康志愿者尿蛋白质差异表达谱,寻找具有诊断价值的生物标志物。【方法】选取肺腺癌患者的尿标本13例,以22例健康志愿者尿标本作为对照组,利用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate-polya... 详细信息

【目的】探讨肺腺癌患者和健康志愿者尿蛋白质差异表达谱,寻找具有诊断价值的生物标志物。【方法】选取肺腺癌患者的尿标本13例,以22例健康志愿者尿标本作为对照组,利用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)技术和MS-Thermo-Orbitrap-Velos质谱对肺腺癌患者和健康志愿者尿进行蛋白质组学比较。采用酶联免疫吸附剂测定(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)验证质谱结果。应用受试者工作曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)评估差异蛋白的临床价值。【结果】表达谱共鉴定出365个差异表达蛋白质,表达上调蛋白质185个、表达下调蛋白质180个,筛选出凝血与免疫通路相关蛋白质10个,ROC分析发现纤维蛋白溶酶原(plasminogen,PLG)和纤维蛋白原γ(Fibrinogen gamma chain,FGG)的敏感性和特异性均>80%,且曲线下面积(area under curve,AUC)>0.8。ELISA法实验结果与质谱结果趋势一致,FGG、PLG作为联合检测项目鉴别肺腺癌与健康人群的AUC为0.947,相对单一检测项目FGG(0.844)和PLG(0.934)的诊断效能更高(P<0.05)。但是,肺腺癌患者尿中FGG、PLG表达水平与患者的年龄、性别、吸烟、临床分期均无关。【结论】尿中FGG与PLG可以作为辅助肺腺癌诊断的标志物,但其与肺腺癌的各项临床参数之间无明显联系,需要进一步扩大样本进行分析。

关键词：肺腺癌尿蛋白质组纤维蛋白酶原纤维蛋白原γ

应用蛋白质组学筛选宫颈癌患者尿液中的肿瘤标志物

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国生物工程杂志 2016年第9期36卷 1-10页

作者：安龙飞金龙孙凤亮李凯闫成智秦钧张普民吴琛陈欢河北大学生命科学学院保定071000 陕西省人民医院肿瘤放射治疗科西安710068 天津医科大学宝坻临床学院泌尿外科天津301800 北京蛋白质组研究中心北京102200

通过比较健康女性和宫颈癌患者的尿蛋白质组,发现并分析差异表达蛋白,从中筛选潜在的宫颈癌的标志物。研究对象由43名宫颈癌患者(CC)和47名健康女性(HW)组成。用超速离心法沉淀尿蛋白,再用一维凝胶电泳(SDS-PAGE)与液相色谱-质谱联用技... 详细信息

通过比较健康女性和宫颈癌患者的尿蛋白质组,发现并分析差异表达蛋白,从中筛选潜在的宫颈癌的标志物。研究对象由43名宫颈癌患者(CC)和47名健康女性(HW)组成。用超速离心法沉淀尿蛋白,再用一维凝胶电泳(SDS-PAGE)与液相色谱-质谱联用技术(LC-MS/MS)鉴定尿液中的蛋白质,蛋白质定量采用无标定量。比较患者尿蛋白质组、健康对照的尿蛋白质组和宫颈癌组织蛋白质组,有1910个蛋白质是患者和健康对照共有的尿蛋白,这其中有746个蛋白质也存在于宫颈癌组织蛋白质组。在这746个蛋白质中找到84个上调蛋白和82下调蛋白。通过生物信息学分析发现牛皮癣素(S100A7)和癌胚抗原相关细胞黏附分子8(CEACAM8)是宫颈癌尿液样本独有蛋白质。在验证组的70例样本中,双盲法测试S100A7、CEACAM8以及两者联合诊断宫颈癌的敏感性能达到73%、87%、93%。结果提示,宫颈癌患者的尿蛋白质组与健康女性的尿蛋白质组不同,并且S100A7和CEACAM8可以作为宫颈癌潜在的肿瘤标志物。

关键词：尿蛋白质组宫颈癌生物标志物

除组织中高丰度蛋白对蛋白鉴定的影响及心肌梗死尿蛋白质组分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

除组织中高丰度蛋白对蛋白鉴定的影响及心肌梗死尿蛋白质组分析

作者：邹丽莉北京协和医学院

学位级别：硕士

研究目的分析免疫沉淀去除组织样品中血清高丰度蛋白对组织蛋白质组鉴定的影响。研究方法人的甲状腺和垂体组织样品经去除12种血清高丰度蛋白抗体柱处理后,得到的低丰度蛋白样品和未处理样品分别进行液质联用分析,以及多肽和蛋白质水平... 详细信息

研究目的分析免疫沉淀去除组织样品中血清高丰度蛋白对组织蛋白质组鉴定的影响。研究方法人的甲状腺和垂体组织样品经去除12种血清高丰度蛋白抗体柱处理后,得到的低丰度蛋白样品和未处理样品分别进行液质联用分析,以及多肽和蛋白质水平的定性和定量分析。研究结果人的甲状腺和垂体样品中血清高丰度蛋白分别被除去了92.11%±12.87%和78%±25%。所鉴定到的多肽和蛋白与未处理样品相比,甲状腺组织鉴定到的非冗余多肽提高了70%、蛋白鉴定数提高了16.5%,垂体鉴定到的非冗余多肽提高了21.9%,蛋白鉴定数无明显变化。研究结论免疫沉淀去除组织中的血清高丰度蛋白法可以显著的提高组织样品的多肽和蛋白鉴定效率,且更适用于血管密集的样品。研究目的：心肌梗死是一种发病率和死亡率很高的疾病,对心肌梗死的治疗花费大量的人力物力。然而由于缺少高灵敏度快速的方法,很难进行心肌梗死的早期诊断。寻找有效可靠的心肌梗死生物标志物是很有必要的。本研究分析了来自ST间期提高的心肌梗死患者(首次发病12小时内和经皮冠状动脉治疗后7天)的尿蛋白质组和血浆蛋白质组,来寻找心肌梗死潜在的生物标志物。研究方法及结果：通过同位素标记相对和绝对定量方法(iTRAQ)和2D-LC-MS/MS分析方法,1684个尿蛋白和468个血浆蛋白被定量。将175个尿的差异蛋白和47个血浆差异蛋白合并,一共得到216个心肌梗死差异蛋白。根据功能分析,这些蛋白主要参加了凝血系统,线粒体功能障碍和动脉粥样硬化信号通路。应用蛋白印记方法(Western blot)验证了纤维蛋白酶原gamma链(FGG),细胞色素C (CYCS)和载脂蛋白A1 (APOA1)的改变。通过二元逻辑回归分析,尿的FGG和CYCS联合用于心肌梗死的诊断可以达到76.9%的灵敏度和100%特异性,受试者工作特征曲线的曲线下面积达到0.893。研究结论：通过对比尿和血浆中差异蛋白功能,发现尿和血浆可以从不同方面反映心肌梗死的病理学改变。因此将尿蛋白质组和血浆蛋白质组的生物标志物结合,可能会为心肌梗死的诊断提供更多的信息。

关键词：甲状腺蛋白质组垂体蛋白质组免疫沉淀去除血清高丰度蛋白液质联用分析生物标志物同位素标记相对和绝对定量尿蛋白质组血浆蛋白质组心肌梗死

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

室温放置4 h对样本尿蛋白质组分析的影响

基础医学与临床 2019年第9期39卷 1330-1334页

作者：杨丽君郭正光景宗攀孙玉琳孙伟赵晓航中国医学科学院北京协和医学院国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室北京100021 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院中心实验室北京100005

目的探讨用医院检验科尿常规检查剩余的尿液样本开展尿蛋白质组分析,以便充分利用资源。方法同一个体尿液样本采集后分别采用立即冻存和室温下放置4h后冻存于-80℃备用。尿液样本分别进行聚丙烯酰胺凝胶电泳、二维凝胶电泳和液相色谱串... 详细信息

目的探讨用医院检验科尿常规检查剩余的尿液样本开展尿蛋白质组分析,以便充分利用资源。方法同一个体尿液样本采集后分别采用立即冻存和室温下放置4h后冻存于-80℃备用。尿液样本分别进行聚丙烯酰胺凝胶电泳、二维凝胶电泳和液相色谱串联质谱分析,对比两种尿液样本采集方法对尿蛋白质组分析的影响。用点杂交免疫印迹法分析了室温放置4h尿液样本(n=150)中胞质非特异性二肽酶(CNDP2)蛋白在结直肠癌(CRC)患者与健康对照尿液中的含量。结果立即冻存和经室温放置4h后冻存的尿液样本的主要蛋白条带、数量和位置无明显差异;从中分别鉴定了(1204±50,n=3)个和(1155±7,n=3)个尿蛋白质,以及(7501±661,n=3)条和(6940±182,n=3)条多肽,两组样本间无差异。尿蛋白CNDP2在结直肠癌患者尿液中含量显著高于健康对照(P尿蛋白质组分析无明显差异。医院检验科尿常规检查剩余的尿液样本可用于尿蛋白质组分析。CNDP2在结直肠癌患者尿液中含量升高,是结直肠癌候选的尿蛋白标志物。

关键词：尿蛋白质组二维凝胶电泳液相色谱串联质谱尿蛋白生物标志物

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

利用尿液蛋白质组学发现疾病早期生物标志物

利用尿液蛋白质组学发现疾病早期生物标志物

儿童微小病变型肾病综合征尿蛋白组的双向电泳及PDQuest图像初步分析

第三届全国质谱分析学术报告会

作者：高友鹤北京师范大学生命科学学院基因工程药物及生物技术北京市重点实验室

疾病生物标志物是指与生理或病理过程相关联的可监测的变化。由于人体存在稳态调节机制,因此血液作为维持内环境稳定的重要参与部分更倾向于保持不变。然而,尿液作为机体排出的废物,能够积累和反映机体的一系列变化。尿液的这一特性使... 详细信息

疾病生物标志物是指与生理或病理过程相关联的可监测的变化。由于人体存在稳态调节机制,因此血液作为维持内环境稳定的重要参与部分更倾向于保持不变。然而,尿液作为机体排出的废物,能够积累和反映机体的一系列变化。尿液的这一特性使得尿液成为疾病早期生物标志物良好的来源[1]。在癌症,纤维化,感染等疾病的动物模型上,早期即可发现很多尿蛋白生物标志物,这些潜在标志物很多都曾经被报道和造模的疾病相关[2,3,4,5,6]。这种利用动物模型找到和疾病相关的尿液潜在生物标志物的方法是尿液生物标志物发展的一个重要路径,为将来在临床样本上高效验证奠定了基础[7]。

关键词：疾病早期生物标志物尿蛋白质组

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

第四军医大学学报 2006年第5期27卷 462-465页

作者：黄艳军黄松明张爱华费莉徐颂周陈荣华南京医科大学小儿肾脏病研究中心江苏南京210029

目的:建立儿童微小病变型肾病综合征尿蛋白组分析所需的固相pH梯度等电聚焦双向电泳及相关技术.方法:冷丙酮萃取肾病综合征患儿尿蛋白,去除白蛋白等高丰度蛋白、除盐,以固相IPGpH梯度等电聚焦为第一向,均一SDS胶聚丙烯酰胺凝胶(T=10%)... 详细信息

目的:建立儿童微小病变型肾病综合征尿蛋白组分析所需的固相pH梯度等电聚焦双向电泳及相关技术.方法:冷丙酮萃取肾病综合征患儿尿蛋白,去除白蛋白等高丰度蛋白、除盐,以固相IPGpH梯度等电聚焦为第一向,均一SDS胶聚丙烯酰胺凝胶(T=10%)为第二向,银染后PDQuest软件进行分析.结果:成功得到儿童微小病变型肾病综合征尿蛋白双向电泳图谱.尿蛋白用17cm,pH3-10L(线性)的IPG胶条进行二维电泳时上样量100μg,60000Vh的等电聚焦是恰当的.PDQuest7.3软件进行图像分析,检测到400个蛋白点.结论:用尿蛋白组学对儿童微小病变型肾病综合征的尿液进行研究是可行的.为今后从更高的水平来寻找肾脏疾病的功能蛋白和特异性蛋白质,阐明肾脏疾病发生发展的网络机制等后续研究提供了可能性.

关键词：尿蛋白质组双向电泳图像分析